آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی – Telegram
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.57K subscribers
1.57K photos
40 videos
423 files
716 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://news.1rj.ru/str/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
تغییر اندازه box plot با استفاده از متغییر dodge
با تغییر dodge از False به True می توانید مطابق تصویر اندازه باکس ها را تغییر دهید.
#add color to box plot in seaborn module
import seaborn as sns
# Load the "tips" dataset from Seaborn
df = sns.load_dataset("tips")
# Set the Seaborn style to "ticks"
sns.set_style("ticks")
# Create a boxplot with the categorical variable assigned to hue
sns.boxplot(x="day", y="total_bill", data=df, hue="day", palette="Set2", dodge=True, legend=False)
# Show the plot
sns.despine()

با ما همراه باشید.
#پایتون #dodge
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
12 ژانویه 2024
👍2
افزودن legend به باکس پلات
برای افزودن legend به باکس پلات می توانید مقدار متغییر legend را بر روی TRUE تنظیم کنید.
#add color to box plot in seaborn module
import seaborn as sns
# Load the "tips" dataset from Seaborn
df = sns.load_dataset("tips")
# Set the Seaborn style to "ticks"
sns.set_style("ticks")
# Create a boxplot with the categorical variable assigned to hue
sns.boxplot(x="day", y="total_bill", data=df, hue="day", palette="Set2", dodge=True, legend=True)
# Show the plot
sns.despine()

با ما همراه باشید.
#پایتون #legend
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
12 ژانویه 2024
👍2
استفاده از ست رنگی magma در پایتون
برای استفاده از رنگ های ست رنگی magma در پایتون می توانید مقدار palette را بر روی magma تنظیم کنید:
#add color to box plot in seaborn module
import seaborn as sns
# Load the "tips" dataset from Seaborn
df = sns.load_dataset("tips")
# Set the Seaborn style to "ticks"
sns.set_style("ticks")
# Create a boxplot with the categorical variable assigned to hue
sns.boxplot(x="day", y="total_bill", data=df, hue="day", palette="magma", dodge=False, legend=True)
# Show the plot
sns.despine()

با ما همراه باشید.
#پایتون #palette
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
12 ژانویه 2024
👍2
استفاده از طیف رنگی spectral در palette
برای استفاده از این ست رنگی کافی است مقدار palette را در کد مربوط به ترسیم باکس پلات با استفاده از ماژول seaborn بر روی spectral تنظیم کنید:
#add color to box plot in seaborn module
import seaborn as sns
# Load the "tips" dataset from Seaborn
df = sns.load_dataset("tips")
# Set the Seaborn style to "ticks"
sns.set_style("ticks")
# Create a boxplot with the categorical variable assigned to hue
sns.boxplot(x="day", y="total_bill", data=df, hue="day", palette="Spectral", dodge=False, legend=False)
# Show the plot
sns.despine()
با ما همراه باشید.
#پایتون #palette
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
12 ژانویه 2024
👍2
استفاده از ست رنگی husl
برای تغییر رنگ پلات با استفاده از husl مقدار palette را به این گرادیانت رنگی تغییر دهید
#add color to box plot in seaborn module
import seaborn as sns
# Load the "tips" dataset from Seaborn
df = sns.load_dataset("tips")
# Set the Seaborn style to "ticks"
sns.set_style("ticks")
# Create a boxplot with the categorical variable assigned to hue
sns.boxplot(x="day", y="total_bill", data=df, hue="day", palette="husl", dodge=False, legend=False)
# Show the plot
sns.despine()
با ما همراه باشید.
#پایتون #palette
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
12 ژانویه 2024
👍2
رفع ایراد:
گاهی اوقات هنگام انتخاب ست رنگی برای پلات های ترسیم شده در پایتون بخصوص باکس پلات ها با خطای پیوست مواجه می شوید. در این صورت بایستی تعداد رنگ ها را در هنگام کد نویسی براساس تعداد باکس هایی ک ترسیم می شود انتخاب کنید. فرض کنید می خواهید از ست رنگی flare استفاده کنید و خروجی پلات شما 4 باکس دارد. در این صورت بایستی کد مورد نظر به صورت زیر نوشته شود
# call seaborn module
import seaborn as sns
# Load the "tips" dataset from Seaborn
df = sns.load_dataset("tips")
# Set the Seaborn style to "ticks"
sns.set_style("ticks")
#define custom plot and paramters
custom_palette = sns.color_palette("flare", 4)
# Create a boxplot with the categorical variable assigned to hue
sns.boxplot(x="day", y="total_bill", data=df, hue="day", palette=custom_palette, dodge=False, legend=False)
# Show the plot
sns.despine()
با ما همراه باشید.
#پایتون #palette
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
12 ژانویه 2024
👍2
معرفی زبان برنامه نویسی جولیا (Julia) و کاربردهای بیوانفورماتیکی این زبان برنامه نویسی
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
12 ژانویه 2024
👍3
نصب و راه اندای زبان برنامه نویسی جولیا
امروزه بسیاری از کاربران رشته های مهندسی، علوم پایه و بخصوص بیوتکنولوژی از زبان های برنامه نویسی R و پایتون به وفور استفاده می کنند. اما همانطور که مشاهده می کنیم همه نرم افزارها با استفاده از این پلتفرم ها توسعه نیافته اند و بخش زیادی از نرم افزارهایی که در حوزه بیوانفورماتیک در یکی دو سال گذشته توسعه داده شده است به زبان برنامه نویسی جولیا بوده است.

جولیا (Julia) یک زبان برنامه‌نویسی سطح بالا با سرعت زبان‌های سطح پایین است. این زبان سینتکس (Syntax) ساده‌ای شبیه پایتون (Python) دارد و سرعت اجرای آن به زبان c نزدیک است. از قابلیت‌های این زبان می‌توان به یک کامپایلر (Compiler) پیشرفته، اجرای هم‌زمان موازی، دقت عددی و یک کتابخانه تابع گسترده ریاضی اشاره کرد،
جولیا یک زبان برنامه‌نویسی پویا و سطح بالا است که بیشتر برای مقاصد محاسبات حجم بالای علمی مورد استفاده قرار می‌گیرد. البته از جولیا می‌توان به عنوان زبان برنامه‌نویسی همه منظوره نیز استفاده کرد. ویژگی‌های جولیا: یک زبان برنامه‌نویسی متن باز با پروانه ام‌آی‌تی است.
عمده کاربرد زبان جولیا در حوزه های زیستی برای انالیز داده های big data مانند خروجی های ترانسکریپتومی، ژنومیکسی و انوتیشن و مشاهده خروجی اسمبلی می باشد. پشتیبانی فوق العاده عالی جولیا از ماژول های گرافیکی و ایجاد خروجی های با کیفیت از جمله ویژگی های ممتاز جولیا است که آن را به یک پلتفرم برنامه نویسی محبوب در میان کاربران زیستی تبدیل کرده است. در ادامه شیوه نصب و راه اندازی جولیا قرار داده شده است.

🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
12 ژانویه 2024
👍5
برای نصب جولیا مراحل زیر را انجام دهید
1- ابتدا PowerShell ویندوز را در حالت ادمین اجرا کنید.
2- به قسمت date and time سیستم عامل خود رفته و لوکیشن را به آمریکا تغییر دهید.
3- اکنون کد زیر را در ترمینال شل ویندوز وارد کنید و جولیا را نصب کنید. بسته به سرعت اینترنت شما این مرحله ممکن است چند دقیقه طول بکشد.
5- سپس یک نوتیفیکیشن برای شما ظاهر می شود و روی گزینه launch کلیک کنید تا جولیا برای شما اجرا گردد. اکنون می توانید از جولیا در محیط ویندوز استفاده کنید.
6- در صورتی که لوکیشن سیستم خود را تغییر ندهید جولیا نصب نمی شود چون بخاطر داستان تحریما... ولی در کل برنامه رایگان هستش و مشکلی نداره ازش استفاده کنین.
# install julia windows shell
> winget install julia -s msstore
با ما همراه باشید
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
12 ژانویه 2024
👍5