اوپن‌سورس‌ شدن جهان پروتئین‌ها توسط دیپ‌مایند

پروتئین‌ها واحد‌های پایه اعمال بایولوژیکی بدن انسان هستند. حمل اکسیژن‌ها توسط گلبول‌ها، تشخیص نور توسط چشم‌، حرکت ماهیچه‌ها و تشخیص سلول‌های سرطانی و خلاصه هر چه مکانیزم بایولوژیکی در هر چه موجود زنده هست رو پروتئین‌ها پی‌ریزی می‌کنند. هر پروتئین خودش از رشته‌ای از آمینواسید‌ها تشکیل شده (کلا ۲۰ نوع آمینواسید داریم) که طول این رشته میتونه تا چند هزار آمینواسید هم برسه. حالا نحوه تعامل و فعل و انفعالات بین این آمینواسید‌ها شکل سه‌بعدی یک پروتئین رو تعیین میکنه که بسیار پیچیده و دارای پیچ‌خوردگی‌ها و تا‌های زیادیه. از طرفی همین شکل سه‌بعدی پروتئین تعیین می‌کنه که پروتئین چه کاری و به چه صورتی انجام میده. ما اگر بدونیم میتونیم مثلا سریع‌تر علت بیماری‌ها رو بفهمیم و سریع‌تر براشون دارو و درمان پیدا کنیم یا حتی انزیم‌هایی رو کشف کنیم که بتونن پلاستیک رو بازیافت کنند.
برای چند دهه دانشمندان این حوزه تلاششون بر فهمیدن ساختار یک پروتئین از آمینواسید‌هاش بود که این تلاش‌ها به روش‌های آماری و بعد هم با ظهور ماشین لرنینگ به دیپ‌لرنینگ سپرده شدند. شرکت دیپ‌مایند در چند سال گذشته ابتدا مدل alphafold رو خلق کرد که میتونست همین تسک رو یعنی پیش‌بینی شکل سه‌بعدی هر پروتئین رو انجام بده. مدل alphafold یک مدل انقلابی در حوزه بیوانفورماتیک حساب میشه که یک مساله واقعی رو حل کرده. حالا دیپ‌مایند اومده و طی یک حرکت خفن پیش‌بینی مدل alphafold از شکل سه‌بعدی ۲۰۰ میلیون پروتئين (کل تعداد پروتئین‌هایی که در جهان تا حالا می‌شناسیم) رو اوپن‌سورس کرده! به امید این که سرعت در حوزه تحقیقات بایولوژی بالا بره.

لینک توضیح دیپ‌مایند:
https://www.deepmind.com/blog/alphafold-reveals-the-structure-of-the-protein-universe
لینک دیتابیس اوپن‌سورس شده:
https://alphafold.ebi.ac.uk/

پ.ن.: از این که پست‌های کانال رو به اشتراک می‌گذارید صمیمانه ازتون ممنونیم.

#read
#news

@nlp_stuff

با این کار و با در نظر گرفتن بودجه خیلی زیادی که چند سال اخیر به خاطر کرونا برای تولید واکسن گذاشته شد و خب الان که کرونا دیگه اونقدر وحشتناک نیست یه مقدار زیادی از بودجه مونده و در همین راستا پیش می‌ره، حدس می‌زنم در زمینه‌ی داروها اتفاقات جالب و قشنگ و شاید در بعضی موارد ترسناکی بتونه بیوفته به زودی.

Several Postdoc and PhD positions are available to work on the following topics:
- Hybrid (data-driven/model-based) methods for planning & scheduling
- Verification of learnt policies and schedules
- Robustness analysis for learnt policies and schedules
- Explanations of plans, policies, and schedules

The positions are at two institutions:

- the Federal University of Toulouse (the ANITI institute). These positions have an ideal start date of October 2022 and are funded by the new Horizon Europe Research project TUPLES. For more details see: http://tinyurl.com/tuples-positions

- the Australian National University. These positions have a more flexible starting date, and are funded by the Australian Research Council project "AI Planning: The Next Generation". For more details about the environment at ANU, including other postdoc/PhD opportunities in the area of planning and scheduling, see: https://comp.anu.edu.au/opportunities/planning/

Please contact Sylvie.Thiebaux@gmail.com if you are interested.

یه لیست خوبی راجع به منابع در حوزه امنیت سایبری:

https://x0rb3l.github.io/Cyber-Bookmarks/bookmarks.html

توی این نقشه روی نقاط مختلف جهان اسم آدمایی معروفی که توی هر شهر به دنیا اومدند رو نوشته. خیلی بامزه بود:
https://tjukanovt.github.io/notable-people

این آهنگ از «کاکوبند» یه گروه موسیقی تلفیقی ایرانیه. تازه پیداش کردم و هر بار گوش میدم مو به تنم سیخ میشه!

https://soundcloud.com/kakoband/wilderness?in=kakoband/sets/kakoband-new-world-2019

یه سری کپچا هست که میاره و مثلا میگه همه چراغ های راهنمایی رو علامت بزن تا بفهمیم ربات نیستی. بعد یه سری ابزار درست کردند با هوش مصنوعی و اینا که بتونه اونا رو تشخیص بده. حالا این یکی انگار از این ابزارهای جدید هوش مصنوعی استفاده کرده که یه سری اسب و فیل و اینا درست کنه که از ابر درست شدند و به کاربر گفته اسب‌هایی که از ابر درست شدند رو مشخص کن!
😂😂😂😂😂

https://twitter.com/bakztfuture/status/1553071605722615809?t=5uhb83FW016sa1_B_d0l1w&s=09

میدونستین اگه کرونای دلتا مثبت شه دوتا جواب داره؟

➖Gloomy Sunday➖

@sut_tw

حسینا گفت: «می‌دانی اولین بوسه جهان چطور کشف شد؟»
دست هاش تا آرنج گِلی بود، گفت که در زمان های بسیار قدیم زن و مردی پینه دوز یک روز به هنگام کار بوسه را کشف کردند. مرد دست هاش به کار بود، تکه نخی را با دندان کند، به زنش گفت بیا این را از لب من بردار و بینداز. زن هم دست هاش به سوزن و وصله بود، آمد که نخ را از لب های مرد بردارد، دید دستش بند است، گفت چه کار کنم. ناچار با لب برداشت، شیرین بود، ادامه دادند.

از کتاب مورد علاقه‌ام: سال بلوا

حدیث عشق شنیدن کم از شهادت نیست
سخن بگو و بفرما کفن کنند مرا
.
#محمدسهرابی
#محمد_سهرابی
#محمد_سهرابی_معنی
#معنی
#معنی_زنجانی

توی ورد اگه کل متن رو سلکت کنید و F9 رو بزنید، همه‌ی رفرنس‌ها و فهرست‌ها رو خودش براتون آپدیت می‌کنه.

به عنوان دارو، روزی یه بار تجویز میشه 😂

این برای خلاصه‌سازی فارسی ابزار بدی نبود:
https://ai.inoor.ir/text-summarizer/

مطلب علمی آخر شب آوردم براتون:

https://en.m.wikipedia.org/wiki/Dinkus

فکر کن یه زمانی توی هوش مصنوعی، در کنار مباحثی مثل «learning-to-rank» یا «learning-to-hash» یا کلی مبحث یادگیری ماشین دیگه، مبحث «learning-to-love» داشته باشیم! خیلی جذاب میشه!!!