Каждый ваш вопрос, каждое «у меня тут не получалось» — это подсказки, благодаря которым мы постоянно улучшаем содержание и структуру курсов
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
❤5
Свежая подборка вакансий за рубежом ⚡️
💻 Computer Vision – Бельгия
Присоединяйтесь к VIB-KU Leuven Center for Cancer Biology в качестве вычислительного биолога, специализирующегося на анализе изображений и компьютерном зрении. Внесите вклад в исследование рака, развивая передовые методы обработки изображений.
😎 PhD в Молекулярной Микробиологии – Швейцария
The Boeck Lab из University of Basel, ищет PhD студента для изучения легочных инфекций с использованием CRISPR технологий. Идеально подходит для тех, кто имеет опыт в молекулярной биологии и микробиологии.
💻 Научный Сотрудник – Швеция
Umeå Plant Science Centre ищет научного сотрудника для поддержки Metabolomics Platform SciLifeLab. Работайте с продвинутыми методами масс-спектрометрии и разрабатывайте биоинформатические инструменты для анализа данных метаболомики.
📊 Биоинформатик – Великобритания
Immunocore предлагает вакансию биоинформатика в проекте разработки алгоритмов и инструментов анализа биологических данных для борьбы с онкологиями, инфекционными и аутоиммунными заболеваниями.
🤘 Постдок – США
Fischer Lab из Dana-Farber Cancer Institute ищет научного сотрудника для изучения убиквитиновых систем с использованием методов биохимии и структурной биологии.
👩💻 Постдоки и PhD студенты – Финляндия
The University of Jyväskylä приглашает присоединиться к проекту DYNANOINT. Группа исследует физические и химические свойства различных наносистем, используя вычислительные методы, основанные на теории функционала плотности, динамических симуляциях и искусственном интеллекте.
👉 Больше вакансий всегда на сайте blastim.ru
#бластим_вакансии
Присоединяйтесь к VIB-KU Leuven Center for Cancer Biology в качестве вычислительного биолога, специализирующегося на анализе изображений и компьютерном зрении. Внесите вклад в исследование рака, развивая передовые методы обработки изображений.
The Boeck Lab из University of Basel, ищет PhD студента для изучения легочных инфекций с использованием CRISPR технологий. Идеально подходит для тех, кто имеет опыт в молекулярной биологии и микробиологии.
Umeå Plant Science Centre ищет научного сотрудника для поддержки Metabolomics Platform SciLifeLab. Работайте с продвинутыми методами масс-спектрометрии и разрабатывайте биоинформатические инструменты для анализа данных метаболомики.
Immunocore предлагает вакансию биоинформатика в проекте разработки алгоритмов и инструментов анализа биологических данных для борьбы с онкологиями, инфекционными и аутоиммунными заболеваниями.
Fischer Lab из Dana-Farber Cancer Institute ищет научного сотрудника для изучения убиквитиновых систем с использованием методов биохимии и структурной биологии.
The University of Jyväskylä приглашает присоединиться к проекту DYNANOINT. Группа исследует физические и химические свойства различных наносистем, используя вычислительные методы, основанные на теории функционала плотности, динамических симуляциях и искусственном интеллекте.
#бластим_вакансии
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
1👍13❤5🥰3😁1
🧬 Метагеномика… Нет, это не приложение от создателей фейсбука. А большое направление в биоинформатике, которое выясняет как устроены те или иные сообщества организмов.
Как функционирует современная метагеномика в эпоху NGS читайте в нашем материале.
1/3
👉 Технологии секвенирования долго применялись для установления последовательности ДНК клеток только одного вида (то есть «чистых культур»), а вот при попытке секвенировать материал из природных образцов возникало немало проблем.
Собственно метагеномика стартовала с секвенирования отдельных ампликонов. И здесь, безусловно, самый известный маркер для прокариот — ген 16s rRNA. По его последовательностям можно оценить разнообразие организмов сообщества. Благодаря этому методу в 1977 году ученые открыли новый домен жизни — Архей.
🌡 Но особенно преобразилась метагеномика с началом эры NGS. А именно стало распространяться полногеномное секвенирование и, соотвественно, Shotgun метагеномика. Она позволила определять таксономию и давать количественную оценку организмов вплоть до вида. Но главное ее отличие заключалось в том, что благодаря упорядочиванию множества различных частей генома каждого организма стало возможно выяснять еще и их функции в сообществе.
Как функционирует современная метагеномика в эпоху NGS читайте в нашем материале.
1/3
Собственно метагеномика стартовала с секвенирования отдельных ампликонов. И здесь, безусловно, самый известный маркер для прокариот — ген 16s rRNA. По его последовательностям можно оценить разнообразие организмов сообщества. Благодаря этому методу в 1977 году ученые открыли новый домен жизни — Архей.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
1👍7
2/3
🙂 Какова же последовательность современного метагеномного анализа?
Сначала ДНК образца нарезается случайным образом, после чего фрагменты секвенируются. Затем их необходимо упорядочить и реконструировать в согласованную последовательность, уже по которой можно будет сделать вывод о видовом составе микроорганизмов в сообществе и их роли в нем.
😶 Поскольку данные состоят из коротких считываний (ридов), необходим этап сборки, который создает длинные последовательности из коротких. Далее требуется сортировка «каши» из последовательностей по принадлежности к таксономическим группам — биннинг.
❓ Есть несколько способов определить, какому микроорганизму принадлежит последовательность. Например, это может быть анализ частоты использования кодонов, поскольку известно, что данная характеристика зависит от набора транспортных РНК и представляет собой уникальный «почерк» микроорганизма.
Другой вариант — анализ степени покрытия: широко представленные в сообществе микроорганизмы обладают широким покрытием, слабо представленные — узким. Вместе собираются контиги с одинаковым покрытием.
Кроме того, контиги можно собирать по сигнатурным наборам генов — это гены, которые содержаться в одной копии в любом геноме прокариот. В сборке должен быть полный набор этих единичных генов.
🧙 По итогу сборки получаются MAGи. MAG — это геном, собранный с помощью метагенома. Он представляет собой сборку одного таксона. В дальнейшем полученные MAGи нужно аннотировать. Как правило этот процесс начинается с автоаннотации: программа разбивает MAGи на белок-кодирующие последовательности и определяет входящие в их состав гены. Однако автоматика часто оперирует не самыми последними данными и требует дальнейшей ручной обработки или комбинации различных программ.
Сначала ДНК образца нарезается случайным образом, после чего фрагменты секвенируются. Затем их необходимо упорядочить и реконструировать в согласованную последовательность, уже по которой можно будет сделать вывод о видовом составе микроорганизмов в сообществе и их роли в нем.
Другой вариант — анализ степени покрытия: широко представленные в сообществе микроорганизмы обладают широким покрытием, слабо представленные — узким. Вместе собираются контиги с одинаковым покрытием.
Кроме того, контиги можно собирать по сигнатурным наборам генов — это гены, которые содержаться в одной копии в любом геноме прокариот. В сборке должен быть полный набор этих единичных генов.
🧙 По итогу сборки получаются MAGи. MAG — это геном, собранный с помощью метагенома. Он представляет собой сборку одного таксона. В дальнейшем полученные MAGи нужно аннотировать. Как правило этот процесс начинается с автоаннотации: программа разбивает MAGи на белок-кодирующие последовательности и определяет входящие в их состав гены. Однако автоматика часто оперирует не самыми последними данными и требует дальнейшей ручной обработки или комбинации различных программ.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
1👍9❤2❤🔥1
3/3
Shotgun метагеномика — это работающий способ узнать больше о микробном сообществе. Однако метагеномика не лишена недостатков. В сообществе могут встречаться гены, чья функция до сих пор не установлена, что оставляет в общей картине белые пятна. Кроме того, наличие определенных генов ничего не говорит об их экспрессии, и для получения этой информации нужна уже метатранскриптомика.
✨ Сделать первые шаги в метагеномике можно на нашем самом популярном курсе «Анализ NGS-данных». Приходите триммировать, картировать, аннотировать, собирать, снипколлить в компании профессионалов. А до 9-го августа еще можно успеть на регистрацию по выгодной цене! ⚡️
Подготовлено при участии Анны Кузнецовой
Shotgun метагеномика — это работающий способ узнать больше о микробном сообществе. Однако метагеномика не лишена недостатков. В сообществе могут встречаться гены, чья функция до сих пор не установлена, что оставляет в общей картине белые пятна. Кроме того, наличие определенных генов ничего не говорит об их экспрессии, и для получения этой информации нужна уже метатранскриптомика.
Подготовлено при участии Анны Кузнецовой
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
3❤15❤🔥3👍3
🍽 Гастрофест от Blastim!
Закуски – начинаем с лёгкого
🍞 Экспресс Linux для NGS (17-18 августа) – доступный, как и бутерброд с маслом – мы за него умереть готовы!
🧀 Бесплатный вебинар «Совместный анализ клинических данных и микробиоты» (25 августа) – новое на нашей кухне.
🌶 Бесплатный Special от Владимира Шитова (29 сентября) – пикантные нотки машинного обучения.
🥝 Бесплатный Special вебинар от Ивана Позднякова (13 октября) – насыщенный вкус статистики.
Горячее – для плотного обеда
🍗 Анализ NGS-данных (9-20 сентября) – наша котлетка с пюрешечкой – её хотят все!
🍛 ML на Python (15 октября - 30 ноября) – насыщенный и полезный, как борщичек, с капусткой, но не красный!
🥟 Статистика, R и анализ данных (28 октября - 17 ноября) – идеальный баланс удовольствия и мяса, как в пельмешках.
Extra – особые предложения на десерт
🧇 Я пообещал себе больше никаких сладостей! Зачем ты одурманила меня, вафелька «Как искать и находить работу в науке и не только» (18 ноября - 2 декабря). Все для вашей карьеры.
🌭 Ученый будущего (3-21 декабря) – в школе мы даже и подумать не могли, какой простор для работы предоставит нам искусственный интеллект! Наш нашумевший, как булочка с сосискою, курс по ИИ обновился и стал хот-догом!
Работа работой, а самое вкусное по расписанию с Blastim!
Закуски – начинаем с лёгкого
🍞 Экспресс Linux для NGS (17-18 августа) – доступный, как и бутерброд с маслом – мы за него умереть готовы!
🧀 Бесплатный вебинар «Совместный анализ клинических данных и микробиоты» (25 августа) – новое на нашей кухне.
🌶 Бесплатный Special от Владимира Шитова (29 сентября) – пикантные нотки машинного обучения.
🥝 Бесплатный Special вебинар от Ивана Позднякова (13 октября) – насыщенный вкус статистики.
Горячее – для плотного обеда
🍗 Анализ NGS-данных (9-20 сентября) – наша котлетка с пюрешечкой – её хотят все!
🍛 ML на Python (15 октября - 30 ноября) – насыщенный и полезный, как борщичек, с капусткой, но не красный!
🥟 Статистика, R и анализ данных (28 октября - 17 ноября) – идеальный баланс удовольствия и мяса, как в пельмешках.
Extra – особые предложения на десерт
🧇 Я пообещал себе больше никаких сладостей! Зачем ты одурманила меня, вафелька «Как искать и находить работу в науке и не только» (18 ноября - 2 декабря). Все для вашей карьеры.
🌭 Ученый будущего (3-21 декабря) – в школе мы даже и подумать не могли, какой простор для работы предоставит нам искусственный интеллект! Наш нашумевший, как булочка с сосискою, курс по ИИ обновился и стал хот-догом!
Работа работой, а самое вкусное по расписанию с Blastim!
9😁24👍7❤6
Я закончил(а) курс. Что дальше?🤔
На этот вопрос на заключительном занятии курса «Python для анализа данных в науке» отвечала Инга Егорова, профессиональный карьерный консультант.
Делимся основными рекомендациями, как не дать приобретённым знаниям обесцениться:
😬 Практика
Применяйте навыки в реальных проектах: участвуйте в конкурсах на платформах вроде Kaggle или работайте над pet-проектами. Практический опыт — лучший способ закрепить знания.
🛍 Новинки
Биоинформатика — быстро развивающаяся область. Подпишитесь на научные журналы, блоги, YouTube-каналы, чтобы оставаться в курсе последних исследований и технологий.
🤝 Единомышленники
Присоединяйтесь к профессиональным сообществам онлайн или офлайн. Это могут быть форумы, группы в социальных сетях или конференции. Общение с коллегами расширит ваши горизонты и поможет обмениваться опытом.
🤫 Ошибка? Это хорошо!
В биоинформатике многое работает через метод проб и ошибок. Ошибки — часть процесса обучения. Если что-то не получается, попробуйте придумать новый подход.
😥 Смежные навыки
Сильный биоинформатик должен разбираться в программировании, математике и биологии. Изучайте новые языки программирования (например, R или Python), математические методы или углубитесь в молекулярную биологию.
➕ Новые вызовы
Не останавливайтесь на достигнутом. Ставьте перед собой новые задачи — участие в конференции, получение стажировки или разработка собственного инструмента для анализа данных.
⭐️ Долгосрочные цели
Биоинформатика может показаться сложной и запутанной, но каждый шаг приближает к значимым результатам. Держите в уме конечную цель — это поможет сохранять мотивацию.
Развитие в биоинформатике — марафон, а не спринт. Завершение курса здесь – важный этап, но настоящее приключение только начинается.
Удачи🥰
На этот вопрос на заключительном занятии курса «Python для анализа данных в науке» отвечала Инга Егорова, профессиональный карьерный консультант.
Делимся основными рекомендациями, как не дать приобретённым знаниям обесцениться:
Применяйте навыки в реальных проектах: участвуйте в конкурсах на платформах вроде Kaggle или работайте над pet-проектами. Практический опыт — лучший способ закрепить знания.
Биоинформатика — быстро развивающаяся область. Подпишитесь на научные журналы, блоги, YouTube-каналы, чтобы оставаться в курсе последних исследований и технологий.
Присоединяйтесь к профессиональным сообществам онлайн или офлайн. Это могут быть форумы, группы в социальных сетях или конференции. Общение с коллегами расширит ваши горизонты и поможет обмениваться опытом.
В биоинформатике многое работает через метод проб и ошибок. Ошибки — часть процесса обучения. Если что-то не получается, попробуйте придумать новый подход.
Сильный биоинформатик должен разбираться в программировании, математике и биологии. Изучайте новые языки программирования (например, R или Python), математические методы или углубитесь в молекулярную биологию.
Не останавливайтесь на достигнутом. Ставьте перед собой новые задачи — участие в конференции, получение стажировки или разработка собственного инструмента для анализа данных.
Биоинформатика может показаться сложной и запутанной, но каждый шаг приближает к значимым результатам. Держите в уме конечную цель — это поможет сохранять мотивацию.
Развитие в биоинформатике — марафон, а не спринт. Завершение курса здесь – важный этап, но настоящее приключение только начинается.
Удачи
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
4❤18👍7🤣4
Не пора ли перевести наши отношения на новый уровень? 😏
Хотите познакомиться с сообществом Бластим ближе и оценить качество наших курсов? Интенсив «Экспресс Linux для NGS» — это идеальная возможность погрузиться в мир анализа больших данных и получить полное представление о том, как мы работаем, по доступной цене. За 4550 р. вы не только освоите работу с NGS, но и узнаете, как легко и эффективно расширять научные перспективы вместе с Бластим. Это шанс пообщаться с нашими преподавателями и кураторами, узнать больше о наших подходах и принципах. А в качестве бонуса — актуальные скилы в анализе NGS-данных😄
В программе:
📌 Основы работы в Linux, терминале и Bash
📌 Знакомство с сервером и настройками
📌 Работа с текстовыми файлами и таблицами
📌 Скачивание файлов
📌 Управление сессиями с помощью tmux
📌 Основы текстового редактора vim
📌 Практическое задание по анализу NGS-данных
Дата: 17-18 августа
Время: с 10:00 до 15:00 (Мск)
Формат: онлайн
🔗 Узнайте больше и зарегистрируйтесь
⚡️ Все участники «Экспресс Linux для NGS» смогут продолжить обучение на полном курсе «Анализ NGS-данных» с персональной скидкой, равной стоимости интенсива.
Хотите познакомиться с сообществом Бластим ближе и оценить качество наших курсов? Интенсив «Экспресс Linux для NGS» — это идеальная возможность погрузиться в мир анализа больших данных и получить полное представление о том, как мы работаем, по доступной цене. За 4550 р. вы не только освоите работу с NGS, но и узнаете, как легко и эффективно расширять научные перспективы вместе с Бластим. Это шанс пообщаться с нашими преподавателями и кураторами, узнать больше о наших подходах и принципах. А в качестве бонуса — актуальные скилы в анализе NGS-данных
В программе:
📌 Основы работы в Linux, терминале и Bash
📌 Знакомство с сервером и настройками
📌 Работа с текстовыми файлами и таблицами
📌 Скачивание файлов
📌 Управление сессиями с помощью tmux
📌 Основы текстового редактора vim
📌 Практическое задание по анализу NGS-данных
Дата: 17-18 августа
Время: с 10:00 до 15:00 (Мск)
Формат: онлайн
🔗 Узнайте больше и зарегистрируйтесь
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
2👍7😁3❤1
Лаборатория клеточных технологий на базе ФГБУ «НМИЦ АГП им. В.И. Кулакова» Минздрава РФ приглашает научных сотрудников, владеющих основными методами клеточной и молекулярной биологии, направленные на генетические модификации клеточных культур.
Обязанности:
▫️Анализ научной литературы;
▫️Планирование и проведение экспериментов;
▫️Постановка методик культивирования клеток и их анализа;
▫️Проведение экспериментов и ведение лабораторного журнала;
▫️Обработка результатов экспериментов, подготовка публикаций и отчетов.
Требования:
🔸Высшее биологическое, медицинское, химико-фармацевтическое, химическое или физико-техническое образование;
🔸Опыт написания заявок, публикаций и отчетов;
🔸Полный рабочий день.
Вашим преимуществом будут:
🔹Научная степень;
🔹Опыт работы в разработке биологических препаратов или на фармацевтическом производстве;
🔹Знание методов фармацевтического анализа;
🔹Опыт оформления фармацевтической разработки, разработки и валидации аналитических методик;
🔹Опыт упаковки вирусных векторов;
🔹Знание программ для работы с нуклеотидными последовательностями, методов построения филогенетических деревьев, умение самостоятельно подбирать праймеры;
🔹Опыт использования препаративной фильтрации и хроматографии для очистки биотехнологических продуктов;
🔹Опыт работы в зарубежной лаборатории;
🔹Наличие научных публикаций индексируемых в базах данных Scopus, WoS, изобретений;
🔹Навыки управления.
Условия:
▪️Возможно предоставление жилья для иногородних, поступление в аспирантуру.
Зарплата:
✔️Зарплата по результатам собеседования (от 100 000 рублей)
#бластим_вакансии
Обязанности:
▫️Анализ научной литературы;
▫️Планирование и проведение экспериментов;
▫️Постановка методик культивирования клеток и их анализа;
▫️Проведение экспериментов и ведение лабораторного журнала;
▫️Обработка результатов экспериментов, подготовка публикаций и отчетов.
Требования:
🔸Высшее биологическое, медицинское, химико-фармацевтическое, химическое или физико-техническое образование;
🔸Опыт написания заявок, публикаций и отчетов;
🔸Полный рабочий день.
Вашим преимуществом будут:
🔹Научная степень;
🔹Опыт работы в разработке биологических препаратов или на фармацевтическом производстве;
🔹Знание методов фармацевтического анализа;
🔹Опыт оформления фармацевтической разработки, разработки и валидации аналитических методик;
🔹Опыт упаковки вирусных векторов;
🔹Знание программ для работы с нуклеотидными последовательностями, методов построения филогенетических деревьев, умение самостоятельно подбирать праймеры;
🔹Опыт использования препаративной фильтрации и хроматографии для очистки биотехнологических продуктов;
🔹Опыт работы в зарубежной лаборатории;
🔹Наличие научных публикаций индексируемых в базах данных Scopus, WoS, изобретений;
🔹Навыки управления.
Условия:
▪️Возможно предоставление жилья для иногородних, поступление в аспирантуру.
Зарплата:
✔️Зарплата по результатам собеседования (от 100 000 рублей)
#бластим_вакансии
1❤14🤣10👍7❤🔥4🔥1
Мы заметили, что вам понравился наш трукрайм-пост об одной из самых таинственных загадок в истории Австралии. Но Океания хранит ещё много интересного! Например, в этом регионе полно случаев таинственного исчезновения туристов... Эти места не только поражают красотой, но и скрывают мрачные тайны 🫣
Пока новый материал готовится, предлагаем погрузиться в другой не менее удивительный мир — историю народов Океании.
🌊 Океания — это не просто группа островов в Тихом океане. Это целая вселенная, разбросанная по бескрайним водным просторам, где каждый остров — отдельный уникальный мир. Представьте себе: если собрать всю сушу Евразии, Африки, обеих Америк, Австралии и Антарктиды и поместить в Тихий океан, этого будет недостаточно, чтобы закрыть его целиком. Океания — это олицетворение безграничного пространства, где расстояние между островами порой измеряется тысячами километров.
Несмотря на такие преграды, человек всё-таки смог освоить эти удалённые уголки Земли. Теперь на каждом из этих островов живут потомки смелых мореплавателей, которые не побоялись бросить вызов стихии. Кто же они, откуда пришли, как им удалось выжить в столь суровых условиях и кто их предки?🤨
Если хотите узнать больше о невероятных народах Океании, которые заселили самые удалённые уголки планеты, не пропустите наш прошлый материал по ссылке.
А также ставьте реакции, чтобы показать, что вам интересно: захватывающая антропология — 👍 или таинственные трукрайм-истории — 🌚? Ваш выбор поможет нам определиться с темой следующего материала.
Пока новый материал готовится, предлагаем погрузиться в другой не менее удивительный мир — историю народов Океании.
🌊 Океания — это не просто группа островов в Тихом океане. Это целая вселенная, разбросанная по бескрайним водным просторам, где каждый остров — отдельный уникальный мир. Представьте себе: если собрать всю сушу Евразии, Африки, обеих Америк, Австралии и Антарктиды и поместить в Тихий океан, этого будет недостаточно, чтобы закрыть его целиком. Океания — это олицетворение безграничного пространства, где расстояние между островами порой измеряется тысячами километров.
Несмотря на такие преграды, человек всё-таки смог освоить эти удалённые уголки Земли. Теперь на каждом из этих островов живут потомки смелых мореплавателей, которые не побоялись бросить вызов стихии. Кто же они, откуда пришли, как им удалось выжить в столь суровых условиях и кто их предки?
Если хотите узнать больше о невероятных народах Океании, которые заселили самые удалённые уголки планеты, не пропустите наш прошлый материал по ссылке.
А также ставьте реакции, чтобы показать, что вам интересно: захватывающая антропология — 👍 или таинственные трукрайм-истории — 🌚? Ваш выбор поможет нам определиться с темой следующего материала.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
35👍23🌚11❤7🤔2
1/3
Какого питомца выбрать? Забудьте про кошек и собак — выбираем pet project. Гипоаллергенно!
Pet project (PP) — это личный исследовательский проект выходного дня. В мире биоинформатики это может быть всё, что угодно: от анализа генома до создания сложного аналитического инструмента.
Зачем pet project?
👏 Практика
Вы не просто читаете книги или проходите курсы, а создаете что-то, что работает и решает конкретные задачи.
👑 Портфолио
Успешный PP можно включить в портфолио и показать потенциальным работодателям. Это отличный способ выделиться среди других кандидатов и продемонстрировать свои умения.
🤘 Свобода
PP дает возможность экспериментировать с новыми идеями и методами. Вы можете не ограничивать себя рамками коммерческих задач или требований.
🤌 Удовольствие от процесса
В РР вы контролируете всё — от идеи до реализации. Это принесет огромное удовольствие. Просто поверьте.
Какого питомца выбрать? Забудьте про кошек и собак — выбираем pet project. Гипоаллергенно!
Pet project (PP) — это личный исследовательский проект выходного дня. В мире биоинформатики это может быть всё, что угодно: от анализа генома до создания сложного аналитического инструмента.
Зачем pet project?
Вы не просто читаете книги или проходите курсы, а создаете что-то, что работает и решает конкретные задачи.
Успешный PP можно включить в портфолио и показать потенциальным работодателям. Это отличный способ выделиться среди других кандидатов и продемонстрировать свои умения.
PP дает возможность экспериментировать с новыми идеями и методами. Вы можете не ограничивать себя рамками коммерческих задач или требований.
В РР вы контролируете всё — от идеи до реализации. Это принесет огромное удовольствие. Просто поверьте.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
3❤🔥16👍9❤1
2/3
О чем может быть pet project?
📍Для начинающих: только начали анализировать NGS данные
Работа с открытыми данными
Используйте данные с платформ, таких как NCBI GEO или ENA, чтобы провести анализ RNA-Seq или ChIP-Seq данных и создать интерактивные визуализации.
Анализ сходства ДНК
Сравните геномы различных видов, чтобы определить их эволюционные связи. Кто же из современных существ является ближайшим родственником тирекса, например?
Аннотация геномов
Выберите организм, который еще недостаточно исследован. Это может стать вашим первым серьезным вкладом в науку.
📍 Для уверенных пользователей: знакомы с анализом данных и программированием
Автоматизация анализа данных
Создайте инструмент или скрипт, который автоматизирует обработку больших объемов данных для экономии времеми и улучшения воспроизводимости результатов.
Метагеномный анализ
Изучите, как микробиом человека или других организмов изменяется в зависимости от различных условий.
Создание базы данных
Постройте собственную базу данных для хранения и анализа биологических данных.
📍 Для продвинутых: машинное обучение и deep learning
Предсказание структуры белков
Разработайте модель машинного обучения, которая будет предсказывать структуру белков.
Single-cell RNA-Seq
Создайте модель для анализа данных, кластеризации и визуализации.
Модели для предсказания активности ферментов
Разработайте алгоритм, который будет предсказывать активность ферментов на основе их аминокислотной последовательности или структуры.
📍 Проекты в биостатистике
Анализ клинических данных
Используйте открытые данные клинических исследований для проведения статистического анализа и проверьте эффективность лечения.
Прогнозирование исходов лечения
Разработайте статистическую модель, которая будет предсказывать исходы лечения на основе демографических данных, результатов анализов и истории болезни пациентов.
О чем может быть pet project?
📍Для начинающих: только начали анализировать NGS данные
Работа с открытыми данными
Используйте данные с платформ, таких как NCBI GEO или ENA, чтобы провести анализ RNA-Seq или ChIP-Seq данных и создать интерактивные визуализации.
Анализ сходства ДНК
Сравните геномы различных видов, чтобы определить их эволюционные связи. Кто же из современных существ является ближайшим родственником тирекса, например?
Аннотация геномов
Выберите организм, который еще недостаточно исследован. Это может стать вашим первым серьезным вкладом в науку.
📍 Для уверенных пользователей: знакомы с анализом данных и программированием
Автоматизация анализа данных
Создайте инструмент или скрипт, который автоматизирует обработку больших объемов данных для экономии времеми и улучшения воспроизводимости результатов.
Метагеномный анализ
Изучите, как микробиом человека или других организмов изменяется в зависимости от различных условий.
Создание базы данных
Постройте собственную базу данных для хранения и анализа биологических данных.
📍 Для продвинутых: машинное обучение и deep learning
Предсказание структуры белков
Разработайте модель машинного обучения, которая будет предсказывать структуру белков.
Single-cell RNA-Seq
Создайте модель для анализа данных, кластеризации и визуализации.
Модели для предсказания активности ферментов
Разработайте алгоритм, который будет предсказывать активность ферментов на основе их аминокислотной последовательности или структуры.
📍 Проекты в биостатистике
Анализ клинических данных
Используйте открытые данные клинических исследований для проведения статистического анализа и проверьте эффективность лечения.
Прогнозирование исходов лечения
Разработайте статистическую модель, которая будет предсказывать исходы лечения на основе демографических данных, результатов анализов и истории болезни пациентов.
2❤12👍8❤🔥3
3/3
Где искать вдохновение?
📌 Coursera, edX, Kaggle, Rosalind — эти платформы помогут вам не только получить знания, но и найти идеи для PP.
📌 Участвуйте в научных конференциях и хакатонах, где обсуждаются тренды.
📌 Сообщества, такие как Science Buddies, BioStars, Reddit, могут стать отличными источниками советов.
📌 Чтение новостей об актуальных исследованиях.
Pet projects — идеальный способ развивать свои навыки, экспериментировать с новыми идеями, создавать что-то уникальное. Независимо от того, новичок вы или эксперт, биоинформатика предлагает огромное пространство для творчества.
😶 А если вдруг что-то не получается, вы застряли на сложной задаче или чувствуете, что не хватает навыков для следующего шага, — не переживайте. Blastim всегда готов прийти на помощь. Мы поможем вам освоить всё необходимое в сжатые сроки и максимально эффективно.
#выходные_у_бластим
Где искать вдохновение?
📌 Coursera, edX, Kaggle, Rosalind — эти платформы помогут вам не только получить знания, но и найти идеи для PP.
📌 Участвуйте в научных конференциях и хакатонах, где обсуждаются тренды.
📌 Сообщества, такие как Science Buddies, BioStars, Reddit, могут стать отличными источниками советов.
📌 Чтение новостей об актуальных исследованиях.
Pet projects — идеальный способ развивать свои навыки, экспериментировать с новыми идеями, создавать что-то уникальное. Независимо от того, новичок вы или эксперт, биоинформатика предлагает огромное пространство для творчества.
#выходные_у_бластим
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
2❤14👍7❤🔥3🔥2
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
Если вы хотите, как Никита, быть готовыми к любым научным вызовам, приходите в Бластим — здесь вы получите все необходимые навыки. А еще мы всегда стремимся поддерживать тех, кто искренне хочет развиваться в биоинформатике.
Как принять участие? Всего три шага:
📌 Сформулировать мотивацию: почему этот курс важен именно для вас, как навыки в анализе NGS-данных изменят вашу карьеру, как планируете использовать их в будущем.
📌 Рассказать о мотивации нам, заполнив короткую анкету до 23 августа.
📌Дождаться результатов, которые будут объявлены 25 августа на бесплатном вебинаре «Совместный анализ клинических данных и микробиоты».
Каждый участник получит персональную скидку 10%.
Сроки конкурса: 19.08 - 23.08
Объявление победителей: 25.08
Ждём ваших вдохновляющих историй — возможно, именно страсть к знаниям откроет путь к новым возможностям
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
🔥9👍8❤2
Да кто такой этот «Совместный анализ клинических данных и микробиоты»? Почему совместный? С кем совместный?
Конечно, с нами!🤗
Мы уже упоминали о нашем новом бесплатном вебинаре, который состоится совсем скоро — 25 августа. И раз уж он называется «Совместный анализ клинических данных и микробиоты», то мы настроены на максимальный интерактив. Соберемся и совместненько все проанализируем. Вы узнаете, как работать с микробиомными данными в контексте клинических исследований.
🫵 Этот вебинар предназначен для тех, кто увлекается биоинформатикой, геномикой или микробиологией на любом уровне. Да и вообще для всех, кто соскучился по нашим уютным и «семейным» встречам — будет много живого общения и полезностей, это гарантируем.
В программе:
📍Как правильно собрать и подготовить пробы для анализа
📍Какие методы статистического анализа применять в клинических исследованиях
📍Как провести статистический анализ микробиоты в R
Спикер:
Анна Попенко — действующий эксперт в биоинформатике и биомедстатистике с впечатляющим опытом работы.
Вишенка на торте:
Мы объявим результаты нашего конкурса в конце вебинара! Спасибо всем, кто уже заполнил форму. Нам очень приятно получать такие сообщения: «Пока не придумал, как эти навыки буду применять, но будет полезно их освоить — да и просто нравится с вами работать»😘
Спойлер:
Заявок пока не так много... Шансы победить очень высокие!
Давайте проведем последнее воскресенье лета вместе — полезно и приятно!
Конечно, с нами!
Мы уже упоминали о нашем новом бесплатном вебинаре, который состоится совсем скоро — 25 августа. И раз уж он называется «Совместный анализ клинических данных и микробиоты», то мы настроены на максимальный интерактив. Соберемся и совместненько все проанализируем. Вы узнаете, как работать с микробиомными данными в контексте клинических исследований.
В программе:
📍Как правильно собрать и подготовить пробы для анализа
📍Какие методы статистического анализа применять в клинических исследованиях
📍Как провести статистический анализ микробиоты в R
Спикер:
Анна Попенко — действующий эксперт в биоинформатике и биомедстатистике с впечатляющим опытом работы.
Вишенка на торте:
Мы объявим результаты нашего конкурса в конце вебинара! Спасибо всем, кто уже заполнил форму. Нам очень приятно получать такие сообщения: «Пока не придумал, как эти навыки буду применять, но будет полезно их освоить — да и просто нравится с вами работать»
Спойлер:
Заявок пока не так много... Шансы победить очень высокие!
Давайте проведем последнее воскресенье лета вместе — полезно и приятно!
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
5🔥18❤1
Продолжаем тему о том, как быть в тренде 😎
⚡️ Не пропустите бесплатное и насущное мероприятие: до старта конференции «Клиническая диагностика и персонализированная медицина» осталось три недели!
Вас ждут выступления более 80 экспертов с опытом в самых разных областях науки и медицины. Будут все горячие темы: персонализированная медицина, диагностика, наш родной NGS, проблемы антибиотикорезистентности, CRISPR-Cas (куда же без него). А еще ожидается холивар на тему «ТФМ: per aspera ad colon», который будет модерировать Алексей Водовозов (уже пересматриваете его обзоры прорывов в медицине?). И это далеко не всё! Больше информации в программе конференции здесь.
Сюрприз😉
На конференции будем и мы! Не упустите возможность познакомиться с Александрой Фильковой — методистом Бластим, к.б.н. и научным сотрудником РНИМУ им. Н.И.Пирогова. Обсудим, как всегда, вопросы только на злобу дня: представим тот самый подробный обзор зарплат, расскажем о нашем опыте рекрутинга в науке и о том, как образовательные проекты помогают индустрии.
📌 Дата и место встречи: 10-11 сентября, Центр событий РБК (Москва)
📌 Регистрация: здесь
📌Участие бесплатное
И еще один секретик🤫
Организаторы нашептали нам, что Троицкий инженерный центр и Центр технологий и микрофабрикации ФНКЦ ФХМ им. Лопухина ФМБА России объявили набор на любопытные вакансии... Ищут выпускников, аспирантов, постдоков, инженеров и программистов. Подробности в комментариях к посту
Вас ждут выступления более 80 экспертов с опытом в самых разных областях науки и медицины. Будут все горячие темы: персонализированная медицина, диагностика, наш родной NGS, проблемы антибиотикорезистентности, CRISPR-Cas (куда же без него). А еще ожидается холивар на тему «ТФМ: per aspera ad colon», который будет модерировать Алексей Водовозов (уже пересматриваете его обзоры прорывов в медицине?). И это далеко не всё! Больше информации в программе конференции здесь.
Сюрприз
На конференции будем и мы! Не упустите возможность познакомиться с Александрой Фильковой — методистом Бластим, к.б.н. и научным сотрудником РНИМУ им. Н.И.Пирогова. Обсудим, как всегда, вопросы только на злобу дня: представим тот самый подробный обзор зарплат, расскажем о нашем опыте рекрутинга в науке и о том, как образовательные проекты помогают индустрии.
📌 Дата и место встречи: 10-11 сентября, Центр событий РБК (Москва)
📌 Регистрация: здесь
📌Участие бесплатное
И еще один секретик
Организаторы нашептали нам, что Троицкий инженерный центр и Центр технологий и микрофабрикации ФНКЦ ФХМ им. Лопухина ФМБА России объявили набор на любопытные вакансии... Ищут выпускников, аспирантов, постдоков, инженеров и программистов. Подробности в комментариях к посту
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
3❤3👍3
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Как же быстро летит время... Уже завтра в 11:00 случится наш бесплатный вебинар «Совместный анализ клинических данных и микробиоты» 🤩
Напоминаем, что будет:
📙 «Сухие» биологи познакомятся с клиническими исследованиями микробиоты
📘 «Мокрые» попробуют себя в статистике и программировании
📗 «Загулявшие» в отпуске плавно вольются в рабочий ритм
Отличная новость: вебинар будет конферансить Вита⚡️
Костров и песен под гитару не обещаем. Но! Обязательно пообщаемся о том, как провели лето, обсудим планы на осень и настроимся на продуктивный научный сезон.
А теперь о приятных бонусах для всех зарегистрировавшихся:
🎁 Бессрочный доступ к записи вебинара
🎁 Запись вебинара «Создание библиотеки: выделение единичных клеток, захват РНК, обратная транскрипция, секвенирование»
🎁 Набор инструментов для анализа single-cell данных
Регистрация на теплый «вебинарник» у Бластим туть: https://u.to/1x7XIA 🍁
Напоминаем, что будет:
📙 «Сухие» биологи познакомятся с клиническими исследованиями микробиоты
📘 «Мокрые» попробуют себя в статистике и программировании
📗 «Загулявшие» в отпуске плавно вольются в рабочий ритм
Отличная новость: вебинар будет конферансить Вита
Костров и песен под гитару не обещаем. Но! Обязательно пообщаемся о том, как провели лето, обсудим планы на осень и настроимся на продуктивный научный сезон.
А теперь о приятных бонусах для всех зарегистрировавшихся:
Регистрация на теплый «вебинарник» у Бластим туть: https://u.to/1x7XIA 🍁
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
3❤7👍1
Мировые проекты, такие как UK Biobank, All of Us и China Kadoorie Biobank, создают обширные базы данных о генетическом разнообразии человечества. Но вот в чем загвоздка: эти проекты не охватывают многие этнические группы, такие как якуты, ненцы, чукчи, коми, ханты, манси, коряки, эвенки и мнооооогие другие малочисленные народы (всего их в России больше 190!). Национальная генетическая инициатива «100 000+Я» пытается восполнить этот пробел. Проект нацелен на создание базы генетических данных 100 000 россиян, включая редкие народности.
Что же помогает изучению генетического разнообразия хайповать?
Особенности геномов отдаленных популяций, сформированных под влиянием «нестандартных» условий среды, могут стать ценным источником информации для понимания биохимии человека. Они могут помочь в исследовании редких заболеваний, факторов долголетия, а также быть любопытными с точки зрения истории человечества.
Представьте себе традиционную ловлю нерпы у арктических народов:
Зимой, когда море покрыто льдом, нерпы дышат через лунки во льду. Охотники находят эти лунки и могут часами, а иногда и днями, лежать неподвижно на морском льду, выжидая, когда нерпа всплывет для вдоха. Используя гарпун или копье, он точно наносит удар, чтобы добыть животное. Нерпы сверхчувствительны к движениям на поверхности, поэтому охотник должен быть осторожным. А тем временем температура воздуха ниже 50 градусов, а влажность стремится к 100%... Не очень верится, что такая морозоустойчивость человека обходится без с генетических особенностей теплообмена и метаболизма.
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
2❤28
А теперь вспомним рацион чукчей, в котором килограммы жиров животного происхождения. И никаких атеросклеротических бляшек в сосудах! Конечно, образ жизни северных народов тоже играет роль в формировании такой контринтуитивной картины. Но есть и генетическая гипотеза: у арктических народов могли развиться особенности, помогающие эффективно усваивать жиры и минимизировать их негативное влияние на здоровье.
Примеры таких адаптаций можно приводить долго. Ставьте 🤔, и мы расскажем больше.
А с точки зрения истории не обойтись без налета детектива: кеты и американский след🤨
Кеты, малочисленный народ Сибири с уникальной культурой, привлекают ученых в том числе и языком, который разительно отличается от всех соседских. Однако, кетский отдалено похож на языки на-дене, которые распространены среди индейцев на западе Канады и Аляске. Если предки коренных народов Америки пересекли Берингов пролив из Сибири 15–20 тысяч лет назад, то именно кеты — потомки тех групп, которые остались в Сибири. Так, генетические исследования могут пролить свет и на другие исторические вопросы антропологии.
☝️ К слову про Pet Projects:
Сейчас любой желающий может провести генетический тест и узнать о своем происхождении. Тесты показывают вероятные регионы и этнические группы, связанные с геномом. Но важно помнить, что результаты не являются истинным отражением этнической принадлежности, а лишь предполагают возможные регионы происхождения на основе генетических маркеров. Базы данных и методы анализа еще развиваются.
«Сырые» данные генетического теста можно анализировать и самостоятельно. Существует множество онлайн-ресурсов и программ. А если вы хотите начать погружение в анализ данных секвенирования с Blastim, то курс «Анализ NGS-данных» стартует через 2 недели. Успейте в предпоследний вагон: завтра цена на курс увеличится!
#выходные_у_бластим
Примеры таких адаптаций можно приводить долго. Ставьте 🤔, и мы расскажем больше.
А с точки зрения истории не обойтись без налета детектива: кеты и американский след
Кеты, малочисленный народ Сибири с уникальной культурой, привлекают ученых в том числе и языком, который разительно отличается от всех соседских. Однако, кетский отдалено похож на языки на-дене, которые распространены среди индейцев на западе Канады и Аляске. Если предки коренных народов Америки пересекли Берингов пролив из Сибири 15–20 тысяч лет назад, то именно кеты — потомки тех групп, которые остались в Сибири. Так, генетические исследования могут пролить свет и на другие исторические вопросы антропологии.
Сейчас любой желающий может провести генетический тест и узнать о своем происхождении. Тесты показывают вероятные регионы и этнические группы, связанные с геномом. Но важно помнить, что результаты не являются истинным отражением этнической принадлежности, а лишь предполагают возможные регионы происхождения на основе генетических маркеров. Базы данных и методы анализа еще развиваются.
«Сырые» данные генетического теста можно анализировать и самостоятельно. Существует множество онлайн-ресурсов и программ. А если вы хотите начать погружение в анализ данных секвенирования с Blastim, то курс «Анализ NGS-данных» стартует через 2 недели. Успейте в предпоследний вагон: завтра цена на курс увеличится!
#выходные_у_бластим
Please open Telegram to view this post
VIEW IN TELEGRAM
2🤔30❤13👍3
Дорогие друзья,
Представляем вашему вниманию дружественный нам канал «ИБХФ РАН. Новости» @ibcp_ras_news – официальный новостной канал Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института биохимической физики им. Н.М. Эмануэля Российской академии наук!
Основные тематики канала:
🔹 Научная жизнь института РАН
🔹 Интервью сотрудников
🔹 Анонсы профильных конференций и конкурсов
🔹 Новые разработки российских ученых
🔎 Если вы в поиске места для выполнения дипломного или диссертационного исследования, научно-исследовательской работы, вам может быть интересна видеозапись Дня открытых дверей ИБХФ РАН, прошедшего в онлайн-формате
#Бластим_рекомендует
Представляем вашему вниманию дружественный нам канал «ИБХФ РАН. Новости» @ibcp_ras_news – официальный новостной канал Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института биохимической физики им. Н.М. Эмануэля Российской академии наук!
Основные тематики канала:
🔹 Научная жизнь института РАН
🔹 Интервью сотрудников
🔹 Анонсы профильных конференций и конкурсов
🔹 Новые разработки российских ученых
🔎 Если вы в поиске места для выполнения дипломного или диссертационного исследования, научно-исследовательской работы, вам может быть интересна видеозапись Дня открытых дверей ИБХФ РАН, прошедшего в онлайн-формате
#Бластим_рекомендует
👍10