goo.gl/uKva33
🔔گزارشی از همایش "Discovery of the Target"
بیشتر از 1300 نماینده های از بیست کشور در سپتامبر 2017 در بوستون برای 15امین همایش "Discovery of the Target" شرکت کردند: "رویدادی در مورد تارگت های جدید مورد توجه صنعت دارویی " که ده ها محقق در زمینه (ایمونوتراپی سرطان، کشف مبتنی بر هدف، تارگت های مورد توجه و تارگت های جدید، روش ها و استراتژی های اعتبارسنجی برای مولکول های کوچک شیمیایی و زیستی جدید) سخنرانی داشتند.
در ادامه این مطلب، کلیپی از خلاصه این همایش به همراه پادکست مصاحبه با یکی از سخنرانان خدمت شما عزیزان ارایه می شود.
🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔گزارشی از همایش "Discovery of the Target"
بیشتر از 1300 نماینده های از بیست کشور در سپتامبر 2017 در بوستون برای 15امین همایش "Discovery of the Target" شرکت کردند: "رویدادی در مورد تارگت های جدید مورد توجه صنعت دارویی " که ده ها محقق در زمینه (ایمونوتراپی سرطان، کشف مبتنی بر هدف، تارگت های مورد توجه و تارگت های جدید، روش ها و استراتژی های اعتبارسنجی برای مولکول های کوچک شیمیایی و زیستی جدید) سخنرانی داشتند.
در ادامه این مطلب، کلیپی از خلاصه این همایش به همراه پادکست مصاحبه با یکی از سخنرانان خدمت شما عزیزان ارایه می شود.
🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🎞گزارشی از پانزدهمین همایش سالانه " Discovery on Target "
🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🎞 تجربه سه دانشجویی دکتری شرکت کننده در پانزدهمین همایش سالانه " Discovery on Target "
🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/uKva33
🎙پادکست: مهار کننده های Ubiquitin Protease - USP7
👤دکتر Tauseef Butt، مدیر عامل شرکت Progenra، در همایش Discovery Target که در بوستون، برگزار می شود، درباره مولکول های کوچک تعدیل کننده سیستم ایمنی و مهارکننده سیستم Ubiquitin Proteasome ، ارائه خواهد شد.
مباحث شامل مزایا و چالش های مولکول های کوچک تعدیل کننده سیستم ایمنی، عملکرد مهارکننده های Ubiquitin Protease-USP7 برروی مدل های حیوانی، پلتفرم ها . کیت های Progenra و برنامه های آنها برای توسعه سایر تعدیل کننده های سیستم ایمنی .
🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🎙پادکست: مهار کننده های Ubiquitin Protease - USP7
👤دکتر Tauseef Butt، مدیر عامل شرکت Progenra، در همایش Discovery Target که در بوستون، برگزار می شود، درباره مولکول های کوچک تعدیل کننده سیستم ایمنی و مهارکننده سیستم Ubiquitin Proteasome ، ارائه خواهد شد.
مباحث شامل مزایا و چالش های مولکول های کوچک تعدیل کننده سیستم ایمنی، عملکرد مهارکننده های Ubiquitin Protease-USP7 برروی مدل های حیوانی، پلتفرم ها . کیت های Progenra و برنامه های آنها برای توسعه سایر تعدیل کننده های سیستم ایمنی .
🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
Audio
🎙 مهار کننده های Ubiquitin Protease - USP7
👤دکتر Tauseef Butt، مدیر عامل شرکت Progenra
⏱مدت : 10 دقیقه
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
👤دکتر Tauseef Butt، مدیر عامل شرکت Progenra
⏱مدت : 10 دقیقه
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
💊دوره طراحی دارو پیشرفته (غربالگری مجازی - فارماکوفور)
🕰 آذر ماه (چهارشنبه 14:30 الی 19)
▪️350 هزار تومان
📞 اطلاعات بیشتر:
۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
🌍https://goo.gl/ZSbJM2
@practicalbioinformatics
🕰 آذر ماه (چهارشنبه 14:30 الی 19)
▪️350 هزار تومان
📞 اطلاعات بیشتر:
۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
🌍https://goo.gl/ZSbJM2
@practicalbioinformatics
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🔔مشاهده ساختار ماکرومولکولهای زیستی به صورت سه بعدی
با کمک از تکنولوژی واقعیت افزوده (Augmented Reality)
با استفاده از ایلیکیشن موبایل Augment
🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
با کمک از تکنولوژی واقعیت افزوده (Augmented Reality)
با استفاده از ایلیکیشن موبایل Augment
🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔یک وب سایت بسیار خوب که به شما انواع گزینه ها و روش های موجود برای مصور سازی داده هاتون را معرفی میکند.👇
http://datavizproject.com
🥇 آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
http://datavizproject.com
🥇 آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
https://goo.gl/1fNiGu
📣آزمایشگاه دکتر هرمزدیاری در دانشگاه کلمبیا به دنبال دانشجویان دکتری برای کار بر روی زیست شناسی محاسباتی است.
دانشجویان علاقه مند باید در یکی از دو برنامه تحصیلات تکمیلی CS دانشگاه UC-Davis درخواست خود را ثبت کنند.
یک متقاضی باید مهارتهای محاسباتی و کامپیوتری (یعنی ساختار داده، الگوریتم، آمار و یادگیری ماشین) قوی داشته باشد و باید تجربه کار با زبان برنامه نویسی (مثلا C / C ++، Java یا Python) را داشته باشد. تجربه کار با داده های بیولوژیکی به عنوان یک امتیاز در نظر گرفته می شود، اما ضروری نیست.
دانش آموزان علاقه مند می توانند با ایمیل fhormozd@ucdavis.edu با دکتر هرمزدیاری تماس بگیرند تا در مورد درخواست شما و چشم انداز پیوستن به گروه علوم کامپیوتر یا IGG در UC-Davis صحبت کنند.
▪️لینک ازمایشگاه دکتر فریدون هرمزدیاری
http://www.hormozdiarilab.org/graduate-students
▪️لینک ثبت درخواست
http://www.cs.ucdavis.edu/graduate/
🥇 آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📣آزمایشگاه دکتر هرمزدیاری در دانشگاه کلمبیا به دنبال دانشجویان دکتری برای کار بر روی زیست شناسی محاسباتی است.
دانشجویان علاقه مند باید در یکی از دو برنامه تحصیلات تکمیلی CS دانشگاه UC-Davis درخواست خود را ثبت کنند.
یک متقاضی باید مهارتهای محاسباتی و کامپیوتری (یعنی ساختار داده، الگوریتم، آمار و یادگیری ماشین) قوی داشته باشد و باید تجربه کار با زبان برنامه نویسی (مثلا C / C ++، Java یا Python) را داشته باشد. تجربه کار با داده های بیولوژیکی به عنوان یک امتیاز در نظر گرفته می شود، اما ضروری نیست.
دانش آموزان علاقه مند می توانند با ایمیل fhormozd@ucdavis.edu با دکتر هرمزدیاری تماس بگیرند تا در مورد درخواست شما و چشم انداز پیوستن به گروه علوم کامپیوتر یا IGG در UC-Davis صحبت کنند.
▪️لینک ازمایشگاه دکتر فریدون هرمزدیاری
http://www.hormozdiarilab.org/graduate-students
▪️لینک ثبت درخواست
http://www.cs.ucdavis.edu/graduate/
🥇 آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔آدرس sci-hub.bz پایگاه Sci Hub که قبلا در کانال معرفی شد. متاسفانه از دسترس خارج شده!
🎁آدرس جدید دسترسی به سایت🎁
💡 http://sci-hub.tw
▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🎁آدرس جدید دسترسی به سایت🎁
💡 http://sci-hub.tw
▪️آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
⏳اخرین فرصت ثبت نام
📣کاملترین دوره انالیز بیان ژن
🕰 شروع دوره ۲۳ اذر
🔖ظرفیت باقیمانده ۳ نفر
🎓مدرس: اساتید دانشگاه
📞 اطلاعات بیشتر:
۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
🌍goo.gl/ZSbJM2
@practicalbioinformatics
📣کاملترین دوره انالیز بیان ژن
🕰 شروع دوره ۲۳ اذر
🔖ظرفیت باقیمانده ۳ نفر
🎓مدرس: اساتید دانشگاه
📞 اطلاعات بیشتر:
۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
🌍goo.gl/ZSbJM2
@practicalbioinformatics
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
🖥 تجسم مولکول ها به روش های جدید با اپ Molecule World
▫️این برنامه فقط در اپ استور برای دستگاه های iOS در دسترس است
🥇 آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
▫️این برنامه فقط در اپ استور برای دستگاه های iOS در دسترس است
🥇 آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔 مهلت ثبت نام و ثبت مقاله در کنفرانس تا ۲۰ آذرماه تمدید شد.
🎁ثبت نام با ۱۰ درصد تخفیف ویژه اعضای کانال پارس سیلیکو🎁
🥇 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@Practicalbioinformatics
🎁ثبت نام با ۱۰ درصد تخفیف ویژه اعضای کانال پارس سیلیکو🎁
🥇 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@Practicalbioinformatics
🔔 مهلت ثبت نام و ثبت مقاله در هفتمین همایش بیوانفورماتیک ایران تا ۲۰ آذرماه تمدید شد.🔔
🎁ثبت نام با ۱۰ درصد تخفیف ویژه اعضای کانال پارس سیلیکو🎁
🏆آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو به عنوان عضو حقوقی انجمن بیوانفورماتیک ایران با رایزنی های صورت گرفته ۱۰ درصد هزینه ثبت نام اعضای کانال را تقبل می کند. اعضای کانال پارس سیلیکو در مهلت باقیمانده میتوانند با ۱۰ درصد تخفیف ویژه پارس سیلیکو در این رویداد شرکت نمایند.🏆
📞جهت اطلاعات بیشتر با شماره های زیر تماس حاصل بفرمایید.
۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
ارتباط با مدیر کانال:
@bioinformatics1
▫️لینک وب سایت همایش
www.icb7.ir
🥇 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@Practicalbioinformatics
🎁ثبت نام با ۱۰ درصد تخفیف ویژه اعضای کانال پارس سیلیکو🎁
🏆آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو به عنوان عضو حقوقی انجمن بیوانفورماتیک ایران با رایزنی های صورت گرفته ۱۰ درصد هزینه ثبت نام اعضای کانال را تقبل می کند. اعضای کانال پارس سیلیکو در مهلت باقیمانده میتوانند با ۱۰ درصد تخفیف ویژه پارس سیلیکو در این رویداد شرکت نمایند.🏆
📞جهت اطلاعات بیشتر با شماره های زیر تماس حاصل بفرمایید.
۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
ارتباط با مدیر کانال:
@bioinformatics1
▫️لینک وب سایت همایش
www.icb7.ir
🥇 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@Practicalbioinformatics
✍️مقاله جذاب در زمینه طراحی دارو با عنوان:
🔔Common Hits Approach: Combining Pharmacophore Modeling and Molecular Dynamics Simulations
که در مجله
📖 Journal of chemical information and modeling
سال 2017 چاپ شده است.
▫️در این تحقیق نویسندگان برای بدست آوردن مدل فارماکوفور مناسب از دینامیک مولکولی پروتئین لیگاند استفاده کرده اند.
🥇 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@Practicalbioinformatics
🔔Common Hits Approach: Combining Pharmacophore Modeling and Molecular Dynamics Simulations
که در مجله
📖 Journal of chemical information and modeling
سال 2017 چاپ شده است.
▫️در این تحقیق نویسندگان برای بدست آوردن مدل فارماکوفور مناسب از دینامیک مولکولی پروتئین لیگاند استفاده کرده اند.
🥇 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@Practicalbioinformatics
10.1021@acs.jcim.6b00674.pdf
4.2 MB
🔔Common Hits Approach: Combining Pharmacophore Modeling and Molecular Dynamics Simulations
📖 Journal of chemical information and modeling
▫️2017
🥇 آزمایشگاه پارس سیلیکو
@Practicalbioinformatics
📖 Journal of chemical information and modeling
▫️2017
🥇 آزمایشگاه پارس سیلیکو
@Practicalbioinformatics
🔔دعوت به همکاری🔔
🏳آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو در نظر دارد جهت تکمیل کادر اداری، نیروی کار پاره وقت بپذیرد.
شرایط:
۱. دانشجو یا فارغ التحصیل رشته های مرتبط با زیست شناسی، شیمی، ریاضی و مهندسی
۲. روابط عمومی بالا
۳. علاقه مند به مباحث بیوانفورماتیک
▪️جهت اطلاعات بیشتر متقاضیان گرامی می توانند با شماره های
09106665590
02188594104
تماس بگیرند و یا رزومه خود را به آدرس ایمیل info@parssilico.com و یا از طریق مدیر کانال @bioinformatics1 ارسال نمایند
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🏳آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو در نظر دارد جهت تکمیل کادر اداری، نیروی کار پاره وقت بپذیرد.
شرایط:
۱. دانشجو یا فارغ التحصیل رشته های مرتبط با زیست شناسی، شیمی، ریاضی و مهندسی
۲. روابط عمومی بالا
۳. علاقه مند به مباحث بیوانفورماتیک
▪️جهت اطلاعات بیشتر متقاضیان گرامی می توانند با شماره های
09106665590
02188594104
تماس بگیرند و یا رزومه خود را به آدرس ایمیل info@parssilico.com و یا از طریق مدیر کانال @bioinformatics1 ارسال نمایند
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
✍️پرسش و پاسخ های متداول برای مبتدیان داکینگ
1️⃣ چگونه سایت اتصال در پروتئین را پیش بینی می کنید؟
شما مجبور نیستید سایت های اتصال را در پروتئینی که میخواهید داک بزارید را پیش بینی کنید. شما می توانید سایت های اتصال را با کمک مقالات مرتبط به آن پروتئین پیدا کنید. هنگامی که در سایت بانک پروتئینی یک PDB خاص را باز می کنید، می توانید یک بخش به نام «Literature» را در همان صفحه پیدا کنید که شامل مقاله تحقیقاتی درباره ساختار آن پروتئین (ورودی PDB) است. این مقاله تمام جزئیات مربوط به اسید های امینه کاتالیتیک یا سایت های اتصال مرتبط به آن پروتئین خاص را نشان می دهد.
شما مجبور نیستید از یک سرور آنلاین استفاده کنید؛ سرور ها برای شما چندین سایت اتصال می دهد، اما نمی دانید لیگاند شما قرار است به کدام یک از این بایندینگ سایت های پیشگویی شده اتصال پیدا کند. پس فقط به PDB بروید و وقتی بطور مثال صفحه 3BJC را باز کنید،مقاله مربوط به آن را پیدا خواهید کرد.
2️⃣تفاوت بین داکینگ کور "Blind docking" و داکینگ براساس بایندینگ سایت چیست؟
داکینگ کور وقتی انجام می شود که ما در مورد سایت های کاتالیتیکی / سایت های اتصال، یک پروتئین هیچ اطلاعاتی نداشته باشیم. این نوع داکینگ اصولا برای پروتئین های جدید انجام می شود، در صورتی که داکینگ براساس سایت اتصال پروتئین در زمانی که ما سایت های اتصال آن پروتئین را می دانیم صورت میگیرد. همچنین از داکینگ کور برای کشف سایت های اتصال یک پروتئین استفاده می شود. در داکینگ کور شما برای داکینگ لیگاندتون کل پروتئین را درنظر میگیرید، در صورتی که در داکینگ براساس بایندینگ سایت شما تنها اسید امینه های سایت اتصال را در نظر میگیریم و لیگاند تنها میتواند به پاکت مشخص شده متصل شود.
3️⃣چرا قبل از داکینگ ما heatoms را از فایل PDB حذف میکنیم؟
ساختاری که ما استفاده می کنیم یک ساختار بلوری است که با لیگاند (ها) کمپلکس شده است، بنابراین، برای داکینگ لیگاند مورد نظر خودمان با پروتئین در یک موقعیت خاص، باید لیگاند متصل به ساختار کریستالوگرافی پروتئین را با حذف heathoms از فایل PDB حذف کنیم. گاهی اوقات، اگر ما بخواهیم اینتراکشن یک لیگاند را با پروتئین در حضور لیگاند دیگر (که قبلا به پروتئین متصل شده است) مطالعه کنیم، در این صورت، hetatoms را از پروتئین حذف نمی کنیم.
4️⃣چرا برای داکینگ فقط یک زنجیره پروتئین را انتخاب می کنیم؟
ما برای جلوگیری از پیچیدگی، زنجیره های ساختار پروتئین را حذف می کنیم . اما ما باید اطمینان حاصل کنیم که اسید های امینه کاتالیتیک یا بایندینگ سایت پروتئین بین دو زنجیره نباشد، در این صورت برای داکینگ باید دو زنجیره را حفظ کنیم.
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
1️⃣ چگونه سایت اتصال در پروتئین را پیش بینی می کنید؟
شما مجبور نیستید سایت های اتصال را در پروتئینی که میخواهید داک بزارید را پیش بینی کنید. شما می توانید سایت های اتصال را با کمک مقالات مرتبط به آن پروتئین پیدا کنید. هنگامی که در سایت بانک پروتئینی یک PDB خاص را باز می کنید، می توانید یک بخش به نام «Literature» را در همان صفحه پیدا کنید که شامل مقاله تحقیقاتی درباره ساختار آن پروتئین (ورودی PDB) است. این مقاله تمام جزئیات مربوط به اسید های امینه کاتالیتیک یا سایت های اتصال مرتبط به آن پروتئین خاص را نشان می دهد.
شما مجبور نیستید از یک سرور آنلاین استفاده کنید؛ سرور ها برای شما چندین سایت اتصال می دهد، اما نمی دانید لیگاند شما قرار است به کدام یک از این بایندینگ سایت های پیشگویی شده اتصال پیدا کند. پس فقط به PDB بروید و وقتی بطور مثال صفحه 3BJC را باز کنید،مقاله مربوط به آن را پیدا خواهید کرد.
2️⃣تفاوت بین داکینگ کور "Blind docking" و داکینگ براساس بایندینگ سایت چیست؟
داکینگ کور وقتی انجام می شود که ما در مورد سایت های کاتالیتیکی / سایت های اتصال، یک پروتئین هیچ اطلاعاتی نداشته باشیم. این نوع داکینگ اصولا برای پروتئین های جدید انجام می شود، در صورتی که داکینگ براساس سایت اتصال پروتئین در زمانی که ما سایت های اتصال آن پروتئین را می دانیم صورت میگیرد. همچنین از داکینگ کور برای کشف سایت های اتصال یک پروتئین استفاده می شود. در داکینگ کور شما برای داکینگ لیگاندتون کل پروتئین را درنظر میگیرید، در صورتی که در داکینگ براساس بایندینگ سایت شما تنها اسید امینه های سایت اتصال را در نظر میگیریم و لیگاند تنها میتواند به پاکت مشخص شده متصل شود.
3️⃣چرا قبل از داکینگ ما heatoms را از فایل PDB حذف میکنیم؟
ساختاری که ما استفاده می کنیم یک ساختار بلوری است که با لیگاند (ها) کمپلکس شده است، بنابراین، برای داکینگ لیگاند مورد نظر خودمان با پروتئین در یک موقعیت خاص، باید لیگاند متصل به ساختار کریستالوگرافی پروتئین را با حذف heathoms از فایل PDB حذف کنیم. گاهی اوقات، اگر ما بخواهیم اینتراکشن یک لیگاند را با پروتئین در حضور لیگاند دیگر (که قبلا به پروتئین متصل شده است) مطالعه کنیم، در این صورت، hetatoms را از پروتئین حذف نمی کنیم.
4️⃣چرا برای داکینگ فقط یک زنجیره پروتئین را انتخاب می کنیم؟
ما برای جلوگیری از پیچیدگی، زنجیره های ساختار پروتئین را حذف می کنیم . اما ما باید اطمینان حاصل کنیم که اسید های امینه کاتالیتیک یا بایندینگ سایت پروتئین بین دو زنجیره نباشد، در این صورت برای داکینگ باید دو زنجیره را حفظ کنیم.
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
goo.gl/NTbbvH
🔔لیپیدومیکس « Lipidomics» : یک مرور کلی
✍️لیپید ها، متابولیت های ضروری در بدن انسان هستند که از جمله فعالیت های مختلف مانند ذخیره انرژی، غدد درون ریز، سیگنالینگ سلولی، مورفوژنز و غیره عمل می کنند. با استفاده از رویکرد لیپیدمیک، مطالعه در مورد گونه های لیپیدی در یک ارگانیسم، ساده تر شده است.
لیپیدومیکس Lipidomics یک فیلد در حال ظهور در مجموعه مطالعات 'omics' برای تجزیه و تحلیل در سطح سیستمی لیپید ها و مولکول های مرتبط با انها در درون سلول است. Lipidomics با هدف تعریف و اندازه گیری تمام انواع مولکولی لیپید موجود در سلول است. این یک رویکرد قدرتمند برای درک زیست شناسی لیپید است. گونه های مولکولی لیپید را می توان با 8 دسته شناخته شده لیپیدها، کلاس های متعدد و زیر کلاس ها تعریف کرد که توسط LIPID MAPS با همکاری کمیته بین المللی طبقه بندی و نامگذاری لیپید ها (ICCNL) ) تهیه شده اند.
✍️برخی از فن آوری های مدرن مانند کروماتوگرافی مایع (LC)، اسپکترومتری جرمی (MS)، رزونانس مغناطیسی هسته ای (NMR) برای شناسایی و تعیین مقدار گونه های چربی به منظور درک عملکرد آنها در سیستم های زیستی مورد استفاده قرار میگیرند. کنسرسیوم LIPID MAPS تجزیه و تحلیل جامعی از لیپیدوم در پستانداران را با توسعه روش های جدید لیپیدومیکیک مبتنی بر کروماتوگرافی مایع همراه با طیف سنجی جرم انجام داد ه است که امروزه به طور گسترده ای مورد استفاده قرار می گیرد. فن آوری MS ثابت شده است که در مشخص کردن و اندازه گیری گونه های مولکولی لیپید در عصاره های چربی بسیار کارآمد است. یکی از دلایل این امر می تواند توانایی MS در تشخیص و جداسازی هر ذره یونیزه براساس نسبت جرم به وزن (m / z) باشد. MS همچنین می تواند اطلاعات ساختاری را با قطعه کردن یون های لیپید فراهم کند که می تواند با استفاده از MS Tandem یا MS / MS به دست آید.
✍️اساسا، دو روش مختلف برای تجزیه و تحلیل لیپیدمیک وجود دارد:
1️⃣ اعمال برخی از پروتکل های بهینه شده برای استخراج هر گروه لیپید و سپس استفاده از LC برای جدا کردن گونه های مولکولی لیپیدها، پس از آن برای تجزیه و تحلیل بیشتر از جمله تجزیه مولکولی (MS / MS)، اسکن یون و غیره، محصول شویش LC به طور مستقیم به طیف سنج جرم داده می شود .
2️⃣ رویکرد دیگر، همچنین به عنوان "لیپیدمیک شاتگان" شناخته می شود، شامل استخراج لیپیدها و بدنبال آن آنالیز MS بدون جداسازی LC می باشد.
چندین ابزار برای لیپیدومیکس در دسترس هستند و برخی از آنها با ترکیب ژنومیک و لیپیدمیک برای شناسایی بیومارکرهای بالینی در حال توسعه می باشند. به عنوان مثال، SimLipid ابزار تشخیص ليپيدها در سطح و حجم بالا است.
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
🔔لیپیدومیکس « Lipidomics» : یک مرور کلی
✍️لیپید ها، متابولیت های ضروری در بدن انسان هستند که از جمله فعالیت های مختلف مانند ذخیره انرژی، غدد درون ریز، سیگنالینگ سلولی، مورفوژنز و غیره عمل می کنند. با استفاده از رویکرد لیپیدمیک، مطالعه در مورد گونه های لیپیدی در یک ارگانیسم، ساده تر شده است.
لیپیدومیکس Lipidomics یک فیلد در حال ظهور در مجموعه مطالعات 'omics' برای تجزیه و تحلیل در سطح سیستمی لیپید ها و مولکول های مرتبط با انها در درون سلول است. Lipidomics با هدف تعریف و اندازه گیری تمام انواع مولکولی لیپید موجود در سلول است. این یک رویکرد قدرتمند برای درک زیست شناسی لیپید است. گونه های مولکولی لیپید را می توان با 8 دسته شناخته شده لیپیدها، کلاس های متعدد و زیر کلاس ها تعریف کرد که توسط LIPID MAPS با همکاری کمیته بین المللی طبقه بندی و نامگذاری لیپید ها (ICCNL) ) تهیه شده اند.
✍️برخی از فن آوری های مدرن مانند کروماتوگرافی مایع (LC)، اسپکترومتری جرمی (MS)، رزونانس مغناطیسی هسته ای (NMR) برای شناسایی و تعیین مقدار گونه های چربی به منظور درک عملکرد آنها در سیستم های زیستی مورد استفاده قرار میگیرند. کنسرسیوم LIPID MAPS تجزیه و تحلیل جامعی از لیپیدوم در پستانداران را با توسعه روش های جدید لیپیدومیکیک مبتنی بر کروماتوگرافی مایع همراه با طیف سنجی جرم انجام داد ه است که امروزه به طور گسترده ای مورد استفاده قرار می گیرد. فن آوری MS ثابت شده است که در مشخص کردن و اندازه گیری گونه های مولکولی لیپید در عصاره های چربی بسیار کارآمد است. یکی از دلایل این امر می تواند توانایی MS در تشخیص و جداسازی هر ذره یونیزه براساس نسبت جرم به وزن (m / z) باشد. MS همچنین می تواند اطلاعات ساختاری را با قطعه کردن یون های لیپید فراهم کند که می تواند با استفاده از MS Tandem یا MS / MS به دست آید.
✍️اساسا، دو روش مختلف برای تجزیه و تحلیل لیپیدمیک وجود دارد:
1️⃣ اعمال برخی از پروتکل های بهینه شده برای استخراج هر گروه لیپید و سپس استفاده از LC برای جدا کردن گونه های مولکولی لیپیدها، پس از آن برای تجزیه و تحلیل بیشتر از جمله تجزیه مولکولی (MS / MS)، اسکن یون و غیره، محصول شویش LC به طور مستقیم به طیف سنج جرم داده می شود .
2️⃣ رویکرد دیگر، همچنین به عنوان "لیپیدمیک شاتگان" شناخته می شود، شامل استخراج لیپیدها و بدنبال آن آنالیز MS بدون جداسازی LC می باشد.
چندین ابزار برای لیپیدومیکس در دسترس هستند و برخی از آنها با ترکیب ژنومیک و لیپیدمیک برای شناسایی بیومارکرهای بالینی در حال توسعه می باشند. به عنوان مثال، SimLipid ابزار تشخیص ليپيدها در سطح و حجم بالا است.
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
📌 سومین کنفرانس زیست شناسی سامانه های ایران
⭐️ارتباط با دانشمندان تراز اول دنیا
⭐️8 و 9 اسفند ماه
سایت همایش
icsb2018.modares.ac.ir
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics
⭐️ارتباط با دانشمندان تراز اول دنیا
⭐️8 و 9 اسفند ماه
سایت همایش
icsb2018.modares.ac.ir
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics