💊طبق گزارش منتشر شده، در سال 2017 سازمان FDA تعداد 16 دارو پزشکی شخصی را در سال 2017 تایید کرده است👇

https://goo.gl/BHGT8Y

🔎 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🛎فرصت شغلی

✔️Searching for a PhD-level computational biologist to work on malaria genomics and trannoscriptomics at #broadinstitute and #HarvardChanSPH. Please RT
https://tinyurl.com/ycs6ktg8

▪️QUALIFICATIONS

▫️Ph.D. in computational biology, genetics, computer science, statistics, math, molecular biology, or related field, or equivalent practical experience.

▫️Expertise in Illumina sequencing data analysis tools and general knowledge of statistical methods for genomic and trannoscriptomic data analysis.

▫️Demonstrated ability to clearly communicate scientific ideas and results in oral presentations.

▫️A publication record reflecting high productivity and the ability to write clearly.

▫️Interest in infectious diseases and global health

▫️Familiarity with population genetic and molecular evolutionary analysis methods, including tests of natural selection and phylogenetics

▫️Fluency in Unix, standard bioinformatics tools (Python, R, or equivalent), and a programming language (C/C++, Java)

▫️Excellent communication, organization, and time management skills

Creative, organized, motivated, team player
👑ازمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics

📊بنچمارک - مقایسه مپرهای NGS
#NGS #aligner #mapping #sequencing

👑ازمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics

✍️مقاله 👇
یادگیری ماشین مبتنی بر شبکه و الگوریتم های تئوری گراف برای درمان دقیق سرطان
www.nature.com/articles/s41698-017-0029-7


🥇 پارس سیلیکو پیشرو در بیوانفورماتیک

@practicalbioinformatics

Rare Disease Day
امروز روز جهانی بیماری های نادر بود و در سرتاسر جهان مردم تشویق به کمک های خیرخواهانه به فعالیت های پژوهشی جهت پیشگیری و درمان این دسته از بیماریها شدند.
@ExirLabs

💐پارس سیلیکو این افتخار را داشت که در سومين كنفرانس زيست شناسي سامانه هاي ايران حضور داشته باشد.

🌹با تشکر از عوامل برگزاری این کنفرانس بسیار عالی و پربار

icsb2018

📣دوره ۳ روزه انالیز بیان ژن

🕰 ۷ الی ۹ فروردین

🎁۲۰ درصد تخفیف ثبت نام تا ۲۰ اسفند

📞 اطلاعات بیشتر:
۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
🌍 www.goo.gl/9ytXkG

آزمایشگاه پارس سیلیکو👇
@practicalbioinformatics

▪️تبدیل فرمت FASTQ به FASTA با استفاده از خط فرمان

✍️ابزار های فراوانی برای تبدیل FASTQ به FASTA وجود دارد ولی یک دستور ساده در ترمینال لینوکس به راحتی میتونه این کارو انجام بدهد. و نیازی به دانلود و نصب نرم افزاری نیست.👇

paste - - - - < file.fq | cut -f 1,2 | sed 's/^@/>/' | tr "\t" "\n" > file.fa

#NGS
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو

@practicalbioinformatics

▪️تبدیل فایل BAM به BED فرمت

✍️برای تبدیل فایل BAM به BED فرمت از این دستور پرل در خط فرمان استفاده کنید .👇👇

samtools view file.bam | perl -F'\t' -ane '$strand=($F[1]&16)?"-":"+";$length=1;$tmp=$F[5];$tmp =~ s/(\d+)[MD]/$length+=$1/eg;print "$F[2]\t$F[3]\t".($F[3]+$length)."\t$F[0]\t0\t$strand\n";'

#NGS #mapping
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

📣دوره آموزشی بیوانفورماتیک عمومی ( انلاین )

⏱مدت دوره: ۲ ماه

💳هزینه دوره: ۵۰۰ هزار تومان

🎁 ۳۰ درصد تخفیف تا ۲۵ اسفند

⏳شروع دوره: نیمه دوم فروردین

🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

📣 دوره آموزشی بیوانفورماتیک عمومی ( انلاین )

🔔(این دوره بصورت غیر حضوری و انلاین برگزار خواهد شد)
www.goo.gl/ZJwJWJ
⏱مدت دوره: ۲ ماه

💳هزینه دوره: ۵۰۰ هزار تومان

🎁 ۳۰ درصد تخفیف تا ۲۵ اسفند

⏳شروع دوره: نیمه دوم فروردین

📋سرفصل‌ ها:

▫️بیوانفورماتیک مقدماتی
▫️آشنایی با انواع فرمت ها توالی های بیو مولکولی
▫️آشنایی با دیتابیس های توالی نوکلئیک اسید
▫️آشنایی با دیتابیس های توالی پروتئینی
▫️بیوانفورماتیک ساختاری
▫️کموانفورماتیک
▫️طراحی پرایمر
▫️فیلوژنی مولکولی
▫️و..

📞 اطلاعات بیشتر:
▫️۰۹۱۰۶۶۶۵۵۹۰
▫️۰۲۱۸۸۵۹۴۱۰۴
🌍 www.goo.gl/9ytXkG
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔 امروز روز میکروبیوم بود .

😋 به خاطر اینکه در این زمینه چند مقاله بسیار عالی در مجله cell و science منتشر شد.

🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو پیشرو در علوم زیستی
@practicalbioinformatics

🔔امروز روز میکروبیوم بود .

😃 یه خاطر اینکه در این زمینه چند مقاله بسیار عالی در مجله cell و science انتشار یافت.

📝The Human Gut Microbiome: From Association to Modulation
✍️Thomas S.B. Schmidt , Jeroen Raes, Peer Bork
8 March 2018
▫️آیا ما باید میکروبیوم خود را توالی یابی کنیم؟ ما میکروب هایمان را شکل می دهیم یا میکروب های ما به ما شکل می دهند؟

📝The Past and Future Biology of the Human Microbiome in an Age of Extinctions
✍️Martin J. Blaser
8 March 2018
▫️سرنوشت تکاملی انسان به طور مستقیم با میکروبیوم ما مرتبط است. پیشرفت های پزشکی و تکنولوژیکی موجب تغییرات بزرگی در ترکیب و بلوغ جوامع میکروبی مرتبط با انسان شده است و حساسیت ما به بیماری های عفونی و پیشرفته را افزایش داده. ترمیم و بازسازی میکروبیوم انسان باید اولویت زیست پزشکی باشد.

📝Gut bacteria selectively promoted by dietary fibers alleviate type 2 diabetes
✍️Liping Zhao, Feng Zhang1, Xiaoying Ding، ,...
Science 09 Mar 2018
▫️رژیم غذایی سرشار از فیبر با تغییر ترکیب میکروبیوم روده عوارض دیابت نوع 2 را کاهش میدهد.

📝Translocation of a gut pathobiont drives autoimmunity in mice and humans
✍️S. Manfredo Vieira1, M. Hiltensperger1, V. Kumar2, ...
Science 09 Mar 2018
▫️جابجایی "میکروب های مستعد بیماریزای" روده به اندام های دیگر مانند کبد باعث ایجاد بیماری های اتوایمنی در انسان می شوند.

🥇آزمایشگاه پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🔔مقالات معرفی شده در پست قبلی را از اینجا دریافت کنید
The Human Gut Microbiome..
🥇آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

📣 سمپوزیوم یک روزه آشنایی با #بیوانفورماتیک
🔴 ثبت نام #رایگان تا ۲۹ اسفند
🔴 همراه با ارائه #گواهی حضور
📆 ۳۰ فروردین ۹۷
📌 دانشگاه #الزهرا
✒️ ثبت نام:
‏https://evand.com/events/bioinformatics

🌹اینک بهار تا دروازه هاى شهر رسیده و رستاخیز دوباره درگیتى دمیده.دستان پرنوازش بهار ، طبیعت خفته را از خواب بیدار می سازد. با آرزوی سالی پر از نشاط و کامیابی
نوروز مبارک.

🔔اطلاعیه
سمینار کموانفورماتیک 2018 با دعوت از سه سخنران از کشورهای ایتالیا و آلمان در تاریخ 3-1 اردیبهشت در شیراز برگزار می شود.

🥇 آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@practicalbioinformatics

🎥 شرکت لکسوس به‌عنوان دروغ آوریل، ویدئوی جالبی منتشر کرده است که در اون هر خودرویی با توجه به DNA خریدار سفارشی‌سازی میشه 😄

@myzoomit

⏳شاید ساخت خودرو با توجه به DNA خریدار در زمان حاضر یه شوخی باشه
ولی در اینده نزدیک، براساس خصوصیات و پروفایل ژنتیک شما وسایل رفاهی اختصاصی طراحی خواهد شد.
همانطور که پزشکی و درمان به سمت شخصی سازی پیش می رود، در حوزه های دیگر هم شاهد این رویکرد خواهیم بود.

📈 پوشش و عمق خوانش پیشنهادی برای تکنیک ها و کاربردهای مختلف توالی یابی نسل جدید NGS

🔍آزمایشگاه بیوانفورماتیک پارس سیلیکو
@PracticalBioinformatics