سلام
تسلیت به همه هم‌وطنای عزیز 🖤

⚪️ زمان ثبت‌نام آزمون کارشناسی ارشد وزارت بهداشت به تأخیر افتاده و هفته آخر بهمن ماه اعلام می‌شه. به دوستان‌تون اطلاع بدید.

⚪️ همین‌طور با توجه به ناپایدار بودن شرایط اینترنت، دوستانی که آنلاین شدن، می‌تونن فایل‌های موردنیاز رو از کانال دانلود کنن تا زمان قطعی اینترنت، بتونن مطالعه کنن.

⚪️ تو این مدت اگه ببینم دوستان تمایلی به فایل‌ها و مباحث درسی دارن، حتما مباحث موردنیاز رو تو کانال آپلود می‌کنم که حداقل بتونید مطالعه داشته باشید.


#اخبار
#کارشناسی_ارشد

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠 ⚡️ 🔠🔠

📢 شروع ثبت‌نام دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی برای کنکور ۱۴۰۵ 📢

🏆 امکانات و آپشن‌های این دوره 👈

1️⃣ جزوه جمع‌بندی ژنتیک پزشکی امری: در این دوره، یک جزوه کم‌حجم فصل به فصل، از تمام مباحث و نکات مهم رفرنس امری داده می‌شه؛ در چهار سال اخیر، رتبه برترهای زیادی از جمله رتبه‌های ۲، ۳، ۵، ۹، ۱۱، ۱۳، ۱۴، ۲۲، ۲۳، ۳۲، ۳۱، ۳۴ و ... از این جزوه استفاده کردن که کارنامه‌شون تو کانال موجود هست (رتبه‌ها - مصاحبه‌ها).

2️⃣ آنالیز کامل آزمون‌های کنکور و تالیفی: نقطه قوت این دوره تحلیل آزمون هست؛ ۷ آزمون تالیفی و سوالات ژنتیک آزمون‌های ۱۱ سال اخیر کنکور ارشد بهداشت، به طور کامل و دقیق آنالیز می‌شن (در مجموع ۱۸ آزمون). تست‌ها هم به‌صورت فصل به فصل ارائه می‌شن.

⭕️3️⃣ تست‌های تألیفی و فصل‌ به فصل از منابع جرد، تامپسون و استراخان: با توجه به اینکه هر سال تست‌های بیشتری از منابع غیر از امری طرح می‌شه، تو دوره جمع‌بندی امسال تست‌های تألیفی فصل به فصل از جرد، تامپسون و استراخان ارائه می‌شه که برای سوالات احتمالی آماده باشید. تمامی تست‌ها پاسخنامه کاملا تشریحی دارن.

4️⃣ برنامه‌ریزی جامع تا روز کنکور: تو این دوره، برنامه‌ریزی روزانه و دقیق بر اساس صفحات جزوات و آزمون‌ها ارائه می‌شه. به طوری‌ که اگه طبق برنامه پیش بیاید، تا روز کنکور می‌تونید چهار دور جزوات رو مطالعه کنید. حجم برنامه هم کاملا منطقی هست و سنگین نیست.

5️⃣ ارزیابی روزانه عملکرد دانشجو تا روز کنکور: هر شب عملکرد و مطالعه دانشجو به‌طور اختصاصی بررسی می‌شه تا مطالعه و برنامه‌ریزی، دقیق‌تر پیش بره. در واقع این دوره، مشاوره‌محور هم هست.

6️⃣ رفع اشکال روزانه تا روز کنکور: به تمامی سوالات شما تا روز کنکور پاسخ داده می‌شه. همین‌طور برای یک ماه آخر، به گروه رفع اشکال اضافه می‌شید.

7️⃣ جزوات فصل به فصل تامپسون: مطابق با فصل‌های امری، جزوات فصل به فصل تامپسون، شامل تمام مباحث تامپسون، داده می‌شه.

⭕️8️⃣ جزوات فصل به فصل جرد طبق آخرین ادیشن: مطابق با فصل‌های امری، جزوات فصل به فصل جرد شامل تمام مباحث این رفرنس داده می‌شه.

9️⃣ نکات فصل‌های مهم استراخان: نکات فصل‌های مهم استراخان ارائه می‌شه. امسال فصل‌ها و نکات بیشتری از استراخان تو دوره قرار داده می‌شه.


🔥 همه‌ی این آپشن‌ها، تمام و کمال، در دوره جمع‌بندی امسال قرار دارن و مطمئن باشید با اجرای برنامه‌ریزی منطقی دوره، تمامی مباحث رو می‌تونید چندبار مطالعه و مرور کنید 🧪💯

⏱️ زمان شروع دوره: ۲۰ بهمن
⌛️ زمان ثبت‌نام دوره: از همین حالا تا ۱۸ بهمن
✏️ ظرفیت دوره: بسیار محدود
💵 امکان پرداخت قسطی با هزینه‌ای کم
🟢 به دوستانی که تا ۱۲ بهمن ثبت‌نام کنند، ۱۵٪ تخفیف و دو جزوه رایگان لغات مهم زبان وزارت بهداشت تعلق می‌گیره 🟢

جهت ثبت‌نام و کسب اطلاعات بیشتر به این آی‌دی پیام دهید: @Cyaxares


کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠 ⚡️ 🔠🔠

🔈 تقویم دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی ۱۴۰۵ 🔈

🟥 دوستان دوره جمع‌بندی بر اساس این تقویم برگزار می‌شه. طبق این تقویم، تمامی مباحث ارائه می‌شه و برنامه‌ریزی کاملا دقیق، بر اساس مباحثِ داده‌شده، تنظیم می‌شه. این برنامه‌ریزی سنگین نیست و کاملا مطابق با فواصل زمانی طراحی شده. یک برنامه‌ریزی جدا هم برای ۲۸ روز آخر براتون در نظر گرفته شده که بتونید باز هم مرور داشته باشید.

📌 دوستانی که تا دوشنبه ثبت‌نام کنن، بهشون تخفیف و دو جزوه لغات زبان پزشکی تعلق می‌گیره. ضمن اینکه امکان پرداخت قسطی هزینه دوره وجود داره.

📝 مشاهده مشخصات دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی

جهت ثبت‌نام و کسب اطلاعات بیشتر به این آی‌دی پیام دهید: @Cyaxares


کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠 ⚡️ 🔠🔠

سلام دوستان 🖤

📌 در رابطه با دوره جمع‌بندی ژنتیک، مثل سال قبل به دوستانی که تو کنکورهای قبل رتبه خوبی کسب کردن ولی به‌هردلیلی قبول نشدن، تخفیف زیادی در نظر گرفته شده. به این صورت که برای دوستانی که رتبه زیر ۶۰ کسب کردن، ۵۰٪ و برای دوستانی که رتبه ۶۰ تا ۹۰ کسب کردن، ۴۰٪ تخفیف داده می‌شه. با این کار داوطلبایی که نزدیک به قبولی هستن، با هزینه‌ای کم می‌تونن به امکانات جمع‌بندی ژنتیک و همه جزوه‌ها دسترسی پیدا کنن و شانس‌شون رو برای کسب رتبه موردنظر افزایش بدن. اگه اشخاصی رو با این شرایط می‌شناسید، حتما این پست رو براش بفرستید تا از این آپشن استفاده کنن.

📌 ضمن اینکه به زودی مباحث مهم برای جمع‌بندی و آزمون‌های تألیفی فصل به فصل و جامع ژنتیک و همین‌طور زبان تو کانال قرار داده می‌شه.


✨ جهت ثبت‌نام دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع و جمع‌بندی ژنتیک پزشکی امری، جرد، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆


کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠 ⚡️ 🔠🔠

درود
امیدوارم حالتون خوب باشه 🌱

📌 دوستان تو این روزها تا کنکور، لازمه که من یک لیست آپدیت‌شده از مباحث مهم که تو این مدت به دردتون می‌خوره رو تو این پست بذارم؛ تو این مدت این فایل‌ها رو حتما مطالعه و مرور کنید.

🟢 تحلیل تست‌های ارشد ژنتیک انسانی ۱۴۰۱-۱۴۰۰
🟢 تحلیل تست‌های ارشد ژنتیک انسانی ۱۴۰۲-۱۴۰۱
🟢 تحلیل تست‌های ارشد ژنتیک انسانی ۱۴۰۳-۱۴۰۲
🟢 تحلیل تست‌های ارشد ژنتیک انسانی ۱۴۰۴-۱۴۰۳
🟢 تحلیل تست‌های ارشد ژنتیک انسانی ۱۴۰۵-۱۴۰۴
🟢 جداول مهم رفرنس امری
🟢 مباحث مهم رفرنس تامپسون
🟢 لیست مباحث مهم فصل‌های رفرنس امری
🟢 لغات ضروری زبان پزشکی (پارت یک)
🟢 لغات ضروری زبان پزشکی (پارت دو)
🟢 لغات ضروری زبان پزشکی (پارت سه)
🟢 جدول بیماری‌های تک‌ژنی (پارت ۱)
🟢 جدول بیماری‌های تک‌ژنی (پارت ۲)
🟢 جدول بیماری‌های تک‌ژنی (پارت ۳)
🟢 جدول بیماری‌های تک‌ژنی (پارت ۴)
🟢 جدول بیماری‌های بیوشیمیایی (پارت ۱)
🟢 جدول بیماری‌های بیوشیمیایی (پارت ۲)
🟢 جدول بیماری‌های بیوشیمیایی (پارت ۳)
🟢 جدول بیماری‌های بیوشیمیایی (پارت ۴)
🟢 جدول بیماری‌های بیوشیمیایی (پارت ۵)
🟢 جدول بیماری‌های بیوشیمیایی (پارت ۶)
🟢 جدول بیماری‌های مادرزادی
🟢 جدول‌ بیماری‌های کروموزومی (پارت ۱)
🟢 جدول‌ بیماری‌های کروموزومی (پارت ۲)
🟢 جدول‌ بیماری‌های کروموزومی (پارت ۳)
🟢 جدول‌ بیماری‌های کروموزومی (پارت ۴)
🟢 جدول‌ بیماری‌های سیستم ایمنی (پارت ۱)
🟢 جدول‌ بیماری‌های سیستم ایمنی (پارت 2)
🟢 لیست آزمون‌ها و کوییزها


✨ جهت ثبت‌نام دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع و جمع‌بندی ژنتیک پزشکی امری، جرد، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠 ⚡️ 🔠🔠

📌 برنامه‌ریزی دو ماهه (پارت دوم)

🔴 توضیحات ◀️

🔴 دوستانی که از برنامه‌ریزی ماه اول برای فصل‌های مهم استفاده کردن، می‌تونن این برنامه‌ریزی رو برای ماه دوم پیش ببرن. تو این برنامه‌ریزی فصل‌های ۹، ۱۴، ۱۸ و ۱۹ رو می‌تونید کامل مطالعه و مرور و همین‌طور فصل‌های ۲، ۳، ۶ و ۱۷ رو که ماه قبل خوندید، مرور کنید.

🟠 مباحث رو می‌تونید از طریق هشتگ‌ها تو لیست کانال دنبال کنید. لینک پست اول ۴ فصل برنامه‌ریزی 👈🏻
پست اول فصل ژنتیک سرطان
پست اول فصل ژنتیک تکوین
پست اول فصل ناهنجاری‌های بیوشیمیایی
پست اول فصل اختلالات تک‌ژنی

🟢 مورد بعد اینکه امروز دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی ۱۴۰۵ شروع شد و دوستانی که به این دوره نیاز دارن، هنوز هم فرصت ثبت‌نام دارن؛ اگه می‌خواید طبق برنامه‌ریزی دقیق پیش برید، ثبت‌نام رو به تأخیر نندازید.


✨ جهت ثبت‌نام دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع و جمع‌بندی ژنتیک پزشکی امری، جرد، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠 ⚡️ 🔠🔠

📎 دوستان پلت‌فرم مکتب‌خونه دوباره یک‌سری از دوره‌هاش رو رایگان کرده که می‌تونید یکیش رو انتخاب کنید؛ دوره گیت‌هاب جادی، دوره جامع مشین‌لرنینگ و ... رو می‌تونید با کد تخفیف hamdeli2 رایگان دریافت کنید؛ فقط اگه دوره‌ای که انتخاب کردید تیک «دسترسی کامل» داره، اون تیک رو بردارید و آموزش رو به سبد خریدتون اضافه کنید. فرصت استفاده از این کد تخفیف تا ۲۴ بهمن هست.

📎 لینک مشاهده دوره‌ها:
https://land.maktabkhooneh.org/hamdeli2/


✨ جهت ثبت‌نام دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع و جمع‌بندی ژنتیک پزشکی امری، جرد، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠 ⚡️ 🔠🔠

📌 مفهوم و آنالیز Trajectory در دیتاهای سینگل‌سل

🔴 توضیحات ◀️

🔴 وقتی فرایندهای پویای سلولی مثل تمایز سلولی یا پاسخ سلول به یک محرک خاص رو بررسی می‌کنیم، می‌بینیم که سلول‌ها از یک حالت عملکردی به حالت دیگه تغییر می‌کنن. در طول این تغییر، بیان ژن‌ها عوض می‌شه؛ یعنی یک‌سری ژن‌ها در حالت اول فعال هستن و در حالت بعدی، ژن‌های دیگه‌ای فعال می‌شن. پس در واقع سلول‌ها به‌صورت پیوسته از یک وضعیت به وضعیت دیگه حرکت می‌کنن.

🟡 حالا اگر داده‌های سینگل‌سل داشته باشیم، متوجه می‌شیم که همه سلول‌ها دقیقاً در یک مرحله نیستن؛ مثلاً در یک مجموعه از سلول‌های B، ممکنه بعضی‌ها immature، بعضی mature و برخی هم به پلاسماسل تبدیل شده باشن؛ یا مثلا ممکنه تو دیتا بعضی از سلول‌ها استم سل باشن، بعضی دیگه وارد مرحله پیش‌ساز شده‌ باشن و بعضی هم در حال تبدیل شدن به سلول‌های تخصص‌یافته باشن.

🟠 وقتی این حالت‌های مختلف رو کنار هم قرار می‌دیم، می‌تونیم مسیر تغییر و تحول این سلول‌ها رو ببینیم. به این مسیر پیوسته تغییرات، مسیر زیستی یا Trajectory بیولوژیکی گفته می‌شود. برای ساخت trajectory، پکیج‌های مختلفی تو R و Python وجود داره که یکی از معروف‌ترین آن‌ها Monocle3 هست که با استفاده از الگوی بیان ژن‌ها، سلول‌ها رو در یک مسیر پیوسته مرتب می‌کنه و مراحل تمایز یا پاسخ سلولی رو نشان می‌ده.

🟢 کدهای پکیج monocle3 ←

remotes::install_github("bnprks/BPCells/r")
remotes::install_github("satijalab/seurat-wrappers")
devtools::install_github('cole-trapnell-lab/monocle3')
BiocManager::install("monocle")
library(monocle3)

cds <- load_mm_data(mat_path = "matrix.mtx.gz", 
                    feature_anno_path = "features.tsv.gz", 
                    cell_anno_path = "barcodes.tsv.gz")
class(cds)

cds <- preprocess_cds(cds = cds,
                      num_dim = 50,
                      method = "PCA",
                      scaling = TRUE,
                      use_genes = NULL,
                      norm_method = "log")

plot_pc_variance_explained(cds)

cds <- reduce_dimension(cds = cds,
                        reduction_method = "UMAP",
                        preprocess_method = "PCA",
                        umap.metric = "cosine",
                        umap.min_dist = 0.1,
                        umap.n_neighbors = 15,
                        max_components = 2)
cds@reduce_dim_aux$UMAP

cds <- cluster_cells(cds = cds,
                     reduction_method = "UMAP",
                     k = 20,
                     resolution = 1e-5,
                     cluster_method = "leiden")
table(as.numeric(cds@clusters$UMAP$cluster_result$optim_res$membership))

plot_cells(cds = cds,
           reduction_method = "UMAP",
           color_cells_by = "cluster",
           group_label_size = 4)

marker_test_res <- top_markers(cds = cds,
                               group_cells_by = "cluster",
                               reference_cells = 1000,
                               cores = 8)

cds <- learn_graph(cds = cds,
                   use_partition = TRUE,
                   close_loop = FALSE)

plot_cells(cds = cds,
           reduction_method = "UMAP",
           color_cells_by = "cluster",
           group_label_size = 4,
           show_trajectory_graph = TRUE,
           trajectory_graph_color = "darkgreen",
           trajectory_graph_segment_size = 2,
           label_roots = TRUE,
           graph_label_size = 2)

cds <- order_cells(cds = cds,
                   reduction_method = "UMAP")

🔴 دوستان توجه کنید که کلاسترها رو قبل از مرحله learn_graph، باید annotate کنید. همین‌طور تو مرحله order_cells، باید root node انتخاب کنید. دوستانی که تو نصب این پکیج و ورک‌فلو ارور می‌گیرن یا سوال دارن، به من پیام بدن.
🔴 ورک‌فلو کامل: https://cole-trapnell-lab.github.io/monocle3/docs/installation/


✨ جهت ثبت‌نام دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع و جمع‌بندی ژنتیک پزشکی امری، جرد، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#بیوانفورماتیک

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠 ⚡️ 🔠🔠

🔍 زمان ثبت‌نام آزمون کارشناسی ارشد وزارت بهداشت ۱۴۰۵ اعلام شد.

🟢 زمان ثبت‌نام: از ۱۶ تا ۲۶ اسفند.
🟢 زمان برگزاری آزمون: ۲۱ و ۲۲ خرداد.


#اخبار
#مشاوره
#وزارت_بهداشت

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠 ⚡️ 🔠🔠

📎 دوستان DataCamp تا ۲۲ فوریه (یک‌شنبه) دسترسی به کورس‌هاش رو رایگان کرده. فرصت خوبیه که مهارت یاد بگیرید و رزومه‌تون رو تقویت کنید. فقط با یک ایمیل می‌تونید تو این سایت پروفایل بسازید و از همه دوره‌هاش به‌طور نامحدود استفاده کنید. ضمن اینکه با تکمیل کردن هر دوره، بهتون سرتیفیکت معتبر می‌ده که می‌تونید تو رزومه‌تون بذارید. بچه‌های ارشد و دکتری از دست ندید.

✅ لینک سایت:
https://www.datacamp.com/
✅ لینک دانلود اپلیکیشن از گوگل‌پلی:
https://play.google.com/store/apps/details?id=com.datacamp

📎 چندتا از دوره‌‌های دیتاکمپ که برای بیوانفورماتیک می‌تونه بدردتون بخوره:
✅ Introduction to R
✅ Intermediate R
✅ Network Analysis in R
✅ Survival Analysis in R
✅ Machine learning with caret in R
✅ RNA-Seq with Bioconductor in R
✅ Differential Expression Analysis with limma in R


✨ جهت ثبت‌نام دوره جمع‌بندی ژنتیک پزشکی ۱۴۰۵ و تهیه جزوات جامع و جمع‌بندی ژنتیک پزشکی امری، جرد، تامپسون و جزوه لغات زبان پزشکی پیام دهید : @Cyaxares

💎 جهت مشاهده مصاحبه و کارنامه رتبه برترهایی که از مشاوره و جزوات من استفاده کردن، از این لینک‌ استفاده کنید : 🏆 رتبه‌ها - مصاحبه‌ها 🏆

😢 کپی کردن مباحث و پست‌های کانال، تنها با ذکر نام کانال بلامانع است!

➕ پست‌ها رو برای دوستانتون فوروارد کنید.


#بیوانفورماتیک

کانال آموزشی آرش صفرزاده (@GeneticsAS 🌐)
🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠🔠 ⚡️ 🔠🔠