بچه ها این کارآموزی‌ها رو میخواستیم تابستون امسال هم بگذاریم، منتهی همونطور که میدونین، تابستون مراکز دولتی و دانشگاه‌ها، به خاطر بحث انرژی و نبود سیستم سرمایشی اغلب تعطیل بودن



به همین جهت نشد که توی تابستون بگذاریم...


زمان شروع‌شون از همین یکی ۲ هفته پیش رو هست (امکان جا به جایی برای بعد از امتحاناتتون هم هست)، اما با توجه به محدودیت فضا و کنترل ترافیک در آزمایشگاه‌ها، نمی‌تونیم تعداد زیادی رو بپذیریم، بنابراین فقط می‌تونیم در خدمت دوستانی باشیم که زودتر اعلام کنن و ثبت‌نامشون رو انجام بدن.



چون احتمال میدم خیلی از عزیزان درگیر کلاس‌های دانشگاه باشن و مثلا صبح‌ها تا یه ساعتی نتونن بیان، اما مشتاقن که وارد این مرکز تحقیقات بشن و تجربه کسب کنن، امکان تعریف یک برنامه متناسب با ساعتی که بتونین بیاین هم توی بعضی از مدل‌های کارآموزی‌ها هست.



حتما نوتیف مربوط به آغاز ثبت نام رو بهش توجه ویژه کنین

مقاله جالبیه


https://www.nature.com/articles/s41467-024-55115-y

پاسخ به چندتا از این سوالاتی که ارسال کرده بودین رو ضبط کردم، به جای یوتیوب خودم توی یوتیوب دایا میذاریمشون چون سوالاتی بودن که به کمک جامعه بزرگ تری میتونه بیاد...

اولیش در مورد این هست که چطوری موضوع پایان نامه انتخاب کنیم برای ارشد و یا علاقه پژوهشی رو پیدا کنیم

یکی از دوستان گفته بودن که یه گروه تلگرامی برای پرسش و پاسخ علمی داشته باشیم، حقیقتش من تجربه خوبی از این گروه ها ندارم چون بعد از یه مدت تبدیل میشه به محل تبلیغات و برای خیلی از بچه ها آزار دهنده میشه...


به جاش یه سری جلسات پرسش و پاسخ آنلاین و مشاوره‌ای میتونیم داشته باشیم...



امشب احتمالا بتونیم یه جلسه مشاوره بذاریم اگه کارام تموم بشه به موقع...


طرفای ساعت ۹ یه لینک میذارم اینجا اگه تایمتون آزاد بود بیاین و در مورد چالش هایی که دارین کمی گپ بزنیم...


اگه این جلسات مفید باشن یه تایم دائمی براشون میتونیم در نظر بگیریم...

چند دقیقه دیگه لینک جلسه رو همینجا میفرستم

تایم جلسه ماکزیمم سعی میکنیم ۴۵ دقیقه باشه، اگه میخواین جوین شین توی این حد فاصل بیاین حتما 😅

اولین ویدئوی پرسش و پاسخ بعد از ۳ روز توی یوتیوب آپلود شد 😒



https://youtu.be/CsfqIvfYxqs?si=FyLt0jxCF7kenxjo

فقط اگه می‌دونستین روزانه چقدر کتابخانه، کارهای تخصصی و آنالیزای جدید تحت R معرفی میشن، همین الان آب دستتونه میذاشتین زمین میرفتین آموزششو شروع میکردین...

جدی این اواخر یه چیزایی دارم ازش میبینم که از پیشرفتی که توی این چند سال اخیر داشته واقعا متحیرم...


جدی بگیرینش...
خیلی خیلی جدی بگیرینش...

⭕️ توی سال ۲۰۲۵، Spatial Omics خیلی خیلی جدی‌تر میشه...


حتی ژورنال Nature methods روش Spatial Proteomics رو به عنوان Method of the year 2024 انتخاب کرده



چند ماه قبل در مورد Spatial trannoscriptomics توی این ویدئو صحبت کرده بودم

در مورد آنالیز اُمیکس‌های مختلف مثل Spatial و موارد اینچنینی سوال پرسیده شد و گفتم اینجا توضیح بدم براتون:


چون این مدل آنالیزها، کارهایی هستن که ممکنه خیلیا نرن سمتش (به خاطر ناآشنا بودن با اتمسفرشون بیشتر)، هنوز تصمیمی بر اینکه بخوام براشون یه کورس ضبط کنم نگرفتم...



انقدر آنالیزهای بیوانفورماتیکی داریم که میشه توی R انجام داد که تولید مداوم درسنامه برای تک تکشون یکم زمانبر هست...


البته که ما چند ماه قبل یه برنامه به نام Omics Master برگزار کردیم که انواع این آنالیزها رو پوشش میداد. برنامه آنلاین بود و خصوصی


اگه علاقمندان به آنالیزهای تحت R زیاد بودن، مجددا شاید مشابه این برنامه رو برگزار کنم (یه سری مباحث که خیلی خاص‌تر هستن، نیاز به فیدبک و علاقه شما داره که براشون آموزشی رو ارائه بدیم)...



اگه دوست داشتید تخصصی این مباحث رو یاد بگیرین، لطفا توی همین تلگرام یا اینستاگرام بهم بگین که ببینم چند نفر علاقمند هستن...

چند ماه پیش که با دوستان در انجمن RSG ایران گپ و گفتی داشتیم، از برنامه شون برای فراهم کردن یک بستر پژوهشی رایگان گفتن که توی اون دانشجوها بتونن برای پروژه‌های بیوانفورماتیکی و محاسباتی اپلای کنن.


ازونجایی که چند سالی هست که خودم سعی کردم به شیوه‌های مختلف شرایطی رو ایجاد کنم که دانشجوهای مشتاق به پژوهش بتونن وارد این دنیا بشن (حالا چه منتورشیپ چه حالت‌های دیگه)، به نظرم کار با ارزشی اومد، چون یه فرصت عالی و البته رایگان رو برای شبکه سازی با اساتید و دانشجویان در سراسر دنیا ایجاد میکنه و در مقیاس بزرگی هم قرار هست که برگزار بشه.


پروژه‌ای که من برای این همکاری تعریف کردم، مبتنی بر سیستمز بیولوژی و اختصاصا تلفیق داده‌های Bulk RNAseq و Single-cell RNAseq هست.


اگه مشتاق این همکاری بودین، می‌تونین از طریق وبسایت موجود در پیام بالا، برای این پروژه اپلای کنید.

مجددا توصیه میکنم امسال Spatial Omics رو خیلی خیلی جدی بگیرین... اخبار و مطالعات زیادی در موردش داره منتشر میشه...


همین الان R یا پایتون رو شروع کنین (ترجیحا R) و بعد از تسلط به خود زبان، برین سراغ آنالیزهای پایه اُمیکس و متعاقبا، Spatial Omics...


این تکنولوژی خیلی خیلی زود فراگیر میشه و یادگیریش از الان، مفید هست...

بچه ها ممنون بابت فیدبکتون به این پیام


درخواست‌هاتون برای این آموزش به اندازه‌ای بود که یه فکرایی براش کنم


اسمش رو گذاشتم برنامه R for life sciences


آنالیزهای مهم زیستی به علاوه آنالیز انواع داده‌های امیکس مثل ترانسکریپتوم، پروتئوم و... رو پیش خواهیم برد.


فقط مطمئن نیستم که با چه شیوه‌ای بهتر هست که برگزار بشه...


اگه دوست دارید توی این برنامه شرکت کنید ممنون میشم نظرتون رو توی نظرسنجی بعد ثبت کنید که بهتر بتونیم این برنامه رو پیش ببریم

ممنون از شرکت توی نظرسنجی


آموزش R for Life Science مجموعا ۲۰ فصل شد


از آنالیز انواع امیکس مثل ترانسکریپتوم‌های مختلف گرفته تا NGS و پروتئوم و حتی Mulit-Omics data integration... و صد البته که یه عالمه آنالیزهای خاص و Workflow های تخصصی


هرچی خودم توی چند سال اخیر کار کردم و مسلط شدم رو میخوام داخلش بذارم دیگه 😂

توی فصل Workflow های تخصصی، یه عالمه پروتکل به شکل پروژه محور رو قرار دادم


یعنی با ترکیب آنالیزهای مختلفی که توی فصل‌های قبلش یاد گرفتین چه مدل پروژه‌ای رو میشه انجام داد


این بزرگترین چالش برای دانشجوهایی هست که تازه وارد دنیای R و آنالیزهای تخصصیش میشن. براشون این ابهام وجود داره که خب من الان چطوری ازین آنالیز استفاده کنم. قبلش چی انجام بدم خوبه، بعدش برای تایید نتایجم چه آنالیزی استانداردتره