🔔فرصت عالی
🔸کمک هزینه مسافرت جهت شرکت در مدرسه زمستانه زیست شناسی محاسباتی دانشگاه کوینزلند استرالیا

🔹فرصت باقی مانده جهت تکمیل درخواست استفاده از کمک هزینه سفر تا 31 می میباشد.
مبلغ کمک هزینه بین 250 تا 500 دلار می باشد.
🔹مدرسه زمستانه شامل 5 روز آموزش برای دانشجویان و فارغ التحصیلان، در زمینه های توالی یابی نسل جدید، توالی یابی تک سلول، سیستم بیولوژی و سنتتیک بیولوژی می باشد
🔹هزینه شرکت برای دانشجویان در ثبت نام زود هنگام تا تارخ 18 June تنها 290 دلار می باشد
🔹مباحث:
▫️Next generation sequencing & bioinformatics
▫️Advances in single-cell sequencing analysis
▫️Modelling ecologies & populations
▫️Advanced data visualisation & computation
▫️Systems and synthetic biology

🔹اطلاعات بیشتر و ثبت نام:
bioinformatics.org.au/ws17/


🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

✍️10 قانون ساده برای جان سالم بردن از مقطع دکتری بین رشته ای

▫️مقاله ای جذاب در مجله Plos ، جهت کمک و راهنمایی برای دوستان در حال تحصیل در رشته ایی مانند بیوانفورماتیک ، نانو و.. که بین رشته ای هستند . این مقاله توسط گروهی از دانشجویان دکتری و اساتید مرکز اموزش دکتری دانشگاه اکسفورد نگارش شده است.

Rule 1: Involve everyone in the planning, and make contingency plans
Rule 2: Be a diplomat: Start managing expectations early on
Rule 3: Define the boundaries of your research: Explore and familiarise, then be pragmatic
Rule 4: Don’t be embarrassed: Always ask the “stupid question”
Rule 5: Build a network: Find other people to complement the gaps
Rule 6: Embrace your unique skillset and use it to redefine discipline boundaries
Rule 7: Feel free to swim against the flow, to experiment, and to fail
Rule 8: Plan your career and publish accordingly
Rule 9: Adjust to your audience
Rule 10: Relax and enjoy

🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔸دوره کارآموزی طراحی دارو
▫️مدت دوره: 2 ماه 20 جلسه
▫️شروع دوره : تیر ماه
🔔آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

goo.gl/mmpd2c

🔔دوره های آموزشی پروژه محور پارس سیلیکو
پروژه های تحقیقاتی در حال حاضر آزمایشگاه پارس سیلیکو در قالب دوره های کار آموزی توسط تیم های شش نفره از متقاضیان انجام خواهد شد و تمامی مراحل اجراء پروژه (شامل آموزش، پژوهش، مشاوره، گزارش نتایج و مقاله) توسط یکی از همکاران آزمایشگاه پارس سیلیکو هدایت و مدیریت خواهد شد. پروژه های در حال حاضر آزمایشگاه پارس سیلیکو در زمینه های طراحی دارو، انالیز بیان ژن و بیوانفورماتیک سرطان می باشد.

🔸دوره کارآموزی طراحی دارو
▫️مدت دوره: 2 ماه 20 جلسه
▫️شروع دوره : تیر ماه

🔸دوره کارآموزی انالیز بیان ژن
▫️مدت دوره: 2 ماه 20 جلسه
▫️شروع دوره : تیر ماه

برای اطلاع بیشتر لطفا از طریق شماره تلفن های آزمایشگاه با ما تماس بگیرید
📱موبایل: ۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
☎️تلفن : ۰۲۱۸۸۳۴۷۷۲۳
و یا به آدرس زیر مراجعه بفرمایید.👇👇
goo.gl/rLfHqU

🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

📢دعوت به همکاری

🔔آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو ، از عزیزانی که دارای تخصص در زمینه Text mining و NLP می باشند جهت همکاری در یک پروژه تحقیقاتی دعوت می نماید.

ارسال رزومه:
✉️ info@DrugDesign.ir

goo.gl/zb6Xuz

🎁پکیج نرمافزاری Open Babel
یک جعبه ابزار کامل در زمینه کموانفورماتیک و طراحی دارو
دارای قابلیت :
تبدیل فرمت های مختلف شیمیایی
مینیمایز کردن ساختار های شیمیای
تبدیل ساختار ها به شکل دو بعدی و سه بعدی
جستجوی شباهت
جستجوی قطعات و ...
این نرم افزار در کارگاه طراحی دارو پیشرفته و دوره کارآموزی طراحی دارو بطور کامل آموزش داده می شود.

🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

goo.gl/mmpd2c

🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو اولین آزمایشگاه بیوانفورماتیک ایران و تنها ارایه دهنده خدمات تخصصی بیوانفورماتیک در خاورمیانه برگزار می کند.

🔸کاملترین و جامعترین دوره آموزشی بیوانفورماتیک
✅سرفصل‌ ها:
▫️بیوانفورماتیک مقدماتی
▫️بیوانفورماتیک ساختاری
▫️کموانفورماتیک
▫️داکینگ مولکولی
▫️بایو لینوکس
▫️طراحی پرایمر
▫️شبکه های زیستی
▫️ و...

▪️مدت دوره: 2 ماه 30 جلسه
شروع دوره : نیمه دوم تیر ماه


برای اطلاع بیشتر لطفا از طریق شماره تلفن های آزمایشگاه با ما تماس بگیرید
📱موبایل: ۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
☎️تلفن : ۰۲۱۸۸۳۴۷۷۲۳

💎 ParsSilico.com

🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔به مادربزرگتان درباره بیوانفورماتیک توضیح دهید!!
▫️داری چی کار میکنی ؟ شرط می بندم که تا به حال این سوالو چند بار از شما پرسیدن. مهم نیست که کجا هستید در یک مهمانی، در حال صحبت با همسایه یا در دیدار خانوادگی!
گفتگو درباره موضوعات علمی با افراد غیر علمی و فاقد تخصص بسیار سخت و اینکه بتوانیم انها را جذب و مشتاق این گفتگو کنیم بسیار مشکل است
اما این کار ناممکن نیست شما این کار را مجبور هستید سال های سال انجام دهید نه تنها با خانواده و دوستان حتی با همکاران خودتان.
بنابراین بهتر است که الان یاد بگیرید. توانایی توضیح دادن کارتان، به دیگران یک مهارت ضروری در علم می باشدجایی که ارتباط داشتن نقش حیاتی ایفا می کند.
در این مقاله که در مجله PLOS Computational Biology انتشار یافته به این سوالات پاسخ میدهد. درباره اینکه چرا مهارت ارتباط برقرار کردن مهم است؟ چگونه میتوان با استفاده از این مهارت ها درگیر فعالیت ها و پروژه ای علمی شد.به شما انگیزه میدهد و برای شما چندین نکته و ایده برای درگیر شدن در فعالیت های علمی ارایه می دهد.

پارس سیلیکو: ** این مقاله جالب به علت عنوان خود مورد سرزنش گروهی از فعالان حقوق زنان قرار گرفته است**

🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔به مادربزرگتان درباره بیوانفورماتیک توضیح دهید!!
🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔 تحصیل در رشته بیوانفورماتیک مقطع دکتری

🏢مرکز تحقیقات سرطان بروکسل، بلژیک

💎با موضوع : اپی ژنومیکس

📢 توضیح :

position is available for a highly motivated student or PhD that wishes to join the Laboratory of Cancer Epigenetics headed by Prof. François Fuks (ULB-Cancer Research Center, Brussels). You will be expected to conduct cancer research in epigenetics and epigenomics. Specifically, you will investigate the mechanisms and functions of a novel epigenetic modification, which our lab
recently investigated (Delatte et al., Science 2016). Genetic, biochemical and cell biological as well as genome-wide approaches (e.g. RNA-Seq, ChIP-Seq, Infinium Methylation) will be applied. The lab is running a Next Generation Sequencing platform: EPICS (http://epics.ulb.be/) and is part of the ULB-Cancer Research Center (U-CRC), providing a high profile scientific environment. Profile/Starting date:
- PhD: candidates should have a good first degree (BSc or MSc) in Biology, Genetics, Biochemistry
or related. The PhD will be funded by the Belgian FNRS



🌐 اطلاعات بیشتر :
http://www.ulb.ac.be//medecine/fukslab/jobs.htm



⏳ آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

فرصت تحصیل در مقطع دکتری بیوانفورماتیک
مرکز تحقیقات سرطان، بروکسل بلژیک
⏳ آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو برگزار می کند:
🔸کاملترین و جامعترین دوره آموزشی بیوانفورماتیک
🔹اطلاعات بیشتر:
📱موبایل: ۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰

💎 drugdesign.ir
⏳ آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔آزمایشگاه پارس سیلیکو اولین آزمایشگاه بیوانفورماتیک ایران و تنها ارایه دهنده خدمات تخصصی بیوانفورماتیک در خاورمیانه برگزار می کند.

🔸کاملترین و جامعترین دوره آموزشی بیوانفورماتیک
✅سرفصل‌ ها:
▫️بیوانفورماتیک مقدماتی
▫️بیوانفورماتیک ساختاری
▫️کموانفورماتیک
▫️داکینگ مولکولی
▫️مدلسازی پروتئین
▫️بایو لینوکس
▫️طراحی پرایمر
▫️شبکه های زیستی
▫️ و...

▪️مدت دوره: 2 ماه 30 جلسه
شروع دوره : نیمه دوم تیر ماه


برای اطلاع بیشتر لطفا از طریق شماره تلفن های آزمایشگاه با ما تماس بگیرید
📱موبایل: ۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
☎️تلفن : ۰۲۱۸۸۳۴۷۷۲۳


💎 drugdesign.ir
⏳ آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

شب زنده داران VS سحر خیزان

⏳ آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🏳راهنمای کسب دانش در زمینه های کموانفورماتیک و طراحی دارو

🌐DrugDesign.ir

🔔آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🏳راهنمای کسب دانش در زمینه های ژنومیکس و آنالیز های پیشرفته ژنوم

🌐DrugDesign.ir

🔔آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

goo.gl/jvUtRd
📝 معرفی مقاله

🔔 انالیز متاپروتئومیک جمعیت میکروبی فلور نرمال (میکروبیتا) روده انسانی: به چه سمتی می رویم؟

✍️ روده انسان منزلگاه جمعیت های میکروبی پیچیده ای است که در پاسخ به محرک های خارجی و داخلی های مختلف به صورت پویا تغییر می کنند.میکروبیوتا روده مزایای کاربردی متعدد و حیاتی را برای سلامتی انسان مهیا می کنند. اما با بهم خوردن این تعادل و آشفته شدن، جامعه میکروبی می تواند باعث نتایج زیان اوری مانند بیماری ها و سرطان ها شوند. شناسایی و توصیف فعالیت ها و عملکردهای میکروبیوتا روده انسانی برای درک نقش آنها در سلامتی انسان و بیماری ها حیاتی است است. Metaproteomics، که به مطالعه تمامی پروتئین های جامعه میکروبی یک نمونه اشاره دارد یک حیطه تحقیقاتی نوظهور می باشد که اطلاعات جامعی درباره عملکردهای میکروبیوتا به ما می دهد. در این مقاله مروری کوتاه، نویسندگان خلاصه ای از پیشرفت ها در انالیز metaproteomic برای مطالعه نقش عملکردی میکروبیوتا روده ارایه می دهید. همچنین درباره چالش های موجود در مطالعات متاپروتئومیکس و جهت گیری ها و آینده این زمینه تحقیقاتی بحث شده است.
▫️میکروبیتا به مجموعه موجودات ریز شامل باکتری ها، ارکی باکتری ها، قارچ ها و ویروس ها که در بدن انسان بصورت طبیعی وجود دارند، گفته می شود.
▫️میکروبیوم به محتوای ژنومی میکروبیتا اشاره دارد.

📎پی نوشت (پارس سیلیکو): مطالعه میکروبیوتا و میکروبیوم انسان جزء زمینه های جذاب و آینده دار علوم پزشکی و زیست شناسی می باشد. اهمیت میکروبیوم در پزشکی شخصی بر کسی پوشیده نیست و تخمین زده میشود بازار میکروبیوم انسانی به خاطر نقش آنها در بیماری های مانند چاقی و سرطان، کاربرد آنها در تشخیص و درمان، و تولیدات و محصولات حاصل از آنها در پروبیوتیک ،دارو و غذا ، تا سال 2025 قریب به 900 میلیون دلار در سال برسد.
شایسته است که مراکز تحقیقاتی، تصمیم گیران، اساتید دانشگاهی و محققان زمینه های تحقیقاتی خود را به این سمت هدایت کنند، و امید است که محققان کشور ما بتواند نقشی در آینده علم میکروبیوم داشته باشند.
🙏 آزمایشگاه پارس سیلیکو آمادگی خود را جهت همکاری در پروژه و طرح های تحقیقاتی در این زمینه اعلام میکند.

🔝آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

📝 Metaproteomic analysis of human gut microbiota: where are we heading?

💾 Journal of Biomedical Science

⏳Published online: 12 June 2017
🔝آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

goo.gl/3oP8YX

📣معرفی پکیج

📚پکیج BatchQC

✍️اغلب جمع آوری و تهیه نمونه های سیکونسینگ و میکرواری در دسته های متعدد و یا بدست آمده در زمان های مختلف صورت می گیرد. اغلب این ها باعث ایجاد بایاس تکنیکی می شوند که منجر به نتایج غلط در انالیز های پایین دستی می شود. چندین ابزاربرای انالیز و تحلیل داده -omics گروهی وجود دارد، اما آنها نشان نمی دهد که چه تنظیماتی لازم است و یا چه اصلاحاتی باید صورت بگیرد. در حال حاضر نرم افزار،BatchQC ارایه شده است که مشکلات مطرح شده را رفع میکند و با استفاده از نمودارها و تصاویر نتایج آماری اثرات دسته ها را در یک مجموعه داده ژنوم ارزیابی میکند و نشان میدهد که کدام دسته باعث بایاس و خطا در داده ها می شوند، و چه روش برای رفع خطا و تصحیح نتایج باید استفاده شود.
این پکیج دارای تحلیل ها و انالیز های
Differential Expression, Median Correlations, Heatmaps, Circular Dendrogram, PCA Analysis, Shape, ComBat and SVA
می باشد.
▫️این پکیج بروی نرم افزار R با دستور زیر به راحتی نصب می شود.

source("https://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("BatchQC")

▫️دستورهای استفاده از این پکیج در اسکریپت زیر قابل استفاده می باشد. ( فایل BatchQC_usage_advanced.R )

🔝آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics