🧬 انواع پرایمرها و اصول طراحی تخصصی آنها در ژنتیک مولکولی
پرایمرها (Primers) یکی از حیاتیترین اجزای واکنشهای PCR و qPCR هستند؛ قطعات کوتاه DNA تکرشتهای که ناحیه هدف را برای آنزیم DNA پلیمراز مشخص میکنند. طراحی درست آنها، پایه و اساس تمام مطالعات ژنتیکی، بیوتکنولوژی و تشخیص مولکولی است.
انتخاب نوع پرایمر به هدف پژوهش، نوع نمونه، و حساسیت مورد نیاز بستگی دارد. طراحی حرفهای آن نیازمند درک عمیق از ساختار ژن، ویژگیهای فیزیکوشیمیایی توالی و نرمافزارهای بیوانفورماتیکی است.
پرایمرها (Primers) یکی از حیاتیترین اجزای واکنشهای PCR و qPCR هستند؛ قطعات کوتاه DNA تکرشتهای که ناحیه هدف را برای آنزیم DNA پلیمراز مشخص میکنند. طراحی درست آنها، پایه و اساس تمام مطالعات ژنتیکی، بیوتکنولوژی و تشخیص مولکولی است.
🔹 ۱. پرایمرهای Forward و Reverse🧪 جمعبندی:
این دو نوع، جفت مکمل هم هستند و دو انتهای ناحیه مورد تکثیر را هدف قرار میدهند. پرایمر Forward از رشته Sense و پرایمر Reverse از رشته Antisense مکملسازی میکند.
🔍 نکته تخصصی: طول مناسب ۱۸–۲۵ نوکلئوتید، Tm مشابه (حدود ۵۸–۶۲°C) و محتوای GC بین ۴۰–۶۰٪ برای تعادل پایداری و اختصاصیت ضروری است.
🔹 ۲. پرایمرهای Degenerate
در مواقعی که توالی هدف دارای تنوع ژنتیکی میان گونهها یا ایزوفرمهاست، از پرایمرهای Degenerate استفاده میشود. این پرایمرها در موقعیتهای خاص از نوکلئوتیدهای جایگزین (مانند R, Y, N) بهره میبرند تا نواحی مشابه ولی غیریکسان را نیز شناسایی کنند.
🧠 کاربرد: ژنهای محافظتشده بین گونهها یا طراحی واکنشهای پانژنومیک.
🔹 ۳. Nested Primers
برای افزایش اختصاصیت PCR، دو مجموعه پرایمر طراحی میشود. در PCR دوم (Nested PCR)، جفت دوم پرایمرها داخل ناحیه محصول PCR اول قرار میگیرند.
🔬 کاربرد: تشخیص نمونههای با DNA کم یا آلوده به توالیهای مشابه.
🔹 ۴. Real-Time (qPCR) Primers
در واکنشهای Real-Time PCR، پرایمرها باید فاقد ساختارهای ثانویه و مکملی داخلی باشند، زیرا این واکنش به دقت بسیار بالا در دمای Annealing نیاز دارد.
📈 نرمافزارهایی مانند Gene Runner، Primer3 و NCBI Primer-BLAST برای طراحی دقیق و بررسی Cross-reactivity به کار میروند.
🔹 ۵. Allele-specific Primers
در ژنتیک بالینی و مطالعات SNP، پرایمرهایی طراحی میشوند که تنها یک واریانت خاص از DNA را تشخیص دهند. حتی تغییر یک نوکلئوتید در انتهای ۳’ میتواند اختصاصیت را تغییر دهد.
💊 کاربرد: تشخیص جهشهای ژنی در سرطانها یا بیماریهای ارثی.
انتخاب نوع پرایمر به هدف پژوهش، نوع نمونه، و حساسیت مورد نیاز بستگی دارد. طراحی حرفهای آن نیازمند درک عمیق از ساختار ژن، ویژگیهای فیزیکوشیمیایی توالی و نرمافزارهای بیوانفورماتیکی است.
─━━━━━⊱✿⊰━━━━━─
ExoBioGene🌱
─━━━━━⊱✿⊰━━━━━─
❤3👍1
🔬 و اما طراحی پرایمر با نرمافزار محبوب Gene Runner؛
گامی دقیق در آنالیز مولکولی
🧬 نرمافزار Gene Runner یکی از ابزارهای قدرتمند در حوزه بیوانفورماتیک کاربردی است که بهطور گسترده برای طراحی پرایمرهای اختصاصی در واکنشهای PCR، qPCR و RT-PCR استفاده میشود. این نرمافزار به زیستشناسان مولکولی و پژوهشگران ژنتیک اجازه میدهد تا بر اساس توالی هدف (Target Sequence)، پرایمرهایی با ویژگیهای بهینه از نظر دما، طول، محتوای GC و احتمال تشکیل ساختارهای ثانویه طراحی کنند.
گامی دقیق در آنالیز مولکولی
🧬 نرمافزار Gene Runner یکی از ابزارهای قدرتمند در حوزه بیوانفورماتیک کاربردی است که بهطور گسترده برای طراحی پرایمرهای اختصاصی در واکنشهای PCR، qPCR و RT-PCR استفاده میشود. این نرمافزار به زیستشناسان مولکولی و پژوهشگران ژنتیک اجازه میدهد تا بر اساس توالی هدف (Target Sequence)، پرایمرهایی با ویژگیهای بهینه از نظر دما، طول، محتوای GC و احتمال تشکیل ساختارهای ثانویه طراحی کنند.
💡 ویژگیهای تخصصی Gene Runner:🧫 در پروژههای پژوهشی و تشخیصی، طراحی دقیق پرایمر بهطور مستقیم بر روی صحت و حساسیت آزمایش تأثیر میگذارد. انتخاب نادرست پرایمر میتواند باعث آمپلیکونهای غیراختصاصی یا حتی عدم تکثیر ژن هدف شود.
1️⃣ بررسی دقیق دمای ذوب (Tm) و انرژی آزاد (ΔG) برای جلوگیری از تشکیل دیمر یا هیرپین (hairpin structures).
2️⃣ آنالیز محتوا و تکرارهای نوکلئوتیدی جهت کاهش پسزمینه غیراختصاصی در واکنش PCR.
3️⃣ قابلیت وارد کردن و ویرایش توالیها از فرمتهای متداول (FASTA، GenBank).
4️⃣ نمایش ساختار ثانویه RNA و DNA جهت پیشبینی پایداری اتصال پرایمر.
5️⃣ امکان تنظیم GC Clamp در انتهای ۳’ برای افزایش پایداری اتصال به رشته هدف.
از اینرو، Gene Runner با رابط کاربری ساده ولی تحلیلی، به یکی از ابزارهای پایه در طراحی تجربیات مولکولی دقیق تبدیل شده است.
❤5👏1
⚙️ در شرکت اگزوبایوژن، خدمات بیوانفورماتیکی ما شامل طراحی پرایمر اختصاصی، بررسی توالیهای هدف، و اعتبارسنجی in silico میشود تا پژوهشگران بتوانند با اطمینان بالاتر به مرحله آزمایشگاهی وارد شوند.
🧠 دقت در طراحی پرایمر، یعنی صرفهجویی در زمان، هزینه، و افزایش کیفیت نتایج ژنتیکی شما.
📍 با اگزوبایوژن، از طراحی پرایمر تا تأیید نهایی، گامبهگام همراه پژوهشگران خواهیم بود. 🧪✨
ثبت سفارش خدمات بیوانفورماتیکی در وبسایت اگزوبایوژن قابل انجام است
http://Exobiogene.ir
❤6🥰1
📢 توضیحات تکمیلی دربارهی برگزاری کارگاههای تخصصی و دورهی آموزشی بایوتاکس رو میتونید در استوری امروز اگزوبایوژن مشاهده کنید.
✨ جزئیات ثبتنام، سرفصلها و اساتید دوره بهصورت کامل اونجا قرار گرفته.
👩🔬👨🔬 حتماً سر بزنید و از برنامههای جدید ما باخبر بشید!
جهت مشاهده استوری های امروز، کلیک کنید
✨ جزئیات ثبتنام، سرفصلها و اساتید دوره بهصورت کامل اونجا قرار گرفته.
👩🔬👨🔬 حتماً سر بزنید و از برنامههای جدید ما باخبر بشید!
جهت مشاهده استوری های امروز، کلیک کنید
❤1
داخل تصویر چی میبینی؟
Anonymous Poll
78%
یه میز پر از جانداران مختلف
11%
نمیدونم چیه...فقط جانداران و تشخیص دادم
11%
یه عکس و پوستره احتمالا🤔
❤2
❌اینجا چه خبره؟🧐
یه معلم خوشذوق و عاشق آموزش دستبهکار شده و این نمونههای زیستی رو برای آموزش دانشآموزاش ساخته!💥
چند روز پیش، وقتی در «کنگره تکوین» شرکت کرده بودم، با این معلم جوون آشنا شدم که فوقلیسانس زیستشناسی داشت.👌
اون با تشخیص خلأهای آموزشی، با هزینه شخصی خودش این مدلها و نمونهها رو طراحی کرده بود تا به بچهها معنای واقعی علم رو نشون
بده.
بهنظرم اومد این کارش واقعاً ارزشمنده و باید دیده بشه؛ چون نشونهای از عشق، خلاقیت و دغدغهمندی یه معلم ایرانیه که نمیخواد یادگیری فقط تو کتابها بمونه.
یه معلم خوشذوق و عاشق آموزش دستبهکار شده و این نمونههای زیستی رو برای آموزش دانشآموزاش ساخته!💥
چند روز پیش، وقتی در «کنگره تکوین» شرکت کرده بودم، با این معلم جوون آشنا شدم که فوقلیسانس زیستشناسی داشت.👌
اون با تشخیص خلأهای آموزشی، با هزینه شخصی خودش این مدلها و نمونهها رو طراحی کرده بود تا به بچهها معنای واقعی علم رو نشون
بده.
بهنظرم اومد این کارش واقعاً ارزشمنده و باید دیده بشه؛ چون نشونهای از عشق، خلاقیت و دغدغهمندی یه معلم ایرانیه که نمیخواد یادگیری فقط تو کتابها بمونه.
امیدوارم با چنین تلاشهایی، نسل جدید بتونه زیستشناسی و محیط زیست رو نه فقط حفظ کنه، بلکه عمیقاً درک کنه و باهاش زندگی کنه.🥹
❤9🥰2
🧬✨ بیولوژی مصنوعی؛ جایی که زیست، مهندسی میشود ✨🧬
🔹 بیولوژی مصنوعی (Synthetic Biology) شاخهای از علم زیستشناسیه که به جای صرفاً مطالعهی موجودات زنده، به بازطراحی و مهندسی سیستمهای زیستی میپردازه. در واقع، ما با استفاده از ابزارهای ژنتیکی و دیگر علوممربوط ، سلولها رو مثل «ماشینهای زیستی برنامهپذیر» طراحی میکنیم!
🔹 در این حوزه از نرمافزارهایی مثل Geneious, Benchling, SnapGene و Gene Runner برای طراحی ژنهای مصنوعی، پروموترهای تنظیمی، و مسیرهای متابولیکی استفاده میشه تا تولید مولکولهای هدف (مثل انسولین نوترکیب، واکسنهای RNA و آنزیمهای صنعتی) بهینهسازی بشه.
🔹 هدف نهایی بیولوژی مصنوعی، ساخت سامانههای زیستی جدید با عملکردهای تعریفشده است. از میکروبهایی که آلودگیها رو تجزیه میکنن گرفته تا سلولهایی که داروهای پیچیده تولید میکنن.
🧫 پژوهشگران زیستشناسی مولکولی، ژنتیک، بیوانفورماتیک و مهندسی شیمی در این زمینه همافزا کار میکنن تا مرزهای تازهای از زیستفناوری رو گسترش بدن.
🔹 بیولوژی مصنوعی (Synthetic Biology) شاخهای از علم زیستشناسیه که به جای صرفاً مطالعهی موجودات زنده، به بازطراحی و مهندسی سیستمهای زیستی میپردازه. در واقع، ما با استفاده از ابزارهای ژنتیکی و دیگر علوممربوط ، سلولها رو مثل «ماشینهای زیستی برنامهپذیر» طراحی میکنیم!
🔹 در این حوزه از نرمافزارهایی مثل Geneious, Benchling, SnapGene و Gene Runner برای طراحی ژنهای مصنوعی، پروموترهای تنظیمی، و مسیرهای متابولیکی استفاده میشه تا تولید مولکولهای هدف (مثل انسولین نوترکیب، واکسنهای RNA و آنزیمهای صنعتی) بهینهسازی بشه.
🔹 هدف نهایی بیولوژی مصنوعی، ساخت سامانههای زیستی جدید با عملکردهای تعریفشده است. از میکروبهایی که آلودگیها رو تجزیه میکنن گرفته تا سلولهایی که داروهای پیچیده تولید میکنن.
🧫 پژوهشگران زیستشناسی مولکولی، ژنتیک، بیوانفورماتیک و مهندسی شیمی در این زمینه همافزا کار میکنن تا مرزهای تازهای از زیستفناوری رو گسترش بدن.
⚗️ تیم اگزوبایوژن در مسیر آموزش و توسعهی خدمات تحقیقاتی، با تمرکز بر طراحی ژن و مسیرهای مولکولی، در حال آمادهسازی دورههای تخصصی بیولوژی مصنوعی برای پژوهشگران کشوره.
❤4👎1
🧬✨ Synthetic Biology
آیندهای که خودمان میسازیم! ✨
آیندهای که خودمان میسازیم! ✨
سینتتیک بیولوژی، مرز میان علم زیستشناسی و مهندسی را از میان برداشته است. در این حوزه، پژوهشگران ژنها و سلولها را نهتنها مطالعه، بلکه بازطراحی و برنامهریزی میکنند تا عملکردهای جدید و هدفمند ایجاد کنند. از تولید داروهای نوترکیب و واکسنهای RNA گرفته تا طراحی سلولهای هوشمند برای تشخیص و درمان سرطان.
🔬 این علم در حال تبدیل شدن به یکی از ارکان اصلی زیستفناوری و پزشکی آینده است.
❤3👍1
🧠💊 کاربردهای سنتتیک بیولوژی ؛ از درمان هدفمند تا بازطراحی حیات 💊🧠
🔹 بیولوژی مصنوعی یا سنتتیک فقط یک شاخه تئوریک نیست؛ امروز بهصورت واقعی در خط مقدم پزشکی، داروسازی و درمان سرطانها قرار گرفته.
پژوهشگران از این علم برای طراحی سلولها و ژنهایی استفاده میکنن که عملکرد خاص و هدفمند دارن. برای مثال:
1️⃣ درمان سرطان با سلولهای مهندسیشده (CAR-T cells):
سلولهای ایمنی بازبرنامهریزی میشن تا گیرندههایی مخصوص سلولهای سرطانی بسازن و فقط اونها رو نابود کنن.
بدون آسیب به سلولهای سالم 🎯
2️⃣ طراحی میکروبهای درمانگر:
میکروارگانیسمهای مصنوعی ساخته میشن که در بدن فعالیت هدفمند دارن، مثل تجزیه سموم یا تولید داروی درجا 💉
3️⃣ تولید واکسنهای نسل جدید:
واکسنهای RNA و DNA از دستاوردهای مستقیم این علم هستن ، سریعتر، دقیقتر و قابل تنظیمتر برای هر نوع پاتوژن 🧬
4️⃣ بیولوژی سنتتیک در زیستمحیط:
با طراحی مسیرهای متابولیکی جدید در باکتریها، آلودگیهای نفتی و فلزات سنگین در محیط زیست تجزیه میشن 🌍
🔹 این علم عملاً در حال ایجاد انقلابی در مفهوم درمان و زیستفناوریه؛ جایی که زیستشناسان، مهندسان و برنامهنویسان کنار هم میایستن تا «زیست» را بسازند، نه فقط توصیف کنند ⚙️
🔹 بیولوژی مصنوعی یا سنتتیک فقط یک شاخه تئوریک نیست؛ امروز بهصورت واقعی در خط مقدم پزشکی، داروسازی و درمان سرطانها قرار گرفته.
پژوهشگران از این علم برای طراحی سلولها و ژنهایی استفاده میکنن که عملکرد خاص و هدفمند دارن. برای مثال:
1️⃣ درمان سرطان با سلولهای مهندسیشده (CAR-T cells):
سلولهای ایمنی بازبرنامهریزی میشن تا گیرندههایی مخصوص سلولهای سرطانی بسازن و فقط اونها رو نابود کنن.
بدون آسیب به سلولهای سالم 🎯
2️⃣ طراحی میکروبهای درمانگر:
میکروارگانیسمهای مصنوعی ساخته میشن که در بدن فعالیت هدفمند دارن، مثل تجزیه سموم یا تولید داروی درجا 💉
3️⃣ تولید واکسنهای نسل جدید:
واکسنهای RNA و DNA از دستاوردهای مستقیم این علم هستن ، سریعتر، دقیقتر و قابل تنظیمتر برای هر نوع پاتوژن 🧬
4️⃣ بیولوژی سنتتیک در زیستمحیط:
با طراحی مسیرهای متابولیکی جدید در باکتریها، آلودگیهای نفتی و فلزات سنگین در محیط زیست تجزیه میشن 🌍
🔹 این علم عملاً در حال ایجاد انقلابی در مفهوم درمان و زیستفناوریه؛ جایی که زیستشناسان، مهندسان و برنامهنویسان کنار هم میایستن تا «زیست» را بسازند، نه فقط توصیف کنند ⚙️
👍3🥰1
میدونستین میشه از اگزوزومها بهعنوان یک سیستم هوشمند برای دارورسانی هدفمند یا حتی درمانهای ژنی استفاده کرد؟
🔹 ولی دقیقاً چطور این لودینگ انجام میشه؟
🔹 چه روشهایی برای بارگذاری RNA و DNA در اگزوزومها وجود داره؟
🔹 و چرا این موضوع تا این حد در تحقیقات و کاربردهای کلینیکی مهمه؟
🎓 توی کارگاه تخصصی «اگزوزومها: از جداسازی تا مهندسی و بارگذاری نوکلئیک اسیدها» قراره همه اینها رو با هم یاد کنیم.
📅 تاریخ برگزاری: ۲ آبان
❌ (آخرین مهلت نام نویسی)
📍 برگزارکننده: اگزوبایون با همکاری آزمایشگاه مرکزی دانشگاه خوارزمی تهران
🔹 ولی دقیقاً چطور این لودینگ انجام میشه؟
🔹 چه روشهایی برای بارگذاری RNA و DNA در اگزوزومها وجود داره؟
🔹 و چرا این موضوع تا این حد در تحقیقات و کاربردهای کلینیکی مهمه؟
🎓 توی کارگاه تخصصی «اگزوزومها: از جداسازی تا مهندسی و بارگذاری نوکلئیک اسیدها» قراره همه اینها رو با هم یاد کنیم.
📅 تاریخ برگزاری: ۲ آبان
❌ (آخرین مهلت نام نویسی)
📍 برگزارکننده: اگزوبایون با همکاری آزمایشگاه مرکزی دانشگاه خوارزمی تهران
برای ثبتنام: از طریق وبسایت ما اقدام کنید.
http://Exobiogene.ir
─━━━━━⊱✿⊰━━━━━─
ExoBioGene🌱
─━━━━━⊱✿⊰━━━━━─
❤3👏2
🔬✨ اگر به دنیای علم، پژوهش و زیستشناسی علاقهمندید...
حتماً به صفحهی اینستاگرام اگزوبایوژن سر بزنید!
حتماً به صفحهی اینستاگرام اگزوبایوژن سر بزنید!
هر روز در استوریهامون، محتوای علمی جذاب، نکات تخصصی آزمایشگاهی و لحظههایی از پشت صحنهی فعالیتهای پژوهشی رو با شما به اشتراک میگذاریم.📍Instagram: @ExoBioGene
📱 با ما همراه باشید تا علم رو از زاویهای تازه تجربه کنید.
❤3👏2
ExoBioGene💊🧬
🔊آخرین فرصت ثبت نام❌جا نمونی🏃➡️ 💠 کارگاه تخصصی اگزوزومها؛ از جداسازی تا مهندسی و بارگذاری نوکلئیک اسیدها 🔬 با همکاری مجموعه تحقیقاتی اگزوبایوژن و آزمایشگاه مرکزی دانشگاه خوارزمی تهران 👩🏫 مدرس: دکتر لیلا درزی دکتری بیوتکنولوژی پزشکی – دانشگاه تربیت مدرس…
آخرین مهلت ثبت نام کارگاه
۲ آبان❌
۲ آبان❌
❤2