С Новым годом🎄

☝️☝️☝️
На Биомолекуле вышел мой новый дайджест, в котором есть мой любимчик.
Это статья о том, что дофамин, серотонин и гистамин — не просто молекулы, которые сигналят клеткам снаружи, но и управляют процессами изнутри.

Буквально недавно я писала для Элементов о работе лаборатории Бенджамина Динана, которая подробно изучила процессы серотонилирования (присоединения серотонина) гистонов в головном мозге и его опухолях. Это была первая работа, которая реально увязала это с физиологическими процессами и тем более заболеванием.

В пятницу я в этой лабе ещё и побывала по работе!
И это, надо сказать, улёт! Ты их читал, ты пёрся с методологии и подхода, и вот видишь, что обычная такая лаба, ничего супер-пупер, просто крутые мозги и прямые руки.

А эта статья уже от другой лаборатории, которая сначала как раз нашла, что серотонин присоединяется к гистонам, а сейчас понимает, что много что в мозгу может. И тот же гистамин присоединяется в зависимости от времени суток и активности организма.

В общем, это крутейшее направление, и я ожидаю ещё больше статей, которые покажут, как же это все регулирует наш мозг, и можно ли это как-то использовать для того, чтобы лечить нейрологические и психиатрические заболевания

История о том, как я получаю образцы пациентов с острым миелоидным лейкозом из MD Anderson.

Я не знаю почему звук на столько ужасен.

В общем, коротко:

Я получаю образцы пациентов с острым миелоидным лейкозом от коллабораторов из MD Anderson. Для этого мне нужно просто перейти через дорогу и забрать их у лаборанта.

Мне нужны образцы от пациентов с определенными мутациями, поэтому коллабораторы присылают мне список образцов, которые будут получены на этой неделе. Они зашифрованы. То есть только номер и список мутаций.

В общем, часто бывает так, что номер на пробирке не соответствует номеру в файле, скорее всего потому что на пробирке клинический ID, а в файле ID биобанка.

Но сегодня произошла невероятная ситуация. Я заказала 1 образец, а мне вынесли 4 😀 и конечно, же они не знают, что это за образцы, потому что они уже убрали фамилии…

Друзья, начинаем стрим через 10 минут
https://youtube.com/live/moSUxelG1tI

Мой основной проект в лаборатории посвящен кооперации мутантных белков в остром миелоидном лейкозе. Я изучаю эпигенетический ландшафт и хроматин клеток, которые приобрели только первую мутацию, и сравниваю с параметрами в лейкозных бластах с тремя мутациями. Для начала нужно было сделать ту самую мышиную модель с тремя мутациями, которые я могу последовательно «включать». И модель получилась!

Научная работа как в кино.

Недавно со мной случилось то, о чем я мечтала всю свою жизнь, даже не зная об этом.

Я сейчас делаю эксперименты для статьи, чтобы ответить на комментарии рецензентов, которые прислали нам 5 страниц вопросов.

И несколько экспериментов, которые они хотят от нас, очень технически сложные. Собственно, поэтому мы их и не сделали, потому что никто не делал такого для нас и никакого прокола нет.

В общем, один из экспериментов это хитрый DNA FISH, не буду рассказывать в чем именно его прикол, так как это часть статьи и не часть этой истории.

А история в том, что я мучала этот прокол 2 недели, без остановки, меняя параметры на разных этапах, добавляя и убавляя что-то.

Сначала получился сам FISH, но не получился наворот; потом получился наворот, но не получился FISH; и вот в один момент…

Темная комната. Фокусировка микроскопа. Первый срез, второй, третий, вижу ДНК локус, переключается канал, вижу вторую вещь в нужном месте. Зову профессора-коллаборатора. Просматриваем слайд. Направо. Налево. Вверх. Вниз. Не верим своим глазам. Зовем моего босса (боссиню 😀):

- Да, это оно. Пора писать ответы рецензентам.

Почему каждый раз, когда я что-то пишу (грант, статью), после мысли «ну остался часик», я не вставая пишу еще три дня

У нашей лабы вышла статья в Nature, демонстрирующая, что:

Гемопоэтическая стволовая клетка (HSC) и мультиполентная клетка-предшественница (MPP) это две разные популяции на вершине кроветворной системы.

Уровень клональной экспансии (=деление клеток с определенной мутацией) у лабораторных мышей намного ниже чем у человека и клоны могут быть обнаружены только с помощью сверх-чувствительных методов секвенирования.

В общем и целом, это модель клональной эволюции кроветворной системы мышей с возрастом.

Над чем я работала за компом за последние несколько месяцев:

Октябрь - заявка на стипендию

Ноябрь - рецензирование (я ревьюер) двух больших статей

Декабрь - ничего (вроде бы)

Январь - заявка на стипендию

Февраль - заявка на стипендию + рецензия (я соавтор) статьи

Март - комментарий на статью для журнала + рецензия (я соавтор) статьи

Хочу делать больше экспериментов 🥹

Не прошло и недели, а у нас новая статья.

Приятно в кои-то веки быть просто соавтором и не нести ответственность за написание текста, выравнивание картинок, коммуникацию с другими людьми. Постараюсь рассказать в следующем посте о чем исследование.

Расскажу про эту статью, когда выйдет сам выпуск с доступом к полному тексту!