جنبه های کاربردی و نظری زیست شناسی سامانه ای

دانلود کتاب

📝تهیه و تنظیم: #سمیه_آزادیان
دانش آموخته ارشد بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه‌ها: #معرفی_کتاب

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

✌ یک قدم تا تحقق پزشکی فرد محور (Personlized medicine):
🔴 در دهه اخیرگسترش دانش بیوبانک با رشد علوم -omics و انالیز داده های حجیم رشد دو چندان پیدا کرد.

⚪ دانش Radiomics با توجه به پتانسیل پردازش تصویر های پزشکی و همچنین انالیز داده های حجیم omics به عنوان یکی از مهم ترین ابزارهای پزشکی فرد محور به شمار می‌رود.
🔵 استخراج الگوهای زیستی از تصاویر و ادغام این الگوها با الگوهای ژنتیکی باعث می‌شود پزشک بتواند نگاه ویژه تری نسبت به میزان درگیری آناتومیکی فرد و ژنتیک بیمار داشته باشد و به دنبال آن بتواند درمان مناسب تری را پیشنهاد دهد.

ادامه مطلب

تعداد کلمات: ۳۱۷
زمان تقریبی: ۱دقیقه و‌۳۵ ثانیه

تهیه و تنظیم: #محمدامین_ماه_منظر
دانشجوی کارشناسی ارشد #بیوانفورماتیک
آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #
#تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31118074/

برای کسب اطلاعات بیشتر به سایت کدکول مراجعه فرمایید.

سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_شغلی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🔮 پیش‌بینی تیپ شخصیتی با استفاده از داده‌های تلفن همراه هوشمند

📱تلفن‌های هوشمند، کامپیوترهای کوچکی پر از سنسورهای گوناگون هستند که می‌توانند به سادگی برای جمع‌آوری داده‌های رفتاری مورد استفاده قرار گیرند.
🗂 این داده‌ها نه تنها برای شرکت‌های شناخته شده IT، که معمولا از آن‌ها برای مقاصد تبلیغاتی استفاده می کنند، بسیار ارزشمند هستند، بلکه می‌توانند در زمینه‌های دیگر همچون مطالعات علوم اجتماعی محاسباتی کاربرد فراوان داشته باشند.
👨🏼‍💻👩🏻‍💻 در تحقیق انجام شده در دانشگاه LMU مونیخ با استفاده از جمع‌آوری داده‌هایی همچون داده‌های ارتباطات و رفتارهای اجتماعی، موسیقی، استفاده از برنامه‌های مختلف (apps)، تحرک زمان کلی استفاده از تلفن همراه و میزان استفاده روزانه و شبانه از آن، می‌توان ویژگی شخصیتی افراد را پیش‌بینی کرد.
⚙ در این تحقیق که با استفاده از یادگیری ماشین و با حضور بیش از 600 داوطلب انجام شده است، الگوریتم قادر است به خوبی تیپ شخصیتی کاربر تلفن همراه را پیش‌بینی کند.
👨🏻‍💼 به گفته‌ی بونر، روانشناس و رهبر این تیم تحقیقاتی: پیش از این بجز اطلاعاتی که افراد انتخاب می‌کردند در قالب پرسشنامه‌ها در اختیار ما قرار دهند، اطلاعات بسیار اندکی از نحوه‌ی رفتار و عملکرد روزمره آن‌ها در دست بود و ارزش این تحقیق به دلیل این است که علیرغم تحقیقات پیشین تنها متکی به خودارزیابی افراد نیست.
ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: 583
⏰زمان مطالعه: کمتر از 3 دقیقه

📝تهیه و تنظیم : #سارا_فیاض‌زاده
دانشجوی دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫
📌منبع :
https://www.pnas.org/content/early/2020/07/13/1920484117

🎧 کتاب صوتی ”پاسخ های کوتاه به پرسش های بزرگ”

🔴 موضوع: ”چگونه همه چیز شروع شد”

📝 پرسش دوم

🖋نویسنده: استیون هاوکینگ

پنجشنبه‌ها: #کتاب_صوتی

#پاسخ_های_کوتاه_به_پرسش_های_بزرگ
#استیون_هاوکینگ

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

💠منبع: کانال خوانش کتاب برای انسان خردمند
@Homosapiensfa💫

#طنز
دانشمندان: انفجار برای علم ✊✊✊
مهندسان: انفجار برای انفجاااار 🤯🤪

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

✂️چرا به اهداف خود نمی رسیم ؟

🎆همه‌ی ما به راحتی با کمی تمرکز می‌توانیم در رویاهای خود غرق شویم ولی چرا وقتی حرف عملی کردن رویاها‌یمان به میان می آید، ناگهان رشته‌ی افکارمان قطع می‌شود و تدوین برنامه عملی و دنبال کردن آن به نظر سخت می‌رسد.

🤵🏽بیست و ششمین رییس جمهور آمریکا می‌گوید : " هیچ چیز در جهان ارزش کار کردن را ندارد مگر اینکه معنای تلاش، درد و سختی را به همراه داشته باشد." فرار از سختی‌ها و مسائلی که ما را ناراحت می‌کند راحت‌ترین راه پیش روی ما است اما ابدا ایده‌ی خوبی نیست. پس چاره چیست؟

در ادامه راهکار هایی جهت پاسخ به این
پرسش ارائه شده است...

ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: ۶۱۱ کلمه
⏰زمان مطالعه: ۳ دقیقه

شنبه ها :#علمی_اجتماعی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:

https://www.lifehack.org/880259/why-we-fail-to-achieve-our-goals

📍#شروع_کلاس
✅#مهندسی_پروتئین

👨‍🏫مدرس:دکتر سید شهریار عرب(عضو هئیت علمی گروه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس)

🛑جهت تکمیل کادر دپارتمان پژوهش🛑
بعد از اتمام دوره با کسب حداکثر نمره و مصاحبه غیر حضوری در حوزه های:
1️⃣داکینگ
2️⃣مدل سازی پروتئین
3️⃣مهندسی پروتئین
به ما ماحق می شوید.

🌀برای ثبت نام با شناسه زیر تماس برقرار فرمایید
@codecool5

♨️ پیش بینی کمپلکس های پروتئینی

💡کمپلکس های پروتئین یکی از مهمترین واحدهای عملکردی در فرآیندهای زیستی درون سلولی هستند. روش های تجربی، داده های ارزشمندی را برای درک بهتر کمپلکس های پروتئینی فراهم کرده اند. با این حال، این روش ها محدودیت های ذاتی دارند. با توجه به این محدودیت ها، روش های محاسباتی بسیاری در دهه گذشته برای پیش بینی کمپلکس های پروتئینی پیشنهاد شده است. تقریباً تمام این روش ها با استفاده از داده های میان کنش پروتئینی (PPI)، کمپلکس های پروتئینی را پیش بینی می کنند.

💎این روش های محاسباتی معمولاً از داده های PPI در قالب یک شبکه میان کنش پروتئین پروتئین عظیم (PPIN) به عنوان ورودی و خروجی زیر شبکه های مختلف PPIN داده شده برای پیش بینی کمپلکس های پروتئینی استفاده می کنند.

🦠برخی از این روش ها به بازده امیدوار کننده ای در پیش بینی کمپلکس های پروتئینی رسیده اند. با این وجود ، در پیش بینی کمپلکس ها، به خصوص کمپلکس های پروتئینی کوچک همچنان چالش هایی وجود دارد.

📝در این مقاله ، مهمترین روش های محاسباتی برای پیش بینی کمپلکس های پروتئین ارزیابی و مقایسه می شود. علاوه بر این ، برخی از چالش های در بازسازی آنها مورد بحث قرار می گیرد. سرانجام ، ابزارهای مختلفی برای پیش بینی پیچیده پروتئین و تجزیه و تحلیل PPIN و همچنین پایگاه داده های دارای توان بالا بررسی می شود.
🔸این مقاله توسط اعضا آزمایشگاه بیوانفورماتیک دانشگاه تربیت مدرس به رشته تحریر در آمده است.

ادامه مطلب

تعداد کلمات: 314 کلمه
زمان تقریبی: 2 دقیقه

تهیه و تنظیم: #علیرضا_دوست_محمدی
دانشجوی کارشناسی ارشد #بیوانفورماتیک
آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

دوشنبه ها: #مقاله_هفته

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S088875431830572X

برای کسب اطلاعات بیشتر به سایت کدکول مراجعه فرمایید.

سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_تحصیلی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🎗تشخیص سرطان چند سال زودتر از ظهور علائم آن، توسط آزمایش خون
👩🏻‍🔬👨🏻‍🔬تیم تحقیقاتی در چین ادعا کرده است که تا 4 سال زودتر از پیدا شدن نشانه‌های سرطان در بدن، می‌تواند تنها با آزمایش خون آن را تشخیص دهد.
💉این آزمایش خون که PanSeer نام دارد، با دقت 95 درصد سرطان را در افرادی که در زمان آزمایش علامتی نداشتند، تشخیص می‌دهد.
طبق مقاله چاپ شده در نشریه Nature Communications این فناوری می‌تواند 5 نوع سرطان (معده، روده، ریه، کبد و مری) را با کمک آزمایش خونی بر اساس متیلاسیون DNA زودتر از روش‌های سنتی تشخیص دهد.
📍همچنین هدف این کار پیش‌بینی سرطان نیست بلکه به تشخیص سرطان در آن دسته از بیمارانی کمک می کند که هنوز علائمی از خود نشان نداده یا بیماریشان با روش‌های معمول تشخیص داده نمی‌شود.

ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: 288
⏰زمان مطالعه: 1ونیم دقیقه

📝تهیه و تنظیم : #نیلوفر_سید_مجیدی
دانش‌آموخته رشته #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه ها: #اخبار_فناوری

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫
📌منبع : گاردین

🎧 کتاب صوتی ”پاسخ های کوتاه به پرسش های بزرگ”

🔴 موضوع: ”چگونه همه چیز شروع شد”

📝 پرسش دوم
✂️بخش دوم

🖋نویسنده: استیون هاوکینگ

پنجشنبه‌ها: #کتاب_صوتی

#پاسخ_های_کوتاه_به_پرسش_های_بزرگ
#استیون_هاوکینگ

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

💠منبع: کانال خوانش کتاب برای انسان خردمند
@Homosapiensfa💫

⛔️مراقب استفاده ربات ها از سایت های نامناسب باشیم
#طنز
#زینب_محمدتبار

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🌀 بازی های آنلاین در سایت های شبکه های اجتماعی

✏️ بازی های آنلاین اجتماعی در سایت ها و رسانه های اجتماعی امروز به یک مؤلفه مهم تبدیل شده اند. این محیط ها بستری را برای بازی های آنلاین فراهم کرده اند تا درفضای مجازی توسعه و گسترش یابند. کاربران اکنون می توانند علاوه بر گشت و گذار و ارتباطات مجازی در این محیط ها، بازی های آنلاین را نیز انجام دهند، امتیازات را با یکدیگر مقایسه کنند و دراین میان بسیاری موارد دیگر را به چالش بکشند. به دلیل تنوع جمعیتی کاربران سایتها و رسانه های اجتماعی، انگیزه های مختلفی برای انجام بازی های اجتماعی پدیدار می شود. ضرورت انجام تحقیق حاضر برای پاسخ به این سؤال است که آیا ادغام بازی های اجتماعی در سایت ها وشبکه های اجتماعی محبوبیت بازی ها را افزایش داده است یا خیر. بنابراین هدف اصلی این تحقیق پیش بینی اقبال بازی ها (ژانرهای ماجراجویی ، جنگی ، هنری ، زندگی مجازی و ...) در سایت ها و رسانه های اجتماعی است تا در مورد سرمایه گذاری یا عدم سرمایه گذاری بر روی آن از سوی استارتاپ ها تصمیم گیری شود. همچنین، می خواهیم بررسی کنیم که آیا گنجاندن بازی های اجتماعی، خدمات ارائه شده توسط سایت های اجتماعی را بهبود بخشیده است یا خیر و اینکه آیا بازی های اجتماعی تاثیری در معاشرت و تعامل با دیگران دارد. اولویت اصلی این تحقیق ،روش کمّی بازیسازان آنلاین، فارغ از سن ، جنسیت و علایق شرکت کنندگان بوده است. داده ها با توزیع نظرسنجی آنلاین جمع آوری و با استفاده از ابزار داده کاوی WEKA تجزیه و تحلیل گردیده است. همانطور که می دانیم ابزار داده کاوی WEKA مجموعه ای از الگوریتم های ماشین لرنینگی است که برای کاوش دیتا استفاده می گردد.

مطالعه بیشتر

📝تعداد کلمات: 380
⏰زمان مطالعه: 3 تا 4 دقیقه

📝 تهیه و تنظیم:#پرهام_حاجی_شفیع
دانشجوی کارشناسی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

شنبه ها :#علمی_اجتماعی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877050916300254

بیوفیزیک و نوروفیزیولوژی حس ششم

دانلود کتاب

📝تهیه و تنظیم: #سحر_برهانی
دانشجو دکتری #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

یکشنبه‌ها: #معرفی_کتاب

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🔴 رمدسیویر چیست و چگونه ساخته شد؟

این دارو، یک داروی آزمایشی آنتی‌ویروس است که به‌وسیله شرکت دارو سازی آمریکایی «گیلیاد ساینس» در آغاز روند درمان بیماری ایبولا ساخته شد.

رمدسیویر که در سال 2015 ساخته شد، نتایج امیدوارکننده‌ای در آزمایش به‌روی حیوانات نشان داد و در مرحله بعد در کنگو مورد استفاده قرار گرفت اما در نهایت، در درمان موثر بیماری ایبولا شکست خورد.

🔍میزان اثر بخشی این دارو بر کرونا؟

بر اساس تحقیقات انستیتوی ملی آلرژی و بیماری‌های مسری، نتایج بالینی مصرف رمدسیویر درمورد بیش از هزار بیمار مبتلا به کووید _19 که از مشکلات تنفسی شدید رنج می‌بردند، به میزان 31% سریع تر از دیگر بیمارانی که شبه دارو مصرف کردند، بهبود یافته‌‌اند.

📌چگونگی کار رمدسیویر:

رمدسیویر به این شکل عمل می‌کند که نحوه کار ادونوزین را شبیه‌سازی می‌کند که یکی از 4باز تشکیل‌دهنده ماده ژنتیکی است. زمانیکه ژن‌های ویروس کرونا به جای ترکیب با ادونوزین با رمدسیویر ترکیب شوند، دیگر قادر به تکثیر نخواهند بود.


بر اساس تازه‌ترین پژوهش انتشار یافته از سوی شرکت گیلیاد ساینس، شایع‌ترین تاثیر منفی استفاده از رمدسیویر، استفراغ و توقف حاد تنفسی است و در 7 % از بیماران، افزایش آنزیم‌های کبد مشاهده شده است.


ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: 215
⏰زمان مطالعه: کمتر از دو دقیقه

📝 تهیه و تنظیم: #غزاله_فهیمیان دانش آموخته ارشد #بیوفیزیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس


✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:

https://www.nih.gov/news-events/news-releases/nih-clinical-trial-shows-remdesivir-accelerates-recovery-advanced-covid-19

برای کسب اطلاعات بیشتر به سایت کدکول مراجعه فرمایید.

سه شنبه ها: #معرفی_موقعیت_تحصیلی

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

🔹 در قلمرو کوانتومی "اثر پروانه‌ای" وجود ندارد.

🦋 در داستان علمی تخیلی "آوای تندر"، یک شخصیت از یک ماشین زمان برای سفر به گذشته‌های دور استفاده می‌کند، جایی که او روی یک پروانه قدم گذاشت. با بازگشت به زمان حال، او با دنیایی متفاوت روبرو می‌شود.
این داستان غالباً با عنوان "اثر پروانه ای" شناخته می شود كه به حساسیت بسیار بالا یك سیستم پیچیده و پویا نسبت به شرایط اولیه‌ی آن اشاره دارد. در چنین سیستمی، عوامل کوچک و اولیه، تکامل کل سیستم را به شدت تحت تأثیر قرار می‌دهد.

📚 محققان با استفاده از یک کامپیوتر کوانتومی، سفر در زمان را شبیه‌سازی کردند و نشان دادند که در قلمرو کوانتومی "اثر پروانه‌ای" وجود ندارد. در این تحقیق، اطلاعات -کوبیت‌ها یا بیت‌‌های کوانتومی- به گذشته‌ی شبیه‌سازی شده سفر کردند. یکی از آن‌ها به شدت آسیب می‌بیند، مانند قدم گذاشتن روی یک پروانه، با کمال تعجب، وقتی همه‌ی کوبیت‌ها به "زمان حال" برمی‌گردند، تا حد زیادی بدون تغییر ظاهر می‌شوند. گویی در فرآیندی مشابه با خوددرمانی، واقعیت، خود را به آنچه باید باشد، اصلاح می‌کند.

محققان این مقاله گفته‌اند: "در رایانه‌ی کوانتومی مشکلی برای شبیه‌سازی تکامل مخالف در زمان یا اجرای یک فرآیند به صورت برعکس و به گذشته وجود ندارد. بنابراین ما می‌توانیم درک کنیم که در صورت بازگشت به گذشته و ایجاد خسارت‌های ناچیز و برگشت به زمان حال چه اتفاقی برای دنیای پیچیده‌ی کوانتومی می‌افتد. ما فهمیدیم که جهان ما به همین صورت باقی می‌ماند و این یعنی هیچ اثر پروانه‌ای در مکانیک کوانتومی وجود ندارد. "

آن‌ها دریافتند که شبیه‌سازی بازگشت به گذشته برای ایجاد صدمات محلی کوچک در سیستم کوانتومی، منجر به آسیب‌های محلی کوچک و ناچیز در زمان کنونی می‌شود.

ادامه‌ی مطلب...

📝تعداد کلمات: ۵۶۲
⏰زمان مطالعه: حدود سه دقیقه

📝تهیه و تنظیم: #مریم_رفیعی‌پور
دانشجوی کارشناسی‌ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

چهارشنبه‌ها: #اخبار_فناوری

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

📌منبع:
sciencedaily

📌🐍چرا زیست شناسا باید زبان پایتون را یادبگیرن⁉️

✅یادگیری یه زبان برنامه نویسی جدید ، تصمیم مهمیه چون زبانی که یاد میگیرین باید قابلیت کاربرد تخصصی و حرفه ای در زمینه کاری شما را داشته باشه
✨پایتون قدرتمندترین زبان برنامه نویسی کاربردی تو ژنتیک 🧬 و سایر رشته زیست شناسی🔬

🔊 اگر فکر می‌کنی 🤔بلدی پیشرفته اش رو برو‼️ و گرنه مقدماتی❗️

🎥 https://news.1rj.ru/str/Iran_Bioinformatics💫

🎞ایمنی گله! 🐑🐑🐑بعععع...

📝 ترجمه و صداگذاری: #احمدرضا_رسولی
دانشجوی ارشد #بیوانفورماتیک آزمایشگاه #بیوانفورماتیک دانشگاه #تربیت_مدرس

پنجشنبه‌ها: #فیلم

✅کانال بیوانفورماتیک ایران
وب سایت:
🌐https://www.codecool.ir
اینستاگرام
@codecool_bioinformatics🌟
تلگرام:
@Iran_Bioinformatics💫

زیست شناسا به دو دسته تقسیم میشن اونایی که برنامه نویسی بلدن و اونایی که برنامه نویسی بلد نیستن👩‍💻👨‍💻
اگه میخوای یه زیست شناس مدرن باشی کلاسهای برنامه نویسیمون رو از دست ندید
🧬🐝📲💻