🟢مراحل PCR (Polymerase Chain Reaction) یا واکنش زنجیره ای پلیمرازی (هدف : تکثیر DNA)



🟣 Denaturation (دناتوراسیون)
DNA با حرارت بالا (۹۴–۹۶ درجه) داغ می‌شه ← شکسته شدن پیوندهای هیدروژنی بین دو رشته DNA

🟣 Annealing(انیلینگ)
دمـا پایین آورده می‌شه (۴۵–۶۵ درجه) ← اتصال پرایمرها به توالی مکمل روی هر رشته‌ی DNA

👈نکته:Annealing در متالورژی (علم فلزات) به معنی « خنک کردن آهسته فلز داغ برای پایدار شدن» هست.
در PCR هم همین مفهوم رو گرفته: یعنی خنک کردن دما تا پرایمرها پایدار روی رشته‌ی DNA بشینن.


🟣 Extension (گسترش)
در دمای حدود ۷۲ درجه، آنزیم Taq پلیمراز نوکلئوتیدها رو به انتهای پرایمر اضافه می‌کنه ← رشته جدید DNA ساخته می‌شه.

نکته:Taq پلیمراز از باکتری Thermus aquaticus جدا شده اسمش شده Taq(مخفف ابتدای دو کلمه)؛ این باکتری در چشمه‌های آب داغ زندگی می‌کنه و آنزیم Taq پلیمراز در برابر دمای بالا مقاومه (پس مناسبه برای PCR)

🟢 این چرخه بارها تکرار می‌شه و در هر بار تعداد DNA دو برابر می‌شه


|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🟢انیشتین در سپتامبر ۱۹۰۵ در چنین روزی معادله‌ی انقلابی خود E=mc² را منتشر کرد.

🟢این معادله نشان داد که جرم و انرژی دو شکل متفاوت از یک چیز هستند و می‌توانند به یکدیگر تبدیل شوند؛ برخلاف تصور قدیمی دانشمندان که آن‌ها را بی‌ارتباط می‌دانستند.

🟢او به پاس دستاوردهای فراوانش در فیزیک نظری، به‌ویژه کشف قانون اثر فوتوالکتریک، جایزه نوبل فیزیک سال ۱۹۲۱ را دریافت کرد.

|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🔆 اثر فوتوالکتریک : وقتی نور به سطح یک فلز (مثلاً سدیم) می‌تابه، اگر انرژی فوتون‌های نور به‌اندازه‌ی کافی زیاد باشه، می‌تونن الکترون‌ها رو از سطح فلز جدا کنن.

✳️ نکات کلیدی :

نور مثل «ذره» هایی از انرژی (فوتون) رفتار می‌کنه.

هر فوتون ← اگر انرژی‌اش بیشتر از یک حد مشخص (تابع کار فلز) باشه ← یک الکترون آزاد می‌کنه.

🟡شدت نور (تعداد فوتون های تابیده شده در واحد زمان ) فقط تعداد الکترون‌های جدا شده رو زیاد می‌کنه، ولی رنگ/فرکانس نور (انرژی فوتون ها)تعیین می‌کنه که اصلاً الکترونی جدا می‌شه یا نه. یعنی شدت نور هرچقد زیاد باشه تا وقتی هر فوتون انرژی لازم رو برای جدا کردن الکترون نداشته باشه اتفاقی نمیفته

❗️یعنی شما هرچقد با سنگ بزنی تو شیشه همسایه تا وقتی سنگ هات ریز باشن( فوتون با فرکانس پایین) صد تا هم بزنی اتفاقی نمیفته😶 اما اگر سنگ ها درشت باشن(فوتون با فرکانس بالا )هر چقد سنگ بیشتری بزنی(تعداد فوتون ها) شیشه بیشتری خرد میکنی و بیشتر فحش میشنوی 😁

📌 اهمیت: این پدیده ثابت کرد نور فقط موج نیست،بلکه رفتار ذره ای هم داره ← پایه‌ای برای مکانیک کوانتومی

|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🐞 سوسکِ خوش‌خط‌و‌خال کالیگرافا (Calligrapha) یکی از زیباترین سوسک‌های برگ‌خوار دنیاست.
این موجود ریز و بامزه بیشتر از ۱۰۰ گونه داره و توی آمریکای شمالی و مرکزی زندگی می‌کنه.

طرح های روی بال هاش انقدر قشنگ و شبیه خط و نقاشیه که بهش لقب «کالیگرافا» دادن
(کالیگرافی = خوش‌نویسی)

#طبیعت

|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🧠 درمان جدید پارکینسون با سلول‌های مغزی آزمایشگاهی

🟡پژوهشگران در ژاپن، آمریکا و سوئد سلول‌های مغزی تولیدکننده دوپامین که در آزمایشگاه پرورش داده شده اند را به مغز بیماران پیوند زدند
✨ نتایج اولیه:

🔸سلول‌های پیوندی زنده می‌مونن، با بافت مغز یکی میشن و شروع به تولید دوپامین می‌کنن.
🔸بیماران دریافت‌کننده دوز بالاتر، بهبود قابل‌توجهی در حرکت نشون دادن.
🔸عوارض شدید گزارش نشده.
🔸اسکن‌های مغزی افزایش سطح دوپامین رو تأیید کردن.

📌 نکات کلیدی مقاله

🔸تیم تحقیق بررسی کرده چطور فاکتور رشد FGF17 و مسیر cAMP می‌تونن روی شکل‌گیری سلول‌های پیش‌ساز دوپامین‌ساز اثر بذارن.
🔸این ترکیب باعث میشه سلول‌های بنیادی به‌طور دقیق‌تر به نورون‌های دوپامین‌ساز مناسب برای پیوند در بیماران پارکینسونی تبدیل بشن.
🔸هدف: تولید سلول‌هایی که کارآمدتر و ایمن‌تر باشن و بعد از پیوند به‌خوبی عمل کنن.


منبع :
https://academic.oup.com/stmcls/article/43/3/sxaf004/8071562



|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

صبح پاییزی تون به زیبایی این بیت از پروین اعتصامی🍁♥️

هزار کوه گرت سد ره شوند، برو
هزار ره گرت از پا در افکنند، بایست

#Good_morning

|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🟣 دوره آنلاین دانشگاه هاروارد


🟢Statistics and R (آمار و زبان برنامه نویسی R)


🔸میتونید به عنوان مستمع آزاد از مطالبش استفاده کنید و اگر مدرک بخواید باید هزینه بدید

🔹ثبت نام


|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🎯 کاربردهای اصلی زبان R

🟠📊 آمار و تحلیل داده

اجرای تست‌های آماری (t-test، ANOVA، رگرسیون و …)

تحلیل داده‌های پیچیده‌ی زیستی، پزشکی یا اجتماعی

ساخت مدل‌های آماری برای پیش‌بینی

🟠🧬 علوم زیستی و پزشکی

بیوانفورماتیک: تحلیل داده‌های DNA، RNA-Seq، پروتئومیکس

ژنتیک جمعیت: بررسی توالی‌ها، فیلوژنی (درخت‌های تکاملی)

آنالیز داده‌های آزمایشگاهی (PCR، micoarray و …)

🟠 📈 مصورسازی داده

رسم نمودارهای حرفه‌ای و تعاملی (ggplot2، plotly)

تهیه گراف‌های سه‌بعدی، heatmap، شبکه‌های ژنی و …

👈نکته: Heatmap (نقشه حرارتی) یک نوع نموداره که داده‌ها رو به صورت رنگی نشون می‌ده تا تغییرات یا الگوها سریع‌تر دیده بشن


|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

کشف مهم دانشمندان: جمجمه ۱ میلیون ساله چینی داستان بشر را از نو می‌نویسد

براساس تحلیل مجدد جمجمه یک میلیون ساله‌ای که در چین کشف شده، خاستگاه انسان‌های مدرن احتمالاً بسیار قدیمی‌تر از آن چیزی باشد که تاکنون تصور می‌شد. حتی شاید انسان خردمند در خارج از آفریقا تکامل یافته باشد.
_Digiato_


|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🔬 طراحی و مهندسی پروتئین با هوش مصنوعی!

🟢پژوهشگران دانشکده پزشکی هاروارد و بیمارستان کودکان بوستون با کمک ابزارهای هوش مصنوعی موفق شده‌اند پروتئین‌هایی طراحی کنند که مسیر سیگنالینگ Notch – یکی از کلیدی‌ترین مسیرها در تبدیل سلول‌های ایمنی به سلول‌های T – را فعال می‌کند.

🟢این نوآوری امکان تولید انبوه سلول‌های T را نه‌تنها روی سطوح صاف آزمایشگاهی، بلکه در بیوراکتورهای تعلیق مایع فراهم می‌سازد؛ دستاوردی که راه را برای تولید در مقیاس وسیع هموار می‌کند.


✨ چرا مهم است؟

🔸سلول‌های T ستون اصلی ایمونوتراپی‌های سرطان (مانند درمان CAR T) هستند.
🔸در ساخت واکسن‌های نوین علیه ویروس‌ها و عفونت‌ها نقش حیاتی دارند.


|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🤔بیوراکتور چیه؟


🔸یک ظرف یا دستگاه مخصوص که در آن شرایط کنترل‌شده‌ای مثل دما، اکسیژن، pH و مواد غذایی فراهم می‌شود تا سلول‌ها یا میکروب‌ها به‌صورت انبوه رشد و تکثیر پیدا کنند.

📌 کاربردها:

🔸تولید داروها (مثل آنتی‌بادی یا واکسن)

🔸کشت سلول‌های انسانی برای درمان (مثل سلول‌های T در ایمونوتراپی)

🔸صنایع زیستی (آنزیم، پروتئین، سوخت زیستی)

🔴انواع بیوراکتور:

🧪 بیوراکتور معمولی (سطحی)

🔸سلول‌ها روی یک سطح صاف یا بستر جامد رشد می‌کنن.
🔸مثل وقتی که سلول‌ها رو توی ظرف کشت (پلیت یا فلاسک) می‌کاریم.
🔸محدودیت: سطح رشد محدوده ، نمیشه تعداد خیلی زیادی سلول به‌دست آورد

🌊 بیوراکتور تعلیق مایع یا سوسپانسیونی (Suspension Bioreactor)

🔸سلول‌ها به‌جای چسبیدن به سطح، توی محیط مایع شناور می‌مونن.
🔸همزن یا سیستم‌های خاص باعث می‌شن سلول‌ها یکنواخت پخش بشن.
🔸مزیت: حجم خیلی بیشتر سلول در مقیاس صنعتی تولید میشه (مناسب برای دارو و ایمونوتراپی)


|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🟢سه نمونه از فناوری های جدید که موفق به دریافت بودجه از دانشگاه هاروارد برای حمایت از پژوهش های زیست‌پزشکی و حرکت به سمت کاربردهای تجاری و بالینی شده‌اند:

🔸 دستگاه کم‌تهاجمی برای درمان بیماری‌های متابولیک

آزمایشگاه Shriya Srinivasan در دانشکده مهندسی و علوم کاربردی در حال کار بر روی دستگاهی است برای مدیریت بیماری‌های متابولیک مزمن.
این دستگاه کم‌تهاجمی به‌جای تکیه بر دارو، با فعال‌سازی ملایم سیگنال‌های عصبی خاص، مسیرهای طبیعی بدن را تحریک می‌کند تا بیماری‌های متابولیک را کنترل کند.

🔸 گلبول‌های قرمز عمومی

دانشکده بهداشت عمومی هاروارد در حال توسعه گلبول‌های قرمز مهندسی‌شده‌ای است که به‌صورت آماده‌مصرف و مقیاس‌پذیر تولید می‌شوند.
این سلول‌های خونی آزمایشگاهی، یک منبع ایمن و جهانی برای انتقال خون در بیماران مبتلا به بیماری‌های خونی نادر مزمن (مانند کم‌خونی داسی‌شکل و بتا تالاسمی) فراهم می‌کنند، و خطر عوارض ایمنی در گیرندگان را کاهش می‌دهند.

🔸 آموزش سیستم ایمنی برای پذیرش داروهای بیولوژیک

واکنش ایمنی به داروهای بیولوژیک اغلب استفاده از آن‌ها را محدود می‌کند و عوارض جانبی خطرناک ایجاد می‌کند.
در دپارتمان زیست‌شناسی سلول‌های بنیادی و بازساختی دانشگاه هاروارد، پژوهشگران در حال توسعه روشی برای آموزش سیستم ایمنی هستند تا این داروها را بپذیرد. این کار می‌تواند واکنش‌های ناخواسته را کاهش دهد و استفاده ایمن‌تر از درمان‌های حیاتی (برای بیماری‌هایی مانند هموفیلی) را ممکن سازد.


|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🟣محققان دانشگاه بریستول با استفاده از ژنی از افراد صدساله، توانستند روند پیری قلب را بیش از ۱۰ سال معکوس کنند.

🔸دانشمندان نسخه‌ای خاص از ژن BPIFB4 را کشف کرده‌اند که به‌طور معمول در افراد بالای ۱۰۰ سال یافت می‌شود و می‌تواند روند پیری قلب را به شکل چشمگیری معکوس کند.

🔸زمانی که این ژن (به نام LAV-BPIFB4) به موش‌های پیر منتقل شد، سلول‌های قلبی آن‌ها شروع به عملکردی مشابه سلول‌های بسیار جوان‌تر کردند و در عمل سن قلب را بیش از ۱۰ سال انسانی به عقب برگرداندند.

🔸حتی در موش‌های میانسال هم افت عملکرد قلب متوقف شد. محققان همچنین این ژن را روی سلول‌های قلبی بیماران سالخورده با مشکلات جدی قلبی آزمایش کردند و جوان‌سازی قابل توجهی مشاهده شد، به‌ویژه در سلول‌هایی که مسئول حفظ رگ‌های خونی هستند.

🔸گام بعدی بررسی اثر انتقال پروتئین BPIFB4 (بدون انتقال کل ژن) است، چون این روش برای درمان‌ها ایمن‌تر و ساده‌تر خواهد بود.

🔸 اثر این ژن در محافظت در برابر بیماری‌های مرتبط با سن مانند آترواسکلروز و دیابت در موش‌ها هم دیده شده است.

👈لینک مقاله



|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🟣تجربه اپلای یک دانشجو

🟢بعد از 700 تا ایمیل تونستم فول فاند بگیرم!
🟢چند تا ایمیل باید بزنیم تا فاند بگیریم؟ این سوالیه که همه‌مون بارها پرسیدیم.
🟢یکی میگه ۵۰ تا، یکی میگه ۱۰۰۰ تا. حتی یه نفر بهم گفت: «۲۰۰۰ تا!» اولش شوکه شدم، اما همون حرف باعث شد انتظارات واقع‌بینانه داشته باشم.

🔸داستان اولین پذیرش من:

سال 2023 شروع به مکاتبه با اساتید کانادا کردم. بعد از فقط ۱۰ تا ایمیل، یه استاد جواب مثبت داد. باورم نمیشد به این زودی اکی شه! اما ذوقم باعث شد دو ماه پروپوزال رو لفت بدم. وقتی فرستادم، استاد گفت: «دیر شده، نمی‌تونم فاند رو تضمین کنم.» اون لحظه مثل یه سیلی بود. فهمیدم این مسیر فقط صبر نمی‌خواد؛ سرعت و تعهد هم شرطه.


🔸از اون روز مسیرم جدی‌تر شد:

☑️۱۴۰۰ ساعت وقت گذاشتم
☑️به ۷۰۰ تا استاد ایمیل زدم
☑️۶۰ پوزیشن اپلای کردم (۱۵ تا سوپروایزر داشتم)
☑️۲۵ مصاحبه گرفتم

🔸و نتیجه این شد:

1️⃣دکترا ریاضی مالی فول فاند در استرالیا
2️⃣پذیرش فایننس از انگلیس
3️⃣پذیرش فایننس از استرالیا
🔸چیزایی که یاد گرفتم:

⬅️ناامیدی بخشی از مسیر اپلای هست، ولی نباید تسلیمش بشی.
⬅️اگه جواب نمی‌گیری، روشت رو تغییر بده.
⬅️ایمیل‌ها و مصاحبه‌ها رو سریع پیش ببر، دنبال لحظه «ایده‌ال» نباش.
⬅️مصاحبه اول تا حد مرگ استرس داشتم و فقط ۲۵٪ حرفای استاد رو فهمیدم، اما بعد ۵
تا مصاحبه همه‌چی برام راحت شد.

منبع: کانال https://news.1rj.ru/str/ApplyPathway


|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🟣ترمیم بافت قلب پس از سکته قلبی

🟢پژوهشگران دانشگاه نورث‌وسترن و UC سن‌دیگو یک درمان تزریقی نوآورانه توسعه داده‌اند که به قلب کمک می‌کند بعد از سکته قلبی از درون خودش بهبود یابد.

🟢برخلاف درمان‌های فعلی که تنها جریان خون را بازمی‌گردانند ولی آسیب دائمی به جا می‌گذارند، این روش جدید از پلیمرهای شبیه‌پروتئین (PLPs) استفاده می‌کند تا پاسخ محافظتی طبیعی قلب را فعال کنند.

🟢این مولکول‌های طراحی‌شده پروتئینی به نام Keap1 را هدف می‌گیرند؛ پروتئینی که معمولاً مانع از ترمیم سلولی می‌شودکه وقتی غیرفعال شود، پروتئین دیگری به نام Nrf2 آزاد می‌شود تا ژن‌های ترمیمی را فعال کند—در نتیجه التهاب کاهش می‌یابد، مانع مرگ سلولی و حتی رشد رگ‌های خونی جدید تحریک می‌شود.

🟢در مطالعات آزمایشگاهی و حیوانی، تنها یک دوز پایین تزریق PLPs توانست چندین هفته حفاظت ایجاد کند—یک جهش بزرگ در مراقبت‌های قلبی.

🟢محققان می‌گویند اثر درمان در عرض چند دقیقه پس از آسیب آغاز می‌شود و در همان زمان بحرانی اولیه عمل می‌کند.

🟢این نوآوری توسط Grove Biopharma تجاری‌سازی می‌شود


|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🟣«پلیمر شبه‌پروتئین» یا به انگلیسی Protein-Like Polymer (PLP)

🔸یعنی یک مولکول مصنوعی (Synthetic polymer) که طوری طراحی شده تا از نظر ساختار و عملکرد شباهت زیادی به پروتئین‌های طبیعی داشته باشد.

✨ ویژگی‌های اصلی PLPs:

🔸شکل و ساختار شبیه پروتئین
🔸پلیمرها طوری ساخته می‌شوند که توالی واحدهایشان مثل اسیدهای آمینه در پروتئین‌ها رفتار کند.
🔸پایداری بیشتر از پروتئین طبیعی
🔸پروتئین‌ها خیلی حساس‌اند (به دما، آنزیم‌ها و محیط زیستی زود تجزیه می‌شوند)؛ ولی PLPs چون مصنوعی‌اند، پایدارتر و مقاوم‌ترند.

🟢قابلیت هدف‌گیری (Targeting)

🔸می‌توان آن‌ها را طوری طراحی کرد که به یک پروتئین خاص در بدن (مثل Keap1) متصل شوند و عملکرد آن را تغییر دهند.
🔸سفارشی‌سازی آسان
🔸برخلاف پروتئین‌های طبیعی که باید از سلول استخراج یا مهندسی ژنتیک شوند، PLPs را می‌توان در آزمایشگاه با ترکیب‌های شیمیایی مختلف طراحی کرد.



|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🟣 محیط دوره بیوشیمی سه بعدی

🟢مدل سه بعدی صفحات پپتیدی و زوایای فای و سای در زنجیره پلی پپتیدی

🟡ثبت نام :@SciAd2025

|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🧠تماشای نورون‌های زنده در حال فعالیت : ۶۵ ساعت رشد پیوسته در هیپوکامپ موش.

🟢هیپوکامپ نقشی اساسی در یادگیری و حافظه دارد، و اینجا می‌بینیم که نورون‌های آن دندریت‌ها و آکسون‌های خود را گسترش می‌دهند، اتصالات جدید تشکیل می‌دهند و شبکه‌هایشان را بازسازی می‌کنند. ثبت این فرایند به صورت زنده، دیدی تازه به چگونگی شکل‌گیری مدارهای عصبی به ما می‌دهد.

🔽چه چیزی این مطالعه را منحصربه‌فرد می‌کند

🔸ثبت زنده و چندروزه از نورون‌های هیپوکامپ زیر میکروسکوپ

🔸نمایش واضح شاخه‌زنی و تشکیل شبکه

🔸نگاهی به فرایندهایی که پایه‌های رشد و انعطاف‌پذیری مغز هستند

|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🟣دوره بیوشیمی سه بعدی

🟢خلاصه اسامی مشابه در متابولیسم گلوکز و گلیکوژن


🟡ثبت نام :@SciAd2025

|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🟣دوره بیوشیمی سه بعدی

🟢نمونه تدریس متابولیسم قندها

💥یک بار برای همیشه این چهار تا کلمه رو یاد بگیر:

🔸گلوکونئوژنز = گلوکو(ابتدای گلوکز) + نئو ( تازه یا از نو) + ژنز ( تولید) : تولید گلوکز جدید (از پیروات)


🔸گلیکوژنز = گلیکو(ابتدای گلیکوژن) + ژنز( تولید) : تولید گلیکوژن از گلوکز


🔸گلیکوژنولیز = گلیکوژن + لیز : شکستن گلیکوژن به گلوکز


🔸گلیکولیز = گلیکو (قند) + لیز(شکستن) : شکستن قندهای ساده (مثل گلوکز)



🟡ثبت نام :@SciAd2025

|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران

🟣دوره بیوشیمی سه بعدی

🟢مراحل 10 گانه گلیکولیز (شکستن گلوکز و تولید انرژی)

توضیح در ویس زیر 👇👇👇


🟡ثبت نام :@SciAd2025

|لینک کانال 3D Science Group|
🔸اولین دوره جامع بیوشیمی سه بعدی در ایران