جلسه سوم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:

* Accurate scaling of fourier coefficients
* The effect of varying window length and overlap on power spectrum
* What are oscillators?
* How can oscillations be generated in the brain? Mechanisms of oscillations in the brain
* Neural oscillations: sustained activity or transient bursts?
* Stationarity and Non-stationarity
* Short-time fourier transform
* Morlet Wavelet representation

#Slides #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session3

اگر بدنبال محتوای مکمل برای جلسات کارگاه هستید میتونید کتاب زیر رو مطالعه کنید:

Analyzing Neural Time Series Data: Theory and Practice

یا ویدیو های مایک رو مشاهده کنید:

Mike X. Cohen Youtube

کدهای متلب جلسه سوم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

پیاده سازی STFT و Morlet Wavelet


Morelet Wavelet Spectrogram
wavelet transform of a signal with n number of frequencies in a user specified range frange

#Code #Matlab #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session3

جلسه چهارم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:

* What are timestamps and what are they used for?

* Multitaper Method for Spectral Estimation: Variability and the problem with averages, Time-locked and Non-time locked, Phase locked and non-phase locked, Slepian Tapers

* Digital Filters - Design and Implementation: What are filters? What are different types of filteres? What are they used for? How do they affect the signal?

+ Matlab Implementations

#Video #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session4

جلسه چهارم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:

* What are timestamps and what are they used for?

* Multitaper Method for Spectral Estimation: Variability and the problem with averages, Time-locked and Non-time locked, Phase locked and non-phase locked, Slepian Tapers

* Digital Filters - Design and Implementation: What are filters? What are different types of filteres? What are they used for? How do they affect the signal?

#Slide #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session4

Matlab Code
Multitaper Spectrogram
Source: https://github.com/preraulab/multitaper_toolbox

#matlab

Noise tools including Zapline (in session 4)
http://audition.ens.fr/adc/NoiseTools/

لینک های متلب مرتبط با جلسه چهارم:

Multitaper Spectral Estimation:
https://www.mathworks.com/help/signal/ref/dpss.html
https://www.mathworks.com/help/signal/ref/pmtm.html

Design Filters:
https://www.mathworks.com/discovery/filter-design.html
https://www.mathworks.com/help/signal/ref/butter.html
https://www.mathworks.com/help/signal/ref/fir1.html

Frequency response of digital filter:
https://www.mathworks.com/help/signal/ref/freqz.html

Apply Filtering:
https://www.mathworks.com/help/matlab/ref/filter.html
https://www.mathworks.com/help/signal/ref/filtfilt.html

Noise Removal:
https://www.mathworks.com/help/signal/ug/remove-the-60-hz-hum-from-a-signal.html

#matlab

در صورتی که پیشنهادی برای محتوا و یا روش ارائه مطالب کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر دارید میتوانید در بخش کامنت های این پست ارائه کنید.

جلسه نخست حل تمرین و مرور کد های جلسات اصلی
کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

محتوای ارائه شده:

FFT, Welch, STFT, Morlet Wavelet,
Unit Conversion,
Plotting



#Video #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #PracSess1

جلسه نخست حل تمرین و مرور کد های جلسات اصلی
کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

محتوای ارائه شده:

FFT, Welch, STFT, Morlet Wavelet,
Unit Conversion,
Plotting,

#Code #Matlab #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #PracSess1

جلسه پنجم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:

* Hilbert Transform

* Envelope magnitude estimation

* Oscillatory Bout Detection using filter-Hilbert Method

* Oscillatory Bout Detection using BOSC


+ Matlab Implementations

#Video #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session5

جلسه پنجم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:

* Hilbert Transform

* Envelope magnitude estimation

* Oscillatory Bout Detection using filter-Hilbert Method

* Oscillatory Bout Detection using BOSC


#Slide #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session5

لینک دانلود تولباکس های BOSC و eBOSC

eBOSC github page:
https://github.com/jkosciessa/eBOSC


BOSC:
https://ars.els-cdn.com/content/image/1-s2.0-S1053811910011614-mmc1.zip

تولباکس های BOSC و eBOSC