‌ (http://jametan.com/t/7f0681b9931839488.png)


آموزش ترسیم شبکه های هم بیانی (WGCNA)
https://labs.genetics.ucla.edu/horvath/CoexpressionNetwork/Rpackages/WGCNA/Tutorials/



📍University of Tehran Bioinformatics and Systems Biology Club📍


آدرس کانال:
@BioUT
📍کلوب بیوانفورماتیک وسیستم بیولوژی دانشجویان دانشگاه تهران 📍
WGCNA flowchart

آموزش ترسیم شبکه های هم بیانی (WGCNA)
@BioUT
📍University of Tehran Bioinformatics and Systems Biology Club📍

خبر درگذشت دریانوردان ایرانی چنان سنگین و جانسوز است که به دشواری به باور می نشیند ولی در برابر تقدیر حضرت پروردگار چاره ای جز تسلیت و رضایت نیست، خداوند قرین رحمتشان فرماید.
@BioUT

‌ (http://jametan.com/t/c0f6aab79931839488.png)

📄 مقاله کلیدی

🗞 مجله Nature Methods 📅 ژانویه 2018
عنوان : توالی یابی موازی مستقیم RNA f بوسیله آرایه های نانوپور
• توالی یابی RNA بصورت مستقیم
• بدون نیاز به رونویسی معکوس
• بایاس کم
• رونوشت های با طول کامل
🖥 آدرس مستقیم مقاله: https://www.biorxiv.org/content/early/2016/08/12/068809
📏 doi: 10.1038/nmeth.4577
خلاصه ترجمه شده:
توالی یابی RNA از نمونه های بیولوژیکی کاری بسیار ارزشمند است زیرا می تواند شامل شناسایی هویت دقیق باکتری ها و ویروس ها شود و همچنین نشانگر تفاوت های ظریف ایجاد شده در فرآیند alternative splicing یا شرایط بیانی متفاوت موجود زنده باشد. با این حال روش های فعلی به خاطر خوانش های کوچکشان و نسخه برداری معکوس دارای محدویت هایی هستند. در مقاله پیش رویتان تکنیک نانوپر مستقیم برای توالی یابی RNA یا nanopore direct RNA-seq که روشی با قابلیت بالای @BioUT موازی سازی، real-time، تک مولکولی است که ما را بی نیاز از فرآیند نسخه برداری معکوس یعنی همان تکثیر الگوها یا reverse trannoscription می کند. این روش رشته ها را بطور کلی توالی یابی کرده و ما را قادر به شناسایی نوکلوتیدهای آنالوگ از روی داده های RNAمی کند.

📌 کانال دانشجویان بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی 📌 @BioUT

📄 مقاله کلیدی
🗞 مجله Nature Methods 📅 ژانویه 2018
عنوان : توالی یابی موازی مستقیم RNA روی آرایه های نانوپور
• توالی یابی RNA بصورت مستقیم
• بدون نیاز به رونویسی معکوس
• بایاس کم
• رونوشت اصلی

استفاده از اطلاعات حاصل از تکنیک NGS جهت درمان بیماریهای نورولوژیکی و سرطان
دانشگاه پزشکی واشنگتن با موسسه CureOne جهت استفاده از اطلاعات حاصل از تکنیک NGS برای درمان ژنتیکی سرطان همکاری می کند.

موسسه CureOne با مشارکت آزمایشگاه ژنومیکس و پاتولوژی دانشگاه واشنگتن اقدام به انجام تست های بالینی درمان سرطان بر پایه اطلاعات حاصل از تکنیک NGS خواهد کرد. این اطلاعات در بانک مربوط به NGS های انجام شده توسط این موسسه موجود می باشد.

اطلاعات ژنومی بالینی توسط این موسسه غیرانتفاعی که بصورت رسمی به نام MED-C شناخته می شود استاندارد می شود. در سال 2015 این موسسه موفق به دریافت بودجه حمایتی برای ثبت اطلاعات ژنتیکی مرتبط با سرطان سینه شد. در اوایل سال جاری نیز دو موسسه دیگر برای همکاری جهت ثبت اطلاعات ژنتیکی N1 اعلام آمادگی کرده اند.
Dane dickson
مدیرعامل موسسه CureOne می گوید: هدف موسسه CureOne، ثبت و استانداردسازی اطلاعات ژنتیکی برای یافتن راهی برای درمان سرطان می باشد.

اطلاعات ژنتیکی بدست آمده به محققان این کمک را می کند تا پروفایل جامعی از جهش های منجر به بروز سرطان را در اختیار داشته و امیدواری جهت دستیابی به راهی برای درمان سرطان های مختلف را ارائه دهد. چنین اطلاعاتی بسیار مفید بوده و برای آینده نیز ضروری می باشد.

👇Join us
@BioUT


✅ https://www.genomeweb.com/sequencing/cureone-washington-university-partner-link-ngs-data-treatment-information

لینک ثبت نام در ایوند:
https://evnd.co/R9LHX وبینار: مقدمه ای عملی بر آنالیز داده ریزآرایه (میکرواری) و ترسیم شبکه با استفاده از نرم افزارهای آنلاین - پنج‌شنبه ۳ اسفند ۹۶
@BioEvent

@BioEvent
دومین همایش ملی میکروفلوییدیک

(http://jametan.com/t/c74bfc689988912509.png)

📄 مقاله کاربردی، معرفی داده پایگاه میکروبیوم، ابزار تحت وب

🗞 مجله Scientific Reports 📅 2017
عنوان : MicroPattern: a web-based tool for microbe set enrichment analysis and disease similarity calculation based on a list of microbes
🖥 آدرس مستقیم مقاله: https://www.nature.com/articles/srep40200
خلاصه ترجمه شده:
با توجه به اهمیت میکروبیوم که از آن به عنوان عضو فراموش شده در سلامتی انسان یاد می شود، امروزه مطالعات متعددی در مورد آنالیز میکروبیوم قسمت های مختلف بدن و بیماری های مختلف در حال انجام است. در این مقاله ابزاری تحت وب، برای بررسی میزان شباهت دو بیماری بر مبنای میکروبیوم و تغییرات آن ارائه شده است. همچنین با وارد کردن مجموعه ای از میکروب ها به عنوان ورودی بر اساس داده پایگاه این ابزار، آنالیز Enrichment این مجموعه برای نقاط مختلف بدن و نیز بیماری های مختلف موجود محاسبه می شود، و میزان معنی دار بودن آن نمایش داده می شود. این ابزار از لینک زیر قابل دسترس است:
http://www.cuilab.cn/micropattern

📌 کانال دانشجویان بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی 📌 @BioUT

فایل پی دی اف مقاله
📌 کانال دانشجویان بیوانفورماتیک و بیولوژی محاسباتی 📌 @BioUT

👆👆👆 حضور پرفسور پیر بورک در دانشگاه تهران 8 اسفند ساعت 14:00 طبقه سوم مرکز تحقیقات بیوشیمی-بیوفیزیک سالن آمفی تاتر👆👆👆

@BioEvent حضور پرفسور کاترینا گاوس برنده سی و یکمین جایزه کیا در سالن شورا دانشکده فناوری های نوین پزشکی دانشگاه علوم پزشکی تهران در تاریخ 6 اسفند 96 ساعت 9-11

@BioEvent
سومین کنگره ی بین المللی ژنتیک ایران، 23 تا 25 اردیبهشت 97

📣📣📣 موقعیت تحصیلی دکترا، موسسه ماکس پلانک آلمان

🔷 PhD Positions in Münster (Germany): Imaging Cellular Processes and Disease
🔴 مهلت ارسال رزومه: 13 آوریل
☑️ لینک: https://www.mpg.de/11945813/imprs-engl

@BioEvent

همایش ملی فرآورده های زنبور عسل از منظر زیست شناسی، سلامت و اقتصاد.
5-6 اردیبهشت، دانشگاه اصفهان
@BioEvent

📣📣📣 موقعیت تحصیلی دکترا، کشور بلژیک
🔷 Molecular pathology of pneumonia, Universiteit Antwerpen
🔴 مهلت ارسال رزومه: 25 آوریل
☑️ لینک: https://www.universitypositions.eu/job/4ts8r/doctoral-grant-molecular-pathology-of-pneumonia
@BioEvent