این گروه تلگرام در راستای جلسات یکشنبه درباره چیستی حیاته. در گروه امکان تبادل دانش با ما و سایر اعضا رو دارید و میتونید پرسش های خودتون درباره جلسات رو بپرسید تا آفلاین بحث کنیم. برای کسانی که جدی این پرسش رو دنبال میکنن، این گروه محیط پربازده ای خواهد بود.

جلسه سوم این بوک کلاب فردا(یکشنبه 9 دی ماه) ساعت 18 در کانال تلگرامی زیر برگزار می‌شه.

لینک کانال بوک کلاب

توی این جلسه به شرح جایگاه مفاهیمی مثل انرژی، ماشین‌های گرمایی و واکنش‌های شیمیایی در مطالعه حیات خواهیم پرداخت.



@The_maze2022

سخنی درباره جلسات "حیات چیست؟"

مجموعه نشست‌های «حیات چیست» با هدف خواندن، پژوهیدن، و به اشتراک‌گذاری دانسته‌ها درباره چیستی موجودات زنده و حیات شکل گرفته است. این نشست‌ها یک «راه» پژوهشی را آغاز می‌کنند، برای کاویدن و اندیشیدن. عنوان نشست‌ها روشنگر نگاه میزبان ها است که دو ویژگی بنیادی از موجود زنده «کنش‌گری» و «شناخت» است که حتی در ساده‌ترین موجودات زنده به شکل فرایندهای زیستی جای گرفته‌اند. این بیشتر یک انگاره (تئوری) است. مانند هر انگاره دیگری، ممکن است نقطه‌ای برای فروپاشی وجود داشته باشد که تنها با مشاهده و پژوهش می‌توان آن را آشکار کرد.

مهم تر از درستی یا نادرستی این انگاره، مسیر اندیشه ای است که کوشش میکند زبان علمی دقیقی را پدید آورد که پژوهش درباره این انگاره را شدنی کند. پرسش درباره حیات در طول تاریخ همواره برای ما دیدگاه‌ها و ابزارهای اندیشه ای تازه‌ای به ارمغان آورده که جریان سازِ فهمِ نسبت ما با جهان پیرامون خودمان بوده است. این دستاوردهاست که فهم این ابزارهای اندیشه ای را بیش از اثبات درستی پیش فرضی که این ابزارها بر مبنای آن شکل گرفته مهم میسازد. (کافی است به دستاوردهای اندیشه‌ی سیبرنتیک نگاهی بیندازید تا ببینید این پرسش چگونه فناوری‌های امروزین، از نظریه کنترل تا شبکه‌های عصبی، را ممکن کرده است).

دهه‌هاست به این نتیجه رسیده‌ایم که زبانی که درباره حیات سخن می‌گوید، تقسیم‌بندی علم بر اساس دنیای مدرن را نمی‌پذیرد و این مرزها را کنار می‌زند. این نقطه‌ای است هیجان‌انگیز و دهشتناک. هیجان انگیز چون مرزهای پژوهشی مختلف را باید درنوردید و آزادتر اندیشید و دهشتناک زیرا که حرکت میان همه این دانسته ها کار دشواری است و از نگاه کسانی که در ابتدای این مسیر هستند ممکن است غیرممکن باشد. اما اگر سراسیمه بدنبال نتیجه گرفتن نباشیم و بدانیم که ارزش این مسیر، به هر اندازه که در آن بتوانیم گام برداریم، ایجاد ساختار اندیشه ای نوینی درون ماست، این مسیر را آسان تر آغاز میکنیم.

چشم‌انداز این نشست‌ها فراهم کردن بستری برای پایه‌ریزی این ساختار اندیشه‌ای نو در میان فارسی‌زبانان است. اما برای کسانی که این نشست‌ها را دنبال می‌کنند، پیشنهاد می‌کنم تنها به شنیدن آن بسنده نکنند. آنچه را می‌شنوید به چالش بکشید، درباره آن بیشتر بخوانید، و این راه را برای خودتان شخصی‌سازی کنید. نشست‌ها را می‌توان به مثابه چراغی دید که بر برخی خطوط دانش بشری نور می‌تاباند تا آنها را برجسته‌تر کند و شما را علاقه‌مند کند که این بخش‌ها را بیشتر بخوانید. این خطوط، گزیده‌ای از راه اندیشه میزبان هاست و بی‌گمان همه ماجرا را در بر نمی‌گیرد. از همین رو، لازم است که راه خودتان را بسازید.

این جلسه از 5 دقیقه دیگه آغاز میشه

📌آزمایشگاه NeuroInk با همکاری انجمن علمی‌ دانشجویی زیست‌شناسی برگزار می‌کند:

🧠پنجمین جلسه ژورنال کلاب علوم اعصاب

📄موضوع: Salience, relevance, and firing: a priority map for target selection
🧾لینک مقاله: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16843702/
🗣ارائه‌دهنده: زینب نصرت طلب حقی(دانشجوی کارشناسی زیست شناسی سلولی و مولکولی)
👨‍⚕️با نظارت سیدجواد ساغروانیان (پژوهشگر پسادکتری علوم اعصاب)

🕒زمان: سه شنبه 11 ام دی‌ماه، ساعت 12 الی 14
🏢مکان: دانشگاه فردوسی مشهد، دانشکده علوم پایه، کلاس 24

📧 برای عضویت در آزمایشگاه، رزومه و انگیزه نامه خود را به آدرس ایمیل آزمایشگاه ارسال فرمائید.
📩 ایمیل: neuroinklab@gmail.com
📶 راه ارتباطی با ما: @Arefhzd


📱انجمن علمی دانشجویی زیست‌شناسی
تلگرام | اینستاگرام

📱نورواینک (NeuroInk Lab)
تلگرام | اینستاگرام | توییتر(ایکس)

📌آزمایشگاه NeuroInk با همکاری انجمن علمی‌ دانشجویی زیست‌شناسی برگزار می‌کند:

🧠ششمین جلسه ژورنال کلاب علوم اعصاب

📄موضوع: Fundamental components of attention
🧾لینک مقاله: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17417935/
🗣ارائه‌دهنده: زهرا ابوالحسنی(دانشجوی کارشناسی ارشد فیزیولوژی)
👨‍⚕️با نظارت سیدجواد ساغروانیان (پژوهشگر پسادکتری علوم اعصاب)

🕒زمان: یکشنبه 16 ام دی‌ماه، ساعت 12 الی 14
🏢مکان: دانشگاه فردوسی مشهد، دانشکده علوم پایه، کلاس 13

📧 برای عضویت در آزمایشگاه، رزومه و انگیزه نامه خود را به آدرس ایمیل آزمایشگاه ارسال فرمائید.
📩 ایمیل: neuroinklab@gmail.com
📶 راه ارتباطی با ما: @Arefhzd


📱انجمن علمی دانشجویی زیست‌شناسی
تلگرام | اینستاگرام

📱نورواینک (NeuroInk Lab)
تلگرام | اینستاگرام | توییتر(ایکس)

آغاز ثبت نام گام سوم دوره جامع "مقدمه ای بر سیبرنتیک"

گام سوم: مسائل بنیادین سیبرنتیک

لینک ثبت‌نام در گام سوم


این گام به صورت 8 ساعت درسگفتار در 4 جلسه است که در نرم‌افزار زوم برگزار می‌شود.

فیلم جلسات بلافاصله پس از کلاس در اختیار دانشجویان قرار می‌گیرد.

علاوه بر این 8 ساعت، تعدادی درسگفتار و مطالب تکمیلی در اختیار دانشجویان قرار خواهد گرفت.



توجه: برای تسهیل دسترسی علاقه‌مندان به شرکت در این دوره، دانشجویانی که پیش‌ از برگزاری جلسات آنلاین ثبت‌نام کنند، می‌توانند با کد تخفیف زیر از 70% تخفیف برخوردار شوند.

🔽🔽
کد تخفیف: DY403



سرفصل‌های گام سوم

نقشه راه دوره جامع "مقدمه ای بر سیبرنتیک"

همچنین دوستانی که علاقه مند به شرکت در گام های قبلی هستند می توانند از لینک زیر ثبت نام کنند.

لینک ثبت‌نام در گام اول(نگاهی تاریخی به سیبرنتیک)
لینک ثبت‌نام گام دوم(شرحی بر سیستم‌های کنترل)

@the_maze2022

در این جلسه "حیات چیست؟" درباره مفاهیم مهمی چون مکانیک آماری، خودسازماندهی، و ذرات فعال صحبت خواهیم کرد.

خودسازماندهی به عنوان یکی از ویژگی های بنیادینی نگریسته میشد که موجود زنده رو از غیرزنده جدا میکرد. هر چند امروز میدونیم این ویژگی کافی نیست و مختص موجود زنده هم نیست (؟)، اما همچنان این فرآیند به عنوان یک ویژگی مهم از موجود زنده به حساب میاد.

با تکیه بر مفاهیم ترمودینامیک که جلسه پیش یاد گرفتیم، به سراغ ارائه یک تعریف فرمال از خودسازماندهی میریم.

سپس این فرآیند رو در دنیای اطراف جستجو میکنیم که ما رو به ذرات فعال میرسونه. توضیح خواهیم داد این ذرات چه هستند و چطور این سیستم های ساده تر به فهم حیات در فرم های پیچیده تر کمک میکنند.

https://news.1rj.ru/str/c/2357905230/97

مبانی نظریه اطلاعات شانون

برای جلسه فردا "حیات چیست" تماشای ویدیو "مبانی نظریه اطلاعات شنون" رو پیشنهاد میکنم.

#neurosyntax

📌آزمایشگاه NeuroInk با همکاری انجمن علمی‌ دانشجویی زیست‌شناسی برگزار می‌کند:

🧠هفتمین جلسه ژورنال کلاب علوم اعصاب

📄موضوع:
Selecting one among the many

🧾لینک مقاله ها:
https://dl.acm.org/doi/abs/10.5555/889283

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/3836989/

https://ieeexplore.ieee.org/document/730558

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10788654/

https://www.nature.com/articles/35058500

🗣 ارائه‌دهنده: ارشیا احمدزاده(دانشجوی کارشناسی زیست شناسی سلولی و مولکولی)

👨‍⚕️با نظارت سیدجواد ساغروانیان (پژوهشگر پسادکتری علوم اعصاب)

🕒 زمان: یکشنبه 23 ام دی‌ماه، ساعت 12 الی 14

🏢 مکان: دانشگاه فردوسی مشهد، دانشکده علوم پایه، کلاس 24

📧 برای عضویت در آزمایشگاه، رزومه و انگیزه نامه خود را به آدرس ایمیل آزمایشگاه ارسال فرمائید.

📩 ایمیل: neuroinklab@gmail.com

📶 راه ارتباطی با ما: @Arefhzd


📱نورواینک (NeuroInk Lab)
تلگرام | اینستاگرام | توییتر(ایکس)

📱انجمن علمی دانشجویی زیست‌شناسی
تلگرام | اینستاگرام

درود به همگی دوستان و همراهان

ما تاکنون چهار جلسه از مجموعه "حیات چیست" رو برگزار کردیم. در این چهار جلسه کوشش کردیم مبانی ای رو بحث کنیم که در طی جلسات به اونها نیاز داریم. بدون شک ساختار و محتوای جلسات کوتاهی هایی داشته که امکان بهتر شدن داره.

اگر در جلسات شرکت کردید و یا فایل های آفلاین رو تماشا کردید دیدگاه های خودتون درباره جلسات رو زیر این پست قرار بدید. بر مبنای این دیدگاه ها برنامه ریزی ما تغییر خواهد کرد.

یکی از چیزهایی که داریم بررسی میکنیم تغییر کتاب انتخاب شده است. ما قرار بود کتاب Understanding Understanding رو در کنار هم بخونیم که در واقع مجموعه ای از مقالات هستن که بر پایه کنفرانس های سیبرنتیک نگاشته شدن. اما با توجه به بازخورد ها فکر میکنیم شاید این کتاب انتخاب مناسبی برای شروع مسیر نباشه. لیست دیگری از کتاب های مورد به پرسش اصلی "حیات چیست" جمع آوری کردیم که از میان آنها میخوایم انتخاب کنیم. دیدگاه های شما بسیار به ما کمک میکنه انتخاب درست تری انجام بدیم.

در کنار جلسات اصلی که یکشنبه ها برگزار خواهد شد ما سعی میکنیم درسگفتارهایی هم درست کنیم که کوتاه هستند و اطلاعاتی تکمیل کننده در رابطه با جلسات اصلی به شما میدن.

تمام این کوشش ها برای آشنایی مخاطب های فارسی زبان با گفتمان جریان های مهم علم در تاریخ اندیشه است. در نتیجه همراهی فعال شما بسیار ارزشمنده.

درود به همگی دوستان

در جلسه این هفته "حیات چیست" که امروز ساعت شش بعد از ظهر برگزار خواهد شد به بررسی منشا حیات خواهیم پرداخت. آسیه علیخواه، پژوهشگر ژنتیک در پژوهشگاه بیوتکنولوژی TeloGenomic تورنتو کانادا، با تکیه بر کتاب The Vital Question: Energy, Evolution, and the Origins of Complex Life یکی از دیدگاه های چگونگی آغاز حیات را روایت خواهد کرد.

این جلسه بسیاری از مفاهیمی که در جلسات گذشته کار کردیم رو به هم پیوست خواهد داد برای نمونه انتروپی، انرژی آزاد، واکنش های خودبخودی و ....

#neurosynatax

❗️❗️❗️ درود دوستان، این برنامه به دلیل کسالت مهمان این هفته برگزار نخواهد شد.❗️❗️❗️

درود بر همراهان،

از یکشنبه دو هفته آینده، خوانش کتاب "حیات چیست" اروین شرودینگر رو آغاز خواهیم کرد. این کتاب، که الهام بخش بسیاری از زیست شناسان بزرگ بوده، به گونه ای منسجم بسیاری از محتوایی که تاکنون در جلسات کتابخوانی بررسی شده رو کنار هم قرار میده، پرسش هایی درباره امکان حیات، ترمودینامیک حیات، به کار گیری مفاهیمی مانند کد و اطلاعات و ...

این کتاب رو سعی میکنیم طی نزدیک به یک ماه و تا پیش از شروع سال جدید تمام کنیم. مطالعه کتاب رو آغاز کنید تا در جلسات فعال تر باشید.

درود به دوستان و همراهان

در موضوع پایانی از فصل نخست آزمایشگاه نوروسینتکس، به "مبانی نگارش علمی" خواهیم پرداخت. نگارش علمی، گام پایانی پژوهش و یکی از مهم‌ترین بخش‌های آن است. این هنر با تمرین و تجربه به دست میاد و هر پژوهشگر با گذر زمان سبک منحصر به فرد خود را در نوشتن پیدا می‌کند. اما مبانی مشترکی زیربنای تمامی این سبک ها هست.

در جلسات "مبانی نگارش علمی":

سبک‌های مختلف نگارش علمی را بررسی می‌کنیم.
انواع مقالات علمی را خواهیم شناخت.
انتظارات ژورنال‌های گوناگون از سبک نگارش را مرور می‌کنیم.

همچنین مبانی مشترکی که زیربنای نگارش علمی هستند، مانند:

▫️انتخاب واژگان مناسب،
▫️ساختاردهی به پاراگراف‌ها،
▫️و چگونگی ایجاد یک روایت منطقی میان پاراگراف‌ها،

را آموزش خواهیم داد.


زمان جلسات "مبانی نگارش علمی":

قسمت اول: شنبه، 6 بهمن، ساعت 18:30
قسمت دوم: شنبه، 13 بهمن، ساعت 18:30

مکان برگزاری: آنلاین (پلتفرم زوم)

#neurosynatax
https://news.1rj.ru/str/Neuro_Syntax

در فصل دوم آزمایشگاه نوروسینتکس مقاله زیر را بررسی خواهیم کرد:

Spontaneous behaviors drive multidimensional, brainwide activity.

تحلیل های داده ای که خواهیم آموخت:

▫️چگونگی ثبت تصاویر فعالیت کلسیمی و آنالیز این تصاویر
- کار کردن با نرم افزار Suite2p برای پیش-پردازش داده های تصویربرداری کلسیمی مانند Image registration و ROI extraction

Suite2p: beyond 10,000 neurons with standard two-photon microscopy
github: https://github.com/Mouseland/suite2p


▫️پیش-پردازش داده های ثبت خارج سلولی (تمرکز بر مبانی Spike Sorting برای High-density recordings - با استفاده از نرم افزار Kilosort)

Spike sorting with Kilosort4
github: https://github.com/MouseLand/Kilosort

- ویرایش نتایج اتوماتیک الگوریتم ها با Phy
github: https://github.com/cortex-lab/phy

▫️آموزش کار کردن با Rastermap برای کشف الگوهای دیتا

Rastermap: a discovery method for neural population recordings
https://github.com/MouseLand/RasterMap

▫️آموزش کار با FaceMap برای پیدا کردن الگوهای رفتاری چهره

github: https://github.com/MouseLand/FaceMap

و بسیاری آنالیز های دیگر ...


بخشی از آنالیز های این مقاله پیشتر در ویدیوهای آموزشی بررسی شده:

- آموزش Support Vector Machines

- آموزش Singular Value Decomposition

اگر تمایل به همکاری در فصل دوم آزمایشگاه دارید، زیر این پست کامنت بذارید تا با شما تماس بگیرم.

#neurosyntax

❗️❗️❗️

درود به همگی دوستان،

جلسه نخست "نگارش علمی" امروز، شنبه، ساعت شش و نیم برگزار خواهد شد.

لینک زوم پیش از جلسه در این کانال ارسال خواهد شد. برای ورود به جلسه ممکن است نیازمند وی پی ان باشید ولی پس از ورود به جلسه میتونید وی پی ان های خودتون رو خاموش کنید.

جلسه بعدی این بوک کلاب فردا (یکشنبه 9 دی ماه) ساعت 18 در کانال تلگرامی زیر برگزار می‌شه.

لینک کانال بوک کلاب