📣 انتشار ارائه دانشجویان کارشناسی‌ارشد بیوانفورماتیک

1⃣ ماتریس BLOUSUM

2⃣ آموزش BLAST

3⃣ آموزش PSI-BLAST

4⃣ الگوریتم PatternHunter

5⃣ الگوریتم MUMmer3.0

6⃣ مروری بر تصاویر تشدید مغناطیسی عملکردی و روش‌های پیش پردازش

7⃣ بررسی پیشرفت‌های اخیر حوزه پیش‌بینی ساختار سوم پروتئین با تمرکز بر AlphaFol

لایو‌های برگزار شده توسط انجمن

1⃣ جلسه اول: معرفی بیوانفورماتیک
با حضور دکتر سید شهریار عرب و خانم رایحه وفایی

2⃣ جلسه دوم: معرفی بیوانفورماتیک
با حضور دکتر سید شهریار عرب و خانم رایحه وفایی

3⃣ جلسه سوم: بیوانفورماتیک ساختاری
با حضور دکتر سید شهریار عرب و آقای احمدرضا رسولی

4⃣ جلسه چهارم: طراحی محاسباتی دارو
با حضور دکتر سجاد قرقانی و آقای احمدرضا رسولی

5⃣ جلسه پنجم: طراحی محاسباتی دارو
با حضور دکتر سجاد قرقانی

🎥معرفی شماره اول دوفصل‌نامه علمی-تخصصی رمزیست

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

اینستاگرام رمزیست
در معرفی نشریه، رمزیست را یاری کنید.

#نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست

@ramzist
@bioinftmu

◼️در بخش پیش‌خوان هر شماره قصد داریم برخی اخبار علوم و فناوری‌های مرتبط با بیوانفورماتیک را با هم مرور کنیم.

بیش‌تر از یک سال است که جهان درگیر ویروس کرونا و بیماری ناشی از آن شده است. با وجود تبعات منفی و فاجعه‌بار همه‌گیری، پیشرفت‌های خیره‌کننده‌ای در فناوری‌های مرتبط با علوم زیستی و صنعت واکسیناسیون رخ داده است. در این شماره، به تاثیر ویروس کرونا روی پیشرفت تکنولوژی و به طور مشخص نسل جدید توالی‌یابی ژنوم پرداخته و از رویکردهای نوین در ساخت واکسن صحبت خواهیم کرد.

🧩اگر علاقمند خبرنگاری علمی هستید، در تیم رمزیست از حضور شما استقبال می‌شود.

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

معرفی فصل‌های #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست

اینستاگرام رمزیست
@ramzist
@bioinftmu

◼️تاریخ روایتی از گذشته است. اما چرا بررسی آن برای ما از اهمیت بالایی برخوردار است؟ در پاسخ به این پرسش باید گفت، از جهتی تاریخ مملو از تجارب گذشتگان است، آزمون و خطاهایی که قدم زدن در این مسیر پر پیچ و خم را ممکن می‌کنند؛ مانند روش کار آزمایشگاهی که اگر مطابق آن عمل نشود، آزمایش نتیجه‌ نامعتبر می‌دهد. از سویی دیگر، خواندن تاریخ به ما یادآور می‌شود که ما نیز زمانی جزئی از آن خواهیم شد و آیندگان داستان ما را روایت خواهند کرد.
روایت تاریخ، تلاشی برای تبدیل دنیا به جایی بهتر برای زیستن، شناخت علم و کمک به درک بیشتر فلسفه حیات است.

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

معرفی فصل‌های #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست

اینستاگرام رمزیست
@ramzist
@bioinftmu

◼️کانون تخصصی
بیوانفورماتیک، طیف وسیعی از مباحث را در بر می‌گیرد، از بررسی حیوانات و گیاهان گرفته تا مطالعات ژنومیک و پرتئومیک. از طرفی پیشرفت روزافزون نگرش‌ها و روش‌ها، زمینه‌های ظهور مباحث نوین در این حوزه را فراهم می‌کند و پیوسته بر گستردگی این علم می‌‌افزاید. بخش کانون ما را با مباحث تخصصی این رشته آشنا و ابزارها، پایگاه‌های داده، مباحث نوین و تازه‌های این حوزه را معرفی می‌کند.
در این شماره، از نقش بیوانفورماتیک در تعیین توالی ژنوم انسان و ابزار OSPREY جهت مهندسی پروتئین و نقش miRNAها در درمان بیماری کووید۱۹ صحبت می‌کنیم و مروری بر علم نوین زیست‌شناسی مصنوعی خواهیم داشت.


🛑||۵۰٪ تخفیف(تا ۲۳ مرداد)||🛑
📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه


معرفی فصل‌های #نشریه_رمزیست #بیوانفورماتیک #رمزیست
#انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس

اینستاگرام رمزیست
@ramzist
@bioinftmu

◼️درباب علم- جستارها و مقالات
وقتی سخن از علم به میان می‌آید، توجه‌ها سمت علومی چون ریاضیات، فیزیک و شیمی جلب می‌شود. اما این تنها یک بعد از علم است. جدای از کاربردهای علم در زندگی روزمره مانند فناوری، پزشکی و کشاورزی، ابعاد دیگری نیز برای علم وجود دارد که مورد توجه همه است. برای مثال مباحث مربوط به فلسفه علم و روش‌های علمی که پای فیلسوفان را به این حوزه باز می‌کند و رابطه اخلاق، جامعه و سیاست با علم که توسط اندیشمندان این حوزه‌ها مطالعه می‌شود. از طرف دیگر نحوه تعامل میان مردم عادی و علم نیز از دیگر مباحث نیازمند توجه است.
در این بخش چنین موضوعاتی مورد مطالعه قرار گرفته است؛ از روایت‌گری علمی و رابطه میان علم و جامعه گرفته تا نقش سیاست در علم و بررسی مثال آشنای همه‌گیری کووید۱۹ و در انتها به موضوع نظریه‌های منسوخ‌شده در تاریخ علم پرداخته می‌شود.

🛑||۵۰٪ تخفیف(تا ۲۳ مرداد)||🛑
📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

معرفی فصل‌های #نشریه_رمزیست #بیوانفورماتیک #رمزیست
#انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس

اینستاگرام رمزیست
@ramzist
@bioinftmu

◼️ ذره‌بین علوم‌ پایه
درخت دانش که بر ریشه‌های ریاضیات استوار است با فیزیک، شیمی و زیست‌شناسی رشد می‌کند، شاخ و برگ می‌گیرد و علوم دیگر محض و کاربردی را می‌سازد. به همین دلیل قبل از ورود به هر رشته‌ای آشنایی با علوم پایه اهمیت دارد. موضوع میان‌رشته‌ای مانند بیوانفورماتیک از این قاعده مستثنی نیست. عمیق شدن در این رشته نیازمند آشنایی با مفاهیم پایه‌ای از ریاضیات، آمار، شیمی، زیست‌شناسی و علوم کامپیوتر است.
با توجه به این نیاز، در بخش ذره‌بین این مفاهیم پایه‌ بررسی می‌شود. در این شماره از کاربردهای مدل‌های احتمالی مارکوف و مارکوف مخفی در زیست‌شناسی و مروری بر شبکه‌های زیستی صحبت خواهد شد.

🛑||۵۰٪ تخفیف(تا ۲۳ مرداد)||🛑
📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

معرفی فصل‌های #نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست

اینستاگرام رمزیست
@ramzist
@bioinftmu

💯 فراخوان عضویت در انجمن سلول های بنیادی و پزشکی بازساختی دانشگاه تربیت مدرس
مستقر در مرکز جامع سلول های بنیادی و پزشکی بازساختی

جهت عضویت و همکاری با آی دی زیر در تلگرام در ارتباط باشید: @scrmtmu

https://www.instagram.com/scrm.modares?r=nametag

📱@tmustemcellnetwork
شبکه سلول‌های بنیادی دانشگاه تربیت مدرس

🎁فرصت استثنایی

🌐هدف ما: بهره مندی از بهترین اساتید بیوانفورماتیک با حداقل هزینه

0⃣ تا 0⃣0⃣1⃣ طراحی دارو

💫دوره جامع ۱۶ ساعته

💥 به همراه مدرک معتبر

🎯با تدریس فوق العاده دکتر قرقانی : هیئت علمی بیوانفورماتیک دانشگاه تهران

📣رمزیست، برترین نشریه دانشجویی علوم پایه

✅نشریه #رمزیست در بخش نشریات علمی تخصصی علوم پایه به مدیرمسئولی خانم مریم رفیعی پور #رتبه_اول جشنواره تیتر ۱۲ را به خود اختصاص داد.

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

#نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست #علوم_پایه #تیتر_۱۲

اینستاگرام رمزیست

@ramzist
@bioinftmu

📣کسب رتبه در بخش مقالات تخصصی علوم انسانی

✅ مقاله 《هر بار سازوکار طبیعت را فهمیدیم تغییرش دادند》، به قلم آقای امیر ضرغامی و خانم سارا فیاض زاده در بخش مقالات تخصصی علوم انسانی #رتبه_سوم جشنواره تیتر ۱۲ را به خود اختصاص داد.

برای خواندن این مقاله در نشریه رمزیست به شماره یکم، فصل 《در باب علم》 مراجعه کنید.

📚 دریافت نسخه الکترونیکی نشریه، از طریق اپلیکیشن طاقچه

#نشریه_رمزیست #انجمن_علمی_دانشجویی_بیوانفورماتیک #بیوانفورماتیک #دانشگاه_تربیت_مدرس #رمزیست #در_باب_علم #تیتر_۱۲

اینستاگرام رمزیست

@ramzist
@bioinftmu

| #ثبتنام 📱|
مجتمع پژوهشی و نوآوری تربیت‌مدرس برگزار می کند:
«ورکشاپ آموزش AutoDock»

زمان:
دوشنبه ۲۶ و سه‌شنبه ۲۷ اردیبهشت‌ماه ۱۴۰۱

🟥ثبت نام از طریق:
modarestc.com/gg2

✅شرکت برای عموم دانشجویان و اساتید، بلامانع است.

پاسخگویی به سوالات از طریق نشانی:
‏📧 MTC@modares.ac.ir
➖➖➖➖➖➖➖➖➖➖
⚪ modarestc.com
🆔 https://news.1rj.ru/str/modarestc
🟣 instagram.com/modarestc
🔵 linkedin.com/in/modarestc

| #ثبتنام 📱|
مجتمع پژوهشی و نوآوری تربیت‌مدرس برگزار می کند:
.
سلسله نشست های «گَپ‌گَعده مدرس»
با موضوع :
«میکروبیوم انسانی؛ از تحقیقات تا کاربردهای بالینی و صنعتی»
زمان:
چهارشنبه ۴ خرداد ۱۴۰۱
ساعت ۱۸:۰۰ الی ۱۶:۰۰
.
🟥ثبت نام از طریق:
‏modarestc.com/gg

✅شرکت برای عموم دانشجویان و اساتید به صورت حضوری و یا آنلاین، رایگان است.
پاسخگویی به سوالات از طریق نشانی:
‏📧 MTC@modares.ac.ir
.
________________
⚪ modarestc.com
🆔 https://news.1rj.ru/str/modarestc
🟣 instagram.com/modarestc
🔵 linkedin.com/in/modarestc

مبحث بیگ دیتا در اوایل قرن بیست و یکم تأثیر شگفت‌انگیز خود را روی تجارت‌‌های مدرن امروزی شروع کرد. با پیشرفت صنعت‌‌ها و تکنولوژی‌‌ها، جای خالی یک سیستم کارآمد که بتواند اطلاعات زیاد را در زمان کم به مرحله پردازش و تحلیل برساند به شدت محسوس بود. به همین خاطر کمپانی‌‌های بزرگ دست به استفاده از راهکارهای جدید زدند و کم‌کم سیستم یکپارچه Big Data به مرحله بهره‌‌برداری رسید.
این مقاله‌ی جذاب به مفهوم بیگ دیتا در حیطه‌ی زیست‌ شناسی، شیمی و آزمایش‌های بالینی پرداخته است.
____

🟠 https://news.1rj.ru/str/bioinftmu
🔴 instagram.com/bioinftmu
🔵 linkedin.com/in/bioinftmu
🟡http://aparat.com/bioinftmu

شبکه‌های عصبی مصنوعی (ANN) یا Artificial Neural Networks، سیستم‌های محاسبه کننده‌ای هستند که از شبکه‌های عصبی زیستی الهام گرفته شده‌اند. در این پرایمر آموزشی ANN ها معرفی شده‌ و نشان داده شده است که چگونه آنها به طور موثر برای مطالعه علوم عصبی به کار گرفته شده‌اند.

____

🟠 https://news.1rj.ru/str/bioinftmu
🔴 instagram.com/bioinftmu
🔵 linkedin.com/in/bioinftmu
🟡http://aparat.com/bioinftmu

یادگیری عمیق از روش‌های یادگیری ماشین و هوش مصنوعی به شمار می‌رود که از روشی که ذهن انسان برای یادگیری موضوعات خاص به کار می‌گیرد، تقلید می‌کند. این نوع یادگیری از عناصر مهم علم داده (Data science) و شامل آمار، مدل‌ سازی و پیش‌ بینی است. یادگیری عمیق برای دانشمندان داده که وظیفه جمع آوری، تجزیه و تحلیل و تفسیر مقادیر زیادی از داده‌ها و اطلاعات را بر عهده دارند، بسیار کارآمد و مفید است و این روندسریع‌تر و آسان‌تر می‌کند. این مقاله Junggu را به عنوان یک کتابخانه پایتون که deep learning را برای برنامه های ژنومیکس تسهیل میکند ارائه می دهد.
____

🟠 https://news.1rj.ru/str/bioinftmu
🔴 instagram.com/bioinftmu
🔵 linkedin.com/in/bioinftmu
🟡http://aparat.com/bioinftmu

در اصل رایانش ابری به این معنا است که سورس یک نرم افزار ، داده‌های آن و همینطور پردازش‌های مربوط به آن را به یک فضای بیرونی منتقل کنیم. کاربران می‌توانند به اپلیکیشن‌ها و داده‌ها با استفاده از ورود به این سیستم با استفاده از هر دستگاهی که به اینترنت متصل است دسترسی داشته باشند. اطلاعات و برنامه‌ها توسط یک فضای خارجی میزبانی می‌شوند و به جای یک هارد دیسک فیزیکی، بر روی یک شبکه جهانی از مراکز داده‌های امن نگهداری می‌شوند. این کار باعث می‌شود تا قدرت پردازش افزایش پیدا کند، امکان اشتراک داده‌ها و همکاری بیشتر با سایر افراد راحت‌تر می‌شود و امکان دسترسی امن به این داده‌ها از طریق تلفن همراه را بدون توجه به موقعیت مکانی کاربر فراهم می‌کند. در این مقاله به کاربردهای محاسبات ابری در زیست پزشکی پرداخته شده است.
____

🟠 https://news.1rj.ru/str/bioinftmu
🔴 instagram.com/bioinftmu
🔵 linkedin.com/in/bioinftmu
🟡http://aparat.com/bioinftmu

عفونت با ویروس کرونا یا کووید-۱۹، برای نخستین بار در اواخر سال ۲۰۱۹ در چین گزارش شد و به سرعت شیوع یافت و موارد ابتلا به آن افزایش یافت. با گذشت مدت زمان بسیار کوتاهی، موارد ابتلا به عفونت با ویروس کرونا در اکثر کشور‌های جهان مشاهده شد و به همین خاطر سازمان بهداشت جهانی در مارس سال ۲۰۲۰ پاندمی (همه گیری) این ویروس را اعلام کرد. در این مقاله یک دیدگاه معقول ارائه شده است که فعل و انفعالات مبتنی بر miRNA بین میزبان و ویروس ممکن است علت اصلی ورود ویروس و حمله به سلول‌های میزبان باشد.
____

🟠 https://news.1rj.ru/str/bioinftmu
🔴 instagram.com/bioinftmu
🔵 linkedin.com/in/bioinftmu
🟡http://aparat.com/bioinftmu