آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی – Telegram
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.57K subscribers
1.57K photos
40 videos
423 files
716 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://news.1rj.ru/str/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
عنوان: زیست شناسی سامانه ای و بیوانفورماتیک
شماره:8
کیفیت:HD 720
زبان: انگلیسی
کد همراه: ندارد
حجم نهایی: 32 مگابایت
نرم افزار پیشنهادی برای مشاهده فیلم: VlCPlayer
🆔@IRBioinformatics🤏😘
عنوان: راهنمای کامل کار با بسته نرم افزاری Shiny در R با تاکید بر مباحث بیوانفورماتیکی
شماره:9
کیفیت:HD 720
زبان: انگلیسی
کد همراه: دارد
حجم نهایی: 32 مگابایت
نرم افزار پیشنهادی برای مشاهده فیلم: VlCPlayer
🆔@IRBioinformatics🤏😘
👍1
RShiny-tutorial-Single-cell-genomics-dashboard-main.zip
7.3 MB
کدهای موردنیاز برای استفاده از Rshiny برای آنالیز و تجزیه و تحلیل داده های ژنومی و ترانسکریپتومی
🆔@IRBioinformatics🤏😘
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
عنوان: راهنمای کامل کار با بسته نرم افزاری Shiny در R با تاکید بر مباحث بیوانفورماتیکی
شماره:9
کیفیت:HD 720
زبان: انگلیسی
کد همراه: دارد
حجم نهایی: 32 مگابایت
نرم افزار پیشنهادی برای مشاهده فیلم: VlCPlayer
🆔@IRBioinformatics🤏😘
اخیرا محققان متوجه شده اند که در بخش کورتکس مغز فعالیت های اسرارآمیزی وجود دارد که به صورت کلیدی در ارتباط با فرآیندهایی است که تاکنون دانشمندان با آن مواجه نشده اند. قبلا دانشمندان براین باور بودند در رفتارهای شناختی و حرکتی جانداران نورون ها از نقش کلیدی برخوردار هستند، اما اخیرا مطالعات جدیدی نشان داده است نورون ها دارای حرکات فوق العاده آهسته و دسته جمعی هستند که در فضا و زمان مشخصی این رفتار نورون ها مشاهده نمی شود و تاکنون نیز ارتباط بین این رفتار نورون ها و ماهیت رفتاری جانداران در خارج از فضای مغز ارتباطی کشف نشده است....
#دانستنی_ها
#نوروساینس
#مغز
#نورون
🆔@IRBioinformatics🤏😘
دوستانی که میخان زبانشون رو تقویت کنن ولی سرمایه لازم رو برای شرکت در دوره های خصوصی ندارن و واقعا براشون سخته معلم خصوصی بگیرن و میخان خودخوان یاد بگیرن و به صورت سلف استادی برن جلو، میتونن از این ابزار خیلی خفن استفاده کنن کار باهاش راحته و برای استفاده اکادمیک خیلی خیلی زیاد عالیه. بهتون پیشنهاد میدم حتما ازش استفاده کنین.
https://www.naturalreaders.com/online/
اگر هم نیاز دارین فایل زبانی رو دانلود کنین میتونین عضو کانال زبان ما بشین و از این طریق فایل های دلخواهتون دانلود کنید
🆔@engvidcourses
🆔@IRBioinformatics🤏😘
معرفی نرم افزار Gephi
این ابزار یکی از بهترین ابزارهای مشاهده و تفسیر داده های برهمکنش ژنی و ترسیم شبکه های ژنی هستش که میتونه به صورت خیلی عالی گراف های فوق العاده با کیفیتی رو برای کاربر ترسیم کنه و کیفیت مقالات کاربران رو با توان حداکثری افزایش بده. این نرم افزار رایگانه و نیاز به نصب افزونه یا ماژول خاصی نداره و شما می تونید برای بهبود کارهاتون ازش استفاده کنید. این نرم افزار از سه پلتفرم ویندوز، مک و لینوکس پشتیبانی می کند...

در صورتی که می خواهید از دیتاست های خاصی برای کار با Gephi بهره ببرید می تاوانید از لینک زیر اقدام کنید
دسترسی به دیتاست های Gephi
🆔@IRBioinformatics🤏😘
#نرم_افزار
#شبکه_ژنی
#بیوانفورماتیک
معرفی نرم افزار Cytoscape
نرم افزار سیتوسکیپ یکی از ابزارهای بیوانفورماتیک چند منظوره است که با استفاده از امکانات آن کاربران می توانند انالیزهای ژنومی، ترانسکریپتومی و پانژنومی مختلفی را انجام دهند. با استفاده از این ابزار می توانید انواع برهمکنش های ژنی، و پروتئنی و همچنین لیگاندها و فاکتورهای رونویسی را بررسی کنید و بهترین خروجی های گرافیکی را با اعمال لایه بندی های مختلف بر روی فایل شبکه ترسیم شده در Cytoscape اعمال نمایید. برای دسترسی به این ابزار می توانید از لینک زیر استفاده کنید:
https://cytoscape.org/
در ادامه فایل نرم افزار قابل نصب بروی انواع مختلف سیستم های عامل ارائه شده است و می توانید برای اهداف مختلف از آنها استفاده کنید.

🆔@IRBioinformatics🤏😘
#نرم_افزار
#شبکه_ژنی
#بیوانفورماتیک
Cytoscape_3_10_1_windows_64bit.exe
220.2 MB
فایل نصبی آخرین ورژن برنامه cytoscape برای ویندوز 64 بیتی
🆔@IRBioinformatics🤏😘
Cytoscape_3_10_1_macos_aarch64.dmg
219.7 MB
نسخه نصبی برنامه cytoscape برای مک
Mac OS Silicon (arm64)
🆔@IRBioinformatics🤏😘
Cytoscape_3_10_1_macos_aarch64.dmg
219.7 MB
Mac OS Intel (amd64)
نسخه نصبی برنامه cytoscape برای مک
🆔@IRBioinformatics🤏😘
Cytoscape_3_10_1_unix.sh
225.3 MB
نسخه نصبی برنامه cytoscape برای لینوکس
🆔@IRBioinformatics🤏😘
معرفی نرم افزار
نرم افزار گرومکس
این ابزار یکی از بهترین و کاربردی ترین ابزارهایی است که در حال حاضر برای شبیه سازی دینامیک مولکولی از آن استفاده می شود. این برنامه کاملا رایگان است و کاربران می توانند در دو حالت پیشفرض و مدیفای شده از کدها و فورس فیلدهایی که این برنامه برای کاربران فراهم آورده است استفاده نمایند. برای نصب گرومکس بایستی اخرین ورژن کمپایلر gcc و همچنین نسخه متناسب Cmake بر روی سیستم عامل شما نصب باشد تا برنامه به درستی کار کند. دقت داشته باشید که گرومکس بر روی سیستم عامل لینوکس و کلاسترهای مبتنی بر لینوکس از حداکثر کارایی و انعطاف پذیری برای انجام پروژه های دینامیک مولکولی برخوردار است. در ادامه می توانید فایل سورس این نرم افزار را به صورت رایگان دانلود نمایید و مطابق با فایل readme موجود در پوشه فشرده اپلود شده در کانال آن را نصب نمایید
🆔@IRBioinformatics🤏😘
gromacs-2023.3.tar.gz
40.1 MB
اخرین بیلد بروزرسانی شده نرم افزار گرومکس
🆔@IRBioinformatics🤏😘
regressiontests-2023.3.tar.gz
46.4 MB
در صورتی که موقع نصب گرومکس مشکل در نصب برنامه وجود داشت می توانید فایل regression اخرید بیلد اپلود شده در کانال را به صورت دستی به مسیر نصب گرومکس هنگام اجرای کامندهای اولیه گرومکس اضافه کنید و آن را نصب کنید.
🆔@IRBioinformatics🤏😘
نصب سریع و آنی گرومکس با استفاده از کد زیر:
دقت داشته باشید برای نصب گرومکس بایستی از قبل فایل cmake و gcc سیستم عامل شما به روز باشد در غیر این صورت امکان نصب این برنامه وجود ندارد و با fatal error موقع نصب مواجه می شوید.

tar xfz gromacs-2023.3.tar.gz 
cd gromacs-2023.3
mkdir build
cd build
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON
make
make check
sudo make install
source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC
👍1