🔸Видеолекция по квантовой химии и построению моделей

Спикер: Михаил Медведев – кандидат физмат наук, старший научный сотрудник, руководитель группы теоретической химии (№24) Института органической химии РАН.

При таком серьёзном резюме Михаил – очень молодой человек для науки. Это яркий пример молодого учёного, который занимается очень сложными вещами и успешен в своём деле.

Основная идея квантовой химии – мы строим модели тогда, когда не хотим ставить много опытов чтобы что-то узнать. Затем выбираем наиболее подходящую нам модель и уже после идём убеждаться на опыте подходит ли она нам или нет.

• Как создаются математические модели?

Подход сверху: «я знаю всё про систему и факторы влияния». Мы выражаем всё через уравнения и получаем ответы.

Подход снизу: «я ничего не знаю про систему, но знаю правильные ответы для каких-то случаев». Можно обучить модель для случаев, которые я пока не знаю. Тут используется машинное обучение.

На практике идёт сочетание этих подходов. Где знаем — пишем уравнения, а где-то пользуемся машинным обучением с опорой на известные случаи.

• Далее объясняется проблема переобучения модели. Тот случай, когда получаемый результат сильно неадекватен, говоря простым языком.

• Приводятся примеры и расчёты из реальной химии.

По результатам работ написаны статьи в крупнейший журнал Science, содержание которых вы можете наблюдать на презентации в этом видео: https://vk.com/video-215834377_456239438

За лекцию спасибо каналу Научная Тематика и Сергею Ивановскому

#Читать далее#

Конференция «Инфохимия: методы IT и математического моделирования в химии» – выкладываем записи лекций 🎬

Весь апрель и май делимся выступлениями ученых! Ловите расписание, чтобы ничего не пропустить:

✅ 14 апреля – Павел Мусиенко: нейропротезирование
функций спинного мозга

✅ 17 апреля – Александр Хватов: весь мир – граф:
об автоматическом моделировании

✅ 21 апреля – Максим Сычев: цифровое материаловедение – развитие концепции Индустрии 4.0

✅ 28 апреля – Сергей Шитяков: от NeuroClick и генерации баз данных в хемоинформатике до вопросов сворачивания белков и аптомеров

✅ 5 мая – Роман Пичугов: будущее воплощение ванадиевых батарей и перспективы использования расчетных моделей

✅ 7 мая – Павел Зун: компьютерное моделирование материалов в биомедицине

✅ 12 мая – Екатерина Козлова: разработка методов синтеза g-C3N4 для процессов альтернативной энергетики

#Читать далее#

Хватит смотреть на талантливых школьников «IChem Prize» – пора стать ими!

В этом году 40 лучших проектов на стыке химии с биологией, IT, робототехникой и другими науками были оценены профессиональным жюри 🔬 Ребята со всех концов России проделали огромную исследовательскую работу.

🔗 О том, как прошёл финал, читайте в статье https://vk.cc/cn0xXe и смотрите в видеосюжете https://vk.com/video-106031752_456240072

Теперь по шагам – что делать, чтобы в следующем году найти себя среди финалистов:

1. Пишите нам и приходите заниматься наукой в Центре инфохимии
2. Подавайте заявки на образовательные программы по инфохимии в Академии талантов и Сириусе (апрельская программа, Сириус.Лето и «Большие вызовы»)
3. Верьте в себя и усердно изучайте материалы, читайте научные статьи, экспериментируйте под руководством менторов

#Читать далее#

💊 Многие спрашивали, когда следующий хакатон в Центре инфохимии ИТМО – и вот дождались!

Встречайте Хакатон «Цифровая фармакология: предсказательное моделирование», который будет посвящен решению задач на стыке IT, химии и медицины!

Партнеры: Medtech.Moscow, Syntelly, Selectel.

📆 Когда: 28-30 апреля
💻 Формат: онлайн
⚡Призовой фонд: 1 000 000 рублей

Участникам предстоит построить модель машинного обучения для точного прогнозирования параметров, характеризующих токсичность химического соединения. Для этого командам нужно сперва собрать свои датасеты на основании открытых источников с использованием технологий обработки естественного языка. Чтобы победить, необходимо продемонстрировать высокую точность модели и ее применимость для широких классов соединений.

🎁 Победители также получат возможность учесть призовое место при поступлении на нашу магистерскую онлайн-программу Chemistry Soft 🎁

Регистрируйтесь по ссылке до 25 апреля и вступайте в чат @digitalfarma.

#Читать далее#

Сверхчувствительный анализ молекул, биореакторы, гибкие сенсоры, выработка электроэнергии из человеческого тела, – все это разработывают участники третьего сезона конкурса школьных проектов IChem Prize

Подробнее – в нашем ролике: https://vk.com/video-76139618_456240166

#Читать далее#

Через час начнется лекция Павла Мусиенко: нейропротезирование
функций спинного мозга 🎬

Павел Мусиенко – доктор медицинских наук, профессор центра нейробиологии и нейрореабилитации Сколтеха, завлабораторией нейропротезов СПбГУ, руководитель направления нейробиологии Университета «Сириус».

Среди научных интересов ученого – экспериментальная нейрорегенерация и нейропротезирование. Научная группа профессора уже более 5 лет исследует создание нейроимплантов с более высоким уровнем биоинтеграции. В работе задействованы ресурсы и накопленный опыт нескольких научных центров страны: СПбГУ, Института физиологии имени И.П. Павлова РАН, Университета «Сириус», Института медицинской приматологии.

⭐ Основное достижение группы – разработка технологии изготовления нейроимплантов из композитного материала на основе углеродных нанотрубок и силикона.

#Читать далее#

Рассказываем, как подготовиться и зачем участвовать в нашем онлайн-хакатоне «Цифровая фармакология: предсказательное моделирование»

📍 Зачем? Разработка нового медицинского препарата занимает в среднем от 10-12 лет и требует инвестиций от $1 млрд. Экспериментальный поиск соединений, обладающих предпочтительными свойствами – крайне дорогостоящий процесс, цена синтеза и профилирования физико-химических свойств только одной молекулы может доходить до десятков миллионов рублей. Необходимость дополнительного исследования токсикологических свойств (а без этого молекулы-кандидаты в лекарства не будут допущены до клинических испытаний) увеличивает эту сумму в несколько раз. Эксперименты используют большое количество лабораторных животных и могут длиться годами.

Решение. Разработчикам и исследователям в области медицинской химии необходимы новые цифровые методы навигации и фильтрации химического пространства для конструирования инновационных и безопасных лекарств. Эти методы позволят существенно сократить время и средства на разработку и внедрение новых биоактивных соединений. Важно, что при этом можно в разы уменьшить количество лабораторных животных используемых в экспериментах и снизить риски побочных эффектов лекарств на людей.

💻Хакатон пройдет 28-30 апреля. Регистрация открыта до 25 апреля. Организаторы: Центр инфохимии ИТМО х Синтелли x Medtech.Moscow. Технологический партнер мероприятия – Selectel.

МОЖНО ПОДГОТОВИТЬСЯ ЗАРАНЕЕ: освоить технологии сбора и обработки данных, изучить литературу и открытые источники, собрать необходимые датасеты (чем больше и разнообразнее датасет, тем больше шансов на хорошую модель и победу), разобраться в параметрах, характеризующих токсичность. Ищите советы в статье: https://vk.com/@infochemistry-hakaton-na-million.

#Читать далее#

‎#вакансия_в_инфохимии – ХЕМОИНФОРМАТИК
‎💵 от 190 тысяч рублей на руки

‎Друг и партнер нашего центра – компания Синтелли – ищет специалиста для разработки и внедрения методов химинформатики в модели ИИ для прогнозирования свойств малых молекул, извлечения данных из химической литературы, наполнения и управления химическими базами данных.‎

‎Требования:‎

‎📌Хорошие навыки программирования на Python
‎📌Опыт работы с хемоинформатическими фреймворками и базами данных (RDKit, PubChem)‎
‎📌Знание методов машинного обучения и их применения в хемоинформатике
‎📌Опыт построения и развертывания моделей ИИ

‎Полное описание тут 👉...

#Читать далее#