از امروز، شنبه، سری جدیدی از جلسات نوروسینتکس رو شروع میکنیم که قراره به جای ارائههای فردمحور، بیشتر روی دیالوگ های جمعی متمرکز باشه. هدف این جلسات به اشتراک گذاشتن اندیشه و دیدگاهها دربارهی موضوعات بحثبرانگیز در علوم اعصاب و رفتار هست. توی این جلسات با هم تلاش میکنیم پرسشهای اساسی رو پیدا کنیم، چالشها رو بررسی کنیم و جوابهای احتمالی رو کنار هم بسازیم. حتی گاهی شاید دست به خیالپردازی هم بزنیم. اسم این جلسات رو گذاشتیم آگورا؛ برگرفته از یونان باستان، جایی که محل گفتگو و تبادل بوده.
هدف این هست که ساختار جلسات به سمتی بره که طی یک ماه چندین دیالوگ هفتگی داشته باشیم و در انتهای اون ماه اگر بتونیم یک مهمان دعوت کنیم که درباره پژوهش های خودش که در اون حوزه هست به انگلیسی برای ما بگه و بتونیم با اون هم صحبت کنیم.
برای هر دیالوگ مجموعه ای از مقالات معرفی میشن ولی این مقالات فقط برای ایجاد یک زمین مشترک برای دیالوگ هستن. مطالعه اونها ضروری نیست. ولی سعی کنید با پرسش وارد جلسه بشید و تا جایی که ممکنه درباره اون حوزه دانش کسب کنید تا بتونید این دانش رو در جلسه به اشتراک بگذارید.
هدف این هست که ساختار جلسات به سمتی بره که طی یک ماه چندین دیالوگ هفتگی داشته باشیم و در انتهای اون ماه اگر بتونیم یک مهمان دعوت کنیم که درباره پژوهش های خودش که در اون حوزه هست به انگلیسی برای ما بگه و بتونیم با اون هم صحبت کنیم.
برای هر دیالوگ مجموعه ای از مقالات معرفی میشن ولی این مقالات فقط برای ایجاد یک زمین مشترک برای دیالوگ هستن. مطالعه اونها ضروری نیست. ولی سعی کنید با پرسش وارد جلسه بشید و تا جایی که ممکنه درباره اون حوزه دانش کسب کنید تا بتونید این دانش رو در جلسه به اشتراک بگذارید.
NeuroSyntax
موضوع این جلسه 👆🏻
جلسه امروز، شنبه، هشت شهریور ساعت پنج و نیم به وقت تهران برگزار خواهد شد.
NeuroSyntax
لینک زوم شرکت در جلسه: https://tinyurl.com/ywahdr4y جلسه ساعت پنج و نیم به وقت تهران آغاز خواهد شد.
دوستان، جلسه رو داریم آغاز میکنیم...
دو رویکرد به مطالعه عملکرد شناختی مغز
در این جلسهی گفتوگوی نوروسینتکس به یک موضوع اساسی در علوم اعصاب پرداختیم:
آیا میتوان میان رویکردهای مداری–ساختاری (که بر انواع نورونها و مدارهای مشخص تمرکز میکنند) و رویکردهای دینامیکی–مانيفولد محور (که فعالیت جمعیتهای بزرگ نورونی را در فضاهای حالت توصیف میکنند) آشتی برقرار کرد؟
ما با بررسی دو مقالهی مهم—Two views on the cognitive brain و A unifying perspective on neural manifolds and circuits for cognition—به این پرسش پرداختیم که:
هر کدام از این رویکرد ها از چه دریچه ای به عملکرد مغز در شناخت نگاه میکنند؟
فلسفه بنیادین و نشانه های نگاه دینامیکی به مغز چیست؟
چه زمانی نگاه مداری برای درک سازوکارهای مغزی ضروری است و چه زمانی نگاه دینامیکی بهتر عمل میکند؟
آیا میتوان این دو را بهجای رقابت، در یک چارچوب تکمیلی دید؟
در مجموعه جلسات این موضوع که در ادامه خواهیم داشت در واقع تلاش خواهیم کرد تا تفاوت های این رویکرد ها را بهتر بشناسیم و آنها را تا جای ممکن به هم نزدیک کنیم.
#neurosyntax #agora
در این جلسهی گفتوگوی نوروسینتکس به یک موضوع اساسی در علوم اعصاب پرداختیم:
آیا میتوان میان رویکردهای مداری–ساختاری (که بر انواع نورونها و مدارهای مشخص تمرکز میکنند) و رویکردهای دینامیکی–مانيفولد محور (که فعالیت جمعیتهای بزرگ نورونی را در فضاهای حالت توصیف میکنند) آشتی برقرار کرد؟
ما با بررسی دو مقالهی مهم—Two views on the cognitive brain و A unifying perspective on neural manifolds and circuits for cognition—به این پرسش پرداختیم که:
هر کدام از این رویکرد ها از چه دریچه ای به عملکرد مغز در شناخت نگاه میکنند؟
فلسفه بنیادین و نشانه های نگاه دینامیکی به مغز چیست؟
چه زمانی نگاه مداری برای درک سازوکارهای مغزی ضروری است و چه زمانی نگاه دینامیکی بهتر عمل میکند؟
آیا میتوان این دو را بهجای رقابت، در یک چارچوب تکمیلی دید؟
در مجموعه جلسات این موضوع که در ادامه خواهیم داشت در واقع تلاش خواهیم کرد تا تفاوت های این رویکرد ها را بهتر بشناسیم و آنها را تا جای ممکن به هم نزدیک کنیم.
#neurosyntax #agora
YouTube
دو رویکرد به مطالعه عملکرد شناختی مغز
از مدار تا مانيفولد: آشتی رویکردهای ساختاری و دینامیکی در مطالعه مغز
در این جلسه از نوروسینتکس، به بحثی میان دو رویکرد در علوم اعصاب پرداختیم: نگاه مداری–ساختاری به مغز و نگاه دینامیکی–مانيفولد محور. نقطه شروع ما دو مقالهی مهم بود:
Two views on the cognitive…
در این جلسه از نوروسینتکس، به بحثی میان دو رویکرد در علوم اعصاب پرداختیم: نگاه مداری–ساختاری به مغز و نگاه دینامیکی–مانيفولد محور. نقطه شروع ما دو مقالهی مهم بود:
Two views on the cognitive…
منابع یاری کننده برای یادگیری بحث neural manifold و state-space analysis
David Barack on "Two Views on the Cognitive Brain"
در این جلسه از سالن علوم اعصاب و فلسفه، نویسندگان مقاله اصلی که مورد بحث جلسه بود درباره رویکرد فکری خودشون بحث میکنن و نقدها رو پاسخ میدن.
Computation and Neural Manifolds
ویدیو دیگری از دیوید باراک بر روی منلیفد نورونی به عنوان رویکردی برای فهم محاسبات نورونی
Elegant Geometry of Neural Computations
Neural manifolds - The Geometry of Behaviour
ویدیوهای آرتم کیرسانو رو دنبال کنید. یکی از معدود منابعی هست که کوشش میکنه با بصری سازی بسیار جذاب و توضیحات ساده مفاهیم رو توضیح بده. خودش هم دانشجوی علوم اعصاب محاسباتی نیویورک هست.
Sara Solla - Stable manifold dyn. underlie consistent execution of learned behavior (Cosyne 2019)
Sara Solla - The effect of network connectivity on population neural dynamics - IPAM at UCLA
سارا سولا از شخصیت ها بنام حوزه منیفلد نورونی هست و نقش بسزایی در گسترش این رویکرد داشته. سخنرانی های مختلفی در یوتیوب داره. در سخنرانی نخست درباره استفاده از رویکرد منلیفلد نورونی برای توضیح رفتار در یک تسک موتوری صحبت میکنه و در سخنرانی دوم درباره اثر ساختار شبکه عصبی روی دینامیک نورونی بحث میکنه.
CCN 2021: Flexible identification of population dynamics from neural activity recordings
یک سمینار چندین ساعته با سخنرانی از پژوهشگران مختلف
David Barack on "Two Views on the Cognitive Brain"
در این جلسه از سالن علوم اعصاب و فلسفه، نویسندگان مقاله اصلی که مورد بحث جلسه بود درباره رویکرد فکری خودشون بحث میکنن و نقدها رو پاسخ میدن.
Computation and Neural Manifolds
ویدیو دیگری از دیوید باراک بر روی منلیفد نورونی به عنوان رویکردی برای فهم محاسبات نورونی
Elegant Geometry of Neural Computations
Neural manifolds - The Geometry of Behaviour
ویدیوهای آرتم کیرسانو رو دنبال کنید. یکی از معدود منابعی هست که کوشش میکنه با بصری سازی بسیار جذاب و توضیحات ساده مفاهیم رو توضیح بده. خودش هم دانشجوی علوم اعصاب محاسباتی نیویورک هست.
Sara Solla - Stable manifold dyn. underlie consistent execution of learned behavior (Cosyne 2019)
Sara Solla - The effect of network connectivity on population neural dynamics - IPAM at UCLA
سارا سولا از شخصیت ها بنام حوزه منیفلد نورونی هست و نقش بسزایی در گسترش این رویکرد داشته. سخنرانی های مختلفی در یوتیوب داره. در سخنرانی نخست درباره استفاده از رویکرد منلیفلد نورونی برای توضیح رفتار در یک تسک موتوری صحبت میکنه و در سخنرانی دوم درباره اثر ساختار شبکه عصبی روی دینامیک نورونی بحث میکنه.
CCN 2021: Flexible identification of population dynamics from neural activity recordings
یک سمینار چندین ساعته با سخنرانی از پژوهشگران مختلف
YouTube
Elegant Geometry of Neural Computations
To try everything Brilliant has to offer—free—for a full 30 days, visit https://brilliant.org/ArtemKirsanov . You’ll also get 20% off an annual premium subnoscription
Socials:
X/Twitter: https://x.com/ArtemKRSV
Patreon: https://patreon.com/artemkirsanov…
Socials:
X/Twitter: https://x.com/ArtemKRSV
Patreon: https://patreon.com/artemkirsanov…
برای جلسه آینده آگورا مقالات زیر رو انتخاب کردیم:
Representational geometry of perceptual decisions in the monkey parietal cortex
امیررضا کوتاه به رویکرد و یافته های این مقاله خواهد پرداخت. هدف از انتخاب این مقاله آشنایی با چگونگی استفاده از رویکرد های State-space و Neural Manifold برای فهم سیستم عصبی و شناخت هست. یافته های بدست آمده از این رویکرد رو با یافته های گذشته مقاله خواهیم کرد.
برای پیشبرد جلسات به سمت جلو هم دو مقاله مروری-پرسپکتیو دیگه انتخاب کردیم که تکمیل کننده و پیشبرنده مباحث جلسه گذشته هستن:
Neural manifolds: more than the sum of their neurons
From cell types to population dynamics: Making hippocampal manifolds physiologically interpretable
هر چند ما برای به پیش بردن جلسات مقاله معرفی میکنیم، تمرکز بیشتر بر روی پرسش ها و بحث هاست نه مقالات خاص. برای همین اگر یک مقاله ای رو مطالعه نکردید هم به جلسه بیاید و دیدگاه ها و پرسش های خودتون رو به اشتراک بذارید. امیدوارم که مثل جلسه گذشته پرانرژی به جلسه بیاید و بیش از پیش در بحث های جلسه شرکت کنید.
#neurosyntax #agora
Representational geometry of perceptual decisions in the monkey parietal cortex
امیررضا کوتاه به رویکرد و یافته های این مقاله خواهد پرداخت. هدف از انتخاب این مقاله آشنایی با چگونگی استفاده از رویکرد های State-space و Neural Manifold برای فهم سیستم عصبی و شناخت هست. یافته های بدست آمده از این رویکرد رو با یافته های گذشته مقاله خواهیم کرد.
برای پیشبرد جلسات به سمت جلو هم دو مقاله مروری-پرسپکتیو دیگه انتخاب کردیم که تکمیل کننده و پیشبرنده مباحث جلسه گذشته هستن:
Neural manifolds: more than the sum of their neurons
From cell types to population dynamics: Making hippocampal manifolds physiologically interpretable
هر چند ما برای به پیش بردن جلسات مقاله معرفی میکنیم، تمرکز بیشتر بر روی پرسش ها و بحث هاست نه مقالات خاص. برای همین اگر یک مقاله ای رو مطالعه نکردید هم به جلسه بیاید و دیدگاه ها و پرسش های خودتون رو به اشتراک بذارید. امیدوارم که مثل جلسه گذشته پرانرژی به جلسه بیاید و بیش از پیش در بحث های جلسه شرکت کنید.
#neurosyntax #agora
Cell
Representational geometry of perceptual decisions in the monkey parietal cortex
Comparison of neuronal activity during decision-making in face and motion discrimination
tasks reveals task-dependent response geometry that shapes optimal readout of the
decision variable.
tasks reveals task-dependent response geometry that shapes optimal readout of the
decision variable.
NeuroSyntax pinned «برای جلسه آینده آگورا مقالات زیر رو انتخاب کردیم: Representational geometry of perceptual decisions in the monkey parietal cortex امیررضا کوتاه به رویکرد و یافته های این مقاله خواهد پرداخت. هدف از انتخاب این مقاله آشنایی با چگونگی استفاده از رویکرد های State…»
در نشست بعدی آگورا من مقاله اورجینال زیر رو ارائه خواهم کرد. پیش از اینکه به این مقاله برسم یک تاریخچه ای از مطالعه Spatial Navigation در هیپوکمپ میگم و درباره نگاه تک نورون و جمعیت نورونی هم خواهم گفت. در نهایت به مقاله زیر میرسم که یک رویکرد دوگانه رو بکار گرفته و منیفلد نورونی رو در جمعیت نورونی گوناگون بررسی کرده و اونها رو به رفتار مرتبط کرده.
Cell-type-specific manifold analysis discloses independent geometric transformations in the hippocampal spatial code
From cell types to population dynamics: Making hippocampal manifolds physiologically interpretable
امیررضا مقاله مروری زیر رو ارائه خواهد کرد.
A neural manifold view of the brain
زمان دقیق جلسه تا چند روز آینده مشخص و اعلام خواهد شد.
سپاس از اینکه ما رو در جلسات همراهی میکنید و امیدوارم که در جلسات بعدی مشارکت های بیشتری داشته باشید.
#neurosyntax #agora
Cell-type-specific manifold analysis discloses independent geometric transformations in the hippocampal spatial code
From cell types to population dynamics: Making hippocampal manifolds physiologically interpretable
امیررضا مقاله مروری زیر رو ارائه خواهد کرد.
A neural manifold view of the brain
زمان دقیق جلسه تا چند روز آینده مشخص و اعلام خواهد شد.
سپاس از اینکه ما رو در جلسات همراهی میکنید و امیدوارم که در جلسات بعدی مشارکت های بیشتری داشته باشید.
#neurosyntax #agora
بررسی مکانیزم های نورونی تصمیم گیری
در این نشست آگورا، امیررضا به مرور بخشی از تاریخ مطالعه مکانیزمهای نورونی تصمیمگیری میپردازد. او ابتدا به رویکردهای مبتنی بر میانگینگیری از فعالیت تکنورونها اشاره میکند و سپس با بررسی مقالهای تازه، به رویکردهای جدیدتر مبتنی بر فعالیت مجموعههای نورونی میپردازد.
مقاله اصلی این جلسه:
Representational geometry of perceptual decisions in the monkey parietal cortex
#neurosyntax #agora
در این نشست آگورا، امیررضا به مرور بخشی از تاریخ مطالعه مکانیزمهای نورونی تصمیمگیری میپردازد. او ابتدا به رویکردهای مبتنی بر میانگینگیری از فعالیت تکنورونها اشاره میکند و سپس با بررسی مقالهای تازه، به رویکردهای جدیدتر مبتنی بر فعالیت مجموعههای نورونی میپردازد.
مقاله اصلی این جلسه:
Representational geometry of perceptual decisions in the monkey parietal cortex
#neurosyntax #agora
YouTube
مکانیزم های نورونی تصمیم گیری
در این نشست آگورا، امیررضا به مرور بخشی از تاریخ مطالعه مکانیزمهای نورونی تصمیمگیری میپردازد. او ابتدا به رویکردهای مبتنی بر میانگینگیری از فعالیت تکنورونها اشاره میکند و سپس با بررسی مقالهای تازه، به رویکردهای جدیدتر مبتنی بر فعالیت مجموعههای نورونی…
در طی دو هفته گذشته در جلسات آگورا، تمرکزمون رو بر بررسی مباحث مربوط به Neural Manifold گذاشتیم.
در جلسه اول سعی کردیم کلیات رو بررسی کنیم و با ایدههای اصلی آشنا بشیم و در جلسه دوم هم نمونهای از کاربرد این رویکرد در بحث تصمیمگیری رو بررسی کردیم.
در ادامه این سری از آگورا، روز یکشنبه (۲۳ شهریور) ساعت ۱۷، مقاله دیگهای رو ارائه خواهم داد که جنبه متفاوتی از کاربرد رویکرد Neural Manifold رو نشون میده:
Geometry of abstract learned knowledge in the hippocampus
در این مقاله خواهیم دید که چطور رویکرد Neural Manifold به ما در توصیف بازنمایی همزمان ویژگیهای فیزیکی و انتزاعی در هیپوکمپ کمک خواهد کرد.
به علاوه بهانهای خواهد بود برای آشنا شدن با یکی از مسیرهای پژوهشی مهم در نوروساینس، یعنی کارهای آقای David Tank
مثل همیشه در نظر داشته باشید که علیرغم وجود ارائه در این جلسه، محوریت اصلی با گفتگو خواهد بود و تا جای ممکن سعی میکنم کوتاه ارائه بدم.
بنابراین لطفاً در جلسه شرکت کنید و با مشارکت در گفتگوها به غنای جلسه کمک کنید.
#agora
@Neuro_Syntax
در جلسه اول سعی کردیم کلیات رو بررسی کنیم و با ایدههای اصلی آشنا بشیم و در جلسه دوم هم نمونهای از کاربرد این رویکرد در بحث تصمیمگیری رو بررسی کردیم.
در ادامه این سری از آگورا، روز یکشنبه (۲۳ شهریور) ساعت ۱۷، مقاله دیگهای رو ارائه خواهم داد که جنبه متفاوتی از کاربرد رویکرد Neural Manifold رو نشون میده:
Geometry of abstract learned knowledge in the hippocampus
در این مقاله خواهیم دید که چطور رویکرد Neural Manifold به ما در توصیف بازنمایی همزمان ویژگیهای فیزیکی و انتزاعی در هیپوکمپ کمک خواهد کرد.
به علاوه بهانهای خواهد بود برای آشنا شدن با یکی از مسیرهای پژوهشی مهم در نوروساینس، یعنی کارهای آقای David Tank
مثل همیشه در نظر داشته باشید که علیرغم وجود ارائه در این جلسه، محوریت اصلی با گفتگو خواهد بود و تا جای ممکن سعی میکنم کوتاه ارائه بدم.
بنابراین لطفاً در جلسه شرکت کنید و با مشارکت در گفتگوها به غنای جلسه کمک کنید.
#agora
@Neuro_Syntax
Nature
Geometry of abstract learned knowledge in the hippocampus
Nature - The hippocampus geometrically represents both physical location and abstract variables on a neural manifold in mice performing a decision-making task in virtual reality.
یادآوری: جلسه فردا (یکشنبه) ساعت ١٧ برگزار خواهد شد.
لینک جلسه رو چند دقیقه قبلش اینجا میذارم.
لینک جلسه رو چند دقیقه قبلش اینجا میذارم.
تا ساعت پنج و نیم که جلسه رو شروع کنیم این ویدیو رو ببینید:
https://youtu.be/QHj9uVmwA_0?si=1rWG-YCUJvH4E5-K
https://youtu.be/QHj9uVmwA_0?si=1rWG-YCUJvH4E5-K
YouTube
Neural manifolds - The Geometry of Behaviour
This video is my take on 3B1B's Summer of Math Exposition (SoME) competition
It explains in pretty intuitive terms how ideas from topology (or "rubber geometry") can be used in neuroscience, to help us understand the way information is embedded in high…
It explains in pretty intuitive terms how ideas from topology (or "rubber geometry") can be used in neuroscience, to help us understand the way information is embedded in high…
Forwarded from پوریا آزادی (Poria Azadi) (Poria)
قراره به زودی یه ژورنال کلاب آنلاین درباره زیستشناسی نظری و حیات مصنوعی راه بندازیم.
جلساتش توی پلتفرم زوم برگزار میشه و برنامه جلسات رو اول هر ماه اعلام میکنیم.
دوستانی هم که علاقه مند به ارائه دادن در این ژورنال کلاب باشند می تونن هماهنگ کنن از چند هفته جلوتر که توی برنامه اعلام شده اول هر ماه قرار بگیره جلسه ارائهشون.
جلساتش رو احتمالا مشابه زمستان سال گذشته یکشنبه ها ساعت 18 میذاریم.
اگر برای حضور مداوم و فعال توی این جلسات پایه هستید یه اعلام حضور کنید ببینیم چند نفریم.
در ضمن بدیهی است که حضور در این جلسات برای همه آزاد و رایگانه.
@the_maze2022
جلساتش توی پلتفرم زوم برگزار میشه و برنامه جلسات رو اول هر ماه اعلام میکنیم.
دوستانی هم که علاقه مند به ارائه دادن در این ژورنال کلاب باشند می تونن هماهنگ کنن از چند هفته جلوتر که توی برنامه اعلام شده اول هر ماه قرار بگیره جلسه ارائهشون.
جلساتش رو احتمالا مشابه زمستان سال گذشته یکشنبه ها ساعت 18 میذاریم.
اگر برای حضور مداوم و فعال توی این جلسات پایه هستید یه اعلام حضور کنید ببینیم چند نفریم.
در ضمن بدیهی است که حضور در این جلسات برای همه آزاد و رایگانه.
@the_maze2022
مقاله بسیار جالبی که اخیراً در ساینس چاپ شده:
Visual objects refine head direction coding
با اینکه موشها میتونن اشیا رو تا حد خوبی تشخیص بدن، اما در مسیر بیناییشون ناحیهای برای این عملکرد پیدا نشده (مثل نواحی تمپورال نخستیها). تو این پژوهش با استفاده از fUS نشون دادن که Postsubiculum به اشیا پاسخ میده و بعدش با الکتروفیزیولوژی متوجه شدن که پاسخ به اشیا داره به head-direction cells این ناحیه برای بهبود عملکردشون کمک میکنه!
باز هم نشون میده که با حذف پیشفرضها درباره نواحی مختلف، میتونیم به عملکردشون در کارهایی که فکر نمیکردیم پی ببریم.
@Neuro_Syntax
Visual objects refine head direction coding
با اینکه موشها میتونن اشیا رو تا حد خوبی تشخیص بدن، اما در مسیر بیناییشون ناحیهای برای این عملکرد پیدا نشده (مثل نواحی تمپورال نخستیها). تو این پژوهش با استفاده از fUS نشون دادن که Postsubiculum به اشیا پاسخ میده و بعدش با الکتروفیزیولوژی متوجه شدن که پاسخ به اشیا داره به head-direction cells این ناحیه برای بهبود عملکردشون کمک میکنه!
باز هم نشون میده که با حذف پیشفرضها درباره نواحی مختلف، میتونیم به عملکردشون در کارهایی که فکر نمیکردیم پی ببریم.
@Neuro_Syntax
Science
Visual objects refine head direction coding
Animals use visual objects to guide navigation-related behaviors. However, visual object–preferring areas have yet to be described in the mouse brain, limiting our understanding of how visual objects affect spatial navigation system processing. Using ...