#ویرایش_ژنوم
#CRISPR
⁉️چرا CRISPR ⁉️

قبل از روش کریسپر ۳ روش دیگری برای ویرایش ژنومی استفاده میشده از جمله: ZFN , TALEN, Meganuclease

🔴اولین روش استفاده شده برای این کاربرد #Meganucleas ها بودند که در واقع یک سری اندونکلئاز هایی هستند که در ژنوم ارگانیسم های خاصی به قسمتی از DNA متصل شده و برش ایجاد میکند ، این آنزیم ها به توالی از ژنوم متصل میشوند که فقط یکبار در طول کل ژنوم وجود دارد و تکراری نیست به همین علت اتصال کاملا تخصصی دارد .
🔸اما چون با این روش فقط میتوان یه قسمت خاص از DNA را برش داد نمیتوان به صورت کاربردی برای تمامی ویرایش های ژنومی استفاده کرد .

🌀بنابراین روش دیگری به نام #ZFN ابداع شد .
🔵ساختار ZFN مجموعه ای از آمینو اسید هایی است که یک ید را در وسط احاطه کرده اند ، هر مولکول ZFN می تواند ۳ نوکلئوتید از توالی DNA را شناسایی کند و به همراه یک سری فاکتورهای رونویسی پروتئینی TF ها و DNA bonding domain ( DBD) به توالی از DNA متصل شده حالا برای برش نیاز به آنزیم اندونوکلئاز دارد که از فلاووباکتریوم استخراج شده به نام FOK1 .

🆔 @PrimerSBU

#ویرایش_ژنوم
#CRISPR

✅ولی آنزیم FOK1 زمانی فعال شده و توانایی برش دارد که هترودایمر تشکیل بدهد بنابراین دمین های برشی این آنزیم را از دمین های شناساگر آن جداکرده و به دمین های ZFN متصل کردند .و این کمپلکس برای هر دو رشته طراحی میشود . از آنجایی که هر ZF تعداد ۳ نوکلئوتید را شناسایی میکند این کمپلکس وقتی که ۹ نوکلئوتید را شناسایی کند یعنی ۳ تا دمین ZF کنار هم در این صورت عملکرد بهتری دارد .

⚠️اما این روش هم منسوخ شده به علت اینکه وقتی دمین ها را با هم ترکیب میکنیم اختصاصیت آنها کاهش یافته و offtarget میدهد و تا کنون از ۶۴ حالت کدون ها فقط ۴۹ حالت برای ZFN شناسایی شده و محدودیت داریم .
🧬💉🧪

🔴و اما روش #TALEN
این روش را از باکتری ها شبیه سازی کرده اند ، باکتری به نام زانتوموناس وقتی به گیاهان حمله میکرد یه effector پروتئینی را به خاطر وجود سیگنالی در N_terminal آن درون سیتوپلاسم ترشح میکرد و به علت وجود سیگنال دیگری به نام LLS این پروتئین از سیتوپلاسم وارد هسته شده و در ناحیه پروموتری ژن درج میشد و به علت داشتن دمین فعال سازی روی C_terminal خود باعث رونویسی میشد و بیان ژن را بالا میبرد .

🔺از این خاصیت در مهندسی ژنتیک استفاده کردند .
این پروتئین در قسمت مرکزی خود یک DBD دارد که از ۲۰ تا ۳۰ دمین تشکیل شده است که توالی کاملا یکسانی دارند فقط در ناحیه ۱۲ و ۱۳ در دو آمینو اسید با هم متفاوت اند و تنوع این آمینواسید های این دو منطقه باعث اتصال این کمپکلس پروتئینی به نواحی اختصاصی DNA میشود .

🔻پس از اتصال باز هم به آنزیم اندونوکلئازی نیاز هست برای برش DNA .این بار نیز از FOK1 استفاده میکنند و با تشکیل هترودیمر بین نواحی برشی آنزیم آن را فعال میکنند .
💰هزینه این روش از ZFN بیشتر است .
و چون حتما باید کمپلکس به نواحی از DNA متصل شود که با تیمین شروع شده و اگر تیمین نباشد اتصالی صورت نمیگیرد و ناپایدار است بنابراین این محدودیت برای اتصال ایجاد کرده و این روش نیر منسوخ شده .

♦️و اما اکنون از روش #CRISPR استفاده میشود .

🆔@PrimerSBU

🔶 بزرگترین سمپوزیوم تخصصی بیوسنسور و نانوبیوسنسور
🔷 بیونا ۱

📆 شنبه ۱۴ اردیبهشت‌ماه ۹۸
🕰 ساعت ۱۳:۰۰ الی ۱۸:۰۰
🏢 دانشگاه صنعتی شریف، آمفی تئاتر مرکزی

🔴 با ارائه گواهي معتبر حضور

👈 اطلاعات بیشتر و ثبت‌نام:
https://evnd.co/BVsL2

✅ تخفیف ویژه برای دانشجویان دانشگاه صنعتی شریف و شهید بهشتی
🎯 تخفیف ویژه ثبت‌نام زودهنگام
⚠️ مهلت ثبت‌نام:٢- ۱۰ اردیبهشت

🆔 @Biona_event

با سلام بچه ها 👋

📗 با #دوشنبه‌های‌همگرا در خدمتتونیم ....

یه پلن ریختیم برای اینکه یه اصول ابتدایی رو از هر فناوری همگرا بدونین و بعدش از ترکیبشون با بیوتکنولوژی براتون بگیم ... 😎

امیدواریم که خوشتون بیاد .... 😉

-------------------------

🔸در اولین قسمت میخوایم شما رو یکم با علوم شناختی آشنا کنیم اونم با چه مجموعه‌ای ...

🔹 #بازی‌های‌مغز کاری از نشنال جئوگرافیکه که نسخه دوبله شدشو براتون فرستادم ....

برید حال کنین

#welcome_to_NBICs

#بازی_های_مغز| قسمت اول : مغز و پیری

کاری از شبکه نشنال جئوگرافیک (دوبله فارسی)

@ranvier_center

#اخبار_هفته

🔺شبیه‌سازی کامل یک ژن در سطح اتم برای نخستین بار در جهان.
پژوهشگران با شبیه‌سازی یک میلیارد اتم، کل یک ژن را در سطح اتمی شبیه‌سازی کردند.🧬
http://bit.ly/2Lg1mb1


🔺تکامل صورت انسان👩🏼‍🦰👩🏾‍🦰👩🏼
https://news.1rj.ru/str/science/1565


🔺راهی جدید برای فریز کردن سلول‌ها🧫
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/04/190424153527.htm


🔺درمان بیماری ریوی قبل از تولد با استفاده از کریسپر🗝
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/04/190417171025.htm

Fish schooling 🐠

🛢💰🐟 بیومیمتیک در چالش انرژی:

🔻در واقع تنها تکنولوژی در حال پیشرفت نیست؛ بلکه طریقه ی چینش این تکنولوژی نیز در حال پیشرفت است.

🐋 پیش تر گفتیم از باله های وال برای ساخت پره های توربین بادی الگو گرفتیم و به این روش اصطکاک را کاهش دادیم.

🌪 حرکت هر توربین وورتکسی (vortex) را اطراف خود ایجاد می‌کند که اصطکاک ناشی از آن حرکت سایر توربین ها را کند میکند؛ بنابراین برای جلوگیری از این مسئله توربین ها را با فاصله ی بسیار زیاد از هم قرار میدهند، در نتیجه مساحت وسیعی را اشغال می‌کنند.

🔸و این بار نیز از بیومیمتیک برای چینش این توربین ها استفاده کردند.

🐠 در حرکت دسته جمعی ماهی ها، هر ماهی اطراف خود مشابه همین وورتکس را ایجاد می‌کند؛ ولی با این حال بسیار نزدیک به سایر ماهی ها حرکت می‌کند در اصل با اشغال کمترین فضا!
وقتی محققان حرکت این ماهی ها را بررسی کردند متوجه شدند نه تنها وورتکس اطراف ماهی ها باعث اصطکاک در حرکت سایرین نمی‌شود بلکه چینش آنها به صورتی بوده که به حرکت یکدیگر کمک نیز می‌کنند.

🛠محققان در موسسه ی caltech در کالیفرنیا توربین های عمودی ای ساختند که اصطکاک را به مقدار قابل توجهی کاهش می‌دهد و حال به هدف نزدیک تر کردن فاصله ها و کم کردن اصطکاک میان توربین ها در حال بررسی حرکت جمعی ماهی ها برای یافتن چینش مناسب این توربین ها اند.


#بیومیمتیک @primerSBU

Fish schooling

توربین های عمودی؛ ساخته ی محققان caltech کالیفورنیا.

با سلام بچه ها 👋

📗 با #دوشنبه‌های‌همگرا در خدمتتونیم ....

یه پلن ریختیم برای اینکه یه اصول ابتدایی رو از هر فناوری همگرا بدونین و بعدش از ترکیبشون با بیوتکنولوژی براتون بگیم ... 😎

امیدواریم که خوشتون بیاد .... 😉

-------------------------
🔸در قسمت دوم میخوایم شما رو با دنیای #رنگ_شناختی آشنا کنیم ...
یکمی هم ذهنتون رو به چالش بکشیم تا ببینیم تحلیل های رنگی‌تون چجوریه ....

🔹 #بازی‌های‌مغز کاری از شبکه نشنال جئوگرافیکه که برای شما میزاریم تا #شناخت رو یادبگیرین

برید حال کنین

#welcome_to_NBICs به دنیای فناوری‌های همگرا خوش آمدید

#بازی_های_مغز| قسمت دوم : پردازش رنگ

کاری از شبکه نشنال جئوگرافیک (دوبله فارسی)

- لطفا با گوشی آندرویدی یا ویندوز مشاهده کنید

@ranvier_center

#drug_delivery 💊
#nano_particles
#tiny_robots

🔎 ⭐️🌟⭐️✨🌟⚡️✨⭐️🌟⭐️🎯

🚩 طراحی و ساخت ریزربات های مغناطیسی ، جهت تسهیل عبور نانوذرات حامل دارو از دیواره رگ های خونی و انتقال آن به بافت هدف

📍🔬♦️🔬🔎♦️🔎🔬♦️🔬🔎📍

🎆 این ریزربات های مغناطیسی ۳۵ صدم میلیمتری واجد پوشش نیکلی ، با الگوگیری از ساختار تاژک باکتری ها ، بوسیله ی چاپگر سه بعدی ، شبیه سازی و ساخته شده اند.

🎯 این ریزربات ها ی شبه تاژک باکتری ، با قرارگرفتن در خلاف جهت مسیر جریان خون ، در نزدیکی بافت مورد نظر ساکن می شوند و به صورت ایستا ، با چرخش های مکرر ، اقدام به تولید جریان مغناطیسی نموده و ضمن هدایت نانوذرات حامل دارو به سمت خود ، موجب تسریع و تسهیل عبور آنها از دیواره ی رگ های خونی اطراف تومور گشته و در نهایت سبب تجمع آنها در بافت هدف ، می گردند.

👇📰📙👇👇👇👇👇👇📰📓👇

https://phys.org/news/2019-04-tiny-robots-powered-magnetic-fields.html

🆔 @PrimerSBU

#پوستر | کاشف سر‌زمین‌دانایی
‌
⚪دوازدهم اردیبهشت ماه‌،‌روز بزرگداشت مقام معلم

◻خانه‌طراحان‌انقلاب‌اسلامی
◻طراح: فاروق‌روحی
◻ترکیب‌نوشتار: مجتبی‌حسن‌زاده

@primerSBU

#بیوتکنولوژی_کشاورزی
🌿پپتیدهای مشتق شده گیاهی با فعالیت آنتی اکسیدانی

🔶تنش های اکسیداتیو معمولا مسئول یکسری از بیماری های قلبی-عروقی، اعصاب مغزی و التهابی مثل سرطان است. تنش اکسیداتیو به وسیله عناصرفعال اکسیژن (ROS) ایجاد می شوند که می تواند آسیب های فیزیکی به DNA، لیپید و پروتئین های بدن بزنند. یک تعدادی از پپتیدهای آنتی اکسیدان در BIOPEP لیست شده اند و علاقه به پپتیدهای آنتی اکسیدان مشتق شده ازگیاهان درحال افزایش است.
⬅️پپتیدهای آنتی اکسیدان می‌توانند طی روند هیدرولیز پروتئین، هضم و فرمانتیشن آن تولید شوند.

⭕️علاوه براین، یک تعدادی از آمینواسیدها برای فعالیت های آنتی اکسیدانی شناخته شده اند؛ شامل: هیستیدین (His)، تریپتوفان (Trp)، تیروزین (Tyr) و لایزین (Lys) هستند. این آمینو اسیدها می توانند با یون های فلزی و سیستئین به کمک گروه های تیولی کلاته (Chelate) شوند.

✔️آندینگو و همکارانش تاکید کردند که فعالین آنتی اکسیدانی آمینواسیدها و پپتید ها به مقدار زیادی به شرایط محیطی وابسته است. برای مثال، فعالیت آنتی اکسیدانی پپتید گندم زمانی که حرارت می بیند از دست می رود و مالون‌دی‌آلدهید (Malondialdehyde) پیدا شده است که پپتیدها را اکسیده کند و باعث از دست رفتن فعالیت آنتی اکسیدانی می شود. پپتیدهای غلات نیز با فعالیت آنتی اکسیدانی شناسایی شدند. لوناسین برای تکه تکه کردن رادیکال های پروکسیل و سوپراکسید هردو پیدا شده است و برای این یافت شد که از حرکت سلول Caco-2 محافظت کند و به عنوان یک عام محافظتی در سطوح لوله گوارش استفاده می شود.
From Book “Peptide_Applications_in_Bitechnology”- Chapter 21

@primerSBU

✅ درمان بیماری CHF با تکنولوژی کریسپر🧬
https://www.instagram.com/crispr.daily/p/BxNqvMwBUs6/?utm_source=ig_share_sheet&igshid=f7qm4jvd3gdr



✅ کشف ولتاژ نورون ها باعث کشف بسیاری از بیماری های عصبی می‌شود🧠
https://www.genengnews.com/news/nerve-cell-voltage-finding-may-lead-to-new-therapies-for-neurological-disorders/



✅ دانشمندان بیومارکر سرطان پروستات را کشف کردند🧪
https://www.genengnews.com/news/potential-metastatic-prostate-cancer-biomarker-identified/




✅ ساخت سلول‌های جنینی از سلول پوست❗🧫
https://www.sciencedaily.com/releases/2019/05/190502143437.htm

🌎“ Saving electrical energy means saving our environment and slowing down climate change. Sustainable architecture urgently requires new materials.”

Zollfrank

@primerSBU

🌎“ Saving electrical energy means saving our environment and slowing down climate change. Sustainable architecture urgently requires new materials.”

Zollfrank


🛢💵🌱 بیومیمتیک در چالش انرژی:

🌲Pine cones. (میوه ی درخت کاج)

🏢 ۴۰٪ انرژی مصرفی در آمریکا در سال ۲۰۱۶ از ساختمان های تجاری و مسکونی بوده.
سیستم های گرمایش و سرمایش و... ساختمان ها انرژی بسیار زیادی مصرف می‌کنند.

🌲 پژوهشگر دانشگاه TUM مونیخ، Zollfrank، با مطالعه بر روی میوه های درخت کاج و مواد تشکیل دهنده ی آنها متوجه شد، این میوه ها با توجه به وضعیت آب و هوایی بسته و باز میشوند بدون مصرف هیچ نوع انرژی.

🌧 این فرآیند به خاطر مواد تشکیل دهنده ی دیواره ی این میوه است. دیواره ی آن از سلولز و لیگنین تشکیل شده. بخش سلولزی آن توانایی این را دارد که آب جذب کرده و بزرگ شود و آب از دست داده و کوچک شود. به همین ترتیب متناسب با وضعیت آب و هوایی باز و بسته میشوند.

در صنعت هرگونه جا به جایی که بتواند بدون مصرف انرژی انجام گیرد میتواند بسیار مفید باشد و مورد استقبال قرار می‌گیرد.

⚽️ از این روش میخواهند برای ساخت پوشش سقف استادیوم فوتبال استفاده کنند. در هنگام بارندگی بدون مصرف هیچ گونه انرژی منافذ سقف بسته شده و در هوای آفتابی و بدون رطوبت خود به خود باز شود.

❓پژوهشگران این پروژه به چالشی برخورده اند: در اندازه ی کوچک این باز و بسته شدن حدود ۱ الی ۲ ساعت زمان میبرد اما وقتی اندازه بزرگ میشود این زمان میتواند به ۱ سال هم برسد.

💡پاسخ: میتوان ساختارهای بزرگ را به بخش های بسیار کوچک با اندازه های میکرومتری تقسیم کرد که هر کدام به صورت مستقل با سرعت عمل کنند.

🍃 در این اندازه ها نیز از فراوان ترین ماده ی موجود بر روی زمین یعنی سلولز استفاده میکنند که زیست تخریب پذیر و قابل بازیافت است.

🔸این روش میتواند برای هر نوع جا به جایی بر اساس وضعیت آب و هوایی به کار رود.



#بیومیمتیک @primerSBU

سقف هوشمند استادیوم که با تغییر آب و هوا باز و بسته میشود.