CytoTech™ – Telegram
CytoTech
430 subscribers
24 photos
9 videos
4 files
41 links
آموزش و نوآوری در بیوانفورماتیک | CytoTech

🌐 ارتقای دانش پژوهشی با ابزارهای هوش مصنوعی

📚 آموزش روش‌های سریع‌ و کم‌هزینه‌ برای تحقیقات علمی

📩 ارتباط: @Meamin

📊 گوگل اسکالر:
https://scholar.google.com/citations?user=gqmu3AkAAAAJ&hl=en
Download Telegram
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
💡 مقایسه ابزارهای هوش مصنوعی در دنیای خلاقیت
🔥 OpenAI Sora در برابر Runway و Kling AI!

📹 ویدیو رو ببینید و نظر بدید:
کدوم ابزار هوش مصنوعی رو برای کارهای خلاقانه انتخاب می‌کنید؟ 😎

ویژگی‌های هر ابزار:
🔹 OpenAI Sora:
ساخت ویدیو از متن، خلق داستان‌های مصور و ریمیکس حرفه‌ای برای پروژه‌های خلاقانه.

🔹 Runway:
ابزاری چندکاره برای ویرایش و توسعه ویدیو و انجام انواع کارهای خلاقانه.

🔹 Kling AI:
مناسب برای مد و برندسازی، با قابلیت امتحان مجازی لباس و تولید محتوای ویدیویی.

📝 نظر شما چیه؟ کدوم ابزار رو بهترین می‌دونید؟

📮 نظراتتون رو با ما به اشتراک بگذارید!

برای اونیکه بهش نیاز داره بفرست 👀


#هوش_مصنوعی
#آموزش #ویدئو

CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
👍2
🔬 شروع یادگیری بیوانفورماتیک: قدم اول 🌱

برای ورود به دنیای هیجان‌انگیز بیوانفورماتیک، ابتدا باید زیست‌شناسی مولکولی را درک کنید. مهم‌ترین مفاهیمی که باید یاد بگیرید:

1️⃣ درک DNA و RNA
مولکول DNA مخزن اطلاعات ژنتیکی است و RNA واسطه‌ای برای ساخت پروتئین‌ها. نقش mRNA، tRNA و rRNA را بشناسید.

2️⃣ سنتز پروتئین
🔻رونویسی: تبدیل DNA به mRNA.
🔻ترجمه: ساخت پروتئین‌ها از روی mRNA.

3️⃣ ساختار پروتئین
از توالی ساده آمینواسیدها (ساختار اولیه) تا شکل سه‌بعدی پیچیده (ساختار سوم و چهارم) را درک کنید.

4️⃣ ژنوم و ژنومیک
مفهوم ژن، جهش و نحوه مطالعه ژنوم موجودات زنده را یاد بگیرید.

5️⃣ فناوری‌های زیستی
با ابزارهایی مثل PCR، NGS و الکتروفورز ژل آشنا شوید.

🎯 از کجا شروع کنم؟

کتاب "Essential Cell Biology"

دوره‌های آنلاین رایگان در Coursera یا Khan Academy

💡 قدم به قدم پیش بروید و آماده ورود به دنیای داده‌های زیستی شوید!


#بیوانفورماتیک #آموزش_زیست_مولکولی #یادگیری

CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
3
🧬 کاربرد DNA و RNA در بیوانفورماتیک

در واقع DNA و RNA قلب تپنده بیوانفورماتیک هستند؛ این مولکول‌های شگفت‌انگیز کلید کشف اسرار زیستی‌اند. اما چطور؟

🔴 مطالعه ژنوم (Genomics):

🔸شناسایی ژن‌ها و عملکرد آن‌ها.

🔸بررسی جهش‌ها و ارتباط آن‌ها با بیماری‌ها.

🔸تحلیل تنوع ژنتیکی برای فهم تکامل.

🔴 تحلیل رونویسی و بیان ژن (Trannoscriptomics):

🔸بررسی RNA برای شناسایی ژن‌های فعال.

🔸کشف الگوهای غیرعادی بیان ژن در بیماری‌ها مثل سرطان.

🔴 پیش‌بینی ساختار و عملکرد پروتئین:
مولکول RNA پیام‌رسان (mRNA) اطلاعاتی برای ساخت پروتئین‌ها فراهم می‌کند که به پیش‌بینی ساختار پروتئین‌ها کمک می‌کند.

🔴 طراحی دارو و درمان‌های هدفمند:
بیوانفورماتیک با شناسایی بیومارکرها و طراحی داروهای مبتنی بر RNA، در خط مقدم توسعه درمان‌های نوین قرار دارد.

🔴 مهندسی ژنتیک و زیست‌فناوری:
با ابزارهایی مثل CRISPR می‌توان ژن‌ها را ویرایش کرد یا محصولات کشاورزی مقاوم به خشکی تولید کرد.

🟪 مولکول های DNA و RNA، پلی به آینده زیست‌شناسی مدرن هستند. آن‌ها را درک کنید تا جهان زیستی را متحول کنید!


#بیوانفورماتیک #ژنتیک


CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
👍3
🔔 چگونه DNA و RNA را در بیوانفورماتیک تحلیل کنیم؟

برای درک DNA و RNA با بیوانفورماتیک این گام‌ها را بردارید:

🔹 ابزارها و پایگاه‌های داده:

از ابزارهایی مثل BLAST برای جستجوی توالی‌ها و از پایگاه‌های داده مثل NCBI برای مطالعه ژنوم استفاده کنید.

🔹 برنامه‌نویسی:

زبان‌هایی مثل Python و R را یاد بگیرید و از کتابخانه‌هایی مثل Biopython برای تحلیل توالی‌ها استفاده کنید.

🔹 تحلیل داده‌های توالی‌یابی:

داده‌های NGS را با ابزارهایی مثل HISAT2 یا STAR هم‌تراز کنید و آماده تحلیل شوید.

🔹 پیش‌بینی ساختار:

از ابزارهایی مثل RNAfold برای پیش‌بینی ساختار RNA و از AlphaFold برای پیش‌بینی ساختار پروتئین استفاده کنید.

🔹 مطالعه شبکه‌های تنظیمی:

از داده‌های بیان ژن برای ساخت و تحلیل شبکه‌های زیستی با ابزارهایی مثل Cytoscape بهره ببرید.

🔅
کلید موفقیت: زیست‌شناسی، ابزارهای بیوانفورماتیک و برنامه‌نویسی را ترکیب کنید تا مفاهیم پیچیده DNA و RNA را کشف کنید



#بیوانفورماتیک #ژنتیک #برنامه_نویسی


CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
👏3
🌍 بهترین ابزارهای هوش مصنوعی برای ترجمه

DeepL Translate (https://www.deepl.com/en/translator) 👈🏻

🔹 ویژگی‌ها:
ترجمه‌ای روان، طبیعی و بسیار دقیق.
امکان انتخاب سبک ترجمه (رسمی یا غیررسمی)
پشتیبانی از چندین زبان پرکاربرد، مانند انگلیسی، آلمانی، فرانسوی و فارسی

🔹 کاربردها:
ترجمه متون تخصصی مانند مقالات علمی و حقوقی
حفظ لحن و ساختار متون پیچیده

Microsoft Translator (https://translator.microsoft.com/) 👈🏻

🔺 ویژگی‌ها:
پشتیبانی از بیش از 100 زبان زنده دنیا
قابلیت ترجمه مکالمات گروهی و متون در لحظه
ادغام با برنامه‌های Microsoft Office مانند Word و Outlook
ترجمه اسناد، تصاویر و حتی مکالمات صوتی

🔺 کاربردها:
ایده‌آل برای کسب‌وکارهای بین‌المللی و جلسات چند زبانه
ترجمه سریع و قابل‌اعتماد برای سفرها و کارهای روزمره


💡 کدام ابزار برای شما مناسب است؟
اگر دنبال ترجمه‌ای دقیق برای متون تخصصی هستید: DeepL Translator
اگر به ابزار چندمنظوره و کامل نیاز دارید: Microsoft Translator


#هوش_مصنوعی #ترجمه #مقاله


CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
👍4
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
💥 خبر خوب برای برنامه‌نویس‌ها: GitHub Copilot رایگان شد!

🎉 از این به بعد می‌توانید GitHub Copilot را در VS Code به‌صورت کاملاً رایگان استفاده کنید!
دیگه نیازی نیست کد بزنید و فکر کنید، چون این دستیار هوشمند با قدرت ChatGPT و Claude در IDE شما حاضر و آماده است.

🔧 ویژگی‌های جذاب:

🔸 تکمیل خودکار کدها (حتی برای توابع پیچیده).
🔸پیشنهاد کدهای بهینه و رفع اشکال سریع.
🔸افزایش سرعت توسعه و صرفه‌جویی در زمان.

💡 نسخه پولی‌اش عالی بود، رایگانش دیگه معرکه‌ست!
همین حالا امتحان کنید و کدنویسی را به سطحی جدید ببرید. 🚀

فوروارد کن تا دیگران هم بهره ببرند ❤️


#هوش_مصنوعی #برنامه_نویسی #مایکروسافت


CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
2
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🎥 آشنایی با SciSpace: ابزار شگفت‌انگیز هوش مصنوعی برای مقاله‌نویسی!

😍تا حالا فکر کردید نوشتن مقاله چقدر می‌تونه راحت‌تر بشه؟

🚨 ابزار SciSpace یه دستیار قدرتمنده که با کمک هوش مصنوعی، فرآیند نگارش، ویراستاری و حتی بررسی مقالات رو متحول می‌کنه.

چرا SciSpace؟

🔻ایده‌ها و جملات رو دقیق‌تر و حرفه‌ای‌تر بیان کنید.

🔻خطاهای گرامری، املایی و ساختاری رو شناسایی و اصلاح کنید.

🔻منابع علمی رو سریع‌تر پیدا و در متن ادغام کنید.

🌟این ابزار برای محقق‌ها، دانشجوها و همه‌ی افرادی که با نوشتن علمی سروکار دارن، یه پیشنهاد طلاییه!

📽️ ویدئوی کامل رو ببینید و با دوستانتون به اشتراک بذارید

🔗 برای محتواهای علمی بیشتر، همراه ما باشید


#هوش_مصنوعی #نگارش_علمی
#مقاله‌نویسی


CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
🔥3
🌐 مرحله دوم: آشنایی با ابزارهای بیوانفورماتیک 🧬

حالا که پایه‌های زیست‌شناسی مولکولی رو یاد گرفتید، وقتشه وارد دنیای ابزارهای دیجیتالی بشید که دانش بیوانفورماتیک رو متحول کرده! 🚀

تو این مرحله یاد می‌گیریم چطور از داده‌های زیستی، دانش ارزشمند بسازیم.

1️⃣ بانک‌های اطلاعاتی زیستی (Databases)
مهم‌ترین ابزارهای شما برای تحلیل داده‌های زیستی:
🔺 NCBI: برای جستجوی ژن‌ها، توالی‌ها و مقالات علمی.
🔺 ENSEMBL: یه پایگاه قوی برای بررسی ژنوم موجودات.
🔺 UniProt: همه چیز درباره پروتئین‌ها!

2️⃣ تراز کردن توالی‌ها (Sequence Alignment)
با ابزارهایی مثل BLAST و Clustal Omega یاد می‌گیرید توالی‌های DNA، RNA یا پروتئین‌ها رو مقایسه کنید. مثلاً کشف کنید دو گونه چقدر شباهت ژنتیکی دارن!

3️⃣ طراحی پرایمر (Primer Design)
ابزارهایی مثل Primer3 و OligoAnalyzer به شما کمک می‌کنن برای آزمایش‌های PCR پرایمرهای دقیق طراحی کنید.

4️⃣ شبیه‌سازی ساختار پروتئین
بررسی ساختار سه‌بعدی پروتئین‌ها با نرم‌افزارهایی مثل PyMOL و SwissModel خیلی جذابه.

5️⃣ تحلیل داده‌های NGS (Next-Generation Sequencing)
ابزارهایی مثل Galaxy و Bowtie برای تحلیل داده‌های حجیم ژنومی ضروری هستن. می‌تونید الگوهای جهش، بیان ژن و ... رو شناسایی کنید.

🔑 تمرین:
ابتدا کار با NCBI و BLAST رو شروع کنید. مثلاً توالی یه ژن رو پیدا کنید و مشابه‌هاشو در موجودات دیگه بررسی کنید. همین کار ساده، اولین گام برای ورود به پروژه‌های هیجان‌انگیزه!


📮 سوال دارید؟ یا تجربه‌ای دارید که بخواید به اشتراک بذارید؟ تو کامنت‌ها منتظرتونم!

مرحله سوم، ورود به برنامه‌نویسی و تحلیل پیشرفته رو از دست ندید! 😉


#بیوانفورماتیک #زیست #یادگیری


CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
👍2
🌐 بانک‌های اطلاعاتی زیستی (Databases): ستون فقرات بیوانفورماتیک


در دنیای بیوانفورماتیک، بانک‌های اطلاعاتی زیستی مهم‌ترین منابع برای دستیابی به اطلاعات ژن‌ها، پروتئین‌ها و دیگر داده‌های زیستی هستند. این منابع به شما کمک می‌کنند تا از داده‌های خام به دانش برسید.

بیایید چند نمونه کاربردی را بررسی کنیم:

🔸 NCBI (National Center for Biotechnology Information)
این بانک جامع شامل ابزارهایی برای جستجو، تحلیل و بازیابی اطلاعات زیستی است. ابزار محبوب BLAST در این پایگاه شما را در مقایسه و تراز کردن توالی‌های ژنتیکی راهنمایی می‌کند.

🔗 لینک: https://www.ncbi.nlm.nih.gov

🔸 ENSEMBL
برای بررسی و مقایسه ژنوم موجودات مختلف، ENSEMBL یک منبع بی‌نظیر است. با استفاده از این پایگاه می‌توانید توالی ژن‌ها، نقاط جهش، و اطلاعات ساختاری ژنوم‌ها را پیدا کنید.

🔗 لینک: https://www.ensembl.org

🔸 UniProt (Universal Protein Resource)
اگر می‌خواهید در مورد ساختار، عملکرد و تعاملات پروتئین‌ها اطلاعات کسب کنید، UniProt انتخاب شماست. این پایگاه جزئیاتی دقیق درباره پروتئین‌ها فراهم می‌کند.

🔗 لینک: https://www.uniprot.org

🔸 PDB (Protein Data Bank)
برای مشاهده و بررسی ساختار سه‌بعدی پروتئین‌ها، PDB منبعی اساسی است. این پایگاه امکان مشاهده مدل‌های اتمی پروتئین‌ها و مولکول‌های بزرگ را فراهم می‌کند.

🔗 لینک: https://www.rcsb.org

🔸 KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)
این منبع به شما در مطالعه مسیرهای زیستی (Pathways)، عملکرد ژن‌ها، و ارتباطات مولکولی کمک می‌کند.

🔗 لینک: https://www.genome.jp/kegg

🌟 چرا مهمه؟
بانک‌های اطلاعاتی زیستی به شما امکان می‌دهند:

🔺داده‌های ژنتیکی، پروتئینی و متابولیکی را تحلیل کنید.
🔺جهش‌ها، تنوع ژنتیکی و بیان ژن‌ها را بررسی کنید.
🔺نتایج آزمایشگاهی خود را با داده‌های جهانی مقایسه کنید.


📌 نکته: ابتدا کار با NCBI و BLAST را یاد بگیرید و کم‌کم به منابع پیشرفته‌تر مثل ENSEMBL و KEGG سر بزنید. تمرین منظم شما را در استفاده از این بانک‌ها حرفه‌ای می‌کند! 🚀



#بیوانفورماتیک #زیست #یادگیری


CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
👍4
🔥 آیا تا به حال خواسته‌اید ارائه‌ای شگفت‌انگیز و تاثیرگذار بسازید اما وقت یا ایده کافی نداشته‌اید؟ Gamma اینجاست تا تحولی در نحوه تولید محتوای بصری و ارائه‌های شما ایجاد کند!

هوش مصنوعی Gamma چیست؟
ابزار Gamma یک ابزار مبتنی بر هوش مصنوعی است که با رویکردی خلاقانه به شما امکان می‌دهد اسلایدها، اسناد، بروشورها و محتوای بصری حرفه‌ای را در کمترین زمان ممکن طراحی کنید.

🎯 ویژگی‌های جذاب Gamma:
💠طراحی خودکار و پویا: کافی است موضوع خود را وارد کنید، Gamma محتوای مرتبط را با چیدمانی زیبا و متناسب ارائه می‌دهد.

💠تطبیق‌پذیری بالا: می‌توانید خروجی‌ها را برای هر نوع مخاطب یا استفاده‌ای شخصی‌سازی کنید.

💠رابط کاربری ساده و شهودی: حتی بدون دانش طراحی، خروجی‌های حرفه‌ای خلق کنید!

💠قابلیت تعاملی: Gamma امکان ایجاد محتوای تعاملی را برای افزایش جذابیت و تعامل با مخاطب فراهم می‌کند.



[لینک دسترسی به Gamma]

📌 این ابزار جذاب را با دوستان خود به اشتراک بگذارید!

#هوش_مصنوعی #پاورپوینت

CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
👍2🤩1🙏1
🔴 یه تصویر جذاب دیدی و می‌خوای شبیه اون رو با هوش مصنوعی بسازی اما نمی‌دونی از کجا شروع کنی؟

خیالت راحت! اینجا قراره یاد بگیری چطور بهترین پرامپت رو برای ساخت تصویری که می‌خوای بنویسی. 😍😍

🌟 راهکار ساده و سریع:
کافیه تصویر مورد نظرت رو توی ChatGPT آپلود کنی و از پرامپت آماده زیر استفاده کنی. این ابزار بهت دقیق‌ترین پرامپت رو می‌ده تا با استفاده از هوش مصنوعی مثل Bing Image Creator یا DALL-E، تصویر دلخواهت رو خلق کنی.

🔰 متن پرامپت پیشنهادی:

I would like to ask DALL-E (Bing) AI to create pictures exactly with this appearance and as realistic as possible. Please provide me with the best prompt possible for designing these types of pictures.


💬 اگه می‌خوای تغییری توی تصویر باشه، این جمله رو هم اضافه کن:
Please apply the following changes: (اینجا تغییرات مد نظرت رو بنویس)


🛠 بعد از دریافت پرامپت، اونو توی Bing Image Creator امتحان کن و از نتیجه خلاقانه لذت ببر.


📌 برای آموزش‌های بیشتر از دنیای هوش مصنوعی، حتماً ما رو دنبال کن.


#هوش_مصنوعی #ادیت_عکس

CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
👍3
CytoTech pinned a photo
CytoTech pinned «🌐 مرحله دوم: آشنایی با ابزارهای بیوانفورماتیک 🧬 حالا که پایه‌های زیست‌شناسی مولکولی رو یاد گرفتید، وقتشه وارد دنیای ابزارهای دیجیتالی بشید که دانش بیوانفورماتیک رو متحول کرده! 🚀 تو این مرحله یاد می‌گیریم چطور از داده‌های زیستی، دانش ارزشمند بسازیم. 1️⃣»
🌟 مرحله سوم: تراز کردن توالی‌ها (Sequence Alignment) 🧬

تو دنیای بیوانفورماتیک، کشف شباهت‌ها و تفاوت‌های ژنتیکی، شاهکار تراز کردن توالی‌هاست! 🚀
با ابزارهای جذابی مثل BLAST و Clustal Omega، میتوانید DNA, RNA و پروتئین‌ها رو مقایسه کنید و به اطلاعات شگفت‌انگیزی برسید! 👀

🛠 ابزارها:
1️⃣ ابزار BLAST: برای پیدا کردن توالی‌های مشابه در موجودات مختلف.
لینک دسترسی —> Blast
2️⃣ابزار Clustal Omega: بهترین ابزار برای تراز کردن چندین توالی به‌طور همزمان.
لینک دسترسی —> Omega

🔎 کاربردها:
بررسی شباهت ژنتیکی بین گونه‌ها.
شناسایی جهش‌های خاص در ژن‌ها.
تحلیل درخت‌های فیلوژنتیکی.

📌 تمرین کاربردی:
🔹 با BLAST، توالی ژن مورد علاقتون رو پیدا کنید و ببینید چه موجوداتی مشابه اون رو دارن!
🔹 با Clustal Omega، چند توالی رو تراز کنید و از تطبیق دقیقشون لذت ببرید!

🌐 پیش به سوی دانش دیجیتالی در دنیای زیست‌شناسی! 🌱


#بیوانفورماتیک #پژوهش #آموزش

CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
👍21
🌟 مقایسه BLAST و Clustal Omega: دو غول تحلیل توالی‌ها! 🧬

بیوانفورماتیک بدون ابزارهایی مثل BLAST و Clustal Omega، مثل پیدا کردن سوزن در انبار کاهه! این دو ابزار، نقشه‌بردار اصلی مسیر ما در دنیای ژنتیک و پروتئین هستند.

بیایید عمیق‌تر بشناسیمشان! 👇
〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️
🔍 BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)
چی هست؟
ابزاری قدرتمند برای جستجوی توالی‌ها در بانک‌های اطلاعاتی زیستی

ویژگی‌ها:
🔺سرعت بالا: در کمترین زمان، شباهت‌ها رو پیدا می‌کنه
🔺شناسایی محلی: بخش‌هایی از توالی که بیشترین شباهت رو دارن، مشخص می‌کنه
🔺بانک اطلاعاتی عظیم: به بانک‌های NCBI متصل هست و میلیاردها توالی رو جستجو می‌کنه
🔺تنوع در کاربری: برای DNA، RNA و پروتئین

مناسب برای:
🔸کشف موجوداتی که توالی مشابه دارند
🔸بررسی ژن‌ها و پروتئین‌ها برای مطالعات تکاملی یا عملکردی
🔸تحلیل جهش‌ها و تعیین نقش ژن در بیماری‌ها
〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️〰️
🔍 Clustal Omega
چی هست؟
ابزاری حرفه‌ای برای تراز چندگانه توالی‌ها (Multiple Sequence Alignment)

ویژگی‌ها:
🔹تحلیل دقیق: بهترین ابزار برای تطبیق چند توالی به‌طور همزمان
🔹درخت فیلوژنتیکی: روابط تکاملی بین گونه‌ها رو مشخص می‌کنه
🔹تعامل با ابزارهای دیگر: خروجی مناسب برای نرم‌افزارهایی مثل MEGA یا FigTree

مناسب برای:
▪️تراز کردن چند توالی ژنتیکی یا پروتئینی
▪️بررسی جهش‌های دقیق و تفاوت‌های تکاملی
▪️تحلیل الگوهای حفاظتی در توالی‌ها

این پست رو برای همکارانت ارسال کن❤️


#بیوانفورماتیک #پژوهش #آموزش

CytoTech Research Group

⚛️@Cyto_Tech
👍2👌2
CytoTech pinned «🌟 مرحله سوم: تراز کردن توالی‌ها (Sequence Alignment) 🧬 تو دنیای بیوانفورماتیک، کشف شباهت‌ها و تفاوت‌های ژنتیکی، شاهکار تراز کردن توالی‌هاست! 🚀 با ابزارهای جذابی مثل BLAST و Clustal Omega، میتوانید DNA, RNA و پروتئین‌ها رو مقایسه کنید و به اطلاعات شگفت‌انگیزی…»
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
▪️ آیا تا به حال برای نوشتن مقاله علمی یا پایان‌نامه خود دچار سردرگمی شده‌اید؟
یا شاید در پیدا کردن خطاهای نگارشی و ساختاری زمان زیادی از دست داده‌اید؟

🎯 ابزار هوشمند PAPERPAL دقیقا همان چیزی است که نیاز دارید!
با قابلیت‌هایی مثل:

🔸 بررسی و اصلاح نگارش و گرامر
🔸 پیشنهاد عبارات حرفه‌ای و علمی
🔸هماهنگی با فرمت مجلات معتبر
🔸سازگاری با نرم‌افزارهای مدیریت منابع

دیگر نگران نوشتن و ارسال مقاله نباشید. ویدئو رو ببین تا کار با ابزار رو خیلی راحت یادبگیری ✍🏻

#هوش_مصنوعی #پژوهش #مقاله

CytoTech Research Group

ما را دنبال کنید ❤️
Instagram | Telegram | Eitaa
👏21💯1
مرحله چهارم آموزش بیوانفورماتیک
طراحی پرایمر

1️⃣ قسمت اول: مقدمه‌ای بر طراحی پرایمر 🧬

امروز وارد دنیای طراحی پرایمر می‌شیم. این ابزار کوچک، کلید بسیاری از آزمایش‌های زیستی، مثل PCR هست. 🎯

💢طراحی پرایمر یعنی چی؟

پرایمرها قطعات کوتاه DNA هستن که در واکنش PCR برای تکثیر بخش خاصی از DNA استفاده می‌شن. طراحی دقیق پرایمرها تضمین می‌کنه که فقط بخش هدف تکثیر بشه. 🧪

🌟ویژگی‌های یک پرایمر خوب:

📍طول مناسب: معمولاً بین 18-24 نوکلئوتید.
📍دمای ذوب (Tm): بین 50-60 درجه سانتی‌گراد.
📍درصد GC: باید 40-60٪ باشه.
📍عدم تشکیل ساختارهای ثانویه: مثل لوپ یا دایمر.
📍تفاوت Tm در جفت پرایمرها: کمتر از 2 درجه.

ابزارهای طراحی پرایمر:

🔹 ابزار Primer3: یکی از محبوب‌ترین ابزارهای طراحی.
🔹 ابزار OligoAnalyzer: برای بررسی ساختارهای ثانویه.
🔹 ابزار NCBI Primer-BLAST: طراحی و بررسی توالی‌ها به‌طور همزمان.

در پست بعدی، مراحل گام‌به‌گام طراحی پرایمر رو یاد می‌گیریم.


📮 سوال یا تجربه‌ای دارید؟ برامون بنویسید!

#بیوانفورماتیک #طراحی_پرایمر #PCR

CytoTech Research Group

ما را دنبال کنید❤️:
Instagram | Telegram | Eitaa
👍2👏2
قسمت دوم: مراحل گام‌به‌گام طراحی پرایمر 🧬

وقتشه طراحی پرایمر رو به صورت عملی یاد بگیریم! آماده‌اید؟ 🚀


1️⃣ انتخاب توالی هدف:

ابتدا توالی موردنظر رو از پایگاه‌هایی مثل NCBI یا ENSEMBL استخراج کنید. مطمئن بشید که ناحیه‌ای که می‌خواید تکثیر کنید، به اندازه کافی خاصه.

2️⃣ استفاده از ابزار Primer3:

🔹 وارد سایت Primer3 بشید و توالی هدف رو وارد کنید.
🔹 پارامترهایی مثل طول پرایمر، دمای ذوب (Tm) و GC Content رو مشخص کنید.
🔹 پرایمر پیشنهادی ابزار رو بررسی کنید.

3️⃣ ارزیابی پرایمر با OligoAnalyzer:

🔸 پرایمرهای پیشنهادی رو در ابزار OligoAnalyzer وارد کنید.
🔸 بررسی کنید که پرایمر ساختارهای ثانویه‌ای مثل دایمر یا لوپ نداشته باشه.
🔸 عدد دلتا جی برای دایمر ها و لوپ ها باید بزرگ تر از منفی 3 باشد
🔸 دمای ذوب و GC Content رو دوباره چک کنید.

4️⃣ بررسی با Primer-BLAST:

پرایمرها رو در Primer-BLAST تست کنید تا مطمئن بشید فقط به توالی هدف متصل می‌شن و هیچ جایی از ژنوم به اشتباه تکثیر نمی‌شه.

در پست بعدی، نکات کلیدی و کاربردهای طراحی پرایمر رو توضیح می‌دیم.

📮 اگر طراحی پرایمر رو امتحان کردید، نتیجه‌هاتون رو با ما به اشتراک بذارید!

#بیوانفورماتیک #PCR #آموزش #طراحی_پرایمر

CytoTech Research Group

ما را دنبال کنید❤️:
Instagram | Telegram | Eitaa
👍5👏1
قسمت سوم: آموزش مرحله‌به‌مرحله کار با OligoAnalyzer 🔍🧬

با استفاده از OligoAnalyzer می‌تونید پرایمرهای طراحی‌شده رو به‌صورت دقیق ارزیابی کنید تا مطمئن بشید عملکرد مناسبی دارن. آماده‌اید؟ 👩‍🔬👨‍🔬

---

1️⃣ ورود به OligoAnalyzer:
🔹 به سایت OligoAnalyzer بروید
🔹 از منوی ثبت نام به رایگان ثبت نام کنید و وارد اکانت خود شوید
🔹 توالی پرایمر خود را در کادر مربوطه وارد کنید

---

2️⃣ بررسی ساختارهای ثانویه:
🔸 روی گزینه "Analyze" کلیک کنید تا نتایج اولیه نمایش داده شود.
🔸 در بخش "Self-Dimer" و "Hairpin"، ساختارهای احتمالی مثل دایمر یا لوپ بررسی می‌شوند.

نکات مهم:

- مقدار G∆ برای دایمرها و لوپ‌ها باید بزرگ‌تر از منفی 3 باشد (مثلاً -1.5 خوب است، اما -5 نامناسب است)
- در صورتی که مقدار G∆ کمتر از -3 بود، پرایمر را تغییر دهید

---

3️⃣ بررسی دمای ذوب (Tm):
🔹 مقدار Tm (دمای ذوب) باید بین 55-65 °C باشد
🔹 اگر Tm در محدوده مناسب نبود:
- طول پرایمر را افزایش دهید تا Tm بیشتر شود
- یا از توالی‌هایی با GC بیشتر استفاده کنید

---

4️⃣ بررسی GC Content:
🔸 میزان GC Content پرایمر باید بین 40-60٪ باشد
🔸 پرایمرهایی با GC خیلی بالا یا خیلی پایین ممکن است عملکرد ضعیفی داشته باشند

---

5️⃣ بررسی هم‌خوانی پرایمرها:
🔹 اگر از جفت پرایمر (Forward و Reverse) استفاده می‌کنید، گزینه "Hetero dimer" را انتخاب کنید و هر دو را در ابزار وارد کرده و "Calculate" را بزنید
🔹 بررسی کنید که پرایمرها با هم Dimer تشکیل ندهند. G∆ برای این حالت نیز باید بزرگ‌تر از منفی 3 باشد

---

6️⃣ ذخیره و یادداشت نتایج:
🔸 پس از تأیید نهایی، مشخصات پرایمر را یادداشت کنید:
- primer lenght
- Tm
- GC Content
- ∆G for Hairpin & Self-Dimer


---

حالا پرایمرهای شما آماده‌اند برای مراحل بعدی آزمایش!

در پست بعدی، نکات کلیدی کار با ابزار مهم Primer-blast را اموزش میدهید 🔬


📮 اگر سؤالی دارید یا نیاز به راهنمایی بیشتر داشتید، زیر همین پست برامون کامنت بذارید 😊


#بیوانفورماتیک #PCR #آموزش #طراحی_پرایمر

CytoTech Research Group

ما را دنبال کنید❤️:
Instagram | Telegram | Eitaa
👏3🤔1🙏1
CytoTech pinned a photo