📝چکیده‌ای از مقاله‌ی مورد بررسی در نهمین #ژورنال_کلاب شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران:

🔹️این مقاله بر روی سویه‌ی MERS ویروس کرونا (MERS-CoV) و توانایی آن برای فرار از پاسخ ایمنی میزبان تمرکز دارد.

🔹️پروتئین MERS-CoV ORF4b مسئول مهار پاسخ ایمنی ذاتی میزبان با اتصال به گیرنده‌‌ی ورود به هسته‌ی IMPα3 است. در این مطالعه، ساختارهای کریستالی‌ای با وضوح بالا ارائه شده‌است که چگونگی تعامل ORF4b را با دو عضو متمایز از خانواده IMPα نشان می‌دهد.

🔹️نکته‌ی قابل توجه در هر دو تعامل این است که در هر دو برهم‌کنش در محل P2 فقدان یک آمینواسید حیاتی را داریم که باعث می‌شود مسیر آن از روند اتصال معمول در سلول‌ها خارج شود. آزمایش‌های بیشتر نشان می‌دهند که جهش‌ها در ناحیه‌ی سیگنال متمرکزکننده‌ی هسته‌ای(NLS)، مکانیسم اتصال را تغییر می‌دهند که این تغییر در نهایت منجر به بازگشت به روند متعارف اتصال P2 Lysine می‌شود.

🔹️این یافته‌ها اهمیت مکانیسم‌های اتصال نامتعارف را برای ورود به ناحیه‌ی هسته‌ای سلول، تعامل IMPα و مهار ایمنی ذاتی را برجسته می‌کنند. علاوه بر این، این مطالعه نشان می‌دهد که نواحی اتصال ORF4b با نواحی اتصال هسته‌ای جزء NF-kB در p50 هم‌پوشانی دارند که این موضوع توضیحی محتمل برای مکانیسم مهار ارائه می‌دهد.

🔹️نتایج نشان می‌دهد که چگونه ویروس MERS-CoV می‌تواند به‌طور موثر IMPα را هدف قرار دهد تا پاسخ ایمنی را مختل کند و بر اینکه چگونه جهش‌های کوچک در ORF4b می‌توانند مکانیسم اتصال را تغییر دهند، تأکید می‌کند.(همان‌طور که در گونه‌های دیگر ویروس‌ کرونا مانند HKU5 مشاهده شده‌است)

Telegram | LinkedIn | Instagram

🗓تقویم رویدادهای آموزشی اسفند ماه ۱۴۰۲ شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی

🔸ادامه‌ی اولین دوره‌ی #باهم‌_خوانی با موضوع هوش‌ مصنوعی در زیست‌شناسی و با هدف افزایش آگاهی در زمینه‌ی زیست‌شناسی محاسباتی برگزار می‌شود.


🔹همچنین #ژورنال_کلاب‌ ها، از سری رویدادهای آموزشی انجمن هستند که در آن‌ها مطالعات‌ اخیر در حوزه‌های مختلف بیوانفورماتیک و زیست‌شناسی محاسباتی مورد بحث قرار می‌گیرند.

🔗با شرکت در این جلسات می‌توانید از دانش اساتید و افراد متخصص این حوزه بهره‌مند شوید و با مشارکت در بحث‌ها به پویایی و مفید بودن جلسات کمک‌کرده و دیگران را از دانش خود بهره‌مند سازید.

Telegram | Linkedin | Instagram

#تقویم‌ماهانه
#باهم‌خوانی
#ژورنال_کلاب

📚 Big Data Analysis for Bioinformatics and Biomedical Discoveries

✍Ye, Shui Qing (ed.)

📃286 (2016)

🔗این کتاب، یک راهنمای جامع در زمینه‌ی کاربرد تحلیل داده‌های بزرگ(Big Data) در حوزه‌های مختلف بیوانفورماتیک و تحقیقات پزشکی‌ است که برای علاقه‌مندان به این حوزه مفید و قابل‌استفاده خواهدبود.

🖇کتاب در ۱۵ فصل و ۳ بخش اصلی به کاربرد تحلیل داده‌های بزرگ(Big Data) در حوزه‌های بیوانفورماتیک و تحقیقات پزشکی پرداخته‌است.

〰۳ بخشی اصلی این کتاب به‌صورت زیر است:
۱. ابزارهای معمول برای تحلیل داده‌های بزرگ
۲. تحلیل داده‌های NGS
۳. تجزیه و تحلیل داده‌های یک‌پارچه و جامع

📌فایل این کتاب به‌صورت رایگان دردسترس شما همراهان است.

Telegram | LinkedIn | Instagram

#پیشنهاد_کتاب

✳ انجمن بیوانفورماتیک ایران و آزمایشگاه سیستم‌های زیستی پیچیده و بیوانفورماتیک دانشگاه تهران با همکاری پژوهشکده هماتولوژی، انکولوژی، و سل تراپی دانشگاه علوم پزشکی تهران و مدیریت امور پژوهشی و مرکز مطالعات و توسعه آموزش پزشکی دانشگاه علوم پزشکی هوشمند برگزار می‌کند.

📱 جهت کسب اطلاعات بیشتر با شماره 09202407110 تماس بگیرید.


✳ DIY | https://news.1rj.ru/str/DIY_PBL

🆔https://news.1rj.ru/str/IranianBioinformaticsSociety

Beyond Boundaries...


Telegram | LinkedIn | Instagram

#HBC2024

📢سخنرانی و ارائه‌ی ویژه پژوهشی با
دکتر امیرحسین سعیدیان، فلوشیپ تخصصی کلینک Baylor آمريکا

در این رویداد آنلاین، دکتر سعیدیان
در ابتدا به ارائه‌ی تفصیلی پژوهش‌های خود در حوزه‌ی ژنتیک پزشکی و به‌طور ویژه موضوع
Advances in Molecular Genetics of  Heritable Skin Disorders
خواهند پرداخت
و سپس به سوالات شرکت‌کنندگان در خصوص مسیر پژوهشی این رشته و همچنین همکاری‌های پژوهشیِ بین‌المللی پاسخ خواهند داد.

🗓شنبه، ۱۲ اسفند ۱۴۰۲
⏰ساعت ۲۰:۳۰

<ثبت نام جهت شرکت در این رویداد الزامی می‌باشد>

👈لینک ثبت‌نام

جهت آشنایی بیش‌تر با سوابق تحصیلی و حرفه‌ای ایشان می‌توانید از کانال تلگرامی ایشان بهره‌مند گردید.

Telegram | LinkedIn | Instagram

#رویداد
#زیست‌شناسی_سلولی

📢 «دهمین #ژورنال_کلاب شاخه‌ی دانشجویی انجمن جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران»

🔸 موضوع:

"Effects of the pathological E200K mutation on human prion protein"

🧑🏻‍💻با حضور سرکار خانم دکتر فاطمه فروتن

🔹«ایشان هم‌اکنون مدیر R&D شرکت Maya Milk ترکیه هستند و مدرک دکترای خود را در رشته‌ی بیوتکنولوژی از دانشگاه Yıldız Technical ترکیه دریافت‌کردند و همچنین دوره‌ی پسادکترای خود را در پژوهشگاه ملی مهندسی‌ ژنتیک و زیست‌فناوری گذرانده‌اند.
ایشان علاقه‌مند به تحقیق در زمینه‌ی مهندسی پروتئین و آنزیم، مهندسی متابولیک و بیوانفورماتیک به‌ویژه ایمونوانفورماتیک هستند.»

🔹جهت کسب اطلاعات بیش‌تر در مورد سابقه‌ی آموزشی و پژوهشی ایشان، می‌توانید به صفحه‌ی گوگل اسکالر و لینکدین ایشان مراجعه نمائید.

🗓تاریخ: یکشنبه، ۱۳ اسفند ۱۴۰۲ (۳ مارچ)
⏰ساعت: ۲۰ الی ۲۲

📎 لینک ثبت‌نام
🌐 این رویداد به صورت آنلاین برگزار می‌گردد.

📚 دوستان علاقه‌مند جهت شرکت در ژورنال کلاب توجه داشته‌باشند که جهت ایجاد پیش‌زمینه‌ی ذهنی بهتر و بهره‌مندی و مشارکت بیش‌تر شما عزیزان، مطالعه‌ی مقاله‌ی زیر پیشنهاد می‌شود.

👈 لینک مقاله


Telegram | LinkedIn | Instagram

#ژورنال_کلاب

🔜
Remember the date, March 13...🔥

Telegram | LinkedIn | Instagram

#HBC2024

📌مؤثر باشیم مثل آقای Pavel Pevzner!

🔗ایشون یکی از اولین نفراتی هست که در فیلد بیوانفورماتیک یک کتاب مرجع نوشته و در اون مطالبی که شاید در نگاه اول کمی خشک به‌نظر برسند رو اونقدر جذاب توضیح داده که هنوز به‌عنوان یکی از بهترین کتاب‌های حوزه‌ی خودش شناخته می‌شه.

🧑🏻‍💻👩🏻‍💻الگوریتم‌های بیوانفورماتیک، اسم این کتابه که اتفاقاً یک سایت هم داره!
تو این وبسایت، خود جناب Pavel Pevzner، بعضی از موضوعات رو درس می‌ده که ویدئوهاش از اون ویدئو‌هایی هستند که حتما در خاطرتون می‌مونند!

👈🏻کتاب مرجع و جذاب برای یک فیلد نوشتن! اونم برای بیوانفورماتیک! اونم در سال 2014! بله! می‌شه یه کار اساسی!

🐒عکس حیوانات و کارتون‌ها حتی روی جلد اون هم حضور داشتند!
میمونی که در عکس می‌بینید، یکی از اون‌هاست!

🔥ما به یک نفر از کسانی که تا ساعت 12 امشب به یک مورد دیگه از کارهای اساسی این فیلد در ریپست پست لینکدین انجمن درمورد این کتاب
اشاره کنند، یک نسخه‌ی چاپی از این کتاب رو هدیه می‌دهیم!

🤝جایزه؟ کار اساسی؟ جاش این‌جاست!

Telegram | LinkedIn | Instagram

#معرفی
#بیوانفورماتیک

این پست رو یادتونه؟

👈اینستاگرام ما رو چک کنید تا هم بیش‌تر با این رویداد علمی هیجان‌انگیز آشنا بشید و هم با گفتن حدس‌های خودتون توی کامنت‌ها، کد تخفیف برای شرکت در رویداد رو برنده بشید.

شمارش معکوس شروع شده، حتماً حواس‌تون به کانال تلگرام ما باشه!🔥

📌نخستین سمینار پیشرفته‌ی زیست‌شناسی محاسباتی، بیوانفورماتیک و سلامت (HBC 2024)

🖇با حضور برجسته‌ترین اساتید و پژوهشگران این حوزه از سراسر جهان!

-از دانشگاه Harvard: دکتر علیرضا حقیقی و دکتر عطا کیاپور
-از دانشگاه Cambridge: دکتر محمد لطف‌اللهی
-از Broad Institute: دکتر Anne Carpenter
-از دانشگاه Boston: دکتر کیهان بتمن قلیچ
-از دانشگاه صنعتی شریف: دکتر محمدحسین رهبان و دکتر علی شریفی زارچی

🔥با حضور افتخاری پروفسور Pavel Pevzner، نویسنده‌ی کتاب ارزشمند Bioinformatics Algorithms از دانشگاه UCSD

🗓۲۳ و ۲۴ اسفندماه ۱۴۰۲

🔗رویداد آنلاین

🔖مهلت ثبت‌نام: ۲۲ اسفند ۱۴۰۲

✔️لینک ثبت‌نام:
https://rayazi.com/events/hbc-2024

📃همراه با صدور #گواهی_حضور در سمینار از طرف شاخه‌ی دانشجویی انجمن‌ جهانی زیست‌شناسی محاسباتی در ایران (ISCB)

Telegram | LinkedIn | Instagram

#HBC2024
#رویداد

✔️Dr. Ata Kiapour | دکتر عطا کیاپور

🔗Director of MSK Informatics Group & Assistant Professor of Orthopedic Surgery at Boston Children's Hospital & Harvard Medical School

🔅Academic & Industrial Background:

🔹Founder of BonePixel

🔸Affiliate Faculty, Harvard Data Science Initiative

🔹Assistant Professor of Orthopedic Surgery at Harvard Medical School

🔸Director of Musculoskeletal Informatics Group at Boston Children's Hospital

🔹Associate Member at Wyss Institute for Biologically Inspired Engineering

🖇Educational Background:

◾️PhD: Biomedical Engineering, University of Toledo

◾️Master of Medical Sciences(MMSc): Clinical and Translational Investigation, Harvard Medical School

〽️Pages
~LinkedIn | Google Scholar | Twitter

📌Presentation Title | عنوان ارائه
~Leveraging Big Data and AI to Personalize Orthopedic Care

💠Language of Presentation
~ Farsi | فارسی

#ComputationalBiology
#PersonlizedMedicine
#BigData
#ArtificialIntelligence

🌐〰Registration Link

#HBC2024
#Presenters

Telegram | LinkedIn | Instagram

✔️Dr. Alireza Haghighi | دکتر علیرضا حقیقی

🔗Assistant Professor of Medicine & Founding Director of International Center for Genetic disease at the Brigham and Women's Hospital, Harvard Medical School

🔅Academic & Industrial Background:

🔹Founding Director, International Center for Genetic Disease at Harvard Medical School

🔸Director and Principal Investigator of National Genome Program of Bahrain at Harvard Medical School

🔹Associate Member at Broad Institute of MIT and Harvard

🔸Founding President at Advancement Initiative for Medicine and Sciences(AIMS)

🖇Educational Background:

◾️Clinical Fellowship: Clinical Genetics, Harvard Medical School

◾️D.Phil: Medical Genetics, University of Oxford

〽️Pages
~LinkedIn

📌Presentation Title | عنوان ارائه
~Global efforts Advancing Genomics Medicine

💠Language of Presentation
~Farsi | فارسی

#ComputationalBiology
#Genomics
#ArtificialIntelligence
#MachineLearning

🌐〰Registration Link

#HBC2024
#Presenters

Telegram | LinkedIn | Instagram

✔️Dr. Mohammad Lotfollahi | دکتر محمد لطف‌اللهی

🔗Faculty at Wellcome Sanger Institute and CCAIM at University of Cambridge, Director of Machine Learning Research at Relation Therapeutics

🔅Academic & Industrial Background:

🔹Faculty at Wellcome Sanger Institute & Cambridge Centre for AI in Medicine(CCAIM)

🔸Researcher, Consultant and Advisor in both Biotechnology & ML/AI Companies like Cellarity, Meta AI, SANTA ANA Bio, and Relation Therapeutics

🖇Educational Background:

◾️PhD: Computational Biology, Technical University of Munich (TUM) & Helmholtz Munich under the Supervision of Fabian J. Theis

◾️MSc: Computer Engineering (Artificial Intelligence), Sharif University of Technology

◾️BSc: Computer Engineering, University of Tabriz

〽️Pages
~LinkedIn | Google Scholar | Twitter | Website

📌Presentation Title | عنوان ارائه
~Generative Modeling for Cellular Biology

💠Language of Presentation
~Farsi | فارسی

#ComputationalBiology
#CellBiology
#MachineLearning
#ArtificialIntelligence

🌐〰Registration Link

#HBC2024
#Presenters

Telegram | LinkedIn | Instagram

✔️Dr. Mohammad Hossein Rohban | دکتر محمدحسین رهبان

🔗Assistant Professor in Computer Engineering at Sharif University of Technology

🔅Academic & Industrial Background:

🔹Assistant Professor in Computer Engineering at Sharif University of Technology

🔸Director of Robust and Interpertable Machine Learning(RIML)

🔹Postdoctoral Associate, Broad Institute of Harvard and MIT

🔸Postdoctoral Research Associate, Boston University

🖇Educational Background:

◾️PhD: Computer Engineering, Sharif University of Technology

◾️MSc: Computer Engineering, Sharif University of Technology

◾️BS.c: Computer Engineering, Sharif University of Technology

〽️Pages
~LinkedIn | Google Scholar | Twitter

📌Presentation Title | عنوان ارائه
~Recent Advances in Weakly Supervised Learning for Diagnosis in Digital Pathology

💠Language of Presentation
~Farsi | فارسی

#ComputationalBiology
#DigitalPathology
#MachineLearning
#ArtificialIntelligence

🌐〰Registration Link

#HBC2024
#Presenters

Telegram | LinkedIn | Instagram

✔️Dr. Anne E. Carpenter

🔗Senior Director of the Imaging Platform at Broad Institute of MIT and Harvard

🔅Academic & Industrial Background:

🔹Applying Methodes for extracting Quantitative Information from Biological Images

🔸Developed CellProfiler, the first open-source, high-throughput Cell Image Analysis Software

🔹Use Image Analysis to Identify Disease States, Therapeutic Potential, and Gene Function from Microscopy Images

🔸Scientific Advisory Board Member at Quiver Bioscience

🔹Institute Scientist and Imaging Platform Senior Director at Broad Institute of MIT and Harvard

🔸Scientific and Technical Advisory Board Member at Recursion Pharmaceuticals

🔹Founder & President at CytoData

🔸Scientific and Technical Advisory Board Member at Bio-Rad Laboratories

🔥Named to the top-100 list of AI Leaders in Drug Discovery and Healthcare by Deep
Knowledge Analytics

🖇Educational Background:

◾️Postdoctoral fellow: High-throughout Microscopy and Living Cell Microarrays to reveal Gene Function, Whitehead Institute for Biomedical Research, Massachusetts Institute of Technology(MIT)

◾️PhD: Cell Biology, University of Illinois Urbana-Champaign

◾️BSc: Biology, Purdue University

〽️Pages
~LinkedIn | Google Scholar | Twitter

📌Presentation Title | عنوان ارائه
~Accelerating Drug Discovery with Microscopy & Machine Learning

💠Language of Presentation
~English | انگلیسی

#ComputationalBiology
#DrugDiscovery
#CellBiology
#MachineLearning

🌐〰Registration Link

#HBC2024
#Presenters

Telegram | LinkedIn | Instagram

✔️Dr. Ali Sharifi Zarchi | دکتر علی شریفی زارچی

🔗 Faculty of Bioinformatics and Artificial Intelligence, Sharif University of Technology

🔅Academic & Industrial Background:

🔹Faculty of Bioinformatics and Artificial Intelligence, Sharif University of Technology

🔸Chair of International Scientific Committee, International Olympiad of Informatics

🔹Member of Scientific Committee, International Olympiad in Artificial Intelligence

🔸Co-Founder of Rayazi Research Group

🔹Head of Bioinformatics Lab, Royan Institute

🖇Educational Background:

◾️Postdoctoral Researcher, Colorado State University

◾️Associate Researcher, Max Planck Institute for Molecular Biomedicine

◾Ph.D: Bioinformatics, University of Tehran

◾️MS.c: Computer Engineering, Sharif University of Technology

◾BS.c: Computer Engineering, Sharif University of Technology

〽️Pages
~LinkedIn | Google Scholar | Twitter

📌Presentation Title | عنوان ارائه
~Bioinformatics in Clinics: How Computational Biology Can Save Human Lives?

💠Language of Presentation
~ Farsi | فارسی

#ComputationalBiology
#Bioinformatics
#ArtificialIntelligence
#PersonlizedMedicine

🌐〰Registration Link

#HBC2024
#Presenters

Telegram | LinkedIn | Instagram

📢به درخواست شما مخاطبین عزیز و برای کسانی که ثبت‌نام زودهنگام رو از دست داده بودند، یک چالش دانش بیوانفورماتیکی داریم که اگه بتونید به حداقل ۳ سوال جواب درست بدید و اسکرین‌شات اون رو برای ادمین ارسال کنید، به‌عنوان هدیه یک کدتخفیف ۲۵ درصدی از طرف ما دریافت می‌کنید.

👈ادمین: @RSG_Iran