#ai #russia #infotech

Топовые меды (Научно- практический центр медицинской радиологии Москвы, Первый московский государственный медицинский университет им. И. М. Сеченова, Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Дмитрия Рогачева) совестно с ИРИ проводят исследование в области применения технологий нейросетей в диагностике по мед. изображениям.

Проект финансируют Игорь Мацанюк и Алексей Басов (Ростелеком)

https://www.vedomosti.ru/technology/articles/2016/08/25/654459-neirosetei-meditsine

#digital #gadget

Датская компания cortrium разрабатываем носимые устройства для мониторинга всего и вся, что только возможно гаджетом. Текущая модель умеет мерить ЭКГ, частоту сердечных сокращений, частоту дыхания, температуру поверхности кожи, восстановление сердечного ритма, анализировать сон, вариабельность сердечного ритма, уровень физической активности. Эти данные посылаются через блютус на телефон.

В следующей версии устройства появится трекинг насыщения кислородом (SpO2) и артериального давление.

http://cortrium.com/

#analytics

Хорошая аналитика по digital heath стартапам в США от фонда rock health за 2015 год:

— главные сделки и экзиты
— инвесторы и фонды
— география по штатам

Ну и главное:

Венчурное финансирование для диджитал хелс стартапов в 15 году достигло $ 4.5B. Совокупный годовой рост (CAGR) в 2011-2015 составил 32%. В 15 году состоялось 302 сделки в 267 компаниях. $ 14,8М — средний размер сделки, что является новым рекордом.

ТОП 6 трендов, которые составляют 50% от всего объема финансирования:
привлечение потребителей, носимые устройства и биосенсоры, персональные хелс-трекеры, какой то "payer administration", телемедицина. payer administration присоединился к шестерке в первый раз в этом году.

Категории роста трех областей, которые показали заметный рост финансирования: персональные хелс-трекеры и консультанты.

Четырнадцать венчурных и десять стратегических фондов принимали участие в по крайней мере 4-х сделках каждый в 15 году.

В 15 году случился целый потоп сделок по слияниям и поглощениям: 187 публичных сделок на $6B.

https://rockhealth.com/reports/digital-health-funding-2015-year-in-review/

#gadget #russia #analytics

http://welltory.com/academy/

Питерский стартап Welltory открыл школу мед.аналитиков (персональный аналитик здоровья). Звучит круто и даже деньги они за это берут (9900 руб между прочим). Все красиво и жизнерадостно, только вот напрягает строчка в FAQ:

— У меня нет медицинского образования, это важно?

— Это не важно. Можете быть юристом, бухгалтером, кем угодно - главное ваше желание развиваться и обучаться.
Вы будете работать вместе с целым штатом экспертов-медиков, которые разбирают сложные случаи. А знания, полученные на курсе, помогут вам самому понимать, как устроен человек.

Незнаю как у вас, но у меня это вызывает небольшое недоумение. Аналитик, работающий с мед. данными, которому "не важно" мед образование. Ладно бы написали "не обязательно".

#analytics #bigdata

У нас сегодня опять интересная аналитика. Семантический анализ медицинского контента и запросов пользователей от mail.ru

#genetics #crispr

Всем привет. На этой неделе будет много про генетику. Накопилось материала — ЭКО, тесты, анализ данных и расскажу про образовательные курсы.

А пока для затравки очень классное видео про будущее с CRISP (там, кстати, качественные русские субтитры)

https://youtu.be/jAhjPd4uNFY

#reproductology

Женщины, идущие на ЭКО, могут использовать собственное тело в качестве инкубатора. Был проведен эксперимент, который доказывает удобство и дешевизну этого подхода, пишет New Scientist. Итак, в основе лежит капсула - INVOcell.

Ее закрепляют во влагалище с помощью гибкой мембраны. В капсулу помещают эмбрионы, где они развиваются при температуре тела. При этом туда поступают и отводятся газы вроде диоксида углерода и кислорода в той концентрации, что необходима при естественном оплодотворении.

Через пять дней эмбрионы уже представляют собой шарики примерно из 100 клеток. Тогда капсулу вынимают, и врачи выбирают самый жизнеспособный эмбрион, готовый к имплантации в матку. В Штатах уже прошли клинические испытания системы с участием 40 женщин.

По словам ученых, капсула показала себя почти так же хорошо, что и обычный инкубатор. 55% женщин, которым имплантировали капсулу, родили. Среди применявших стандартный метод таковых было 60%.

https://www.newscientist.com/article/mg22930554-500-women-can-grow-their-own-ivf-embryos-with-in-body-incubator/

Пользуясь случаем всем рекомендую отличный канал про репродуктологию https://telegram.me/reproductology 👌

#pharma

⚡️ Вот новость так новость ⚡️
Немного не в тему чата, но все же.

Упомянутый уже не раз Bayer покупает производиетля ГМ семян Monsanto, внимание, за 66 МИЛЛИАРДОВ БАКСОВ


http://www.bbc.com/news/business-37361556

#genetics

Сделал небольшую подборку персональных удаленных генетических тестов, представленных на российском рынке.

http://mygenetics.ru/
от 5900 до 29900р. Несколько пакетов продуктов. Результат присылают в виде красивой книги.

https://atlas.ru/gentest
29 900р. Результат в личном кабинете с классным интерфейсом

https://www.genotek.ru/
Различные продукты от 14990 до 90 000 р(ДНК анализ «Мой геном+»).

https://www.i-gene.ru/
2 направления: мой ген здоровье и мой ген этно. Из названий можно все понять

http://www.gentis.ru/
Судя по последней новости в 2013 году компания не очень то и жива.

Ну а вдруг мимо вас прошла новость про Биохаб Цукерберга? Давайте попробуем собрать все воедино.

Марк с Женой в прошлом году заявили, что потратят 99% своего состояния на благотворительность (http://www.nytimes.com/2015/12/02/technology/mark-zuckerberg-facebook-charity.html) и учредили фонд Chan Zuckerberg Initiative (https://chanzuckerberg.com/). На прошлой неделе супруги устроили грандиозную презентацию https://www.youtube.com/watch?v=YKt8XUYqRjw, на которой объявили, что вложат 3B$ в течение 10 лет в биотех и медтех.

На первом этапе планируется потратить $600 млн на создание в Сан-Франциско лаборатории под названием Biohub, в которой будут работать инженеры и ученые из Беркли, Калифорнийского и Стэнфордского университетов и Университета Сан-Франциско.

Там, конечно, целая гора всего интересного (как вам чип для непрерывной диагностики инфекций?). Посмотрите презентацию. Там можно, если проблемы с языком, включить вполне сносный перевод субтитров.

Презентация, конечно, не такая зажигателная и суперская, как последний ивент эппла, когда у 40 летних мужиков намокали от счастья штаны от выхода марио на айфоне и зал дрожал от оваций. Вот где настоящие инновации!

В связи с жестким цейтнотом в последнее время выпуски Медтеха стали не особо частыми. Поэтому сегодня порекомендую несколько дружественных каналов со схожей тематикой, которые я с удовольствием читаю. Подписывайтесь ;)

https://telegram.me/ibrablogs Отличные подборки юного техно-врача)


https://telegram.me/tehnomedbrat Канал нашего подписчика и активного участника чата. Незаслуженно мало подписчиков)

https://telegram.me/darthbiology Биотех, генетика и прочие приятные вещи

https://telegram.me/namochimanturu очень популярный канал про доказательную медицину

https://telegram.me/reproductology канал про репродуктологию и ЭКО

#HIV

В последнее время занимался неинвазивными тестами, как областью развития Медтеха. Там много всего, но расскажу про 2 интересных направления: ВИЧ и КРР.

1. Экспресс тесты на ВИЧ проходят какую то странную стадию. FDA одобрило первый такой тест еще в 2004 году (Oral Quick Advanced Rapid HIV-1/2 Antibody Test — http://www.oraquick.com/). В нашем реестре. Помимо него так же есть Aware HIV 1/2 OMT (http://www.calypte.com/aware1.html), однако одобрения FDA у него до сих пор нет.

Разброс цен на рынке очень большой (в интернете находил цены от 560 до 1300 рублей за тест), в аптеках тестов нет.

Для меня это очень странная ситуация, учитывая количество и динамику ВИЧ в России. Последний доклад UNAIDS рассказывает о положительной динамике всего восточноевропейского и центральноазиатского региона, где 80% занимает Россия (http://riaami.ru/read/yunejds-bolee-80-novyh-sluchaev-zarazheniya-vich-v-vostochnoj-evrope-i-tsentralnoj-azii-otmechayutsya-v-rossii)

Тем более странна для меня полная "андеграундность" неинвазивных экспресс тестов. В чем проблема? почему они не продаются на кассе каждого супермаркета вместе с презервативами, жвачкой и тестом на беременность?

2. Скринниг КРР (и не только, конечно). http://www.biohithealthcare.com/products/diagnostics-tests/products/21/colonview-quick-test

Тест для диагностики скрытых крови из жкт при аденомах, полипах и других деструктивных процессах в кишечнике. Тесты «ColonView Hb» и «ColonView Hb/Hp» основаны на обнаружении человеческого гемоглобина и гемоглобин/гаптоглобинового комплекса (Hb/Hp) в образцах стула. Молекула гемоглобина распадается при прохождении через желудочно-кишечный тракт, а гемоглобин-гаптоглобиновый комплекс - устойчивая форма гемоглобина, поэтому он может быть обнаружен даже после достаточно продолжительного пассажа через кишечник.

Розничная цена теста порядка 1200 рублей, в аптеках так же его нет.

Медтех опять в деле ;) Прошу простить меня за длительное отсутствие, но были объективные причины.

Сегодня о том, как глобальные IT гиганты работают в области внедрения AI в исследования рака.

Начнем с последней новости.

NVIDIA запустила проект CANDLE (Cancer Distributed Learning Environment), который позволит использовать распределенную сеть NVIDIA DGX-1 (http://www.nvidia.com/object/deeplearningsystem.html?mboxSession=251fbe2a15f747dc84d26144bac3f995) для внедрения deep learning методов изучения.

Во-первых, CANDLE будет использоваться, чтобы помочь обнаружить основные генетические аномалии, присутствующие в ДНК и РНК на наиболее распространенных формах рака. Во-вторых, ускорит молекулярно динамическое моделирование ключевых белковых взаимодействий, чтобы понять основные биологические механизмы, создающие условия для развития раковых опухолей. В-третьих, CANDLE позволит автоматизировать сбор информации и анализ миллионов историй болезни пациентов для создания общей базы данных наблюдения рецидива рака.

Подробнее написано в оф. пресс релизе — http://nvidianews.nvidia.com/news/nvidia-teams-with-national-cancer-institute-u-s-department-of-energy-to-create-ai-platform-for-accelerating-cancer-research

Если учитывать компьютерные мощности NVIDIA и их прогресс в DL (подробнее почитать http://www.nvidia.com/object/deep-learning.html), то эта новость перекроет создание биохаба Цукерберга.

В следующих выпусках расскажу про hanover (проект майкрософта) и deepmind (гугл).

#pharma #russia #oncotech

Новость — в России изобретен противораковый препарат с ФАНТАСТИЧЕСКОЙ эффективностью.

http://www.vesti.ru/doc.html?id=2837960&cid=2161#

Ну что, давайте разбираться.

Во первых, PD-1 это не название препарата, а название белка-мишени для таргетного препарата.

Во вторых блокатора PD-1 в мире зарегестрировано ровно 2: Opdivo (nivolumab) от Bristol-Myers Squibb (BMS) и Keytruda (pembrolizumab) от Merck, и то не в РФ

В третьих, все понимают о каком ллекарстве идет речь (погуглите BCD-100). Одно из ранних упоминаний http://tass.ru/nauka/1478989

В четвертых, как нам сообщает Реестр выданных разрешений на проведение КИ, препарат только закончил 1 фазу исследований https://goo.gl/kSXhyW
А это значит, что ни о какой оценке эффективности пока речи не идет. На первой фазе КИ изучается только безопасность препарата.

Потом будет вторая фаза, потом третья. В лучшем случае препарат сможет быть зарегестрирован через несколько лет. И это, если все пойдет хорошо (правда нельзя в этом сомневаться мне, а то опять прибегут юристы Биокада и наедут на меня 😃)

Ну ладно, вернемся к теме канала.

Вообще блокаторы PD-1 это реально бомбическая штука, которая реально может порвать меланому, как тузик грелку.

Но есть проблема, что препараты эти КРАЙНЕ дорогие. Стоимость лечения стартует от 10к евро примерно в месяц.

Так что новость позитивная, хоть и немного не правда.

Ну а отличные материалы по теме PD-1 и вообще ингибиторов иммунного ответа
1. http://slipups.ru/4969
2. http://dr-jamais.livejournal.com/177550.html

С Новым годом, медтехи! В 2017 году нас ждёт ещё больше открытий и удивительных технологий. Главное не болейте и берегите себя. С Новым годом!

#oncotech #AI #watson

Продолжим знакомство с AI в медицине. Основные технологии здесь понятны. Это сервисы работы с большими данными, когнитивные системы с ML и computer vision.

В прошлый раз я рассказывал про CANDLE (сетка из Nvidea DGX для DL в области обработки данных).

Сегодня про мой любимый IBM Watson.

https://www.youtube.com/watch?v=TuxL3yzXxJo

MSK запартнерился с IBM для создания когнитивной системы анализа данных. Основное применение сейчас — подбор пациентов для релевантных клинических исследований и какая то "помощь в принятии решений на основе медицинских наукзаписей пациента". Что это и как это работает не особо понятно :) Но алгоритм заявлен такой:

- Анализ всех доступных данных о пациенте, в т.ч. просто записи на английском языке
- На основе этих данных определяет потенциальные варианты лечения и предлагает их специалисту
- Находит и предоставляет подтверждающие документы из широкого спектра источников (более 290 медицинских журналов, более 200 учебников и 12 миллионов страниц текста)

Как это работает на практике, большой вопрос. Но вот здесь можно попробовать получить тестовый доступ, если вы специалист http://watsonhealth.ibm.com/Oncology-Clinical-Trials.html

Официальный пресс релиз от MSK — https://www.mskcc.org/about/innovative-collaborations/watson-oncology

#blockchain

Сегодня пара слов о, прости Господи, блокчейне в медтехе. Вообще я давно смотрю за технологией и интересно, в каком виде она докатится до healthcare.

Самое очевидное решение — применение блокчейна для хранения любых данных о пациенте (глобальная база данных всех медицинских записей о любом человеке на земле) и идентификация врачей (врачебный "мультипаспорт")

1. Bron.tech (Сидней)

Чуваки делают несколько продуктов (OWLEE — DAPP система подтверждения репутации), Blockchain Digtial ID (цифровые идентификаторы) и Cyph.MD

http://bron.tech/cyphmd-dapp/
Это построенная на Эфириуме система, которая использует асимметричную криптографию с иерархической системы сертификатов в которой каждое мед учреждение может выдавать жетоны, удостоверяющие личность его сотрудников, которые должны быть подписаны цифровой подписью больницы. В итоге получается что то типа глобальной системы подтверждения подлинности врачей.

2. https://gem.co/health/ (Калифорния)

Делает примерно тоже самое, но говорит об этом еще более непонятно. Помимо этого они обещают нам систему авторизации и хранения информации о пациенте, включая информацию по его геному.

3. https://tierion.com/ (хз)

Создание шифрованной распределенной базы данных записей о пациентах поверх блокчена Биткоина.

4. http://www.2.forms.healthcare.philips.com/blockchainlabs (Амстердам)

Филипс Хелсвэр создал в Амстердаме лабораторию по изучению блокчейна в сфере медицины. Заявляют, что будут работать опять же в области хранения данных о пациенте http://www.coinspeaker.com/2016/03/04/philips-healthcare-division-launches-blockchain-research-lab-in-amsterdam/

5.https://www.hyperledger.org/industries/healthcare

HLHC (Hyperledger Healthcare Working Group) — рабочая группа нашумевшего в последнее время проекта Hyperledger, которая будет заниматься проектами медтеха на блокчейне.

Вообще вокруг блокчейна, как вокруг любой новой технологии, очень много чуши. Проекты прямо соревнуются за звание "самое непонятное описание проекта", кругом какие то рабочие группы, исследовательские лаборатории. Никто ничего не понимает, но все делают очень умные лица :) Стоит только почитать вот такие статьи http://www.cio.com/article/3041641/health/person-centric-healthcare-amplified-by-blockchain.html

А вообще, вот мой топ идей по применению блокчейна в медицине:

1. Распределенная база данных всех записей о пациенте. Человек может дать токен доступа только конвретному врачу, который с ним работает.

2. Распределенная БД всех клинический исследований в мире.
Соединение с пунктом 1 — подбор наиболее подходящих пациентов под конкретное КИ в глобальной базе данных по всему миру

3. Система отслеживания подлинности любой фармы. Глобальная БД всех выпущенных препаратов.

#yandex #conference

В этом году многим знакомая и любимая Yet another Conference от Яндекса расширится блоком о технологиях в медицине. Выступать будет Бобук (@addmeto), а это значит что нас точно ждет рассказ про AI и нейронки :)

Учитывая большую редкость подобных мероприятий в России (не беря в рассчет круглые столы по фитнес браслетам и выступления на тему "10 главных поисковых запросов в медицине") посетить строго рекомендую всем, кто увлекается медтехом и IT в медицине в частности.

Регистрация тут https://events.yandex.ru/events/yac/30-may-2017/

#oncotech #AI #google

Продолжим знакомство с проектами машинного интеллекта у крупнейших IT гигантов. На очереди Google.

В прошлом году Alphabet (aka Google) запустили проект DeepMindHealth https://deepmind.com/applied/deepmind-health/ , который занимается развитием технологий AI в медицине.

Интересен подход гугла. Они не пытается изобрести мудрого робота-врача, а концентрируются на конкретных проблемах, которые способны решить с помощью ML уже сейчас.

ключевых направления сейчас 2:

1. Скрининг заболеваний глаз на ранней стадии http://www.theverge.com/2016/7/5/12095830/google-deepmind-nhs-eye-disease-detection

Я ничего не понимаю в офтальмологии, но везде пишут, что сетка будет анализировать "digital scans" тысяч пациентов и выявлять признаки начинающейся "age-related macular degeneration and diabetic retinopathy"

Задача классная и понятная для ML — есть тысячи сканов (см. видео) а людей столько нет для анализа этих данных.

2. Планирование радиотерапии https://www.engadget.com/2016/08/31/google-deepmind-health-neck-head-cancer-treatment/

Проблема лучевой терапии головы состоит в том, что она должна быть ювелирной. количество тонких структур и нервов огромное. лучевая терапия должна быть тщательно спланирована и гарантировать, что никакие здоровые структуры не будут повреждены в процессе. Составление карты облучения — сложная задача для врача и занимает порядка 4 часов.

Алгоритмы ML способны значительно ускорить процесс сегментации, сохраняя при этом максимальную точность.

Ни у вообще, кто увлекается ML, советую посмотреть поближе https://deepmind.com, если вдруг не знали ;)