میدونستید...؟ 58% از افراد به دلیل فرهنگ کاری سمی شغل خود را ترک می‌کنند.
70% از کارمندان احساس می‌کنند که درگیر مدیریت جزئی هستند.
65% از کارکنان از فرسودگی شغلی رنج می‌برند.
@irbioinformatics

بیماری رینیت آلرژیک ممکن است باعث احتقان بینی، آبریزش بینی، عطسه و خارش چشم‌ها، بینی و گلو شود.

این صفحه بیماران ژورنال JAMA به توصیف رینیت آلرژیک و عوامل خطر، تشخیص و درمان آن می‌پردازد.
مجله JAMA یکی از مجلات علمی در حوزه علوم پزشکی و علوم پایه است و ایمپکت فاکتور این ژورنال 63.1 می باشد.
@irbioinformatics

سلام بر امیدهای جوانه زده و لبخندهای پر از امید، صبحتون به خیر و شادی رفقا، ارزوی یک روز خوب و پر نشاط و پر از موفقیت و حس خوب برای همه ی شما عزیزان❤️🌷،

📚 آشنایی با مقاله پایه ای و نحوه استفاده از آن

اکثر دانشجویان موقع انتخاب عنوان برای پایان نامه، به مشکل بر میخورند. اما از کجا باید شروع کرد؟ چه موضوعی را باید به عنوان موضوع پایان نامه انتخاب کرد؟ چطور موضوعی را انتخاب کنیم که اطمینان داشته باشیم تا آخر می توانیم آن را انجام دهیم؟ چطور مدل مفهومی و روش تحقیق پایان نامه را از همین ابتدا مشخص کنیم؟ برای پاسخ به این سوالات، مقاله پایه ای می تواند به شما کمک زیادی کند.


⭕ مقاله پایه ای معمولا یک مقاله ی به روز و غیر فارسی (به علت تکراری بودن پژوهش های داخلی انجام شده) است که نهایتا مربوط به چند سال قبل تا الان است


⚫ علاوه بر جدید بودن و به روز بودن، مقاله پایه ای باید ویژگی های زیر را دارا باشد تا بتوان از آن به عنوان مبنایی برای کار پایان نامه استفاده کرد:

● حاوی مدل مفهومی است.
● چارچوب نظری دارد.
● فرایند انجام کار را به روشنی توضیح داده است.
● حاوی ابزار جمع آوری اطلاعات است. مثلا اگر ابزار جمع آوری اطلاعات پرسش نامه است، باید سوالات پرسش نامه در مقاله پایه ای آمده باشند.
● روش تحقیق را به خوبی توضیح داده است و روش های آماری مورد استفاده در آن مشخص هستند.
● در عنوان و مدل مفهومی، معمولا ارتباط یا اثر چند متغییر جدید سنجیده شده است.
● حاوی جامعه، نمونه و روش نمونه گیری است.

20 ابزار مفید هوش مصنوعی برای دانشجویان

1. Perplexity.ai
2. Hissab.io
3. Otter.ai
4. Stepwisemath.ai
5. Scholarcy.com
6. Caktus.ai
7. Bookai.chat
8. Chatdoc.com
9. Textero.ai
10. Scienceos.ai
11. gamma.app
12. Plaito.ai
13. HeyScience.ai
14. Wisdolia.com
15. Duolingo.com
16. Knowji.com
17. Quillbot.com
18. Consensus.app
19. Knewton.com
20. Grammarly.com


@irbioinformatics

دوستی میگفت من اگر با آدمی در مورد موضوعی بحث کنم هیچوقت به خاطر اهمیت موضوع نیست، به خاطر اهمیت اون آدم است.
هیچ موضوعی ارزش بحث‌کردن ندارد! اگرکسی باهاتون بحثی میکنه چه بسا برای اون شخص مهم هستید که مخاطب بحثش هستین😘🤏♧

ای مهربان‌تر از برگ، در بوسه‌های باران!
بیداری ستاره، در چشم جویباران!
آیینه‌ی نگاهت، پیوند صبح و ساحل
لبخند گاه‌گاهت، صبحِ ستاره‌ باران
بازآ که در هوایت، خاموشی جنونم،
فریادها برانگیخت از سنگ کوهساران
ای جویبار جاری! زین سایه برگ مگریز
کاینگونه فرصت از کف، دادند بی‌شماران
گفتی: به روزگاران مهری نشسته گفتم:
بیرون نمی‌توان کرد حتی به روزگاران
بیگانگی ز حد رفت، ای آشنا مپرهیز
زین عاشق پشیمان، سر خیل شرمساران
پیش از من و تو بسیار، بودند و نقش بستند
دیوار زندگی را زین‌گونه یادگاران
وین نغمه‌ی محبت بعد از من و تو ماند
تا در زمانه باقیست آواز باد و باران

معرفی نرم افزار movibox
یکی از بهترین اپ های اندروییدی برای مشاهده فیلم و سریال در هر ژانری که علاقه دارین، اونم به صورت رایگان. خیلی عالیه فیلم هاش واقعا برای تمرین زبان عالیه

👇

نرم افزار movibox نسخه درنا ورژن ۲
برای استفاده ابتدا نرم افزار را روی گوشی اندرویید خود نصب کنید سپس فیلترشکن خاموش کنید و استفاده کنید

#ایرانشناسی
‏این فریدونشهر اصفهان هم شهر جالبیه، مرتفع‌ترین شهر و بام ایران با ۲۵۵۰ متر ارتفاع از سطح دریا،  ۹۰ درصد مردمش هم گرجی هستن که زمان شاه عباس از گرجستان به اینجا آوردنشون، حتی رئیس جمهور و رئیس مجلس و سفیرای گرجستان هم از این شهر دیدن کردن. جالبه بدونین این شهر نامزد امن ترین شهر دنیا از طرف یونیسکو هم بوده❤️


[‌‎اسم گرجیش‌رو ویکیپدیا نوشته بود مارتقُپی به معنی تنها]

کجا احساس برتری کنیم؟

این سی ثانیه به تنهایی افتخار موسیقی ایرانه😍

توصیه اکید میشه تک تک این PCR ها رو بلد باشید
Knowledge is power
اینجا معنی پیدا میکنه


----------------------------------

کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics

امروز رفتم تهران ‏مثل یک جنتلمن واقعی سوار مترو و اتوبوس می‌شی و شبیه یه بی‌خانمان ازش پیاده می‌شی😒🤏🧎‍➡️

‌
#معین

آهنگ #شوق_سفر

🏢 4th International Conference of Iranian Bioinformatics
💥Accepts Bioinformatics and Computational Biology papers

🗓 Date: 4-6 February, 2024
📍Location: In-Person & Virtual
💣 Extended deadline submission: 2024-11-21

🌐 More information and conference website:
Icb13.znu.ac.ir

📲Channel: @irBioinformatics
#conference #iran

مرگِ ما درست از روزی آغاز می‌شود
که در برابر آنچه مهم است؛
سکوت مى‌كنیم...



مارتین لوتر

دانلود و نصب SRAtoolkit در لینوکس برای دریافت داده های RNAseq، اگزوم، و ژنوم

همانطور که می دونین برای دریافت داده های SRA به یک ابزار نیاز دارین که بتونین به عنوان رابط سیستمتون و پایگاه داده SRA اطلاعات ترانسفر کنین. برای این کار ابزار SRAtoolkit توسعه داده شده ابزار خیلی خوب و سبکیه و میتونین ازش به راحتی استفاده کنین. قبل از استفاده از SRAtoolkit به چند نکته دقت داشته باشین.
-----------------------------------------------------
1- ابزار رایگانه
2- اندازه داده های موجود در SRA با چیزی که روی سیستم شما منتقل میشه یکی نیست. چون به صورت نرمال در SRA برای کاهش حجم داده های سابمیت شده، سایزشون در کمترین حالت ممکن فشرده میشه. ی جوری که انقدر فایل بدبخت میچلونن که جاش بدن ی گوشه. بنابراین اگر ی فایلی دانلود کردین مثلا توی SRA نوشته 10 گیگ، مطمن باشین روی سیستم شما اندازش بیش از 12 گیگه پس اگر مرحله دانلود طول کشید دپرس نشین و ی دفه ابزار ببندین. لدفنی ارامش خودتون رو حفظ کنین 😁
3- داده های SRA حجمشون متغییره. برای ژنوم ویروس ها اندازه ها خیلی کمه، برای باکتری بزرگتر میشه، برای سلول گیاهی خیلی بزرگتر میشه و همینطور ادامه داره.
4- به صورت نرمال داده های توالی ژنی (ی ژن) کوچیکه. بعدش فایل های اگزوم کوچیکتر از RNAseq هستن، فایل های ژنوم بزرگتر از هر دوتاش هستش و همینطور سازماندهی فایل ها تغییر میکنه. پس زیاد نگران چیزی نباشین
-----------------------------------------------------
برای دانلود SRAtoolikt با کلیدهای ترکیبی ctrl T N میتونین ترمینال رو باز کنین یا اینکه روی ایکونش کلیک کنین باز بشه. بعد به ترتیب زیر ابزار رو دانلود کنین.

اول از دستور wget فایل سورسش رو بگیرین. اینجا من نسخه 2.11 رو دانلود کردم. شما میتونین نسخه 3 رو دانلود کنین فرقی زیاد باهم ندارن فقط یسری ابزار جدید به نسخه های بالاتر اضافه میشه و هی میان سرعت ترانسفر توشون تغییر میدن.
-----------------------------------------------------
$ wget https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.11.3/sratoolkit.2.11.3-ubuntu64.tar.gz
-----------------------------------------------------
مرحله بعد بیاین فایلی ک در مسیر /usr/downloads دانلود کردین رو از حالت فشرده با دستور زیر خارج کنین
-----------------------------------------------------
$ tar -zxvf sratoolkit.2.11.3-ubuntu64.tar.gz
-----------------------------------------------------
بعدش با دستور cd برین توی پوشه ای که از حالت فشرده خارج شده و در نهایت با ی دستور cd دیگه برین تو پوشه bin بعدش بیاین با دستور pwd مسیرشو تو ترمینال مشخص کنین. برای اینکار کافیه فقط برین تو پوشه bin و توی ترمینال تایپ کنین pwd خودش مسیر بهتون میده حالا باید مسیر پوشه bin رو اکسپورت کنین و در فایل bashrc ذخیره کنین و بعدم توی ترمینال اون رو source کنین که برای همیشه در دسترس باشه. دقت کنین بجای your path to ادرسی که توی ترمینالتون نشون داده میشه رو بزنین. الان که ادرس رو پیدا کردین خیلی راحت میتونین اونو اکسپورت کنین و بزنین به رگ😁
-----------------------------------------------------
export PATH=$PATH:/your path to/sratoolkit.2.11.3-ubuntu64/bin
-----------------------------------------------------
ترمینال ببندین و دوباره باز کنین و توی ترمینال بزنین fastq-dump -V. بعدش اگر همه چی درست انجام داده باشین بهتون ورژنی که نصب کردین رو میده و از الان ب بعد هرجا ک دلتون خواست میتونین رانش کنین. تو هر پوشه ای. فقط یادتون باشه فایل ک از حالت فشرده خارج کردین از مسیر ک به بش دادین رو حذف نکنین چون حذفش کنین دیگه خدابهتون رحم کنه 😂 به همین صورت میتونین در عرض کمتر از 10 دقیقه ابزار رو دانلود و نصب کنین و برین تو کار داده ها.

من مطمنم دو سه بار باهاش خوب کار کنین خیلی خفن یاد میگیرین. نیازم نیست هیچ هزینه ای بدین برین جایی شرکت کنین یاد بگیرین مثلا یه نصف روز بهتون آموزش نصب SRA بگن. خیلی تمیز و شیک و مجلسی با همین چندتا دستور نصب و رانش کنین. فقد و فقد ی چیزی اونم اینه اگر از HPC استفاده میکنین یادتون باشه تو مسیر ROOT نصبش نکنین چون باید شما وقتی SRAtoolkit رو دانلود میکنین و مسیر پوشه bin رو به فایل بش ار سی اضافه میکنن جوری تعریف کنین که رو همه هسته های HPC شما قابل دسترسی باشه.

بنابراین از کارشناس محترم HPCتون بپرسین تو چه مسیری نرم افزارا رو نصب میکنه. که دقیقا تو همون مسیر انجامش بدین. بعدم اینکه در سنتوس ممکنه ازتون بخواد کامپایلر gccتون رو اپدیت کنین میتونین با دستور yum اپدیتش کنین و بدون هیچ مشکلی رانش کنین.

انصافا برای ما هم ارزوهای قشنگ بکنین که بتونیم براتون باز مطالب خوب بزاریم ❤
@irbioinformatics

ابزار Gephi برای ترسیم شبکه های بیولوژیکی

یکی از ابزارهای خوب که اخیرا برای مشاهده شبکه های بیولوژیکی توسعه داده شده است ابزار gephi است. این ابزار از انواع مختلف شبکه های همسو و ناهمسو پشتیبانی می کند و می توان از آن برای انالیز داده های اینتراکتوم استفاده کرد. با این حال در مقایسه با pathvisio و cytoscape از امکانات و جلوه های گرافیکی کمتری برخوردار است، و به هر حال می توان از آن برای بررسی شبکه ها ی زیستی استفاده کرد. این ابزار در رده ابزارهای با لول متوسط از لحاظ امکانات طبقه بندی می شود
لینک دانلود:
https://gephi.org/


@irbioinformatics