معرفی Manhattan plot
یکی از پلات های کاربردی که در آنالیزهای GWAS استفاده میشه پلات Manhattan می باشد. این نمودار به طور خاص برای نمایش میزان ارتباط نشانگرهای ژنتیکی (معمولاً SNPها) با یک صفت یا بیماری به کار میرود. ابزارهای مختلفی برای ترسیم این نوع پلات وجود داره ولی بهترین اونا که فیچرهای اختصاصی برای تنظیم رنگ و سایز گراف و ... ارائه میده پکیج ggmanh هستش که نسخه اپدیت 2024 اون هم ارائه شده. این بسته رایگان است و کافی است . برای نصب این پکیج کد زیر را در نرم افزار R اجرا کنید:
با ما همراه باشید.
@irbioinformatics
یکی از پلات های کاربردی که در آنالیزهای GWAS استفاده میشه پلات Manhattan می باشد. این نمودار به طور خاص برای نمایش میزان ارتباط نشانگرهای ژنتیکی (معمولاً SNPها) با یک صفت یا بیماری به کار میرود. ابزارهای مختلفی برای ترسیم این نوع پلات وجود داره ولی بهترین اونا که فیچرهای اختصاصی برای تنظیم رنگ و سایز گراف و ... ارائه میده پکیج ggmanh هستش که نسخه اپدیت 2024 اون هم ارائه شده. این بسته رایگان است و کافی است . برای نصب این پکیج کد زیر را در نرم افزار R اجرا کنید:
if (!require("BiocManager"))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("ggmanh")با ما همراه باشید.
@irbioinformatics
👍6
در شکل پیوست انواع مختلف کاهنده های درد طبیعی را می تونین ببینین :) اگه میدون تره بار نزدیکتون هستش و از این خوشمزه ها داره حتما تهیه کنین و مصرف کنین تا سطح فاکتورهای التهابی و کموکاین های بدنتون بیاد پایین. اینجاست که باید سر تعظیم فرود بیاریم در مقابل این جمله بقراط که میگه:
Let food be thy medicine and medicine be thy food!
@irbioinformatics
Let food be thy medicine and medicine be thy food!
@irbioinformatics
👍4
آنزیم برشی EcoRI آنزیمEcoRI یک آنزیم محدودکننده (restriction enzyme) است که به طور اختصاصی توالیهای خاصی از DNA را شناسایی و برش میدهد. این آنزیم بهطور طبیعی در باکتری Escherichia coli یافت میشود و نقش آن محافظت از باکتری در برابر ویروسها (فاژها) از طریق تجزیه DNA خارجی است. این انزیم در مهندسی ژنتیک کاربرد دارد و پس از شناسایی یک ناحیه خاص در DNA باعث برش ان ناحیه و ایجاد یک ناحیه چسپنده یا sticky ends می شود.
جایگاه شناسایی آنزیم:
جایگاه برشی آنزیم:
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
@irbioinformatics
جایگاه شناسایی آنزیم:
5'—GAATTC—3'
3'—CTTAAG—5'
جایگاه برشی آنزیم:
5'—G AATTC—3'
3'—CTTAA G—5'
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
@irbioinformatics
🥰2👍1👏1
معرفی آنزیم BamHI
آنزیم BamHI یک آنزیم محدودکننده برشی است که بهطور خاص توالیهای خاصی از DNA را شناسایی و برش میدهد. این آنزیم از باکتری Bacillus amyloliquefaciens استخراج میشود و بهعنوان یکی از ابزارهای پرکاربرد در مهندسی ژنتیک و بیوتکنولوژی مورد استفاده قرار میگیرد. این آنزیم بین دو باز G برش ایجاد میکند و مانند EcoRI انتهای چسبنده تولید میکند:
جایگاه شناسایی آنزیم:
توالی برشی آنزیم:
با ما همراه باشید
@irbioinformatics
آنزیم BamHI یک آنزیم محدودکننده برشی است که بهطور خاص توالیهای خاصی از DNA را شناسایی و برش میدهد. این آنزیم از باکتری Bacillus amyloliquefaciens استخراج میشود و بهعنوان یکی از ابزارهای پرکاربرد در مهندسی ژنتیک و بیوتکنولوژی مورد استفاده قرار میگیرد. این آنزیم بین دو باز G برش ایجاد میکند و مانند EcoRI انتهای چسبنده تولید میکند:
جایگاه شناسایی آنزیم:
5'—GGATCC—3'
3'—CCTAGG—5'
توالی برشی آنزیم:
5'—G GATCC—3'
3'—CCTAG G—5'
با ما همراه باشید
@irbioinformatics
👍3🥰1🕊1
#اخبار_بیوتکنولوژی
با افتخار آلبومین و آیویآیجی (ivig) تولید شده در بزرگترین پالایشگاه پلاسمای ایران وارد بازار شدند
مدیرعامل شرکت نوژین زیست فارمد از ورود محصولات بزرگترین پالایشگاه پلاسمای کشور به بازار در ماه گذشته خبر داد و گفت: پالایشگاه پلاسمای نوژین زیست فارمد با ظرفیت پالایش سالانه ۱۵۰ هزار لیتر پلاسما احداث شده است که تا سال آینده به ظرفیت کامل تولید خواهد رسید. همچنین دو محصول کنونی این پالایشگاه شامل آلبومین (برند آلبوژین) و آیویآیجی (برند ایمونوژین) که سالانه حدود ۶۰ میلیون یورو برای کشور ارزبری دارند، از ماه گذشته وارد بازار کشور شدند.
محمدحسین متولی در گفتوگو با خبرنگار فانا افزود: طبق برنامهریزیهای انجام شده قرار است ظرفیت پالایشگاه پلاسمای نوژین زیست فارمد تا سال ۱۴۰۵ به سالانه ۳۵۰ هزار لیتر برسد.
@irbioinformatics
با افتخار آلبومین و آیویآیجی (ivig) تولید شده در بزرگترین پالایشگاه پلاسمای ایران وارد بازار شدند
مدیرعامل شرکت نوژین زیست فارمد از ورود محصولات بزرگترین پالایشگاه پلاسمای کشور به بازار در ماه گذشته خبر داد و گفت: پالایشگاه پلاسمای نوژین زیست فارمد با ظرفیت پالایش سالانه ۱۵۰ هزار لیتر پلاسما احداث شده است که تا سال آینده به ظرفیت کامل تولید خواهد رسید. همچنین دو محصول کنونی این پالایشگاه شامل آلبومین (برند آلبوژین) و آیویآیجی (برند ایمونوژین) که سالانه حدود ۶۰ میلیون یورو برای کشور ارزبری دارند، از ماه گذشته وارد بازار کشور شدند.
محمدحسین متولی در گفتوگو با خبرنگار فانا افزود: طبق برنامهریزیهای انجام شده قرار است ظرفیت پالایشگاه پلاسمای نوژین زیست فارمد تا سال ۱۴۰۵ به سالانه ۳۵۰ هزار لیتر برسد.
@irbioinformatics
👍6❤2
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🤖سریعترین ربات انساننمای جهان با سرعت ۱۳ کیلومتربرساعت
دانشمندان شرکت چینی Robot Era ربات انساننما جدیدی به نام STAR1 را به نمایش گذاشتهاند که میتواند با حداکثر سرعت ٣.۶ متردرثانیه (۱۳ کیلومتربرساعت) بدود. اگرچه این ربات با کمک نوعی کفش توانسته به چنین سرعتی دست یابد، سریعترین ربات در نوع خود محسوب میشود.
قد این ربات ١٧١ سانتیمتر اعلام شده و ۶۵کیلوگرم وزن دارد. در ویدیوی پایین، دانشمندان دو ربات STAR1 را در صحرای گبی در شمال غربی چین مقابل یکدیگر قرار دادند.
دانشمندان شرکت چینی Robot Era ربات انساننما جدیدی به نام STAR1 را به نمایش گذاشتهاند که میتواند با حداکثر سرعت ٣.۶ متردرثانیه (۱۳ کیلومتربرساعت) بدود. اگرچه این ربات با کمک نوعی کفش توانسته به چنین سرعتی دست یابد، سریعترین ربات در نوع خود محسوب میشود.
قد این ربات ١٧١ سانتیمتر اعلام شده و ۶۵کیلوگرم وزن دارد. در ویدیوی پایین، دانشمندان دو ربات STAR1 را در صحرای گبی در شمال غربی چین مقابل یکدیگر قرار دادند.
👍5
فرقی نمیکند آغازِ هفته باشد یا پایانش
صبح باشد یا شب
بذرِ امید؛ نه وقت میشناسد
نه موقعیت
هر وقت بکاری
شبیه لوبیای سحر آمیز،
با اولین طلوع آفتاب خواستن؛
جوانه میزند...
وتا آسمان موفقیت و توانستن
اوج میگیرد...
هرگز ناامید نباش...!!!
ناامیدی، تیشهی بی رحمیست؛
به جان ریشهی شعور و خوشبختیات...
پس تا دیر نشده،
بذر جادویی امیدت را بکار،
و معجزههایت را دروکن...!
صبح جمعهتون بخیر😍
صبح باشد یا شب
بذرِ امید؛ نه وقت میشناسد
نه موقعیت
هر وقت بکاری
شبیه لوبیای سحر آمیز،
با اولین طلوع آفتاب خواستن؛
جوانه میزند...
وتا آسمان موفقیت و توانستن
اوج میگیرد...
هرگز ناامید نباش...!!!
ناامیدی، تیشهی بی رحمیست؛
به جان ریشهی شعور و خوشبختیات...
پس تا دیر نشده،
بذر جادویی امیدت را بکار،
و معجزههایت را دروکن...!
صبح جمعهتون بخیر😍
👍7🥰1
ملا نصرالدین از همسایه اش دیگی قرض گرفت،پس از چند روز دیگ را به همراه دیگ کوچکی به او پس داد.
وقتی همسایه قضیه دیگ اضافی را پرسید،ملا گفت:دیگ شما درخانه ما وضع حمل کرد.
چند روز بعد،ملا دوباره برای قرض گرفتن دیگ به سراغ همسایه رفت وهمسایه خوش خیال این بار دیگی بزرگتر به ملا داد
به این امید که دیگچه بزرگتری نصیبش شود.
تا مدتی از ملانصر الدین خبری نشد،همسایه به در خانه او رفت وسراغ دیگ خود را گرفت.ملا گفت:دیگ شما موقع وضع حمل در خانه ما فوت کرد😊
همسایه گفت:مگر دیگ هم میمیرد؟چرا مزخرف می گویی!!!
ملا گفت: چرا روزی که گفتم دیگ تو زاییده نگفتی دیگ نمیزاید.دیگی که میزاید حتما مردن هم دارد😄
این حکایت بعضی از ماست که هرجا به نفعمان باشد عجیب ترین دروغ ها و داستان ها راباور میکنیم اما کوچکترین ضررها را برنمی تابیم.
#اندرز_روز
وقتی همسایه قضیه دیگ اضافی را پرسید،ملا گفت:دیگ شما درخانه ما وضع حمل کرد.
چند روز بعد،ملا دوباره برای قرض گرفتن دیگ به سراغ همسایه رفت وهمسایه خوش خیال این بار دیگی بزرگتر به ملا داد
به این امید که دیگچه بزرگتری نصیبش شود.
تا مدتی از ملانصر الدین خبری نشد،همسایه به در خانه او رفت وسراغ دیگ خود را گرفت.ملا گفت:دیگ شما موقع وضع حمل در خانه ما فوت کرد😊
همسایه گفت:مگر دیگ هم میمیرد؟چرا مزخرف می گویی!!!
ملا گفت: چرا روزی که گفتم دیگ تو زاییده نگفتی دیگ نمیزاید.دیگی که میزاید حتما مردن هم دارد😄
این حکایت بعضی از ماست که هرجا به نفعمان باشد عجیب ترین دروغ ها و داستان ها راباور میکنیم اما کوچکترین ضررها را برنمی تابیم.
#اندرز_روز
😁7
معرفی ژورنال
ژورنال Mobile DNA یکی از ژورنال های مجموعه BMC است که توسط انتشارات اشپرینگر چاپ می شود و حوزه تخصصی مطالبی که در این مجله چاپ می شود در رابطه با عناصر جهنده ژنومی است. این ژورنال عوامل دخیل در تشکیل و حرکت و تنظیم رفتار عوامل جهنده ژنتیکی چه در پروکاریوت ها و چه در یوکاریوت ها را چاپ می کند.
اگر در پایان نامه یا پروژه خود دیتاهایی دارید که در رابطه با عناصر جهنده ژنومی مانند ترانسپوزون ها، عوامل LTR، عومل LINE & SINE و ... است می توانید شانس خود را برای چاپ داده های مورد نظر در این ژورنال را امتحان کنید.
ایمپکت فاکتور این ژورنال 4.7 می باشد زمان تصمیم گیری برای چاپ یا عدم چاپ مقاله در این ژورنال تنها 6 روز است و پروسه سابمیت تا اکسپت در آن 96 روز طول می کشد.
@irbioinformatics
ژورنال Mobile DNA یکی از ژورنال های مجموعه BMC است که توسط انتشارات اشپرینگر چاپ می شود و حوزه تخصصی مطالبی که در این مجله چاپ می شود در رابطه با عناصر جهنده ژنومی است. این ژورنال عوامل دخیل در تشکیل و حرکت و تنظیم رفتار عوامل جهنده ژنتیکی چه در پروکاریوت ها و چه در یوکاریوت ها را چاپ می کند.
اگر در پایان نامه یا پروژه خود دیتاهایی دارید که در رابطه با عناصر جهنده ژنومی مانند ترانسپوزون ها، عوامل LTR، عومل LINE & SINE و ... است می توانید شانس خود را برای چاپ داده های مورد نظر در این ژورنال را امتحان کنید.
ایمپکت فاکتور این ژورنال 4.7 می باشد زمان تصمیم گیری برای چاپ یا عدم چاپ مقاله در این ژورنال تنها 6 روز است و پروسه سابمیت تا اکسپت در آن 96 روز طول می کشد.
@irbioinformatics
👍6
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
معرفی ژورنال ژورنال Mobile DNA یکی از ژورنال های مجموعه BMC است که توسط انتشارات اشپرینگر چاپ می شود و حوزه تخصصی مطالبی که در این مجله چاپ می شود در رابطه با عناصر جهنده ژنومی است. این ژورنال عوامل دخیل در تشکیل و حرکت و تنظیم رفتار عوامل جهنده ژنتیکی چه…
معرفی مقاله
A beginner’s guide to manual curation of transposable elements
در مطالعه عناصر ترانسپوزون (TEs)، ایجاد یک مجموعه با اعتماد بالا از توالیهای توافقی که تنوع عناصر ترانسپوزون موجود در یک ژنوم خاص را نشان میدهد، گام کلیدی در مسیر بررسی این عناصر جذاب ژنومی است. الگوریتمها و ابزارهای متعددی برای شناسایی خودکار خانوادههای احتمالی ترانسپوزون در یک ژنوم در دسترس هستند. با وجود این منابع ارزشمند، تولید یک کتابخانه از توالیهای توافقی کامل و با کیفیت بالا از عناصر ترانسپوزون همچنان عمدتاً فرآیندی نیازمند بررسی و ویرایش دستی است. این دانش معمولاً به صورت تجربی از مربی به شاگرد در گروههای تحقیقاتی منتقل میشود که دسترسی افراد خارج از این حوزه به این مهارت تخصصی را دشوار میسازد....در این مقاله این مورد به دقت توضیح داده شده است.
@irbioinformatics
A beginner’s guide to manual curation of transposable elements
در مطالعه عناصر ترانسپوزون (TEs)، ایجاد یک مجموعه با اعتماد بالا از توالیهای توافقی که تنوع عناصر ترانسپوزون موجود در یک ژنوم خاص را نشان میدهد، گام کلیدی در مسیر بررسی این عناصر جذاب ژنومی است. الگوریتمها و ابزارهای متعددی برای شناسایی خودکار خانوادههای احتمالی ترانسپوزون در یک ژنوم در دسترس هستند. با وجود این منابع ارزشمند، تولید یک کتابخانه از توالیهای توافقی کامل و با کیفیت بالا از عناصر ترانسپوزون همچنان عمدتاً فرآیندی نیازمند بررسی و ویرایش دستی است. این دانش معمولاً به صورت تجربی از مربی به شاگرد در گروههای تحقیقاتی منتقل میشود که دسترسی افراد خارج از این حوزه به این مهارت تخصصی را دشوار میسازد....در این مقاله این مورد به دقت توضیح داده شده است.
@irbioinformatics
👍6
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
جنگجوی زندگیتون باشین همیشه همه جا🤞💪
❤7👍3
مراحل انجام آنالیز داده های RNAseq
برای هر مرحله ابزارهای مختلفی وجود دارد که در ادامه به توضیح روش ها و ابزارهای موجود حواهیم پرداخت
@irbioinformatics
برای هر مرحله ابزارهای مختلفی وجود دارد که در ادامه به توضیح روش ها و ابزارهای موجود حواهیم پرداخت
@irbioinformatics
👍3🔥2🙏2