Генеративный дизайн молекулярных машин – Telegram
Генеративный дизайн молекулярных машин
190 subscribers
43 photos
3 videos
2 files
21 links
▪️жизнь лаборатории
▪️научные разработки
▪️полезные материалы
▪️люди
▪️события и анонсы

По всем вопросам @oaiuai
Download Telegram
По разнице между первыми и вторыми тремя фотографиями можно понять, что здесь что-то произошло 🤔. А произошла подготовка помещения к ремонту! 🛠 Именно в этих комнатах (и ещё парочке, которые в кадр не вошли) будет уже через пару месяцев располагаться наша лаборатория. 🎉

Несмотря на то, что почти вся работа ведётся в цифровом формате, очное совместное присутствие остается очень важным и для продуктивной работы, и для ощущения принадлежности. Наша лаборатория активно растет как полноценный академический производитель и обустройство физического пространства - важная часть этого роста. Stay tuned, чтобы увидеть, какой будет результат 👍
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥94👏1
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
Привет! Решили показать будущие помещения лаборатории, а также рассказать более подробно о том, чем лаборатория занимается и как вообще появилась 🎉

00:00-1:35
Как сделать свою лабораторию, как появилась идея, в чем актуальность 🔬

1:35-3:05
Первая часть экскурсии по лаборатории, кухня и основное помещение для сотрудников 🥐

3:05-8:15
Основные направления деятельности и исследований лаборатории 🧑‍🔬

8:16-9:55
Ещё один кабинет, а также почему в лаборатории нет непосредственно лаборатории, а только столы под компьютеры 🖥

9:55-11:00
Последнее помещение, комнатка для отдыха, собраний и обсуждений 😎

В ближайшие пару месяцев ожидаем, что ремонт завершится, покажем потом, как будет после 🙌
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥73
⚡️Новая архитектура нейронных сетей: Kolmogorov–Arnold Networks (KAN)⚡️

Исследователи из MIT представили настоящий прорыв в архитектуре глубоких нейросетей - Kolmogorov–Arnold Networks (KAN). Изменения в парадигме перцептрона влекут за собой изменения во всем глубоком обучении. Это может повлиять в том числе на большие языковые модели и системы компьютерного зрения, кардинально меняя правила игры.

🔎В отличие от традиционных нейронных сетей, где активации распространяются через слои нейронов с весовыми коэффициентами, KAN перемещает активации на ребра сети. Теорема Колмогорова-Арнольда доказывает, что аппроксимация непрерывных функций многих переменных может быть сведена к сумме полиномиального числа одномерных функций. Архитектура KAN напрямую использует это математическое свойство, обучая не веса связей, а именно одномерные функции на ребрах сети.

Данный подход наделяет KAN рядом ценных характеристик:
Во-первых, одномерные функции, параметризованные сплайнами, обеспечивают гладкость и дифференцируемость, что позволяет эффективно обучать сеть методом обратного распространения ошибки.
Во-вторых, добавление новых точек аппроксимации в сплайны дает возможность улучшать точность модели без необходимости полного переобучения.
В-третьих, KAN демонстрирует лучшую обобщающую способность и интерпретируемость по сравнению с классическими нейронными сетями.

Безусловно, новая архитектура имеет и некоторые недостатки. KAN обучается примерно в 10 раз медленнее, чем многослойные перцептроны, но это, вероятно, проблема, которую инженеры быстро научатся решать, открывая новые горизонты для самых разных приложений машинного обучения.

Материал подготовила Мария Еремеева
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥4❤‍🔥1
Сильная работа наших коллег из центра Химии и Искусственного Интеллекта. Всем советуем послушать 🏆

ИИ для химии: как мы вырастили сокристаллы с помощью глубокого обучения


Искусственный интеллект становится незаменимым инструментом во многих научных областях. Мы хотим поделиться успешным опытом применения методов генеративного ИИ в химической задаче подбора коформеров для образования сокристаллов, обладающих заданными свойствами. Такая постановка не является чисто академической - успешное решение данной задачи поможет сделать производство твердых лекарственных форм быстрее и эффективнее. Наилучших результатов в предсказании таблетируемых сокристаллов объединенной команде из представителей центров “Сильный ИИ в промышленности” и химико-биологического кластера ИТМО удалось достичь с помощью нового подхода, объединяющего три генеративные модели, эволюционную оптимизацию и автоматическое машинное обучение.

Спикеры:
Николай Никитин, руководитель лаборатории автоматического машинного обучения
Глеб Соловьев, аспирант ФЦТ
Нина Губина, магистрант ХБК

РЕГИСТРАЦИЯ: https://forms.gle/Qc5kwFmNmnqigAg17
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
👍3🔥2
Channel name was changed to «Генеративный дизайн молекулярных машин»
Новый прорыв в биоинформатике от Google DeepMind: AlphaFold 3

Google DeepMind представляет AlphaFold 3, революционную ИИ-модель, способную моделировать не только трехмерные структуры белков, но и их взаимодействие с другими молекулами. Эта модель открывает новые горизонты в понимании биомолекулярных структур и процессов.

🧬 Что умеет AlphaFold 3?
AlphaFold 3 способен предсказывать структуры белков, ДНК, РНК и лигандов, а также моделировать отдельные клеточные процессы. Модель использует диффузионный метод для генерации 3D-моделей, подобно созданию изображений в Midjourney или Stable Diffusion. Статья Nature про то, как это работает.

🔍 Преимущества для науки
Эта технология позволяет ученым отказаться от многих сложных лабораторных экспериментов, заменив их быстрыми и точными визуализациями и предсказаниями от ИИ. Это значительно ускоряет исследования, например, в области разработки новых лекарственных препаратов.

🌐 Доступность
На данный момент AlphaFold 3 не доступен в открытом доступе (есть целый документ, почему). Однако ученые могут использовать бесплатный AlphaFold Server для загрузки своих данных и получения предсказаний от модели.

💬 Перспективы и обсуждения
Среди научного сообщества уже ведутся обсуждения о том, что будущие версии могли бы моделировать происхождение жизни или даже всю структуру Вселенной. Эти темы порождают разговоры о биотерроризме и гипотезе симуляции. Действительно, такие открытия и разработки открывают колоссальные перспективы, которые ещё предстоит осмыслить.

🔬 Вклад в науку и медицину
AlphaFold 3 не только предсказывает структуру белков, ДНК и РНК, но и показывает, как эти молекулы взаимодействуют друг с другом, что может радикально изменить наше понимание биологии и ускорить разработку новых лекарственных средств. Эта модель уже обогнала по качеству молекулярный докинг, классический метод для оценки взаимодействия белков с молекулами

https://blog.google/technology/ai/google-deepmind-isomorphic-alphafold-3-ai-model/

Что думаете?🌟
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥5🏆1
🔍Математики раскрыли часть тайны принятия решений нейросетями 🔍

🤔Проблема
Самая главная загадка работы нейросетей - как они решают, какие признаки более, а какие менее важные в решении конкретной задачи. Простой пример: если мы пытаемся прогнозировать растворимость молекул по их составу и строению - как нейросети оценивают вклад отдельных атомов в величину растворимости, учитывая в окружении каких атомов они находятся?

🔬Что сделано
Под руководством нашего соотечественника Михаила Белкина ученые из Гарварда математически показали, как происходит процесс обучения признаков в самых разных нейросетях:
- многослойных перцептронах (полносвязные нейросети)
- сверточных нейросетях (для работы с изображениями)
- рекуррентных нейросетях (для работы с последовательностями, например, с текстом)
- трансформерах (например, ChatGPT)

🏆Что получили
Проанализировав процесс градиентного спуска (главный механизм обучения современных нейросетей), они вывели математическое уравнение (грузить математикой не будем), позволяющее очень точно воспроизводить процесс обучения признакам всеми этими нейросетями, и всё это вообще без обучения нейросетей!

🖥Практическая польза
Многие классические алгоритмы машинного обучения куда эффективнее нейросетей на малых данных, но из-за отсутствия градиентного спуска как правило плохо справляются с задачей обучения признаков. Этот метод, по сути, позволяет перенести это преимущество нейросетей (отбор признаков с помощью градиентного спуска) в классические алгоритмы машинного обучения, усиливая их.

Подробнее: https://doi.org/10.1126/science.adi5639
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥54🏆1
Forwarded from NSS Lab News
Митап "ИИ для химии: как мы вырастили сокристаллы с помощью глубокого обучения" - уже сегодня, в 16 часов.

Для тех кто не сможет прийти очно - трансляция в zoom.
🔥4🏆2
Приглашаем на лекцию "Quantum Machine Learning: Future Revolution in AI"

Лектор: Никита Серов, PhD, руководитель лаборатории "Генеративный дизайн молекулярных машин"

Искусственный интеллект уже стал ключевым фактором перемен в XXI веке, о котором говорят в каждом втором новостном сюжете. Но существуют ли фундаментальные проблемы, которые могут ограничить развитие современных технологий ИИ в ближайшем будущем? На этой лекции вы узнаете, как квантовые эффекты способны перевернуть с ног на голову самые базовые идеи машинного обучения и произвести революцию в области ИИ.

Описание лекции:

Эта лекция предоставит уникальную возможность заглянуть за горизонт текущих технологий ИИ и понять, как квантовые вычисления могут кардинально изменить правила игры. Никита Серов, PhD, руководитель лаборатории "Генеративный дизайн молекулярных машин", как человек со знанием квантовой химии и ИИ, взял на себя задачу структурировать основные достижения в этой области и выделил плюсы и минусы новой технологии.

В ходе лекции будут рассмотрены следующие ключевые вопросы:
- Какие ограничения существуют у современных методов машинного обучения?
- Как квантовые эффекты могут преодолеть эти ограничения?
- Какие перспективы открываются перед ИИ благодаря квантовым вычислениям?
- Примеры реальных приложений квантового машинного обучения в химии и материаловедении.

👩‍🔬👨‍🔬Для кого подойдет эта лекция:

Лекция будет интересна всем любителям ИИ, владеющим английским языком. Входных требований нет, однако для более глубокого понимания материала полезно иметь базовые знания в области линейной алгебры и квантовой механики.

🌐 Эта лекция станет первой в серии "The era after AI we know", где мы будем обсуждать будущее ИИ, естественного интеллекта и нейроморфных вычислений.

🔥Не упустите шанс узнать о передовых разработках и обсудить будущие перспективы.

Дата и время проведения: 26 июля, 17:00

Место проведения: университет ИТМО, Ломоносова 9, аудитория 1303/8 Медиацентр

❗️Язык лекции: английский ❗️

⚡️ Регистрация по ссылке ⚡️

Мы ждем вас на нашей лекции!

🖥 Также будет вестись трансляция и запись лекции. Чтобы не пропустить - подписывайтесь на телеграм-канал лаборатории.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🏆10🔥75🤩2
Привет, друзья! 🌟

У нас отличные новости — в журнале Artificial Intelligence Chemistry опубликован наш большой обзор! 🎉

🌟 В обзорной статье "User-Friendly and Industry-Integrated AI for Medicinal Chemists and Pharmaceuticals" мы подробно рассмотрели современные ИИ-решения в фармацевтической индустрии. Мы охватили все аспекты: от работы алгоритмов до оптимизации исследований в области естественных наук. Также мы проанализировали доступные инструменты, которые помогают медицинским химикам на всех этапах их работы, и привели примеры успешной интеграции ИИ в индустрию и клиники.

В обзоре вы найдете:
🔬 Простое и понятное объяснение работы нейронных сетей
📊 Описание открытых баз данных для задач медицинской химии
🛠️ Обзор удобных и интегрированных в индустрию ИИ-инструментов
📅 Ретроспективный анализ развития ИИ в период пандемии COVID-19 (виртуальные ассистенты врачей, приложений для пациентов и многое другое)

⚡️Особенно хочется отметить комментарий от Полины Бурмакиной, сотрудницы нашей лаборатории, для которой это был первый опыт публикации:

👩‍🔬Работа над статьей по интересной и актуальной теме - это крутой опыт, прокачивает английский. Я сама узнала почти про все тулы, про которые писала, впервые и если честно очень впечатлилась масштабом предлагаемых решений. Теперь отношусь к нейронкам серьезнее и вдохновилась внедрить что-то из этого в свою работу в мокрой лабе. Иногда кажется, что нейронки - это не очень серьезная помощь (ну там неумное использование чатов GPT и простых дизайнерских приложений), но теперь я вижу их потенциал. Я вызвалась участвовать в написании статьи, даже не рассчитывая, что напишу довольно много текста и что он будет качественно неплох.”

Обзор будет полезен всем, кто интересуется интеграцией ИИ в медицину и фармацевтику.

https://doi.org/10.1016/j.aichem.2024.100072
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥103🏆3🦄1
❗️Напоминаем, что уже завтра состоится лекция "Quantum Machine Learning: Future Revolution in AI" от руководителя лаборатории, PhD, Никиты Серова.

Лекция пройдёт на третьем этаже корпуса ИТМО на Ломоносова 9 в аудитории 1303/8 Медиацентр. У нас будут указатели, чтобы помочь вам сориентироваться.

Если вы не из ИТМО и у вас нет пропуска, но вы регистрировались и указали свои данные, то на вас будет оформлен разовый пропуск. Зарегистрироваться всё ещё можно. На входе в корпус справа стоит терминал: на нём нужно будет ввести свой номер телефона и получить QR-код для входа.

⚡️Ссылка на трансляцию будет опубликована завтра ближе к самой лекции, пока решаем технические вопросы 😅

Запись будет здесь и на YouTube

По всем сложностям можно оперативно писать сюда: @oaiuai
👍54
🙌Пока мы готовим запись научной лекции от руководителя лаборатории Никиты Серова, есть возможность записаться на научно-популярную лекцию от ведущего исследователя в проекте генеративного дизайна ДНК-сенсоров, сотрудницы лаборатории Зинаиды Красовской 🎉

☝️Лекция называется «Искусственный интеллект в науке: от персонального ассистента до цифровых биотехнологий»

Зинаида расскажет:
-как ИИ применяется в передовых научных областях, таких как, например, биотехнологии
-как искусственный интеллект используется для создания и оптимизации сложных молекулярных структур, открывая новые перспективы в нанотехнологиях и медицине.
-какие есть актуальные траектории развития ИИ в науке, включая потенциал квантовых вычислений и развитие нейроморфных структур, имитирующих работу человеческого мозга.

Кроме того, будет возможность более подробно познакомиться с деятельностью нашей лаборатории и узнать о других проектах, над которыми мы работаем.

Регистрация по ссылке

Адрес: Наб. Обводного канала, 74Б. Библиотека Планетария №1

Дата и время: 1 августа, 19:00
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
8🔥5🏆2
💥Запись лекции Никиты Серова Quantum Machine Learning: Future Revolution in AI💥

Запись лекции доступна по ссылке: https://youtu.be/eauUeNZBvu4?si=aSqJDqM3SH4bJdCQ

Основные тезисы:

🔍Введение в квантовые вычисления и квантовое машинное обучение:
- Классические вычисления с битами и логическими операциями
- Концепция кубита и квантовой суперпозиции
- Квантовый параллелизм и преимущества квантовых вычислений

🔍 Решения уравнения Шредингера:
- Необходимость точного моделирования квантовых систем
- Ограничения классических методов, а именно, отсутствие точных решений для большинства систем

🔍 Примеры применения квантовых вычислений в химии:
- Вычисление энергетических спектров молекулярных систем
- Изучение механизма биологической фиксации азота
- Использование вариационного квантового решателя для малых молекул и квантовых магнитов

🔍 Квантовое машинное обучение:
- Квантовые нейронные сети и квантовые перцептроны
- Метрики для оценки производительности квантовых моделей
- Различные подходы к обучению квантовых моделей

🔍 Текущие проблемы и ограничения квантового машинного обучения:
- Ограничения квантовых вычислений, такие как декогеренция и сложность оптимизации
- Необходимость разработки новых алгоритмов и архитектур
- Интеграция квантовых и классических компонентов

Квантовые вычисления и квантовое машинное обучение открывают новые возможности для решения сложных задач в химии, физике и других областях, но также сталкиваются с рядом технических и теоретических проблем, которые предстоит решить. Именно это делает область в равной степени противоречивой и такой привлекательной.

🤔А что думаете вы на этот счёт? Получит ли эта технология развитие или же останется на задворках науки? Вопросы и комментарии можно писать под постом 🙌
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
17🔥11👍4
Machine learning.pdf
11.1 MB
Также прикрепляем презентацию лекции. В ней можно найти ссылки на источники, а также более внимательно ознакомиться с информацией.
👍16🔥6🏆6
⚡️Сегодня руководитель лаборатории Никита Серов принял участие в совещании с министром образования и науки Валерием Николаевичем Фальковым ⚡️

На совещании была представлена наша лаборатория как часть кампуса цифровых технологий, реализуемого при содействии фонда поддержки инноваций и молодежных инициатив Санкт-Петербурга. Было рассказано про наши разработки и актуальные проекты.

🎉По результатам встречи договорились о грантовой поддержке подобных лабораторий. Важным является договоренность о поддержке не только лабораторий, разрабатывающих новые ИИ-инструменты, но и тех, которые реализуют проекты по применению ИИ в доменных областях, например, в химии и биотехнологиях.

Отдельно была выражена заинтересованность в проектах лаборатории генеративного дизайна молекулярных машин, как от министерства образования и науки, так и от Сбера. Со Сбером даже намечается потенциальное сотрудничество: помощь в инфраструктурном плане и разработка ПО, которое сделает технологии более доступными для обычных пользователей.

Работаем 💪
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
17🏆4👍3