📚#مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 کشف RNAهای حلقوی با کمک تکنولوژی‌های نوظهور توالی‌یابی و یادگیری عمیق
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۱۵ ثانیه

نوعی از مولکول‌های RNA موسوم به RNAهای حلقوی (circRNA) هستند که برخلاف RNAهای خطی، ساختاری بسته و حلقوی دارند. این مولکول‌ها در تنظیم ژن و بروز بیماری‌ها نقش دارند، اما به دلیل سطح بیان پایین و شباهت زیاد به RNAهای خطی، شناسایی آن‌ها دشوار است. پیشرفت‌های اخیر در فناوری توالی‌یابی RNA با قرائت بلند (long-read) و در سطح تک‌سلولی، همراه با الگوریتم‌های هوش مصنوعی و یادگیری عمیق، امکان بررسی دقیق‌تر و گسترده‌تر circRNAها را فراهم کرده‌اند.

منبع: Nature Genetics




📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup

📚#مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 تسریع ترمیم DNA از طریق ریلکس‌کردن کروماتین با دی‌آمینه شدن هیستون H1
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۲۵ ثانیه

برای ترمیم مؤثر شکست‌های دو رشته‌ای DNA، باز شدن ساختار فشرده‌ی کروماتین ضروری است. در این مطالعه نشان داده شده که آنزیم CTPS1 با دی‌آمینه کردن باقی‌مانده‌های آسپاراژین 76 و 77 در هیستون H1، موجب تسهیل استیلاسیون بعدی در لیزین 75 می‌شود. این دگرگونی دوگانه در H1 به باز شدن ساختار کروماتین منجر شده و روند پاسخ به آسیب DNA را تقویت می‌کند. آنزیم p300، که استیلاسیون را انجام می‌دهد، ترجیحاً روی H1 دی‌آمینه‌شده عمل می‌کند و این موضوع نشان می‌دهد که دی‌آمینه‌شدن پیش‌نیازی برای استیلاسیون است. همچنین، بیان بالای CTPS1 با مقاومت به پرتودرمانی در مدل‌های حیوانی و بیماران انسانی همراه بوده است. این یافته‌ها نقش مهمی برای تغییرات شیمیایی هیستون H1 در تنظیم پاسخ به آسیب DNA معرفی می‌کند.

منبع: Nature




📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup

📚#مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 ژنومیکس تک‌سلولی: قشر بویایی موش بازمانده‌ای از امضای تکاملی مغز اجدادی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۲۰ ثانیه

در این مطالعه، با استفاده از تکنیک‌های ژنومی تک‌سلولی، مشخص شد که نورون‌های قشر بویایی موش برخلاف نئوکورتکس، تنوع ژنتیکی پیوسته‌ و غیرخوشه‌بندی شده دارند. آنالیز ترنسکریپتومی و اپی‌ژنتیکی نشان داد که این نورون‌ها علیرغم برخی شباهت‌ها به نئوکورتکس، دارای وضعیت‌های تنظیم ژنی و دسترسی کروماتین متفاوتی هستند. جالب‌تر اینکه، این نورون‌ها از نظر پروفایل بیان ژن، شباهت زیادی به نورون‌های خزندگان و دوزیستان دارند، که نشان‌دهنده حفظ امضای تکاملی اجدادی در قشر بویایی است.

منبع: Nature Neurosience
#R



📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup

📚#مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 مدلاسیون ژن‌های مکانوسنسور و تمایز سلول‌های چربی با امواج صوتی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۰ ثانیه

در این مطالعه، پژوهشگران نشان دادند که سلول‌های یوکاریوت می‌توانند به امواج صوتی در محدوده قابل شنیدن (مثل 440 هرتز و 14 کیلوهرتز) پاسخ دهند. آنالیز RNA-seq روی سلول‌های عضلانی C2C12 موش نشان داد که پس از 2 تا 24 ساعت قرارگیری در معرض صدا، ده‌ها ژن مکانوسنسور به طور معناداری تغییر بیان دارند. یکی از این ژن‌ها، Ptgs2/Cox-2، نقش کلیدی در پاسخ‌دهی سلولی به صدا ایفا می‌کند و مسیر سنتز پروستاگلاندین E2 را فعال می‌سازد. همچنین، سلول‌های چربی (آدیپوسیت‌ها) حساسیت بیشتری به تحریک صوتی داشتند و تمایزشان با تحریک مداوم صوتی به طور چشمگیری مهار شد. این نتایج نشان می‌دهند که امواج صوتی می‌توانند به عنوان محرک فیزیکی غیرتهاجمی برای تنظیم بیان ژن و مسیرهای تمایز سلولی مورد استفاده قرار گیرند.

منبع: Communications Biology



📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup

اطلاعیه فوری سازمان خون کشور
افراد دارای گروه خونی -O خون بدهند


🩸سخنگوی سازمان انتقال خون ایران اعلام کرد:
با وقوع حادثه انفجار شدید در اسکله شهید رجایی بندر عباس، شبکه ملی خون‌رسانی بلافاصله فعال شد و تأمین خون مورد نیاز مصدومان با استفاده از ذخایر استان‌های هم‌جوار در دستور کار قرار گرفت.

🔴 بر همین اساس، ارسال خون و فرآورده‌های خونی از استان‌های گیلان، تهران، یزد، همدان، کرمان، خراسان شمالی و اصفهان به بندرعباس آغاز شده‌است.

📌 سازمان انتقال خون از دارندگان گروه خونی -O در استان‌های گیلان، تهران، یزد، همدان، کرمان، خراسان‌شمالی و اصفهان درخواست کرده برای اهدای خون داوطلب شوند.

🔺 همچنین از داوطلبان دارای گروه خونی -O در استان هرمزگان خواسته شده‌است اهدای خون را در اولویت قرار دهند.

🌱 انجمن های علمی دانشجویی مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی دانشگاه ارومیه و بیوانفورماتیک دانشگاه یزد، با همکاری انجمن بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه ارومیه برگزار میکند

🔰 کارگاه آموزشی آشنایی با PCR و طراحی پرایمر

🔻 مدرس: هلنا چوبینه، دانشجوی کارشناسی ارشد دانشگاه یزد

❗️ برگزاری بصورت مجازی

🗓 پنجشنبه ۱۸ اردبیشهت ماه

⏱ ساعت ده صبح

💰 هزینه ثبت نام: صد هزار تومان

❇️ همراه با ارائه گواهی

✅ ثبت نام و کسب اطلاعات بیشتر:

🆔 @amaneh_mo

📱09027651379


🌱انجمن علمی دانشجویی مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی دانشگاه ارومیه

🆔 @ Agrobreeding_uu

📢 معرفی خدمات ژنتیکی آکادمی GENETIX
🔥 Genes Ignite Xcellence 🔥

#درباره_ما :
🏢 گروه تولیدی و خدماتی ژنتیکس
ارائه‌دهنده‌ی خدمات تخصصی در حوزه‌های:
✅ تولیدی | ✅ آموزشی | ✅ پژوهشی
با همکاری دانشجویان و اساتید دانشگاه تهران
📚 آماده‌ی مشارکت با مؤسسات علمی و تحقیقاتی


🧬 خدمات تخصصی ژنتیکس در حوزه ژنتیک:
▫️ سنتز cDNA | استخراج RNA | استخراج DNA
▫️ خدمات PCR | RT-PCR | Cloning
▫️ مهندسی ژنتیک و طراحی پروژه‌های بیان ژن
▫️ تشخیص مولکولی میکروارگانیسم‌ها
▫️ توالی‌یابی (Sanger) و تحلیل داده‌ها


🎓 ویژه‌ی دانشجویان:
🔹 امکان حضور در پروژه‌ها به‌عنوان طرح آموزشی
🔹 تخفیف ویژه برای خدمات دانشجویی



📩 برای مشاوره و همکاری:

📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup

🌟 معرفی آموزش و خدمات آنالیز داده آکادمی GENETIX 🌟

اگر به دنبال یادگیری تحلیل داده‌ها و نرم‌افزار R هستید؟ 📈
آکادمی تولیدی و خدماتی ژنیکس با ارائه خدمات تخصصی و آموزش‌های حرفه‌ای در زمینه تحلیل داده‌ها، آماده همکاری با شماست!

🔍 خدمات ما شامل:
- آموزش نرم‌افزار R
- تست‌های پارامتریک و ناپارامتریک
- رگرسیون
- دسته‌بندی
- خوشه‌بندی
- یادگیری ماشین و یادگیری عمیق

👨‍🏫 با همکاری دانشجویان و اساتید دانشگاه تهران

🔻برای اطلاعات بیشتر و ثبت‌نام در دوره‌ها، با ما تماس بگیرید:
📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup

🎓 آکادمی GENETIX با همکاری دانشگاه تهران و بیش از ۵۰ انجمن علمی دانشگاهی برگزار می‌کند:

✨ 《کارگاه مصورسازی داده با R 》 ✨

🔻 آشنایی با تکنیک‌های پیشرفته مصور سازی داده در نرم افزار برنامه‌نویسی #R و ارتقای مهارت‌های بصری‌سازیِ علمی برای مقالات، Graphical Abstractها، پایان‌نامه‌ها و ارائه‌های بین‌المللی.

سرفصل‌های کارگاه:

○ ایجاد نمودارهای چندلایه (scatter، box، bar به‌صورت ترکیبی).
○ حرفه‌ای سازی پلات‌ها با تنظیم رنگ، فونت، عنوان، تم و ابعاد.
○ آشنایی با پکیج‌های پیشرفته‌ای مانند ggplot2، Plotly و ComplexHeatmap.
○ کار با ابزارهای بصری‌سازی ژنوم و پروتئوم مانند Upset plot و Circos plot.
○ ترکیب چند گراف در یک چیدمان (multi-plot) با patchwork یا cowplo
t.

📅 تاریخ برگزاری: ۱۵ و ۱۶ اردیبهشت
🕔 زمان: ۱۷ تا ۱۸:۳۰
▪️ هزینه ثبت نام و گواهی بین‌المللی دانشگاه تهران با احترام:
با ارائه کدتخفیف انجمن علمی همکار ⬅️ ۱۰۰ هزارتومان
بصورت آزاد ⬅️۱۵۰ هزارتومان

برای ثبت‌نام و کسب اطلاعات بیشتر، به آیدی/شماره موبایل زیر در تلگرام پیام دهید:
📱 @GENETIX_Admin
📞 09100848481

➖➖➖➖➖➖➖➖➖
🧬 GENETIX

📚#مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 ده اصل برای کدنویسی قابل اعتماد، کارآمد و سازگار در روانشناسی و علوم اعصاب شناختی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه

در این مقاله، ده اصل کاربردی برای بهبود کدنویسی در سطوح مختلف مهارت ارائه شده است؛ اصولی که می‌توانند به خودکارسازی پروژه‌ها، کاهش خطاهای انسانی و افزایش کیفیت و قابلیت بازاستفاده از کد کمک کنند.
1. ساختار دایرکتوری استاندارد، نام‌گذاری واضح فایل‌ها
2. استفاده از سیستم‌های کنترل نسخه مانند Git
3. اتوماسیون وظایف تکراری، بهینه‌سازی کد
4. ساده، خوانا، بدون تکرار، نام‌گذاری معنادار
5. استفاده از تست‌های خودکار برای شناسایی خطاها
6. مستندسازی دقیق، طراحی برای استفاده مجدد
7. تعیین استانداردهای گروهی برای کدنویسی
8. بررسی کد توسط همکاران برای بهبود کیفیت
9. ذخیره‌سازی کد و مستندات در فضای مشترک مانند GitHub
10. دسترسی به منابع محاسباتی مناسب مانند ابر یا خوشه‌های HPC

منبع: Communications Psychology
#R



📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup

📚#مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 یک روش هیبریدی مبتنی بر مدل‌های زبانی بزرگ (LLM) برای بهبود نمره‌دهی خودکار مقالات
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۵ ثانیه

روش‌های سنتی نمره‌دهی خودکار مقالات (AES) عمدتاً بر داده‌های سطحی مانند فراوانی واژگان یا طول جملات تکیه داشتند و ساختار متن و معنای عمیق را نادیده می‌گرفتند، که باعث ارزیابی‌های محدود در زمینه انسجام و کیفیت نوشتار می‌شد. در این مطالعه، یک روش هیبریدی جدید معرفی شده است که با ترکیب ویژگی‌هایی از سطوح مختلف زبانی و استفاده از قدرت مدل‌های زبانی بزرگ (#LLM)، توانسته روابط پیچیده موجود در متون منسجم را بهتر شناسایی کند. آزمایش‌ها بر روی دیتاست‌های استاندارد نشان داد که این مدل هیبریدی نسبت به روش‌های پیشین، چه مبتنی بر ویژگی‌های سطحی و چه شبکه‌های عصبی خالص، عملکرد برتری دارد. این پیشرفت، گامی مؤثر در جهت توسعه ابزارهای دقیق‌تر و کارآمدتر برای ارزیابی نگارش دانشجویان است.

منبع: Scientific Reports




📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup

📚#مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 تشخیص دقیق بازآرایی‌های ژنتیکی در سرطان با الگوریتم Severus
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۲۵ ثانیه

تشخیص تغییرات ساختاری سوماتیک در ژن سرطان با استفاده از long-read sequencing نسبت به روش‌های کوتاه‌خوان مزایای قابل توجهی دارد، اما اغلب ابزارهای موجود برای پیچیدگی‌های ژنوم توموری طراحی نشده‌اند. ابزار جدیدی به نام Severus با استفاده از الگوریتم گراف شکستگی، قادر به شناسایی دقیق بازآرایی‌های پیچیده و چندنقطه‌ای در ژنوم سرطان است. این ابزار علاوه بر پشتیبانی از کاریوتیپ‌های نامتعادل، تماس‌های هاپلو‌تایپ-ویژه ایجاد می‌کند و در نمونه‌های بالینی سرطان خون کودکان، بازآرایی‌های پنهانی و مهمی را شناسایی کرده که در روش‌های مرسوم دیده نمی‌شوند. در مقایسه با سایر ابزارها، Severus دقت بالاتری در تشخیص تغییرات ساختاری نشان داده و توانایی‌های long-read را در مقابل short-read به شکل مؤثری آشکار کرده است.

منبع: Nature Biotechonology




📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup

📚#مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 ردیابی انتقال ویروس‌های باکتریایی در روده ماهی گورخر با وضوح تک‌ویریونی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۳۰ ثانیه

پژوهشگران با توسعه روشی به نام Phollow موفق شدند انتقال ویروس‌های باکتریایی (فاژها) را در روده ماهی گورخر با وضوح تک‌ویریونی ردیابی کنند. این روش با استفاده از پروتئین‌های فلورسنت، مسیر تکثیر و انتشار فاژها را بین باکتری‌ها نشان می‌دهد. نتایج نشان داد که فاژهای بومی ماهی توانایی انتشار تا کبد و مغز را دارند، در حالی که فاژهای انسانی چنین قابلیتی ندارند. همچنین، آنتی‌بیوتیک‌ها موجب جهش‌هایی در انتقال فاژ و تغییرات شدید در ترکیب میکروبی شدند. این فناوری می‌تواند راه را برای درمان‌های فاژمحور در مهندسی میکروبیوم هموار کند.

منبع: Nature Microbiology




📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 @GENETIXgroup

⭕️ #Coming_Soon ... 🔜

⚜️ کارگاه جدید و رایگان آکادمی GENETIX ⚜️

✨ طراحی پرایمر ✨

🧬 در این ورکشاپ قراره به‌صورت کاملاً کاربردی، صفر تا صد طراحی یک پرایمر رو به صورت عملی یاد بگیرید و نهایتاً، خودتون بتونید در ۱۵ دقیقه با ابزارهای رایگان یک پرایمر طراحی کنید و حتی پروژه‌های تجاری دریافت کنید.

➖➖➖➖➖➖➖➖

❇️ سرفصل‌های این ورکشاپ:

● مقدمه‌ای بر همانندسازی DNA و اصول PCR
● آشنایی با ویژگی‌های یک پرایمر مطلوب
● استخراج توالی ژن از پایگاه داده NCBI
● طراحی پرایمر با نرم‌افزار Primer3Plus
● بررسی تخصصی با ابزار NCBI Primer-BLAST
● آنالیز ترمو-شیمیایی پرایمر با OligoAnalyzer
🔴 در انتهای کارگاه، حل تمرین و طراحی عملی به‌همراه شرکت‌کنندگان


⭕️⏳ منتظر اطلاعیه زمان برگزاری و نحوه ثبت‌نام در این هفته باشید...

📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 GENETIXgroup

🎓 آکادمی ژنتیکس با همکاری بیش از 40 انجمن علمی همکار برگزار می‌کند:

ورکشاپ آنلاین و رایگانِ

《طراحی پرایمر》

❇️ سرفصل‌های این ورکشاپ:

● مقدمه‌ای بر همانندسازی DNA و اصول PCR
● آشنایی با ویژگی‌های یک پرایمر مطلوب
● استخراج توالی ژن از پایگاه داده NCBI
● طراحی پرایمر با نرم‌افزار Primer3Plus
● بررسی تخصصی با ابزار NCBI Primer-BLAST
● آنالیز ترمو-شیمیایی پرایمر با OligoAnalyzer

🔴 در انتهای کارگاه، حل تمرین و طراحی عملی به‌همراه شرکت‌کنندگان

➖➖➖➖➖➖➖➖

🗓 تاریخ: ۱ خرداد ۱۴۰۴

🕔 زمان: ۱۹ تا ۲۰:۳۰

🔴 شرکت برای عموم آزاد و رایگان است

◾️ هزینه سرتیفیکیت معتبر بین‌المللی دانشگاه تهران: با احترام ۴۹ هزار تومان

➖➖➖➖➖➖➖➖


برای ثبت‌نام و کسب اطلاعات بیشتر، به آیدی زیر در تلگرام پیام دهید:

🆔 @GENETIX_Admin

➖➖➖➖➖➖➖➖
🧬GENETIX🧬
🔥 Genes Ignite Xcellence 🔥

📚#مقالات_و_مطالعات_علمی
📢 ژنتیک و لذت موسیقی
⏱️ مدت زمان مطالعه: ۲۰ ثانیه

تحقیقات جدید با استفاده از مدل‌سازی ژن دوقلوها نشان می‌دهد که تفاوت‌های فردی در "میزان لذت بردن از موسیقی" تا ۵۴٪ تحت تأثیر عوامل ژنتیکی است. جالب‌تر اینکه حدود ۷۰٪ از این اثرات ژنتیکی مستقل از توانایی‌های درک موسیقی هستند.
تحلیل‌های چندمتغیره نشان می‌دهد که لذت از موسیقی مسیرهای ژنتیکی و محیطی متفاوتی دارد و این مسیرها الگوهای خاصی از ارتباط ژنتیکی با توانایی‌های درک موسیقی را نشان می‌دهند. این یافته‌ها پیچیدگی زیستی لذت بردن از موسیقی را برجسته کرده و مسیرهای مجزایی را برای تأثیر ژنتیک بر این ویژگی معرفی می‌کند

منبع: Nature Communications
#R


📧 Genetixtechnology@gmail.com
📞 09100848481
🆔 GENETIXgroup

⌨️ ژنتیکس #FunWithR : وقتی R سوت می‌زنه!

می‌دونستید R می‌تونه براتون صدا دربیاره؟
تابع بانمک beep() از پکیج beepr این قابلیتو فراهم می‌کنه تا به کدهای R، صدا اضافه کنید!

🧾 ابتدا پکیج رو بادستور 1 نصب کنید. سپس کتابخونش رو با دستور 2 فراخوانی کنید و درنهایت با عوض کردن عدد داخل پرانتز beep()، مثل دستور 3 و 4، صداهای مختلفی رو امتحان کنید.

    install.packages("beepr")  #1
    library(beepr)             #2
    beep(2)    #Mario Coin     #3
    beep(8)    #Mario          #4
***    Channel: @GENETIXgroup    ***

✨ البته این تابع، فارغ از سرگرمی میتونه مفید هم باشه. مثلا بعد از تموم شدن یک دستور طولانی براتون صدا بده تا بفهمید دستور اجرا شده یا وقتی کدتون ارور داد یا به درستی اجرا شد بهتون اطلاع بده.


📞 09100848481
🆔 GENETIXgroup

کنترل نوری در تنظیم رونویسی ژن‌ها با استفاده از مولکول‌های کوچک

تحقیقات جدید نشان می‌دهد که تنظیم رونویسی ژن‌ها یک فرآیند پویاست که فعالیت‌های سلولی مختلف را هماهنگ می‌کند. در این راستا، استفاده از مولکول‌های کوچک برای دستکاری بیان ژن کمک زیادی به درک مکانیسم‌های تنظیمی کرده است. اما این مولکول‌ها معمولاً دقت مکانی-زمانی لازم را در محیط‌های غیرتهاجمی ندارند. به‌تازگی، مولکولی به نام G4switch معرفی شده است که می‌تواند اتصال به G-quadruplex‌های DNA را با نور مرئی کنترل کند. این مولکول قادر است در سلول‌های زنده تنظیم دقیقی بر بیان ژن‌های خاص و تکثیر سلولی داشته باشد.

Nature Chemistary
#R



📞 09100848481
🆔 GENETIXgroup

#سوگیری بقا (Survivorship Bias)

🔹 در جنگ جهانی دوم، نیروی هوایی متفقین برای کاهش تلفات، به بررسی هواپیماهای بازگشته پرداخت و تصمیم گرفت نقاط آسیب‌دیده‌ی آنها را مانند بال و بدنه (نقاط قرمز رنگ تصویر این پست) با یک پوشش زرهی تقویت کند تا کمتر آسیب ببینند. اما این اقدام بی‌نتیجه ماند و همچنان نرخ سقوط هواپیماها بدون تغییر باقی ماند.

🔹 آبراهام والد ریاضی‌دان، نظری متفاوت ارائه داد. او اعتقاد داشت: نقاطی از هواپیماهای بازگشتی که اصلاً آسیب ندیده‌اند، همان نواحی حیاتی‌اند که اگر گلوله بخورند، هواپیما نابود می‌شود و اصلاً به پایگاه باز نمی‌گردد. بنابراین، صفحه‌های زرهی باید به همین بخش‌ها افزوده شود.

🔻این نگاه باعث تحول در تحلیل داده‌ها شد. سوگیری بقا یک خطای نمونه برداری رایج و یکی از #خطاهای_شناختی متداول است و به ما یادآوری می‌کند که، تنها تمرکز بر نمونه‌های موفق – مانند شرکت‌های پابرجا یا افراد مشهور – بدون بررسی شکست‌خورده‌ها، می‌تواند به درک ناقص و حتی گمراه‌کننده از داده‌ها منجر شود و دقیقا نتیجه عکس دهد.
پس برای تصمیم‌گیری درست، باید هم موفقیت‌ها را دید و هم شکست‌های پنهان را در نظر گرفت.

🆔 GENETIXgroup