آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی – Telegram
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.57K subscribers
1.57K photos
40 videos
423 files
716 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://news.1rj.ru/str/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
#نکته_آزمایشگاهی دوستان شما به عنوان متخصص بیوتک یا بیوانفورماتیک یا سایر علوم زیستی ممکنه خواه و ناخواه یک روزی گذرتون به ازمایشگاه و کار ازمایشگاهی بیفته. پس نیازه حتما یک اطلاعات پایه و کاربردی از مباحث ازمایشگاهی بخصوص مواردی که در کار با اسیدو بازها نیاز…
بلی دوستان همونطور که میفرمودییییییم کار با اسیدو بازها خودش یک دنیای دیگه ای داره و شما هرچقدرم کد زده باشی هرچقدرم باکلاس بازی دربیاری و بگی بیوانفورماتیکی و از این دست حرفا ممکنه روزی گذرتون به ازمایشگاه بیفته لذا کارهایی که بهتون میگیم انجام بدین تا در ازمایشگاه سردرگم نشیم.

1-رقت سازی رو کامل بلد باشین. فرقی نداره شما در چه جایگاهی تحصیلی هستین باید بلد باشین چطور از یک محلول غلیظ یک محلول رقیق درست کنین. مثلا شما میخاین رب انار به یک خورشتی اضافه کنین نمیاین که کفگیر گفگیر رب توش بریزین که میان اول ی مقداری رب برمیدارین توی ی لیوانی چیزی می ریزین بعدش کم کم اب بهش اضافه می کنین و بعد ک رقیق شد به ارامی به خورشتتون اضافه میکنن و از خورشتتون می چشین تا به طعم مورد نظر برسین. در ازمایشگاه هم همینطوریه شما از یک محلول غلیظ ی محلول رقیق تر می سازین و این مورد رو تا اونجا ادامه می دین که به غلظت دلخواه برسین نه کمتر و نه بیشتر.

2- کار با اسید-بازهای مزدوج رو بلد باشین. همونطور ک گفتم وقتی یک اسید یا باز رو میخواین استفاده کنین حتما حتما باید بدونین اون اسید یا باز به چه صورت تفکیک میشه. این مورد میتونه روی خاصیت شیمیایی محلول نهایی ک درست می کنین تاثیر بزاره و اگر مثلا قبل از تفکیک اون اسید یا باز تاثیر چندانی نداشته باشن ممکنه بعد از تفکیک باز یا اسید مزدوج اونا خاصیت به مراتب صدها فولد بالاتر داشته باشن. لذا همانگونه که فرمودینه اند که همه چیز زوج افریده شده، در نتیجه اسید و باز هم مزدوج هستن و از اجزای تشکیل دهنده اونا بعد از تفکیک خاصیت شیمیایی متفاوت تری از خودشون نشون میدن.

3-بخورات مواد شیمیایی همیشه مشکل ساز هستن. مثلا شما وقتی درب باتل HCL 37% با مولاریته 12.08 رو باز میکنین سریعا یه بخار سفیدرنگی از اون متصاعد میشه که اگر اون بخار وارد سیستم تنفسی شما یا چشم شما بشه انقدر اذیت میکنه که ممکنه برای مدت کوتاهی قادر به پلک زدن نباشید یا نفس کشیدن براتون با مشکل مواجه بشه. بنابراین قبل از کار با هر ماده شیمیایی حتما حتما دوتا دستکش بلند بپوشین. برای کار با اسیدها و بازها حتما باید از دستکش های زخیم تر و بلندتر استفاده کنین چون دستکش های وینیل معمولا تا مج دستتون رو پوشش میدن و مهمتر از همه ماسک و شیلد مناسب داشته باشین تا بخورات شیمیایی حاصل از مواد شیمیایی که از اونا برای محلول سازی استفاده می کنین اذیتتون نکنه، حالا اگر مثلا شما از NaOH Flake استفاده کنین وقتی اون رو در اب می ریزید یک بخار شدیدا بدی ازش بلند میشه که به مراتب اثر اذیت کنندگیش بالاست و سیستم تنفسی و چشماتون درگیر میکنه. و از طرف دیگه ترکیب سود و اب هم به علت گرماده بودن واکنش شدیدا حرارت تولید میکنه در نتیجه مراقب باشین هم دستتون نسوزه هم جایی درستش کنین که اسیبی به میز یا روکش کف زمین یا هرچیز دیگه ای ک به حرارت حساسه نزنین.

4- هیچ وقت به تنهایی در ازمایشگاه کار نکنید. اگر واقعا چیزی بلد نیستید از یکی ک بلد تر هستش بخواین بهتون راهنمایی بده تا چش و چالتون کور نشه.
👍5😁1🙏1🤣1
5- همیشه یک کپی از جدول تناوبی عناصر مشهدی مندلیف رو با خودتون در ازمایشگاه داشته باشید. چون وقتی بافری درست میکنین یا محلولی میخواین بسازین نیازه جرم اتمی مواد سازنده رو باهم جمع و ضرب کنین تا به نسبت دقیقی از اونا باهم میکس کنین. 99% بافرهای ازمایشگاهی زیستی از عناصر ردیف 2 و 3 جدول مشهدی مندلیف هستن یا جرم اتمی این عناصر رو حفظ کنین یا مثل من کد ملیتون رو ی جای مینویسین و عدد حفظ نمیکنین همیشه این جدول با خودتون داشته باشین که موقع حساب کتاب دچار مشکل نشین. بخصوص جایی که کار میکنین و بهتون اجازه نمیدن گوشی با خودتون بیارین داخل ازمایشگاه یا از اینترنت استفاده کنین.
👍4😁2🙏1🌚1
6- برخی مواد شیمیایی مشتقات همدیگه هستن تو ازمایشگاه. بچه های بیوتک و میکروبیولوژی که تست های PGP انجام میدن حتما با پیکریک اسید که یک پودر زرد رنگ بی آب هستش کار کردن این ماده باید کاملا خشک باشه و در جای بدور از رطوبت و حرارت نگهداری بشه. چون این ترکیب مشتقی از TNT هستش اگر رطوبت بهش برسه یا حرارت شدیدا گرما از خودش ساطع میکنه و حتی احتمال انفجارش وجود داره. بنابرین در نگهداری مواد شیمیایی در قفسه هایی مخصوص اطمینان حاصل کنید و همینطوری مواد شیمیایی رو کنار هم نزارین یا موادی که باید در جای خشک ذخیره بشن در جای مرطوب نگهداری نکنین. چون شرایط بد نگهداری مشکلات خاص خودش در ازمایشگاه ایجاد میکنه.
👍5👏1🙏1😈1
7- اسم دقیق ابزارالات و تجهیزات ازمایشگاهی که مربوط به رشتتون هستش رو بلد باشین. فرض کنین شما رفتین مصاحبه یک شرکتی و قبول شدین ولی کار ازمایشگاهی نکردین و میاین تو ازمایشگاه بعد بهتون میگن برین پوار و پیپت بیارین میرین ی چی دیگه میارین و کلا کارشناس مسئولتون نامید میشه ازتون. لذا برای اینکه یک به عنوان یک فردی ک با کدنویسی اشنایی داره و کارش بیوانفورماتیک و پشت میز نشینه حتما بایستی اشنایی با وسایل و تجهیزات ازمایشگاهی داشته باشین. اگرم بلد نیستین توی نت بگردین کلیپ ببینین یاد بگیرین که لنگ نزنین این موارد رو
👍5😁1🙏1🤷1
8- مفهوم مولاریته رو بلد باشین تا در هنگام تهیه محلول های شیمیایی سریع و دقیق عمل کنید. مولاریته یعنی تعداد مولکول گرم یا مول های ماده حل شونده در یک لیتر حلال. همانطور که موقع شیرین کردن قهوه یا چایی به نسبت خاصی از شکر به اون اضافه می کنین برای تهیه یک بافر در یک غلظت خاص هم باید به نسبت مناسب و دقیقی از ماده حل شونده بهش اضافه کنین در نتیجه مفهوم مولاریته اینجا نمود پیدا میکنه و شما بایستی با اون اشنایی داشته باشین چه متخصص بیوانفورماتیک باشین چه کارشناس علوم زیستی. مثلا اگر بهتون گفتن در تهیه محلول NaCL به میزان 300 گرم از اون رو 5 لیتر اب حل کردن مولاریته محلول حاصل چقدره شما بایستی بدونین که وزن مولکولی نمک 58.44 هستش. با تقسیم گرم داده شده بر وزن مولکولی تعداد مول حل شونده ماده مورد نظر بدست میادش و اگر اون رو تقسیم بر حجم محلولتون (بر حسب لیتر) کنین مولاریته محلول نمک حاصله (بر حسب مول/لیتر) مطابق تصویر پیوست محاسبه میشه.
👍3🔥3🙏2😐1🙈1
معرفی #ابزار محاسباتی Damietta

نرم افزار Damietta یکی از ابزارهای پیشرفته ای که طی ماه های اخیر به عنوان یک بسته جامع طراحی پروتئین ارائه گردیده است ابزار Damietta می باشد که در دو نسخه سروری و لینوکسی در دسترس قرار گرفته است. علاقه مندان به کارهای محاسباتی می توانند از این ابزار برای ارزیابی ساختار پروتئین ها و تغییر ساختار آنها به منظور سازماندهی برهمکنش داروها با مرکز فعال پروتئین های هدف استفاده نمایند. برای دسترسی به این ابزار از لینک های زیر استفاده کنید
1- مقاله Damietta

2- نسخه آنلاین Damietta

3- ورژن لینوکس Damietta

توضیحات تکمیلی: برای نصب Damietta بر روی سرورهای محاسباتی حتما از نسخه ارتقا یافته سیستم عامل اوبنتو استفاده نمایید. دقت داشته باشید که قبل از اجرای این برنامه بایستی تمامی پیش نیازهای محاسباتی آن بر روی سیستم شما نصب باشد. این ابزار بر روی سرور محاسباتی نصب می شود نه سیستم خانگی معمولی یا لپتاپ
👍6
دنیای پروتئین ها همینقدر زیبا و شیک و شکیله :) مکانیسم عمل حضرت DNA topoisomerase را در تصویر مشاهده می فرمایید. در تصویر نوع دو توپوایزومراز و برهمکنشش با مولکول DNA نشان داده شده است.
👍7
ابزار Clipboard-to-SMILES-Converter یکی از جدیدترین ابزارهای محاسباتی در حوزه شیمی دارویی است که با استفاده از آن می توان فایل دقیق SMILES یک مولکول شیمیایی را طراحی کرد. برای استفاده از این ابزار از لینک پیوست استفاده کنید.
👍5
معرفی ابزار rdeditor
اگه دنبال یه ابزار خوب و ساده و رایگان برای ایجاد تغییرات در فایل دو بعدی لیگاندهای شیمیایی هستید و می خواهید باندهای شیمیایی و استخلاف های شیمیایی را در ساختار یک مولکول دارویی یا غیر دارویی ادیت کنید می توانید از این ابزار استفاده کنید. برای استفاده از این ابزار می توانید ان را در محیط پایتون نصب کنید.
👍6
Basic_Concepts_in_Biochemistry_A_Student's_Survival_Guide_IS.pdf
1.4 MB
معرفی کتاب Basic concept in Biochemistry یکی از کتاب های کاربردی و خیلی خوب در زمینه یادگیری مفاهیم بیوشیمی هستش که به دانشجویان علوم زیستی کمک می کند مفاهیم مربوطه را به درستی فرا گیرند و از آنها برای انجام فعالیت های پژوهشی خود استفاده نمایند.

🆔https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
7🙏1👌1
#نکته_سلامتی
‏عزیزان من همه روش ها رو برای لاغری سریع امتحان کردم، تنها چیزی که تضمینی جواب میده خوردن غصه‌ست.😂😂😂
😁13
‏من نمیفهمم، یعنی اون اولین نفری که ۷ صبح رفت سرکار چی بهش گذشت که گفت ایول فردا هم همین موقع برم سرکار و این ساعت جا افتاد؟😂 ایشالا بری جهنم 😂😂
#تلخند
🤣11😁2👍1👏1
اُسكار دروغگوترين ها تعلق ميگيره به اونايي كه سر جلسه امتحان ميگفتن
بذار اول خودم بنويسم
بعد هرچي خواستي بهت ميرسونم😂 ایشالا بری جهنم 😂😂
#تلخند
🤣5😁2
Periodic_Table_PRO-v3.2.8.apk
36.4 MB
Periodic Table Pro
بهترین اپلیکیشن جدول تناوبی اندروید شیمی شامل
Chemical Elements & Properties
عناصر شیمیایی و خواص آن ها می باشد.
👍4🔥1
ORCA_CCW.pdf
5.4 MB
فایل آموزشی برنامه اورکا
3👍1👏1
CHEMIX School 12_2.rar
2.6 MB
نرم افزار CHEMIX School v12.2 به صورت کرک شده برای سیستم عامل ویندوز

برنامه CHEMIX School یک نرم افزار آموزشی تعاملی است که توسط یک شیمیدان برای دانش آموزان ومعلمان و شیمیدانان توسعه یافته است. به عنوان یک محصول مستقل، طیف گسترده ای از موضوعات در زمینه شیمی را پوشش می دهد.
👍41🥰1
MestReNova v15.rar
543.7 MB
نرم افزار MestReNova v15.0.0.34764 به همراه کرک و لایسنس برای سیستم عامل ویندوز
این برنامه نرم افزاری در زمینه نمایش ، شبیه سازی ، پیش بینی ، ارائه و آنالیز رزونانس مغناطیسی هسته ‌ای و پردازش داده های LC/GC/MS می باشد.
2👍1🔥1