This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
آیا می دانید در حال حاضر ده ها نوع پروتئین جدید توسط هوش مصنوعی طراحی و تولید شده است؟ اگر به کاربرد هوش مصنوعی در سنتز و طراحی پروتئین علاقه مند هستید این مقاله جالب و خواندنی را که در ژورنال نیچر چاپ شده است از دست ندهید...
لینک مقاله
لینک مقاله
👍5
اگه قدرت این داشتیم که کاندید جایزه نوبل انتخاب میکردیم قاعدتا انتخاب ما پرفسور ریچاردسون بود.... این خانم بنیانگذار خط و مشی فکری دانش امروزی ما از پروتئین ها هستند، کسی که زندگیشون وقف پروتئین ها کردند و انقدر نواوری در تعیین ساختار پروتئین ها داشتند که هرچی ما راجبش بگیم کم گفتیم... همین ساختار سه بعدی پروتئینی که باز میکنین توی نرم افزارهای مربوطه طرح اولیه و مفهومی اون رو خانم ریچاردسون برای اولین بار ارائه کرد موقعی که نه هوش مصنوعی بود و نه هیچ چیز دیگه ای، اما امروز میبینیم این طور دانشمندایی اصلا دیده نمیشه زحماتشون و کسایی نوبل میبرن که توسعه دهنده هوش مصنوعی هستند و از تکنولوژی روز برای ادغام داده ها استفاده میکنن شاید اگر زمان ریچاردسون هوش مصنوعی بود این ریچاردسون بود که امروز برنده این جایزه میشد....هنوز هم در سن ۸۳ سالگی مقالاتی که چاپ میکنه بی نظیر هستن....
👍12
شاهکار خلقت: نحوه سازماندهی مولکول DNA با استفاده از پروتئین های هیستونی. به تصاویر خوب دقت کنید که چطوری پروتئین های هیستونی باعث متراکم شدن DNA و سازماندهی اون میشن. تصاویر اختصاصی رندر شده توسط ادمین کانال برای شما همراهان گرامی تهیه شده است.
#هیستونها گروهی از پروتئینها هستند که نقش مهمی در بستهبندی و سازماندهی DNA در سلولهای یوکاریوتی دارند. DNA در سلول بسیار طولانی است و برای جا گرفتن در #هسته سلول باید به شکل فشردهای سازماندهی شود. هیستونها این وظیفه را بر عهده دارند.
DNA به دور این پروتئینهای هیستونی پیچیده میشود و ساختاری به نام #نوکلئوزوم ایجاد میکند. هر نوکلئوزوم از یک هسته پروتئینی تشکیل شده که از هشت مولکول هیستون (دو تا از هر یک از چهار نوع هیستون اصلی: H2A، H2B، H3، و H4) تشکیل شده است. DNA به طول حدود 146 جفت باز به دور این هسته پیچیده میشود.
هیستونها نه تنها در فشردهسازی DNA نقش دارند، بلکه در تنظیم فعالیتهای ژنتیکی نیز موثرند. تغییرات شیمیایی که روی هیستونها صورت میگیرد، مانند متیلاسیون یا استیلاسیون، میتواند بیان ژنها را فعال یا غیرفعال کند.
#هیستونها گروهی از پروتئینها هستند که نقش مهمی در بستهبندی و سازماندهی DNA در سلولهای یوکاریوتی دارند. DNA در سلول بسیار طولانی است و برای جا گرفتن در #هسته سلول باید به شکل فشردهای سازماندهی شود. هیستونها این وظیفه را بر عهده دارند.
DNA به دور این پروتئینهای هیستونی پیچیده میشود و ساختاری به نام #نوکلئوزوم ایجاد میکند. هر نوکلئوزوم از یک هسته پروتئینی تشکیل شده که از هشت مولکول هیستون (دو تا از هر یک از چهار نوع هیستون اصلی: H2A، H2B، H3، و H4) تشکیل شده است. DNA به طول حدود 146 جفت باز به دور این هسته پیچیده میشود.
هیستونها نه تنها در فشردهسازی DNA نقش دارند، بلکه در تنظیم فعالیتهای ژنتیکی نیز موثرند. تغییرات شیمیایی که روی هیستونها صورت میگیرد، مانند متیلاسیون یا استیلاسیون، میتواند بیان ژنها را فعال یا غیرفعال کند.
👍4
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
شاهکار خلقت: نحوه سازماندهی مولکول DNA با استفاده از پروتئین های هیستونی. به تصاویر خوب دقت کنید که چطوری پروتئین های هیستونی باعث متراکم شدن DNA و سازماندهی اون میشن. تصاویر اختصاصی رندر شده توسط ادمین کانال برای شما همراهان گرامی تهیه شده است. #هیستونها…
مهمترین انواع هیستونها در سلولهای یوکاریوتی شامل پنج نوع اصلی هستند که نقش کلیدی در بستهبندی DNA و تشکیل نوکلئوزومها ایفا میکنند. این پنج نوع هیستون عبارتند از:
H1 (هیستون لینکر): وظیفه هیستون H1 تثبیت ساختار نوکلئوزوم و اتصال نوکلئوزومها به یکدیگر است. این هیستون در خارج از هسته نوکلئوزوم قرار دارد و باعث فشردهسازی بیشتر DNA در سطوح بالاتر بستهبندی میشود.
H2A: این هیستون یکی از چهار نوع هیستونی است که هسته نوکلئوزوم را تشکیل میدهد. دو مولکول H2A با دو مولکول H2B جفت میشوند تا بخش خاصی از ساختار هسته نوکلئوزوم را ایجاد کنند.
H2B: هیستون H2B با هیستون H2A جفت میشود و در تشکیل هسته نوکلئوزوم نقش دارد. این جفت هیستونها بخشی از ساختار هشتتایی نوکلئوزوم را تشکیل میدهند.
H3: دو مولکول هیستون H3 با دو مولکول هیستون H4 جفت میشوند تا هسته اصلی نوکلئوزوم را بسازند. H3 نیز نقش مهمی در بستهبندی و تنظیم DNA دارد و به دلیل تغییرات پسترجمهای، در تنظیم بیان ژن بسیار مهم است.
H4: هیستون H4 به همراه H3 هسته نوکلئوزوم را تشکیل میدهد. هر نوکلئوزوم از دو مولکول H4 و دو مولکول H3 تشکیل شده است که به دور آنها DNA پیچیده میشود.
این پنج نوع هیستون با همکاری یکدیگر ساختار فشردهای از DNA به نام کروماتین را ایجاد میکنند که نه تنها DNA را در هسته سازماندهی میکند، بلکه در تنظیم بیان ژنها نیز نقش دارد.
H1 (هیستون لینکر): وظیفه هیستون H1 تثبیت ساختار نوکلئوزوم و اتصال نوکلئوزومها به یکدیگر است. این هیستون در خارج از هسته نوکلئوزوم قرار دارد و باعث فشردهسازی بیشتر DNA در سطوح بالاتر بستهبندی میشود.
H2A: این هیستون یکی از چهار نوع هیستونی است که هسته نوکلئوزوم را تشکیل میدهد. دو مولکول H2A با دو مولکول H2B جفت میشوند تا بخش خاصی از ساختار هسته نوکلئوزوم را ایجاد کنند.
H2B: هیستون H2B با هیستون H2A جفت میشود و در تشکیل هسته نوکلئوزوم نقش دارد. این جفت هیستونها بخشی از ساختار هشتتایی نوکلئوزوم را تشکیل میدهند.
H3: دو مولکول هیستون H3 با دو مولکول هیستون H4 جفت میشوند تا هسته اصلی نوکلئوزوم را بسازند. H3 نیز نقش مهمی در بستهبندی و تنظیم DNA دارد و به دلیل تغییرات پسترجمهای، در تنظیم بیان ژن بسیار مهم است.
H4: هیستون H4 به همراه H3 هسته نوکلئوزوم را تشکیل میدهد. هر نوکلئوزوم از دو مولکول H4 و دو مولکول H3 تشکیل شده است که به دور آنها DNA پیچیده میشود.
این پنج نوع هیستون با همکاری یکدیگر ساختار فشردهای از DNA به نام کروماتین را ایجاد میکنند که نه تنها DNA را در هسته سازماندهی میکند، بلکه در تنظیم بیان ژنها نیز نقش دارد.
👍6👏1
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
تعاریف زیر را برای همیشه به خاطر بسپارید #تعریف #اصطلاحات
1. هاپلویید (Haploid)
تعریف: هاپلویید به حالتی اطلاق میشود که یک سلول تنها یک مجموعه کامل از کروموزومها (n) را دارد. به عبارت دیگر، در این حالت، کروموزومها به صورت تکی و بدون جفت وجود دارند.
مثال: سلولهای جنسی (گامتها) در انسان، مانند اسپرم و تخمک، هاپلویید هستند و 23 کروموزوم دارند.
2. دیپلویید (Diploid)
تعریف: دیپلویید به حالتی اطلاق میشود که یک سلول دو مجموعه کامل از کروموزومها (2n) را دارد، یعنی هر کروموزوم با یک همتای خود جفت شده است.
مثال: سلولهای سوماتیک در انسانها دیپلویید هستند و 46 کروموزوم دارند (23 جفت).
3. پلی پلویید (Polyploid)
تعریف: پلی پلویید به حالتی اطلاق میشود که یک سلول دارای بیش از دو مجموعه کامل از کروموزومها است. این حالت میتواند شامل سه یا بیشتر مجموعههای کروموزوم باشد.
مثال: گیاهانی مانند گندم که به صورت تریپلویید (3n) یا تریپلویید (4n) وجود دارند.
4. تریزومی (Trisomy)
تعریف: تریزومی یک نوع آنیوپلوییدی است که در آن یک کروموزوم خاص به صورت اضافی وجود دارد، به طوری که مجموع کروموزومها یکی بیشتر از حالت دیپلویید (2n + 1) است.
مثال: تریزومی 21 که به سندرم داون (Down syndrome) معروف است، به دلیل وجود یک کروموزوم اضافی در شماره 21 است.
5. یوپلوئیدی (Euploid)
تعریف: یوپلوئید به حالتی اطلاق میشود که سلولها دارای تعداد صحیحی از مجموعههای کروموزومی هستند، یعنی میتواند هاپلویید (n) یا دیپلویید (2n) یا پلیپلویید (3n، 4n و غیره) باشد.
مثال: یک گیاه گندم با 6 مجموعه کروموزوم (hexaploid) که دارای 42 کروموزوم است (6n).
6. آنیوپلوییدی (Aneuploidy)
تعریف: آنیوپلوییدی به حالتی اطلاق میشود که تعداد کروموزومها در یک سلول از تعداد طبیعی آنها انحراف دارد، یعنی کمتر یا بیشتر از تعداد طبیعی کروموزومها.
مثال: سندرم تریزومی 18 که به دلیل وجود یک کروموزوم اضافی در شماره 18 ایجاد میشود.
7. اپیزومی (Epizomy)
تعریف: اپیزومی به حالتی اطلاق میشود که یک DNA اضافی به صورت غیر کروموزومی در سلول وجود دارد. این DNA میتواند به شکل حلقهای باشد و معمولاً به ویروسها و پلاسمیدها تعلق دارد.
مثال: پلاسمیدهای موجود در باکتریها که میتوانند ژنهای مقاومت به آنتیبیوتیکها را حمل کنند و به آنها اجازه میدهند که در شرایط خاص بقا یابند.
تعریف: هاپلویید به حالتی اطلاق میشود که یک سلول تنها یک مجموعه کامل از کروموزومها (n) را دارد. به عبارت دیگر، در این حالت، کروموزومها به صورت تکی و بدون جفت وجود دارند.
مثال: سلولهای جنسی (گامتها) در انسان، مانند اسپرم و تخمک، هاپلویید هستند و 23 کروموزوم دارند.
2. دیپلویید (Diploid)
تعریف: دیپلویید به حالتی اطلاق میشود که یک سلول دو مجموعه کامل از کروموزومها (2n) را دارد، یعنی هر کروموزوم با یک همتای خود جفت شده است.
مثال: سلولهای سوماتیک در انسانها دیپلویید هستند و 46 کروموزوم دارند (23 جفت).
3. پلی پلویید (Polyploid)
تعریف: پلی پلویید به حالتی اطلاق میشود که یک سلول دارای بیش از دو مجموعه کامل از کروموزومها است. این حالت میتواند شامل سه یا بیشتر مجموعههای کروموزوم باشد.
مثال: گیاهانی مانند گندم که به صورت تریپلویید (3n) یا تریپلویید (4n) وجود دارند.
4. تریزومی (Trisomy)
تعریف: تریزومی یک نوع آنیوپلوییدی است که در آن یک کروموزوم خاص به صورت اضافی وجود دارد، به طوری که مجموع کروموزومها یکی بیشتر از حالت دیپلویید (2n + 1) است.
مثال: تریزومی 21 که به سندرم داون (Down syndrome) معروف است، به دلیل وجود یک کروموزوم اضافی در شماره 21 است.
5. یوپلوئیدی (Euploid)
تعریف: یوپلوئید به حالتی اطلاق میشود که سلولها دارای تعداد صحیحی از مجموعههای کروموزومی هستند، یعنی میتواند هاپلویید (n) یا دیپلویید (2n) یا پلیپلویید (3n، 4n و غیره) باشد.
مثال: یک گیاه گندم با 6 مجموعه کروموزوم (hexaploid) که دارای 42 کروموزوم است (6n).
6. آنیوپلوییدی (Aneuploidy)
تعریف: آنیوپلوییدی به حالتی اطلاق میشود که تعداد کروموزومها در یک سلول از تعداد طبیعی آنها انحراف دارد، یعنی کمتر یا بیشتر از تعداد طبیعی کروموزومها.
مثال: سندرم تریزومی 18 که به دلیل وجود یک کروموزوم اضافی در شماره 18 ایجاد میشود.
7. اپیزومی (Epizomy)
تعریف: اپیزومی به حالتی اطلاق میشود که یک DNA اضافی به صورت غیر کروموزومی در سلول وجود دارد. این DNA میتواند به شکل حلقهای باشد و معمولاً به ویروسها و پلاسمیدها تعلق دارد.
مثال: پلاسمیدهای موجود در باکتریها که میتوانند ژنهای مقاومت به آنتیبیوتیکها را حمل کنند و به آنها اجازه میدهند که در شرایط خاص بقا یابند.
👍4💯1
#تلومراز (Telomerase) یک آنزیم مهم است که به حفظ طول تلومرها، نواحی انتهایی کروموزومها، کمک میکند. تلومرها از توالیهای تکراری DNA تشکیل شدهاند که از کروموزومها در برابر تخریب و انقباض محافظت میکنند. با هر بار تقسیم سلولی، تلومرها کوتاهتر میشوند و در نهایت میتوانند به اندازهای کوتاه شوند که باعث توقف تقسیم سلولی و پیری شوند. تلومراز با اضافه کردن توالیهای تکراری به انتهای کروموزومها، این فرایند را معکوس میکند و به سلولها اجازه میدهد تا به طور نامحدود تقسیم شوند، به ویژه در سلولهای بنیادی و سلولهای جنسی.
تلومراز در زمینههای مختلفی کاربرد دارد، از جمله تحقیقات بیولوژی مولکولی، ژنتیک و پزشکی. در بسیاری از سلولهای سرطانی، تلومراز فعال است و این امر به رشد غیرکنترلشده سلولها کمک میکند. بنابراین، تحقیقات زیادی برای توسعه درمانهای هدفمند که بتوانند تلومراز را مهار کنند، انجام میشود. همچنین تلومراز به عنوان یک هدف تحقیقاتی برای درمانهای ضدپیری و بیماریهای مرتبط با پیری، مانند بیماریهای قلبی و عروقی، مورد توجه قرار گرفته است.
#دانستنی
تلومراز در زمینههای مختلفی کاربرد دارد، از جمله تحقیقات بیولوژی مولکولی، ژنتیک و پزشکی. در بسیاری از سلولهای سرطانی، تلومراز فعال است و این امر به رشد غیرکنترلشده سلولها کمک میکند. بنابراین، تحقیقات زیادی برای توسعه درمانهای هدفمند که بتوانند تلومراز را مهار کنند، انجام میشود. همچنین تلومراز به عنوان یک هدف تحقیقاتی برای درمانهای ضدپیری و بیماریهای مرتبط با پیری، مانند بیماریهای قلبی و عروقی، مورد توجه قرار گرفته است.
#دانستنی
👍8
📃A Comprehensive Review of Bioinformatics Tools for Genomic Biomarker Discovery Driving Precision Oncology
📗Journal: Genes (I.F.=2.8)
🗓Publish year: 2024
🧑💻Authors: Alexis J. Clark, James W. Lillard, Jr.
🏢University: Morehouse School of Medicine, USA
📎 Study the paper
📲Channel: @irBioinformatics
#review #biomarker #oncology
📗Journal: Genes (I.F.=2.8)
🗓Publish year: 2024
🧑💻Authors: Alexis J. Clark, James W. Lillard, Jr.
🏢University: Morehouse School of Medicine, USA
📎 Study the paper
📲Channel: @irBioinformatics
#review #biomarker #oncology
👍2👏2
📌سایتهای رایگان دریافت کتاب و مقالههای انگلیسی
🔰درحال حاضر، سایتهای زیادی برای دانلود کتابها انگلیسی وجود دارن. خوبی بعضیاز این سایتها اینه که نیازی به پرداخت هزینه برای دریافت کتاب موردنظرتون نیست. با این کتابها میتونید دانش خودتون رو درزمینه قواعد و دایره لغات زبان انگلیسی افزایش بدید. پس بریم تا منابع معتبر دانلود رایگان کتابها رو معرفی کنیم!
🔰سایت "BookBoon"، اولین سایتیه که میخوایم بهتون معرفی کنیم. این سایت بیشتراز ۵۰ میلیون کتاب بهشکل "PDF" داره. این وبسایت شامل کتابهای کوتاه و مقالات مختلفه. توی این سایت، امکان دستهبندی کتابها وجود داره که همین خصوصیت یکیاز مزایای این سایت رو میسازه.
🔰یکیاز سایتهای مناسب برای مباحث علمی، "DOAbooks" هست که توسط یکیاز موسسههای هلندی ایجاد شده. این سایت دسترسی رایگان به کتابها رو ممکن میکنه و به کاربران این اجازه رو میده که کتابهای نشرهای مختلف رو ببینن. همچنین تمام امکانات این سایت رایگانه!
🔰سایت "OAPEN" یه منبع معتبر برای دریافت رایگان کتابهای دانشگاهی علمیه که به دانشجویان و محققان کمک میکنه تا در زمینه علوم انسانی بتونن علم خودشون رو بیشتر کنن. اما نکته قابل توجه درمورد این سایت، اینه که "OAPEN" فقط به کشورهای درحال توسعه، خدمات ارائه میده!
🔰سایت "hu1lib" یکی دیگه از سایتهاییه که کتابهای انگلیسی رو بهصورت رایگان در دسترس میزارن. این سایت کتابهای مختلف انگليسی ازجمله رمانها رو بهصورت رایگان قرار داده.
🔰برای دانلود رایگان کتابهای انگلیسی همچنین میتوان به سایت"gen.lib.rus.ec" اشاره کرد. این سایت، داستانهای علمی، رمانها و انواعی از کتابهای انگلیسی رو پوشش میده. بنابراین، برای اینکه علم خودتون رو چه در زمینه علمی و چه در زمینه قواعد افزایش بدید، میتونید از این سایت استفاده کنید.
🔰کتابخونه "booksee.org"، یک سایت روسیه که مجلات و کتابهای انگلیسی رو شامل میشه. همچنین، این سایت رایگانه و نیازی به پرداخت هزینه برای استفاده از این کتابها نیست.
🔰سایت "freebookspot.club" مناسب برای دانلود رایگان کتابها و داستانهای انگلیسیه که انواعی از داستانها و کتابها با ژانرهای علمی و... داره.
🔰سایت "bookyards.com" یکی دیگه از سایتهای رایگانه که کتابها رو براساس نام نویسنده، ژانر و نام کتاب، اونها رو دستهبندی میکنه. همچنین، در این سایت میشه با سرچ حروف اول اسم کتاب یا نویسنده کتاب موردنظرتون رو پیدا کنید.
--------------------------------------------
کانال بیوانفورماتیک محققان ایران
✅https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
🔰درحال حاضر، سایتهای زیادی برای دانلود کتابها انگلیسی وجود دارن. خوبی بعضیاز این سایتها اینه که نیازی به پرداخت هزینه برای دریافت کتاب موردنظرتون نیست. با این کتابها میتونید دانش خودتون رو درزمینه قواعد و دایره لغات زبان انگلیسی افزایش بدید. پس بریم تا منابع معتبر دانلود رایگان کتابها رو معرفی کنیم!
🔰سایت "BookBoon"، اولین سایتیه که میخوایم بهتون معرفی کنیم. این سایت بیشتراز ۵۰ میلیون کتاب بهشکل "PDF" داره. این وبسایت شامل کتابهای کوتاه و مقالات مختلفه. توی این سایت، امکان دستهبندی کتابها وجود داره که همین خصوصیت یکیاز مزایای این سایت رو میسازه.
🔰یکیاز سایتهای مناسب برای مباحث علمی، "DOAbooks" هست که توسط یکیاز موسسههای هلندی ایجاد شده. این سایت دسترسی رایگان به کتابها رو ممکن میکنه و به کاربران این اجازه رو میده که کتابهای نشرهای مختلف رو ببینن. همچنین تمام امکانات این سایت رایگانه!
🔰سایت "OAPEN" یه منبع معتبر برای دریافت رایگان کتابهای دانشگاهی علمیه که به دانشجویان و محققان کمک میکنه تا در زمینه علوم انسانی بتونن علم خودشون رو بیشتر کنن. اما نکته قابل توجه درمورد این سایت، اینه که "OAPEN" فقط به کشورهای درحال توسعه، خدمات ارائه میده!
🔰سایت "hu1lib" یکی دیگه از سایتهاییه که کتابهای انگلیسی رو بهصورت رایگان در دسترس میزارن. این سایت کتابهای مختلف انگليسی ازجمله رمانها رو بهصورت رایگان قرار داده.
🔰برای دانلود رایگان کتابهای انگلیسی همچنین میتوان به سایت"gen.lib.rus.ec" اشاره کرد. این سایت، داستانهای علمی، رمانها و انواعی از کتابهای انگلیسی رو پوشش میده. بنابراین، برای اینکه علم خودتون رو چه در زمینه علمی و چه در زمینه قواعد افزایش بدید، میتونید از این سایت استفاده کنید.
🔰کتابخونه "booksee.org"، یک سایت روسیه که مجلات و کتابهای انگلیسی رو شامل میشه. همچنین، این سایت رایگانه و نیازی به پرداخت هزینه برای استفاده از این کتابها نیست.
🔰سایت "freebookspot.club" مناسب برای دانلود رایگان کتابها و داستانهای انگلیسیه که انواعی از داستانها و کتابها با ژانرهای علمی و... داره.
🔰سایت "bookyards.com" یکی دیگه از سایتهای رایگانه که کتابها رو براساس نام نویسنده، ژانر و نام کتاب، اونها رو دستهبندی میکنه. همچنین، در این سایت میشه با سرچ حروف اول اسم کتاب یا نویسنده کتاب موردنظرتون رو پیدا کنید.
--------------------------------------------
کانال بیوانفورماتیک محققان ایران
✅https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
👍4
با ابزار جدید CABS-DOCK به راحتی برهمکنش های پروتئین-پپتید و پروتئین-پروتئین را می توانید بررسی کنید. در مقایسه با سرورهای دیگر محاسباتی این ابزار از زمان کوتاه تری برای بررسی برهمکنش بین رسپتور و لیگاند پروتئینی استفاده می کند. برای دسترسی به این سرور بر روی لینک زیر کلیک کنید
https://biocomp.chem.uw.edu.pl/CABSdock/
https://biocomp.chem.uw.edu.pl/CABSdock/
👍5