✅Clinical NGS is being used frequently in medical practices in which genetic testing has traditionally taken place — for example, medical genetics and medical subspecialties such as neurogenetics. Emerging diagnostic applications include rapid-reporting approaches in intensive care settings and use early in the course of complex disease.This suggests a future in which genomic data will influence medical decision making for a diverse and growing group of patients.
⤵️ Reference: NEJM


اخیرا روشهای تعیین توالی نسل جدید یا Next Generation Sequencing (NGS) که تا حد زیادی جایگزین روشهای تعیین توالی کلاسیک مانند تعیین توالی سنگر شده، بطور گسترده در کلینیک برای شناسایی علت بیماریهای ژنتیکی بکار گرفته شده است. این ویدیو به بحث در مورد کلیات استفاده از NGS در تشخیص و درمان بیماریهای توارثی می پردازد.


🧬برای مشاهده ویدیو های بیشتر

🆔 @hassan.vahidnezhad

🌐https://www.instagram.com/hasan.vahidnezhad

🔸 با ما همراه باشید در
👇👇👇
@cancereducation

🔴قابل توجه دانشجویان، پژوهشگران و اساتید محترم علاقه مند
✅ آنالیز شبکه هم بیانی ژنی وزن دار WGCNA (۲ و ۳ بهمن)
✅ داکینگ مولکولی (۱۲ و ۱۳ بهمن)
✅ مرور سیستماتیک و متاانالیز (۲۹ و ۳۰ بهمن الی ۱ اسفند)

🏠 امکان معرفی خوابگاه برای شرکت کنندگان شهرستان
🔸 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی
📄 ارائه گواهی معتبر از جهاد دانشگاهی

🔗 مشاوره تلفنی و آنلاین و نحوه ثبت نام
📞۰۲۱۸۸۷۹۵۸۸۵
📱۰۹۰۳۵۸۰۲۲۹۴
Admin👤@cancergeneticsgroup
🌐لینک مستقیم ثبت نام
👇
https://goo.gl/C6EhuZ

🔸لطفا پس از ثبت نام تصویر فیش پرداختی را برای ادمین کانال ارسال نمایید

🔴قابل توجه دانشجویان، پژوهشگران و اساتید محترم علاقه مند

❌❌آخرین فرصت جهت ثبت نام در دوره آنالیز شبکه هم بیانی ژنی وزن دار (WGCNA) (2 و 3 بهمن ماه)❌❌

🏠 امکان معرفی خوابگاه برای شرکت کنندگان شهرستان
🔸 ۱۰ درصد تخفیف دانشجویی
📄 ارائه گواهی معتبر از جهاد دانشگاهی

🔗 مشاوره تلفنی و آنلاین و نحوه ثبت نام
📞۰۲۱۸۸۷۹۵۸۸۵
📱۰۹۰۳۵۸۰۲۲۹۴
👤@cancergeneticsgroup
🌐لینک مستقیم ثبت نام
https://goo.gl/C6EhuZ

✅لطفا پس از ثبت نام تصویر فیش پرداختی را برای ادمین کانال ارسال نمایید

چهارمین کنگره بین_المللی و شانزدهمین کنگره ملی ژنتیک GC2020🇮🇷🇮🇹

📣فراخوان اولین جشنواره تجاری سازی ایده‌ها، محصولات و خدمات حوزه ژنتیک

🖊از کلیه پارک های علمی و فناوری، مراکز رشد، شرکت های دانش بنیان، استارتاپ و شتاب دهنده های حوزه بیولوژی، ژنتیک و زیست فناوری علاقمند به حضور و مشارکت در این جشنواره بزرگ دعوت می نماییم.
👈🏻دریافت فرم تقاضای غرفه

🔶دیگر بخش های کنگره ژنتیک؛

☑️سمینار وسخنرانی علمی
(👈🏻 مهلت ارسال مقالات و ثبت نام)
☑️ نمایشگاه‌ها
☑️ کارگاه‌ها
☑️جشنواره دانش‌آموزی در حوزه ژنتیک

📌برای کسب اطلاعات بیشتر
🌐 www.geneticscongress.com

📌برای دسترسی سریع‌تر به بخش‌ها ی مختلف می‌توانید از لینک های زیر استفاده کنید.

💡جشنواره تجاری‌سازی ایده‌ها و دریافت فرم:
🌐https://bit.ly/2NFvF9G

⌛️آخرین مهلت ارسال مقالات:
🌐https://bit.ly/2RAka4o

🧪🔬کارگاه‌ها:
🌐https://bit.ly/379Lm0A

🏢 اقامت‌:
🌐https://bit.ly/38mqIuh

International Conference on Integrative Medicine
🗓6-8 March 2020
📍Malaysia

🔸Join us
@cancereducation

معرفی:
اپلیکیشن جالبی برای تقویت زبان انگلیسی. پر کاربردترین لغات از فیلمها و اخبار و ... انتخاب شده و با مثالهایی‌ از متن موزیک، شعر، فیلم و ... آموزش انجام میشه.

https://i.wrdp.app/65B21M


@cancereducation

💢مکانیسم هیپومتیلاسیون DNA، القا شده توسط داروی CC-486 در بیماران مبتلا به AML
براساس نتایج یک کارازمایی بالینی، یک داروی تحقیقاتی با نام CC-486 قادر خواهد بود تا بقای بزرگسالان مبتلا به لوسمی حاد میلوئیدی (AML) را افزایش دهد. در این مطالعه، CC-486 به عنوان یک روش درمانی نگهدارنده برای بزرگسالان مبتلا به AML که پس از دریافت شیمی درمانی علائم بيماريشان فروكش كرده مورد آزمایش قرار گرفت. بسیاری از بزرگسالان مبتلا به AML بعد از درمان اولیه به سمت بهبودی پیش می‌روند. با این حال در اکثر موارد حتی اگر شیمی درمانی پس از درمان اولیه تداوم پیدا کند علائم سرطان برمی‌گردد. درمان AML بازگشتی پس از درمان اولیه دشوارتر است و منجر به مرگ اکثر بیماران طی چند ماه میشود. داروی CC-486 اولین روش درمانی نگهدارنده است که می‌تواند مدت زمان بهبودی بیماران AML بهبود یافته پس از درمان اولیه را افزایش دهد. براساس نتایج مثبت این کارآزمایی بالینی قابل توجه، امید است که درمان با CC-486 یک استاندارد درمانی بالقوه جدید باشد.
هنگامی که CC-486 وارد DNA سلول‌های سرطانی می‌شود، مانع از متیله شدن DNA با گروه‌های متیل می‌شود که این مکانیسم ممکن است منجر به فعال‌سازی مجدد ژن‌های خاص و در نتیجه از بین بردن سلول های سرطانی شود.
🔸 با ما همراه باشید در
👇
@cancereducation
🔹لینک خبر جهت مطالعه بیشتر
https://www.cancer.gov/news-events/cancer-currents-blog/2020/cc-486-aml-improves-survival-maintenance-therapy

پژوهشگران و اساتید محترم
با سلام و احترام
از شما تقاضا می شود با همکاری در تکمیل پرسشنامه با عنوان
"تحلیل و تفسیر داده های حجیم Big Data در علوم زیستی"
ما را در جهت تحقق اهداف این مطالعه یاری فرمایید.
👇👇👇

پرسشنامه "تحلیل و تفسیر داده های حجیم Big Data در علوم زیستی"

💢مولکول Circular RNA و نقش بیومارکری آن در سرطان پستان

مولکول های RNA حلقوی تحت عنوان Circular RNAs، از جمله RNA های درون زاد رقابت کننده با توانایی تنظیم بیان ژن هستند.
این مولکول ها از دسته اسفنج های microRNA هستند که با اتصال به microRNA هدف، از اتصال آن ها به مولکول های هدف اصلی خود جلوگیری میکنند.
در مطالعه مروری سیستماتیک که اخیرا توسط دپارتمان ژنتیک پژوهشکده معتمد در ژورنال
"Journal of cellular physiology"
به چاپ رسیده است، بیوژنز circRNAs و نیز نقش بالقوه این مولکول ها به عنوان بیومارکر در سرطان پستان مورد بررسی قرار گرفته است.
اختلال در تنظیم بیان ژن circRNAs نقش مهمی در شروع و پیشرفت سلول های سرطانی دارد.
در این مطالعه ارتباط بین circRNAs و رشد، متاستاز، آپاپتوز و نیز حساسیت و مقاومت به شیمی درمانی در سرطان پستان مورد بررسی قرار گرفته است.

🔹فایل مقاله جهت مطالعه علاقه مندان به پیوست می باشد
🔸با ما همراه باشید در
👇👇👇
@cancereducation

💢میکروبیوم و سرطان پستان: نقشی جدید برای جمعیتی باستانی

در مطالعه مروری که اخیرا توسط گروه ژنتیک پژوهشکده معتمد در ژورنال
"frontiers in oncology"
به چاپ رسیده است، مطالعات و تحقیقات جدید در خصوص ارتباط معنادار بین میکروبیوم و ریسک ابتلا به سرطان پستان به عنوان یک فاکتور جدید مورد بررسی قرار گرفته است. هدف از این بررسی، ارزیابی نقش میکروبیوم به عنوان یک عامل خطر در بروز سرطان پستان، بررسی مکانیسم های پیشنهادی تعامل بین میکروبیوم و ژن های انسانی درگیر در سرطان پستان و تاثیر تغییر ترکیب میکروبیوم پستان و شیر در فیزیولوژی پستان طبیعی، سرطانی و پستان دارای توده خوش خیم عنوان شده است. بعلاوه این مطالعه حاکی از آن است که تغییر در این جمعیت میکروبی ممکن است در مقاومت به شیمی درمانی موثر باشد. مطالعات نشان داده اند میکروبیوم در توسعه التهاب، متابولیسم استروژن و تغییرات اپی ژنتیکی اثر دارد. در آخر، این مقاله به ارزیابی برنامه های درمانی شامل استفاده از پروبیوتیک ها و تغییرات ژنوم و آنزیم های مهندسی شده میکروبیوم برای کنترل سرطان پستان پرداخته است.

🔸 با ما همراه باشید در
👇👇👇
@cancereducation
🔹لینک خبر جهت مطالعه بیشتر
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fonc.2020.00120/full
[05/03, 07:56].

💢شناسایی واریانتهای ژنی جدید در بیماران مبتلا به استئوسارکوما

مطالعه محققان مؤسسه ملی سرطان (NCI)، دیدگاه جدیدی را در مورد تغییرات ژنتیکی مرتبط با استئوسارکوما، شایع ترین تومور سرطانی استخوانی در کودکان و نوجوانان، ارائه می دهد.
در این مطالعه  با استفاده از Whole-exome sequencing  یا توالی یابی هدفمند، واریانتهای 238 ژن مستعد کننده‌ی سرطان در نمونه های DNA افراد مبتلا به استئوسارکوما و گروه کنترل بررسی گردید. مجموعه‌ی مورد مطالعه در این پژوهش از 10 مرکز تحقیقاتی بین المللی جمع آوری شده بود، که تا به امروز بزرگترین مجموعه جمع آوری شده جهت ارزیابی ژنهای مستعد کننده سرطان در pediatric solid cancer می‌باشد. نتایج تحقیق نشان داد، 28 درصد از افراد مبتلا به استئوسارکوما دارای حداقل یک واریانت پاتوژن/ احتمالا پاتوژن می باشند. در مقابل  تنها 12 درصد افراد غیرسرطانی، ناقل واریانتهای این چنینی می باشند. Lisa Mirabelo و همکارانش ابراز داشتند، علاوه بر شناسایی وجود حداقل یک واریانت ژنی شناخته شده برای سرطان در افراد مبتلا به استئوسارکوما، واریانت ژنهای دیگری را که قبلا با این نوع سرطان درارتباط نبودند را نیز شناسایی نمودیم. این تحقیق نشان داد که واریانت ژن‌های CDKN2A,MEN1,VHL,POT1,APC,MSH2,ATRX علاوه بر TP53 به صورت ژرمینال در بیماری استئوسارکوما به توارث می‌رسد. محققین این پژوهش معتقدند در صورت حضور یک نوع واریانت ژنی مرتبط با استئوسارکوما در یک کودک، انجام تستهای ژنتیکی و مشاوره ژنتیکی ممکن است برای اعضای خانواده او ضروری باشد، زیرا ممکن است آنها نیز ناقل این نوع واریانت ژنی باشند که در صورت، این امر منجر به تشخیص زودهنگام می‌گردد.
نتایج این پژوهش در ژورنال JAMA Oncology در 19 مارس 2020 به چاپ رسیده است.
🔸با ما همراه باشید در
👇👇👇
@cancereducation
🔹لینک خبر جهت مطالعه بیشتر
JAMA Oncol. 2020;6(5):724-734. doi:10.1001/jamaoncol.2020.0197
https://jamanetwork.com/journals/jamaoncology/article-abstract/2762589?resultClick=1

💢مسیر تحریک آزادسازی اگزوزوم در سلول‌های سرطانی

محققان دریافته‌اند که پروتئین Munc13-4 به سلول‌های سرطانی کمک می‌کند تا تعداد زیادی اگزوزوم ترشح کنند. اگزوزوم‌ها می‌توانند در تحریک پیشرفت تومور نقش ایفا کنند. این مطالعه بیانگر روشی نوین در پیشگیری از سرطان با متوقف کردن تولید اگزوزوم است که در این راستا می‌توان از رشد تومور و متاستاز جلوگیری کرد. سلول‌های سرطانی تعداد زیادی اگزوزوم تولید می‌کنند، که به طریق مختلف در پیشرفت تومور نقش دارند. اگزوزوم‌ها می‌توانند انكوژن‌های تحریک کننده ایجاد سرطان را به سلول‌های همسایه منتقل كنند تا تکثیر سلولی در آن‌ها افزایش یابد. اگزوزوم‌ها حاوی پروتئین‌هایی هستند که در سازماندهی محیط سلول‌های سرطانی و گسترش آن در بافت‌های دیگر نقش دارد. بعلاوه اگزوزوم‌ها ممکن است حاوی فاکتورهایی باشند که اختلال پاسخ ایمنی بدن در مقابل تومور را منجر شود.
در این مطالعه دریافتند که کلسیم، که غالباً میزان آن در سلول‌های سرطانی افزایش می‌یابد، ترشح اگزوزوم‌ها را توسط سلول‌های تهاجمی سرطان پستان تحریک می‌کند. رها سازی اگزوزوم به پروتیین متصل شونده به کلسیم با نام Munc13-4 بستگی دارد. حذف این پروتئین یا جایگزین کردن آن با یک نسخه جهش یافته با عدم توانایی اتصال به کلسیم، از انتشار اگزوزوم توسط سلول‌های سرطانی پستان در پاسخ به کلسیم جلوگیری می‌کند. سطح بیان پروتیین Munc13-4 اغلب در تومورهای پستان، پانکراس و ریه انسانی بالا می‌رود. محققان در این مطالعه دریافتند كه سلول‌های سرطانی در سرطان ریه و پانکراس سطح Munc13-4 خود را افزایش داده و با تهاجمی‌تر شدن سلول‌ها اگزوزوم‌های بیشتری را آزاد می‌كنند. 
اگزوزوم‌هایی که از سلول‌های سرطانی آزاد می شوند، آنزیمی به نام MT1-MMP دارند که ماتریکس خارج سلولی اطراف سلول‌های سرطانی را تخریب می‌کند. این امر به تشکیل تومورهای متاستاتیک ثانویه کمک می‌کند. در نتیجه افزایش بیان Munc13-4، همراه با افزایش سطح کلسیم، باعث آزاد سازی اگزوزوم بیشتر توسط سلول‌های سرطانی بسیار تهاجمی می‌شود، بنابراین Munc13-4 یک هدف بالقوه برای مداخله درمانی است.
🔸با ما همراه باشید در
👇👇👇
@cancereducation
🔹لینک خبر جهت مطالعه بیشتر
http://jcb.rupress.org/cgi/doi/10.1083/jcb.201710132?PR

💢راز مقاومت در برابر داروی تاموکسیفن

توانایی درک بهتر رفتار داروها در سلولهای سرطانی از جمله نحوه تمرکز دارو در محل تومور و دلیل مقاومت در برابر دارو ممکن است یک ابزار جدید برای تولید داروهای کارامد تر در اختیار داروسازان قرار دهد.
تحقیقات نشان داده است که ارگانل های سلولی بدون غشا به نام Condensate در کنار هم قرار گرفته اند. این ارگانل ها، قطرات ریزی هستند که پروتئینهای خاصی را در خود حمل می کنند و عملکردهای پیچیده ای در داخل آنها انجام می شود. یکی از نقش های پیشنهادی برای آنها ایجاد مقاومت در برابر درمان است.
تاموکسیفن با اتصال خود به گیرنده های استروژن در سطح سلول های سرطانی با هورمون استروژن رقابت می کند. با این مکانیسم رشد سلول های سرطانی متوقف می شود. این دارو یکی از مؤثرترین روش های درمانی بیماران سرطان پستان است، که میزان عود سرطان های پستان ER مثبت را حدود 50 درصد کاهش می دهد.
متأسفانه، بسیاری از بیماران به سرعت و در مدت چند ماه در برابر تاموکسیفن مقاومت پیدا میکنند. مکانیسم های مقاومت انواع متفاوتی دارند. به عنوان مثال، بعضی اوقات سلولهای سرطانی جهش یافته می شوند تا بتوانند تاموکسیفن را از سلول خارج کنند، یا به سادگی گیرنده های استروژن کمتری تولید کنند تا این دارو متصل نشود. یک شکل از مقاومت با تولید بیش از حد پروتئین MED1 همراه است.
مطالعات اخیر نشان می دهند که فعالیت یک دارو تحت تاثیر محل متمرکز شدن آن قرار دارد. با توجه به این موضوع دانشمندان فرضیه ای را مطرح کردند: ممکن است افزایش بیان پروتئین MED1 باعث افزایش اندازه ی سایز این وزیکول هاشود.
این افزایش به طور موثر غلظت تاموکسیفن را در محل سلولهای توموری کاهش داده و اتصال آن به گیرنده هایش را دشوار می کند.
🔸 با ما همراه باشید در
👇👇👇
@cancereducation
🔹لینک مقاله جهت مطالعه بیشتر
https://science.sciencemag.org/content/368/6497/1386?rss=1/blog

💢 یک مرکز تحقیقاتی در تهران اقدام به جذب نیروی امریه (خدمت سربازی) با مدرک کارشناسی ارشد و یا دکتری در رشته های علوم زیستی، بیوانفورماتیک و سایر رشته های مرتبط جهت فعالیت در حوزه تحقیقات پزشکی سرطان نموده است.

🔸از واجدین شرایط دعوت به عمل می آید تا رزومه خود را به آدرس ایمیل ذیل با قید "امریه" در عنوان ایمیل، ارسال نمایند.
تاریخ انتشار درخواست ۹۹/۱۱/۰۶

📧 cancergeneticsgroup@gmail.com

💢مطالعات هم بیانی ژن ها تراوش سلول های ایمنی به بافت سرطانی را به عنوان فاکتور پیش آگهی خوب در لیومیوسارکوم مشخص کرد.
در مطالعه ای که که با رویکرد زیست شناسی سامانه­ ای در گروه ژنتیک سرطان پژوهشکده سرطان معتمد انجام شد ژن­ های موثر در پیش­ آگهی لیومیوسارکوم غیر رحمی (NULMS) مورد بررسی قرار گرفت.
در این پژوهش بر اساس شبکه­ ی وزن­ دارِ ژنی هم­ بیان و ارتباط آن با بقا بیماران مشخص شد که نفوذ سلول های ایمنی به بافت سرطانی در این بیماران باعث بقا بهتر بیماران می شود. همچنین پیشنهاد شد که این سرطان ممکن است به عنوان نامزد ایمنی درمانی باشد.
ژن­ های ICAM3 و NCR3 و KLRB1 و IL18RAP و CECR1 به عنوان ژن­ های با تاثیر مثبت بر پیش­ آگهی این زیرگروه از سرطان سارکوما و در ارتباط با سلول­ های ایمنی شناسایی شد.
 همچنین در این مطالعه که مبتنی بر داده­ های اطلس ژنوم سرطان (TCGA) انجام شد مشخص شد ژن­ های PYCR1 و SRM و MDFI بر پیش آگهی این دسته از مبتلایان به سرطان تاثیر منفی دارد. این ژن­ ها با فرایند­های زیستی همچون رگ­زائی، چسبندگی سلول-سلول، گلیکوزیلاسیون پروتئین، و انتقال پروتئین مرتبط هستند که می تواند نامزد مطالعات آینده جهت یافتن داروهای هدفمند باشد.
حاصل این پژوهش در مجله scientific reports به چاپ رسیده در دسترس است. 
🔸با ما همراه باشید در
👇👇👇
@cancereducation

🔹لینک مقاله جهت مطالعه بیشتر
https://www.nature.com/articles/s41598-021-81952-8.epdf?sharing_token=77Nc9roG5BzPDkgUk2bDKNRgN0jAjWel9jnR3ZoTv0MIyJXmWpVyqSRXuHQzcwUETvD_FLRF7FQDPzZ7f3i-M0lu0PBj7hvZ8w2hGuF-6Q0cF-JGnImkRqysXk895b9EYB6wuhdG9UM1TENzkpEXF7Jnazm-1OiW6VjcMrVxNP4%3D

💢شناسایی واریانتهای ژنی جدید در بیماران مبتلا به استئوسارکوما

مطالعه محققان مؤسسه ملی سرطان (NCI) در یک مطالعه چند مرکزی، دیدگاه جدیدی را در مورد تغییرات ژنتیکی مرتبط با استئوسارکوما، شایع ترین تومور سرطانی استخوانی در کودکان و نوجوانان، ارائه می دهد. در این مطالعه  با استفاده از Whole-exome sequencing  یا توالی یابی هدفمند،  واریانتهای 238 ژن مستعد کننده‌ی سرطان در نمونه های DNA افراد مبتلا به استئوسارکوما و گروه کنترل بررسی شد. نتایج تحقیق نشان داد، 28 درصد از افراد مبتلا به استئوسارکوما دارای حداقل یک واریانت پاتوژن/ احتمالا پاتوژن می باشند. در مقابل  تنها 12 درصد افراد غیرسرطانی، ناقل واریانتهای این چنینی می باشند. این تحقیق نشان داد که واریانت ژن‌های CDKN2A,MEN1,VHL,POT1,APC,MSH2,ATRX علاوه بر TP53 به صورت جرم لاین در بیماری استئوسارکوما به توارث می‌رسد. محققین این پژوهش معتقدند در صورت حضور یک نوع واریانت ژنی مرتبط با استئوسارکوما در یک کودک، انجام تستهای ژنتیکی و مشاوره ژنتیکی برای اعضای خانواده او ضروری است، زیرا ممکن است آنها نیز ناقل این نوع واریانت ژنی باشند که منجر به تشخیص زودهنگام شود.
نتایج این پژوهش در ژورنال JAMA Oncology در 19 مارس 2020 به چاپ رسیده است.
🔸با ما همراه باشید در
👇👇👇
@cancereducation
🔹 لینک مقاله جهت مطالعه بیشتر
JAMA Oncol. 2020;6(5):724-734. doi:10.1001/jamaoncol.2020.0197
https://jamanetwork.com/journals/jamaoncology/article-abstract/2762589?resultClick=1