جلسه سوم حل تمرین کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
* Oscillation Detection using Envelope Thresholdon Method
* FOOOF - fitting oscillations & one over f (Matlab Implementation)
* fBOSC

#Code #Matlab #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #PracSess3

کدهای جلسه سوم کارگاه دینامیک مغز

جلسه هشتم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
* Introducing Phase Time Series
* The conditions for a meaningful Phase (Bedrosian Theorem)
* Uses of Phase Time Series
- Inter-trial Phase Clustering
- Cross-frequency phase-amplitude coupling
- Spik-field coherence
- Travelling Waves


#Video #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session8

جلسه هشتم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
* Introducing Phase Time Series
* The conditions for a meaningful Phase (Bedrosian Theorem)
* Uses of Phase Time Series
- Inter-trial Phase Clustering
- Cross-frequency phase-amplitude coupling
- Spik-field coherence
- Travelling Waves


#Slide #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session8

با به اشتراک گذاری محتوا و یا آدرس کانال در سایر گروه/کانال های تلگرامی و یا دوستان خود که علاقه مند به مطالب هستند به گسترش محتوای نوروسینتکس کمک کنید.

https://news.1rj.ru/str/Neuro_Syntax

جلسه چهارم حل تمرین کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
* Extracting Phase from Hilbert and Morlet Wavelet Transform
* Interpreting Phase Time Series
* Intertrial-phase clustering/Resultant Vector
* Polar plots and Polar Histograms
* Introduction to Rayleigh test for non-uniformity of circular data

#Code #Matlab #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #PracSess4

کدهای جلسه چهارم کارگاه دینامیک مغز

#BrainDynamicsWorkshop
#matlab

جلسه نهم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
* Cross-frequency Coupling
————Introduction
————Network Architecture and Mechanisms
+ Phase-phase coupling
+ Phase-frequency coupling
+ Phase-amplitude coupling
+ Amlitude-amplitude coupling


#Video #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session9

اسلاید های جلسه نهم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
* Cross-frequency Coupling
————Introduction
————Network Architecture and Mechanisms
+ Phase-phase coupling
+ Phase-frequency coupling
+ Phase-amplitude coupling
+ Amlitude-amplitude coupling

#Slide #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session9

Torrence & Compo Wavelet Analysis Software

https://github.com/chris-torrence/wavelets

http://atoc.colorado.edu/research/wavelets/

جلسه دهم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
* Cross-frequency Coupling - Implementation

— Cross-frequency amplitude amplitude coupling
— Cross-frequency phase-amplitude coupling (PAC)
— Modualtion Index
— Dissociating spurious from valid PACs
— Harmonics
— Harmonic vs Non-Harmonic PAC

#Video #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session10

اسلاید های جلسه دهم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
* Cross-frequency Coupling - Implementation

— Cross-frequency amplitude amplitude coupling
— Cross-frequency phase-amplitude coupling (PAC)
— Modualtion Index
— Dissociating spurious from valid PACs
— Harmonics
— Harmonic vs Non-Harmonic PAC

#Slide #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session10

جلسه یازدهم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
* Cross-frequency Coupling - Implementation

— Filter Settings for Phase and Amplitude Estimation in phase-amplitude coupling measures
— Detecting n:m phase-phase coupling
— Surrogate statistical tests for cross-freq coupling and cautions

* Cross-frequency Coupling - Function
— Integration Problem
— CFC for long-distance communication
— Multi-item/sequence representation
— Sensory Parsing


#Video #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session11

جلسه یازدهم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
* Cross-frequency Coupling - Implementation

— Filter Settings for Phase and Amplitude Estimation in phase-amplitude coupling measures
— Detecting n:m phase-phase coupling
— Surrogate statistical tests for cross-freq coupling and cautions

* Cross-frequency Coupling - Function
— Integration Problem
— CFC for long-distance communication
— Multi-item/sequence representation
— Sensory Parsing


#Slide #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session11

نظرات، انتقادات، و پیشنهادات خودتون رو درباره کارگاه دینامیک مغز میتونید به صورت ناشناس به آیدی زیر ارسال کنید:

https://news.1rj.ru/str/HarfBeManBOT?start=NDUyMzU3NjEz


یا میتونید به صورت شناس به بات کانال ارسال کنید:

@neurosyntax_bot

جلسه پنجم حل تمرین کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
* Cross-frequency amplitude-amplitude comodulation
* Cross-frequency phase-amplitude coupling (Modulation Index)

#Code #Matlab #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #PracSess5

کدهای جلسه پنجم کارگاه دینامیک مغز

تابع و داده MI را میتوانید از لینک زیر دریافت کنید:

https://github.com/tortlab/phase-amplitude-coupling

و Colormap استفاده شده را میتوانید از لینک زیر دریافت کنید:

https://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/35730-fire-and-or-custom-colormap-function

#BrainDynamicsWorkshop
#matlab

جلسه دوازدهم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
Brain Oscillations and the Importance of Waveform Shape

* Introduction and Examples of Nonsinusoidal signals in the neural recordings

* Physiological Relevance of Oscillation Waveform
— Features of Nonsinusoidal Waveforms Relate to Physiology
— Features of Oscillatory Waveforms Relate to Behavior and Disease

* Methods
— Zero-crossing/Quadrant Point Method of Phase Estimation
— Empirical mode decompositions
——— Computations
——— Drawbacks
——— Ensemble Empirical Mode Decomposition
——— Noise-aided Multivariate Empirical Mode Decomposition
— Cycle-by-cycle analysis of Neural Oscillations
— Instantaneous Frequency


#Video #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session12

اسلایدهای جلسه دوازدهم کارگاه دینامیک مغز: تئوری، آنالیز و تفسیر

مباحث جلسه:
Brain Oscillations and the Importance of Waveform Shape

* Introduction and Examples of Nonsinusoidal signals in the neural recordings

* Physiological Relevance of Oscillation Waveform
— Features of Nonsinusoidal Waveforms Relate to Physiology
— Features of Oscillatory Waveforms Relate to Behavior and Disease

* Methods
— Zero-crossing/Quadrant Point Method of Phase Estimation
— Empirical mode decompositions
——— Computations
——— Drawbacks
——— Ensemble Empirical Mode Decomposition
——— Noise-aided Multivariate Empirical Mode Decomposition
— Cycle-by-cycle analysis of Neural Oscillations
— Instantaneous Frequency


#Slide #Advanced_Neuroscience #BrainDynamicsWorkshop #Session12