تحقیقات روی ماده شیمیایی تولید شده توسط قارچ کرم ابریشم نشان داده است که این ماده چگونه می‌تواند به عنوان یک درمان برای سرطان عمل کند. این ماده سیگنال‌های رشد سلولی که در سرطان بیش‌فعال هستند را مختل می‌کند و می‌تواند در مقایسه با بسیاری از درمان‌های موجود، آسیب کمتری به بافت‌های سالم وارد کند.

دانشمندان دانشکده داروسازی دانشگاه ناتینگهام در حال بررسی اثرات قارچ انگل‌گونه‌ای هستند که روی کرم‌های ابریشم رشد می‌کند و ممکن است به‌عنوان یک درمان بالقوه برای طیف وسیعی از بیماری‌ها کاربرد داشته باشد. آن‌ها به‌ویژه در حال مطالعه ماده کوردیسپین هستند که یکی از ترکیبات موجود در این قارچ‌هاست. این تحقیق در مجله FEBS Letters منتشر شده است

قارچ‌های کرم ابریشم در آسیا به عنوان غذای سلامت‌بخش و داروی سنتی شهرت دارند. کوردیسپین، که توسط قارچ Cordyceps militaris تولید می‌شود – قارچی نارنجی رنگ که کرم‌های ابریشم را آلوده می‌کند – در مطالعات مختلفی به عنوان داروی ضد سرطان نویدبخش بوده است، اما تاکنون نحوه عملکرد آن مشخص نبوده است.

تیم تحقیقاتی انجام دهنده این مطالعه با استفاده از تکنیک‌های پیشرفته توانستند اثرات کوردیسپین را بر فعالیت هزاران ژن در چندین رده سلولی اندازه‌گیری کنند. نتایج مقایسه اثرات کوردیسپین با سایر درمان‌ها در پایگاه‌های داده نشان داد که کوردیسپین از طریق تأثیرگذاری بر مسیرهای القاکننده رشد در سلول‌ها عمل می‌کند.

با بررسی نحوه عملکرد کوردیسپین درون سلول، تیم تحقیقاتی تأیید کرد که کوردیسپین به کوردیسپین تری‌فسفات تبدیل می‌شود که آنالوگی از حامل انرژی سلول، یعنی ATP است. کوردیسپین تری‌فسفات به عنوان عامل احتمالی اثرات آن بر رشد سلولی شناسایی شد و به این ترتیب، به عنوان مولکولی که می‌تواند مستقیماً بر سلول‌های سرطانی تأثیر بگذارد، معرفی شد.

دکتر کورنلیا د مور، از دانشکده داروسازی دانشگاه ناتینگهام که این پژوهش را رهبری کرده است، توضیح می‌دهد: «ما سال‌هاست که در حال تحقیق روی اثرات کوردیسپین بر طیف وسیعی از بیماری‌ها هستیم و با هر گام به درک نحوه استفاده از آن به عنوان یک درمان مؤثر نزدیک‌تر می‌شویم. یکی از نکات هیجان‌انگیز این است که انجام این آزمایش‌های بزرگ اکنون آسان‌تر و ارزان‌تر شده است، بنابراین توانستیم هزاران ژن را به‌طور همزمان بررسی کنیم.

داده‌های ما تأیید می‌کند که کوردیسپین نقطه شروع خوبی برای داروهای نوین ضد سرطان است و اثرات مفید آن را توضیح می‌دهد. به عنوان مثال، مشتقات کوردیسپین می‌توانند به تولید فرم تری‌فسفات این دارو هدف‌گذاری کنند تا اثر مشابهی داشته باشند. علاوه بر این، این داده‌ها به پایش اثرات کوردیسپین در بیماران کمک خواهد کرد، زیرا داده‌های ما نشان می‌دهند که برخی ژن‌ها به‌طور قابل اعتمادی به کوردیسپین پاسخ می‌دهند، که می‌توان آن‌ها را مثلاً در سلول‌های خونی اندازه‌گیری کرد.»

#خبر
تدوین: ادامین کانال
🤏⭕️ارتباط میان سنتز کلسترول و سرطان
در یک مطالعه جدید ارتباط مهمی بین سرطان، سلول‌های بنیادی و اجزای سازنده کلسترول ارائه شده است. به‌طور خاص، این تحقیق نشان می‌دهد که آنزیم FAXDC2 چگونه از طریق نقش خود در سنتز کلسترول، بر رشد و تمایز سلول‌های سرطانی تأثیر می‌گذارد. این یافته‌ها رویکردهای جدیدی را برای درمان سرطان پیشنهاد می‌دهند.
این مطالعه به تشریح زنجیره‌ای از رویدادهای مولکولی می‌پردازد که از سرکوب FAXDC2 آغاز شده و به اختلال در سنتز طبیعی کلسترول و تغییرات سرنوشت سلول‌های سرطانی منتهی می‌شود. این تحقیق بر آسیب‌پذیری احتمالی در سلول‌های سرطانی تأکید دارد که می‌تواند به عنوان هدفی برای مداخله درمانی شناسایی شود

🚩 کتاب مبانی PCR و طراحی پرایمر تالیف مهندس حسن رسولی و دکتر فاطمه دهقان نیری

🧬 راهنمای جامع آزمایشگاه مولکولی برای یادگیری مراحل تکثیر ژن، اشنایی با طراحی پرایمر، ژنومیکس مقایسه ای، مارکرهای مولکولی و ...

🔑 قابل استفاده برای تمامی دانشجویان علاقه مند به مباحث مولکولی

📦 روش تهیه کتاب: متقاضیان ارجمند می توانند به یکی از سه طریق زیر این کتاب را تهیه نمایند:

۱-مراجعه مستقیم به آدرس انتشارات در خیابان انقلاب: خیابان انقلاب-روبروی دبیرخانه دانشگاه تهران-ساختمان ولیعصر، پلاک ۱۴، طبقه دوم، دفتر مرکزی انتشارات آثار سبحان.

۲- سفارش از طریق واتس اپ: درخواست کتاب با ثبت سفارش از طریق شماره ۰۹۰۱۳۱۰۵۰۳۹

۳-سفارش انلاین از طریق آدرس سایت انتشارات:
www.asaresobhan.com


@irbioinformatics

آلودگی های پلاستیکی تأثیرات تمام مرزهای سیاره‌ای را بدتر می‌کند.
تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران

یک مقاله جدید نشان می‌دهد که آلودگی پلاستیکی به صورت چشمگیری اثرات مخرب بر روی تمام مرزهای سیاره‌ای، از جمله تغییرات اقلیمی، اسیدی شدن اقیانوس‌ها و از دست رفتن تنوع زیستی را تشدید می‌کند. پیش از مذاکرات نهایی پیمان بین‌المللی پلاستیک، محققان از تصمیم‌گیران می‌خواهند که به آلودگی پلاستیکی فقط به‌عنوان یک مشکل مدیریت پسماند نگاه نکنند.

پاتریشیا ویاروبیا-گومز، نویسنده اصلی مقاله از مرکز تاب‌آوری استکهلم، می‌گوید: "ضروری است که به کل چرخه حیات پلاستیک‌ها توجه کنیم، از استخراج سوخت فسیلی گرفته تا تولید اولیه پلیمرهای پلاستیکی." پلاستیک‌ها به آن اندازه که قبلاً تصور می‌شد ایمن و خنثی نیستند. مقاله پژوهشی جدید که توسط یک تیم بین‌المللی از محققان نوشته شده، از چارچوب مرزهای سیاره‌ای برای ساختاربندی شواهد فزاینده اثرات پلاستیک بر محیط زیست، سلامت و رفاه انسانی استفاده می‌کند. سالانه ۵۰۰ میلیون تن پلاستیک تولید می‌شود، اما تنها ۹ درصد از آن‌ها در سطح جهانی بازیافت می‌شود. پلاستیک‌ها همه جا هستند: از قله کوه اورست تا عمیق‌ترین نقطه گودال ماریانا.
تیم تحقیقاتی از طریق بررسی تحلیلی مطالعات علمی درباره تأثیرات پلاستیک‌ها در محیط طبیعی نشان می‌دهد که آلودگی پلاستیکی فرآیندهای کل سیستم زمین را تغییر می‌دهد و بر همه مشکلات مهم زیست‌محیطی جهانی، از جمله تغییرات اقلیمی، از دست رفتن تنوع زیستی، اسیدی شدن اقیانوس‌ها، و استفاده از آب شیرین و زمین تأثیر می‌گذارد.

این مقاله با عنوان "Plastics pollution exacerbates the impacts of all planetary boundaries" بر ضرورت درک پیچیدگی پلاستیک‌ها تأکید دارد. به‌عنوان موادی مبتنی بر پلیمرهای مصنوعی که با هزاران ماده شیمیایی دیگر همراه هستند، تأثیرات پلاستیک‌ها در تمام چرخه حیات این محصولات و مواد رخ می‌دهد
پاتریشیا ویاروبیا-گومز، دانشجوی دکتری در مرکز تاب‌آوری استکهلم در دانشگاه استکهلم، می‌گوید: "پلاستیک‌ها به‌عنوان محصولاتی بی‌اثر دیده می‌شوند که از محصولات محبوب ما محافظت می‌کنند یا زندگی ما را آسان‌تر می‌کنند و به‌راحتی قابل پاک‌سازی هستند هنگامی که به زباله تبدیل شوند. اما این دیدگاه بسیار دور از واقعیت است. پلاستیک‌ها از ترکیب هزاران ماده شیمیایی ساخته شده‌اند. بسیاری از این مواد، مانند مختل‌کننده‌های غدد درون‌ریز و مواد شیمیایی ماندگار، دارای سمیّت و زیان برای اکوسیستم‌ها و سلامت انسان هستند. ما باید پلاستیک‌ها را به‌عنوان ترکیبی از این مواد شیمیایی ببینیم که روزانه با آن‌ها تعامل داریم."

دزدا دنبال این پسر ۲۸ساله کردن یارو رفت تو خونه با ار‌پی‌جی برگشت 😂 آرپیجی داشت تو خونه ش 😂🤏🔫

آیا می دانید فرایند دیالیز چگونه کار می کند؟ در این مقاله مروری که در ژورنال جاما چاپ شده است چگونگی این فرایند تشریح شده است.

#خبر
تهیه و تدوین: ح. رسولی دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی دانشگاه تربیت مدرس تهران
در شرایط خاص، اصلاح هدفمند بخش‌های معیوب در ژنوم می‌تواند منجر به بروز نقص‌های ژنتیکی جدید شود. این مسئله توسط یک تیم از دانشگاه زوریخ (UZH) در مورد بیماری ارثی نادر به نام گرانولوماتوز مزمن گزارش شده است.
موضوع از این قراره که اخیرا محققان سویسی با استفاده از تکنولوژی کریسپر توانستند یک ایراد ژنتیکی را برطرف کنند، اما به ناگاه متوجه شدند درست شدن ایراد ژنتیکی همانا یه بخش قضیه هستش و وقوع یک ایراد جدیدتر بخش دیگر قضیه. این گزارش به عنوان اولین اثر جانبی تکنولوژی کریسپر در مطالعات بالینی در هفته های گذشته منتشر شده است.

#خبر-علمی
پژوهشگران انستیتو Hubrecht دریافته‌اند که نحوه بسته‌بندی DNA در سلول‌ها می‌تواند مستقیماً بر سرعت تکثیر DNA در حین تقسیم سلولی تأثیر بگذارد. آن‌ها گزارش کرده‌اند که بسته‌بندی DNA از طریق یک مسیر غیرمعمول سیگنال‌هایی ارسال می‌کند که بر توانایی سلول برای تقسیم و رشد اثر می‌گذارد. این کشف راه‌های جدیدی را برای بررسی ارتباط بین تکثیر DNA و بسته‌بندی آن باز می‌کند. این یافته‌ها ممکن است در آینده به دانشمندان کمک کنند تا درمان‌ها و داروهایی برای بیماری‌هایی مانند سرطان پیدا کنند.

#دانستنی‌ها
مسیرهای سیگنالینگ وابسته به G پروتئین ها از مهمترین مسیرهای زیستی در سلول های گیاهی هستند. اگرچه سلول‌های گیاهی بیشتر عناصر اصلی موجود در سیگنال‌دهی G پروتئین های حیوانی را دارند، تفاوت‌های موجود در معماری شبکه و ویژگی‌های ذاتی عناصر پروتئین G در گیاهان، سیگنال‌دهی G را در سلول‌های گیاهی از مدل حیوانی متمایز می‌سازد. بر خلاف پروتئین‌های G حیوانی، پروتئین‌های G گیاهی به‌طور خودکار فعال می‌شوند و به همین دلیل، تنظیم فعال‌سازی G در گیاهان در مرحله غیرفعال‌سازی رخ می‌دهد. خاصیت خودفعال‌شوندگی همچنین به این معناست که پروتئین‌های G گیاهی نیازی به گیرنده‌های معمولی پروتئین G در حیوانات ندارند و بنابراین فاقد آن‌ها هستند. اهداف پروتئین‌های G فعال‌شده در گیاهان، که به عنوان افکتورها نیز شناخته می‌شوند، متفاوت از افکتورها در سلول‌های حیوانی هستند. مجموعه ساده‌تری از عناصر سیگنال‌دهی G در آرابیدوپسیس باعث می‌شود که سیگنال‌دهی G در یک بستر چندسلولی راحت‌تر قابل دستکاری باشد...... مطالعه بیشتر...

همراهان عزیز پیرامون اثر جانبی #کریسپر که توسط محققان دانشگاه زوریخ سویس برای اولین بار در بازارایی کروموزومی در بیماری گرانولوماتوز گزارش شده است اطلاعات بیشتری درخواست نمودند و اکنون دوستان می توانند با مطالعه دو لینک زیر به جزییات خبر و مطالعه منتشر شده در این زمینه دست پیدا نمایند. مقاله هدف که این یافته را گزارش نموده است بر ترمیم توالی ژن NCF1 با استفاده از تکنولوژی ویرایش ژن پرداخته است که منجر به مشاهده چنین موردی در رابطه با کریسپر شده است.

لینک خبر بر روی سایت دانشگاه زوریخ سویس

لینک مقاله

@irbioinformatics

Gene editing of NCF1 loci is associated with homologous recombination and chromosomal rearrangements
🔬👇
"....In conclusion, we have shown that targeted editing of the NCF1 gene and pseudogenes on the same chromosome can correct the NCF1 ΔGT mutation but is inherently associated with the introduction of chromosomal aberrations in a fraction of the edited cells. Importantly, our presented data provided valuable insights on genome editing involving multiple on-targets on the same chromosome, such as the HBB/HBD and CCR2/CCR5 loci58,59, in which DSB-independent editing systems may be advantageous in terms of safety for future clinical application of pseudogene-associated disorders."

@irbioinformatics

📃 Protein Structure Prediction: Challenges, Advances, and the Shift of Research Paradigm

📕 Journal: Genomics, Proteomics & Bioinformatics (GPB) (I.F.=11.5)
🗓Publish year: 2023

🧑‍💻Authors: Bin Huang, Lupeng Kong, Chao Wang, ...
🏢Universities: University of Chinese Academy of Sciences, Microsoft Research AI4Science, Huawei Noah’s Ark Lab, China

📎 Study the paper

📲Channel: @irBioinformatics
#review #protein

👩‍🏫 Machine Learning and AI in Bioinformatics
💥Texas A&M University

👩‍💻 Course link

📲Channel: @irBioinformatics
#course #machine_learning #ai