در مورد آنالیز اُمیکس‌های مختلف مثل Spatial و موارد اینچنینی سوال پرسیده شد و گفتم اینجا توضیح بدم براتون:


چون این مدل آنالیزها، کارهایی هستن که ممکنه خیلیا نرن سمتش (به خاطر ناآشنا بودن با اتمسفرشون بیشتر)، هنوز تصمیمی بر اینکه بخوام براشون یه کورس ضبط کنم نگرفتم...



انقدر آنالیزهای بیوانفورماتیکی داریم که میشه توی R انجام داد که تولید مداوم درسنامه برای تک تکشون یکم زمانبر هست...


البته که ما چند ماه قبل یه برنامه به نام Omics Master برگزار کردیم که انواع این آنالیزها رو پوشش میداد. برنامه آنلاین بود و خصوصی


اگه علاقمندان به آنالیزهای تحت R زیاد بودن، مجددا شاید مشابه این برنامه رو برگزار کنم (یه سری مباحث که خیلی خاص‌تر هستن، نیاز به فیدبک و علاقه شما داره که براشون آموزشی رو ارائه بدیم)...



اگه دوست داشتید تخصصی این مباحث رو یاد بگیرین، لطفا توی همین تلگرام یا اینستاگرام بهم بگین که ببینم چند نفر علاقمند هستن...

چند ماه پیش که با دوستان در انجمن RSG ایران گپ و گفتی داشتیم، از برنامه شون برای فراهم کردن یک بستر پژوهشی رایگان گفتن که توی اون دانشجوها بتونن برای پروژه‌های بیوانفورماتیکی و محاسباتی اپلای کنن.


ازونجایی که چند سالی هست که خودم سعی کردم به شیوه‌های مختلف شرایطی رو ایجاد کنم که دانشجوهای مشتاق به پژوهش بتونن وارد این دنیا بشن (حالا چه منتورشیپ چه حالت‌های دیگه)، به نظرم کار با ارزشی اومد، چون یه فرصت عالی و البته رایگان رو برای شبکه سازی با اساتید و دانشجویان در سراسر دنیا ایجاد میکنه و در مقیاس بزرگی هم قرار هست که برگزار بشه.


پروژه‌ای که من برای این همکاری تعریف کردم، مبتنی بر سیستمز بیولوژی و اختصاصا تلفیق داده‌های Bulk RNAseq و Single-cell RNAseq هست.


اگه مشتاق این همکاری بودین، می‌تونین از طریق وبسایت موجود در پیام بالا، برای این پروژه اپلای کنید.

مجددا توصیه میکنم امسال Spatial Omics رو خیلی خیلی جدی بگیرین... اخبار و مطالعات زیادی در موردش داره منتشر میشه...


همین الان R یا پایتون رو شروع کنین (ترجیحا R) و بعد از تسلط به خود زبان، برین سراغ آنالیزهای پایه اُمیکس و متعاقبا، Spatial Omics...


این تکنولوژی خیلی خیلی زود فراگیر میشه و یادگیریش از الان، مفید هست...

بچه ها ممنون بابت فیدبکتون به این پیام


درخواست‌هاتون برای این آموزش به اندازه‌ای بود که یه فکرایی براش کنم


اسمش رو گذاشتم برنامه R for life sciences


آنالیزهای مهم زیستی به علاوه آنالیز انواع داده‌های امیکس مثل ترانسکریپتوم، پروتئوم و... رو پیش خواهیم برد.


فقط مطمئن نیستم که با چه شیوه‌ای بهتر هست که برگزار بشه...


اگه دوست دارید توی این برنامه شرکت کنید ممنون میشم نظرتون رو توی نظرسنجی بعد ثبت کنید که بهتر بتونیم این برنامه رو پیش ببریم

ممنون از شرکت توی نظرسنجی


آموزش R for Life Science مجموعا ۲۰ فصل شد


از آنالیز انواع امیکس مثل ترانسکریپتوم‌های مختلف گرفته تا NGS و پروتئوم و حتی Mulit-Omics data integration... و صد البته که یه عالمه آنالیزهای خاص و Workflow های تخصصی


هرچی خودم توی چند سال اخیر کار کردم و مسلط شدم رو میخوام داخلش بذارم دیگه 😂

توی فصل Workflow های تخصصی، یه عالمه پروتکل به شکل پروژه محور رو قرار دادم


یعنی با ترکیب آنالیزهای مختلفی که توی فصل‌های قبلش یاد گرفتین چه مدل پروژه‌ای رو میشه انجام داد


این بزرگترین چالش برای دانشجوهایی هست که تازه وارد دنیای R و آنالیزهای تخصصیش میشن. براشون این ابهام وجود داره که خب من الان چطوری ازین آنالیز استفاده کنم. قبلش چی انجام بدم خوبه، بعدش برای تایید نتایجم چه آنالیزی استانداردتره

سلام دوستان، در مورد بحث کارآموزی‌ها که توی روزهای قبل پیامش رو گذاشتم امروز مرکز بهم شرایطشون رو ارائه دادن


⭕️ در حال حاضر برای ثبت نام توی این کارآموزی‌ها می‌تونین درخواست بدین:

- کارآموزی Real-time PCR (دو هفته)
- کارآموزی کشت سلول‌های جانوری (سه هفته)
- کارآموزی بیوانفورماتیک (یک ماهه و سه ماهه)


✅ در تمام مدت زمان کارآموزی از صبح تا پایان ساعت اداری مثل سایر دانشجوها و پرسنل میتونین تشریف بیارین توی مرکز...



⭕️ جهت حفظ کیفیت و بازدهی ظرفیت هرکدوم از مواردی که گفتم توی هر دور فقط ۲ تا ۳ نفر هست... پس هرچی سریع‌تر ثبت نام داشته باشید، سریع‌تر می‌تونید شروع کنید.



خواهش کردم بچه‌هایی که میان واقعا خودشون کارها رو انجام بدن و صرفا Observe نباشن یا کار با مواد فیک نباشه، به خاطر همین قرار شد که متریال هرکدوم از تست‌ها خریداری بشه یا از موجودی مرکز در اختیار بچه‌ها قرار بگیره که بتونن تست‌ها رو در شرایط واقعی و با حالت‌های مختلف انجام بدن

مباحث دیگه مثل کلونینگ، فلوسایتومتری و... رو هم بعد از نهایی شدن قرار میدم

برای کسب اطلاعات بیشتر، لطفا اسم کارآموزی که مدنظرتون هست رو به پشتیبانی تلگرام دایا ارسال بفرمایید تا جهت ثبت نام راهنمایی لازم رو خدمتتون ارسال کنن


@dayazf_support



✅ محل کارآموزی:

مرکز تحقیقات سرطان شناسی، دانشکده پزشکی، علوم پزشکی شیراز

اومدم DeepSeek R1 رو لوکالی روی لپ تاپ نصب کردم، اصن نگم براتون...


خیلی خوبهههه


مدل‌های اوپن سورس رو میتونین رایگان نصب کنین روی سیستم‌هاتون و آفلاین استفاده کنین


دیگه بدون نت و VPN و بدون حتی نیاز به خرید اشتراک ChatGPT به یه مدل خفن دسترسی دارم 😅😅


خدایا شکرت

کظم غیظ کردم و پیام قبلی رو پاک کردم :))) بیاین مقاله R1 رو بخونین کیفشو ببرین

بچه ها مرسی بابت استقبالتون از کارآموزی‌ها، ما هنوز توی شبکه‌های اجتماعی دایا اطلاع رسانی رو شروع نکردیم 😅

برای تایم‌های قبل از عید، کشت سلول تکمیل شد ❤️


- برای ریل تایم یه دونه خالی مونده
- برای بیوانفورماتیک هم ۲ نفر فقط مونده



⛔️ با توجه به اینکه بعد از عید ممکنه شرایط مرکز کمی تغییر کنه، یا دانشگاه مدتی محدودیت بذاره به خاطر بحث انرژی، توصیه میکنم از این چند ظرفیت باقی مونده غافل نشین

سلام عزیزان،
وقت همگی بخیر
پیرامون موضوعات جدید کارآموزی که خدمتتون گفته بودم به زودی فعال میشن، یه کارآموزی جدید در مرکز پذیرش داره


✅ کارآموزی تکنیک‌های پرکاربرد مهندسی ژنتیک شامل:

- استخراج نوکلئیک اسید
- PCR
- الکتروفورز
- کلونینگ ژن


چون یه مجموعه تکنیک پایه‌ای هست، برای کسایی که تسلط زیادی روی این مباحث ندارن میتونه خیلی کاربردی باشه


محل کارآموزی هم آزمایشگاه تحقیق و توسعه در مرکز تحقیقات سرطان شناسی شیراز هست


برای ثبت نام لطفا به این آیدی یه پیام بدین (چون ظرفیتش زیاد نیست توصیه میکنم اگر مشتاق بودین زودتر اقدام کنید)

@Dayazf_Support

کارآموزی‌های جدید:

- برنامه نویسی R با رویکرد زیستی
- برنامه نویسی پایتون با رویکرد زیستی
- سیستمز بیولوژی سرطان (با محوریت انجام پژوهش واقعی در کنار کارآموزی)

سلام عزیزان، برای رزرو این کارآموزی‌های جدید لطفا با پشتیبانی در ارتباط باشید


هر ۳ مورد حضوری در مرکز تحقیقات سرطان شناسی هستن


@Dayazf_Support