🎥 Tutorial – RNA-seq analysis of human breast cancer data
⏳ Duration: 14 min
💾 Size: 22 MB
✨ #RNA_seq #cancer
🌐 www.DrugDesign.ir
آزمایشگاه پارس سیلیکو

vhdo.nl/2cxRFQv
گزارش مجله‌ی #ساینس از بازار خرید و فروش مقالات و پایان‌نامه‌های دانشگاهی در ایران. sciencemag.org/news/2016/09/shady-market-scientific-papers-mars-iran-s-rise-science

از متن:
💬
« اگر پایان‌نامه‌ی شما کار آزمایشگاهی لازم نداشته باشد 1.8 میلیون تومان (600$) + 400$ هم اگر مقاله منتشر شده در ژورنال بخواهید»
💬
«تخمین زده میشود که سالانه 5000 پایان نامه دانشگاهی در دوره فوق لیسانس و دکترا از چنین بازاری خریداری می‌شود»
💬
« یکی از فروشندگان میگوید بهای هرمقاله‌ی ISI حداقل 5 میلیون تومان (1660$) است.دیتاها معتبرند و متخصص هر رشته مقاله را تایید میکند»
💬
«رشد این بازاراصلا عجیب نیست. کار، کم است و به‌همین‌دلیل، فارغ التحصیلان جوان به سمت کسب‌و‌کار مقاله و پایان‌نامه روی می آورند»
💬
«دکتر آخانی: این پدیده خسارت عظیمی به دانش‌ورانی میزند که تقلب نمی‌کنند واعتبار علمی ایران را در جوامع بین‌المللی خدشه دار میکند.
و
💬
«ساینس» به نقل از یکی از دانشگاهیان «مدرک‌گرایی مسئولان سیاسی و نیازشان به پایان‌نامه ومقاله» را عامل دیگر تقویت این بازار ذکر کرده

📡 @VahidOnline

🔴 چه کسی از ارزیابی دقیق می‌ترسد؟

🎖نویسنده: جان بوانن
📝مترجم: فاطمه امین‌پور

💥 پیشنهاد میکنم مطالعه بفرمائید💥

🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalBioinformatics

🎥 سخنرانی بسیار زیبا و جذاب از دکتر Martin J. Blaser در مرکز NIH
🔷درباره نقش "میکروبیوم " بروی متابولیسم، سیستم ایمنی . ریسک بیماری در انسان و اثر انتی بیوتیک ها بر ایجاد بیماری های مانند چاقی، دیابت، آسم، سرطان و..

▫️ Early Life Microbiome Influences on Metabolism, Immunity, and Disease Risk
📢 Martin J. Blaser, M.D., New York University Langone Medical Center
⏳ مدت: 1 ساعت

💾 حجم:256مگابایت

آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🔗https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

📣 سخنرانی تحت عنوان : «طراحی دارو های پپتیدی»
🕙 سخنران : آقای سینا پژمان دانشجویی دکتری بیوشیمی مرکز تحقیقات بیوشیمی بیوفیزیک دانشگاه تهران
🔷ارایه شده در گروه تلگرامی (بیوانفورماتیک ) در تاریخ 4 شهریور ماه
⌛️ مدت 30 دقیقه
🔷 فایل صوتی به همراه اسلاید های ارایه شده 👇👇👇
👇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🔗https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

فایل صوتی سخنرانی تحت عنوان : «طراحی دارو های پپتیدی»
آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

اسلاید های سخنرانی تحت عنوان : «طراحی دارو های پپتیدی»
آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

http://goo.gl/UHzJJX

🔔 وبینار رایگان Upcoming Webinar

💎با موضوع : Introducing AutoQSAR: an automated tool for best-practice QSAR modeling

📢 توضیح :
We introduce AutoQSAR, an automated application to build, validate, and deploy predictive QSAR models. The process of denoscriptor generation, feature selection, and the creation of a large number of QSAR models has been automated into a single workflow within AutoQSAR. Models are built using a variety of methods with multiple random training/test set splits. Based on the performance of the models on the training and test sets, we have developed a score to rank the QSAR models, enabling reliable predictions using a consensus or single QSAR model. When making predictions from an AutoQSAR model alerts are thrown for compounds that are structurally distinct from training set compounds. Effectiveness of the method is demonstrated through comparison with literature QSAR models using identical learning datasets for six properties (endpoints): protein-ligand binding affinity, solubility, blood-brain barrier permeability, carcinogenicity, mutagenicity, and bioaccumulation in fish. AutoQSAR models generally demonstrate similar or better predictive performance as compared with published results while requiring minimal human time and expertise.

🏆مجری برگزاری: schrodinger

🕘 چهارشنبه 28 مهر ماه ساعت 20:30

🌐 لینک ثبت نام https://goo.gl/1psZOF

🌐سایت آزمایشگاه www.DrugDesign.ir

⏳ آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🔗https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

https://goo.gl/vpqhUs

🔔 تحصیل در رشته بیوانفورماتیک مقطع لیسانس در دانشگاه بارسلونا

💎با موضوع : Bachelor's Degree in Bioinformatics

📢 توضیح :

Pompeu Fabra University (UPF), Universitat Politècnica de Catalunya–BarcelonaTech (UPC) and the University of Barcelona (UB) offer a three-year Bachelor’s Degree in Bioinformatics taught entirely in English. The degree is managed by ESCI-UPF and classes are taught mainly on the Mar Campus.
Bioinformatics lies at the crossroads of computing, biomedical sciences and physics and chemistry. It is an area of research that applies computer sciences and information technology to process data from the field of biology.
The Bachelor’s Degree in Bioinformatics brings together mathematical skills, computer modelling and biological knowledge with an interdisciplinary focus, with particular emphasis on biomedical applications. It provides comprehensive education and training based on knowledge, values and skills.

🏆180 واحد

💰شهریه سالیانه: 7.900 یورو

🕘 مدت تحصیل : 3 سال

🌐 اطلاعات بیشتر : http://www.bioinformaticsbarcelona.com/

✔️سایت آزمایشگاه www.DrugDesign.ir

⏳ آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🔗https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

💎به ما در اینستاگرام بپیوندید.👇👇

instagram.com/pars_silico/

🔔 مقاله برتر

⬅️در این مقاله جالب درباره خاستگاه و سرزمین اصلی یهودیان. بر اساس این مقاله یهودیان اشکنازی در منطقه ای از امپراتوری ایران باستان، (شرق ترکیه امروز) سکونت داشته اند.این مقاله شرح میدهد که یهودیان اشکنازی در منطقه در حدود 4 روستا در شرق ترکیه و در کنار جاده ابریشم زندگی میکرده اند. براساس مطالعات ژنتیکی صورت گرفته تشابهات ژنتیکی بسیار بالای بین یهودیان اشکنازی و ایرانیان و ترکان وجود داشته است.
* این مقاله به شدت نظریه و باور اینکه یهودیان یک نژاد بوده و تمامی یهودیان در یک منطقه از مدیترانه سکونت داشته اند. را زیر سوال برده . و بحث و جدل زیادی را در بین محققان و دانشمندان بوجود اورده.
📝 Localizing Ashkenazic Jews to Primeval Villages in the Ancient Iranian Lands of Ashkenaz

💾 Genome Biology and Evolution (2016)

💡 doi:10.1093/gbe/evw046

⏳Published online: March 3, 2016

✨ #genomics

🌐 www.ParsSilico.com

🖥 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو (https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ)

📝Localizing Ashkenazic Jews to Primeval Villages in the Ancient Iranian Lands of Ashkenaz

💾 Genome Biology and Evolution (2016)

💡 doi:10.1093/gbe/evw046

⏳Published online: March 3, 2016

🎥DNA GPS: What is the origin of Yiddish?
🎞ویدیو درباره منشأ و خاستگاه یهودیان اشکنازی
⏳مدت :4دقیقه
🔋حجم:12مگابایت
💡آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

http://goo.gl/UHzJJX

🔔 وبینار رایگان Upcoming Webinar

💎با موضوع : RNA-Seq in Colorectal Cancer Impacting Future Treatments

📢 توضیح :
In this webinar, we will examine how using integrative genomic techniques in cancer research has the potential to transform the future of colorectal cancer therapy.
Oncogenomics research conducted by featured speaker, Dr Enzo Medico, have described stromal gene expression signatures which go beyond providing assessment of stromal cell fraction in the tumor. This additionally provides information on stromal composition and functional state which can be used to highlight clinically relevant correlates.

🏆مجری برگزاری: Xtalks

🕘 چهارشنبه 28 مهر ماه ساعت 18:30

🌐 لینک ثبت نام https://goo.gl/fucWGv

🌐سایت آزمایشگاه www.DrugDesign.ir

⏳ آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🔗https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

https://goo.gl/4QfuVU

🔔 تحصیل در رشته سنتتیک بیولوژی در مقطع دکتری در دانشگاه اکسفورد و..

💎با موضوع :
4 year PhD training studentships in the new field of Synthetic Biology, the "Engineering of Biology

📢 توضیح :

The SynBioCDT is a collaboration between the Universities of Oxford, Bristol and Warwick offering 4-year PhD training studentships in the new field of Synthetic Biology, the "Engineering of Biology".
The course is designed for students with both physical and life sciences backgrounds. The first two terms are devoted to acquiring the necessary theoretical and technical skills through a combination of intensive lecture courses, practicals, seminars, project work and research and communication skills training. Over the third term and summer period of the first year, students undertake two extended projects of approximately ten weeks' duration each. These are similar in scope to a Masters' level project and serve both as advanced training and to help students to choose their research topic for the final three years of the course.

🏆فرصت تکمیل فرم درخواست : تا 18 نوامبر

💰فاند: Funding will cover full tuition fees and pay an annual stipend of £14,140.

🕘 مدت تحصیل : 4 سال

🌐 اطلاعات بیشتر : http://www2.warwick.ac.uk/fac/sci/lifesci/study/pgr/studentships/synbiocdt

✔️سایت آزمایشگاه www.DrugDesign.ir

⏳ آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🔗https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

https://goo.gl/ybmrlv
🔔 پادکست نیچر 18Aug 2016

💎با موضوع :
This week, how fins became limbs, a giant gene database cracks clinical cases, and making better opioids.
📢 توضیح :
In this episode:

01:00
Gene editing reveals how fish fins turned into land-ready limbs

07:14
The largest database yet of human protein-coding genes

14:20
Researchers find a drug that stops pain and has fewer nasty side effects

19:16
Saturn’s moon Titan experiences erosion; and super-senior sharks can live to 400

20:42
Matter beats antimatter; and Cuba keeps Zika at bay

🕘 مدت :58 دقیقه

🌐سایت آزمایشگاه www.DrugDesign.ir

⏳ آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
🔗https://telegram.me/joinchat/BAf7RjvM0GlPgHBuk_JBEQ

🎤 پادکست نیچر.
⏳مدت :28دقیقه
🔋حجم: 38 مگابایت
💡آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🎥 What are Antibody-drug Conjugates (ADCs)?
⏳ Duration: 4 min
💾 Size: 9 MB
✨ #Antibody #drug
🌐 www.DrugDesign.ir
آزمایشگاه پارس سیلیکو

📣کارگاه های فصل پاییز
✔️طراحی دارو، مدلسازی پروتئین،دینامیک مولکولی، لینوکس، زبان R و..
⌛️برگزارکننده: آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
📞تماس: ۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
👇اطلاعات بیشتر

https://goo.gl/EQNKW6

📊‌نرم‌افزار اکسل علت «۲۰ درصد» از اشتباهات مقاله‌های علم ژنتیک


📃اکسل مسبب بیست درصد از اشتباهات مقالات علمی مرتبط با علم ژنتیک است.

مقاله‌ای به تازگی در مجله علمی ژنوم بایولوژی منتشر شد است که فرمت پیش‌فرض شده برنامه اکسل (که یکی از برنامه‌های اداری شرکت مایکروسافت است) را مسئول حدود بیست درصد از خطاهای موجود در مقالات علمی در علم ژنتیک می‌داند.
@practicalbioinformatics
پژوهشگران دریافته‌اند که این خطاها از آنجا ناشی می‌شوند که برنامه تصحیح خودکار (auto correcting) اکسل،نام‌های متداول ژن‌ها را به تاریخ یا عدد تبدیل می‌کند. از آنجا که هیچ راهی برای خاموش کردن این گزینه اکسل وجود ندارد، دانشمندان باید این خطاهای خودکار را به طور دستی درست کنند؛ کاری که بسیاری از آنها فراموش می‌کنند و در نهایت، مقاله با همان خطای درست نشده،‌ منتشر می‌شود.
@practicalbioinformatics
یک گروه استرالیایی که به بررسی خطاهای موجود در صفحات اکسل مقالات ژنتیکی پرداخته می‌گوید اگر برای پردازش داده‌های ژنتیکی از اکسل در همان فرمت اولیه و خودکارش استفاده شود، آن وقت نام ژن‌ها به تاریخ و همینطور اعداد عوض می‌شود.
@practicalbioinformatics
این گروه تحقیقاتی بیش از سی و پنج هزار صفحه اکسل متعلق به بیش از سه هزار و پانصد مقاله علمی منتشر شده در ۱۹ مجله متفاوت در سال‌های بین ۲۰۰۵ و ۲۰۱۵ در حوزه علم ژنتیک را بررسی کرد و به این نتیجه رسید که تقریبا یک پنجم تمام مقالاتی که از اکسل در آنها استفاده شده است، دارای خطا هستند.
@practicalbioinformatics
به گزارش واشینتگن پست، اگر محققی نام ژن MARCH1 را در اکسل وارد کند و دکمه Enter را بزند، اکسل به طور خودکار این نام را به تاریخ یکم مارچ یا 1-MAR عوض می‌کند. اگر محقق در همان زمان متوجه این اشتباه بشود و دکمه Undo را بزند، نام اولیه باز نمی‌گردد بلکه اکسل عدد 42430 را جایگزین می‌کند. چرا که این عدد معادل همان تاریخ یک مارس در برنامه‌ریزی داخلی اکسل است.
@practicalbioinformatics