Forwarded from Alexander Slesarev
scientific reasons: napizdeli
A Certain Scientific Impostor
Продолжаем разговор о чудесах #flow_chemistry Красивый и технологичный процесс дифторметилирования альфа-аминокислот разработали в группе Kappe в 2018 году. А потом доработали его до блеска в приложении к производству Эфлорнитина - первого препарата на рынке…
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
#flow_chemistry
На видео не что иное, как гирлянда из микрофлюидных чипов.
(спонсор новогоднего настроения - центр трансфера технологий flow chemistry "РИТМ" на базе МИТХТ)
К слову, именно они делали НИР по трансферу в промышленность производства эфлорнитина.
Мы же тоже планируем делать с ними одну из ключевых стадий получения нашего противотуберкулезного препарата, потому что литиорганику чрезвычайно привлекательно замасштабировать в чипах и уйти совсем от batch- процессов с металлоорганикой.
На видео не что иное, как гирлянда из микрофлюидных чипов.
(спонсор новогоднего настроения - центр трансфера технологий flow chemistry "РИТМ" на базе МИТХТ)
К слову, именно они делали НИР по трансферу в промышленность производства эфлорнитина.
Мы же тоже планируем делать с ними одну из ключевых стадий получения нашего противотуберкулезного препарата, потому что литиорганику чрезвычайно привлекательно замасштабировать в чипах и уйти совсем от batch- процессов с металлоорганикой.
Forwarded from molecular porn
Ассоциации для запоминания однобуквенных обозначений аминокислот
Согласно номенклатуре, для аминокислот, у которых первая буква не совпадает с первой буквой остальных, она и используется для обозначения: Сysteine, Histidine. Isoleucine, Methionine, Serine, Valine. Две или больше аминокислот начинаются с букв A, G, L, P и T. Эти буквы были зарезервированы за самыми часто встречающимися и простыми по структуре аминокислотами: Alanine, Glycine, Leucine, Proline, Threonine.
Аргинин и фенилаланин обозначили буквами R и F, соответственно, по фонетической ассоциации. Действительно легко запомнить.
Триптофан окрестили буквой W, потому что его боковая цепь с двумя кольцами такая же большая, как эта буква. Авторская альтернативная ассоциация: triptophan созвучен trip-to-fun, а трип/путь к веселью действительно по траектории может ассоциироваться с буквой W, похожей на американские горки.
Основная сложность возникает с запоминанием остальных аминокислот. Их назвали просто красивыми буквами без определенных ассоциаций: N - asparagine, D - aspartic acid, Q - glutamine, E - glutamic acid, K - lysine, Y - tyrosine. Вот что выдумала, чтобы запомнить:
Нужно запомнить, какие две буквы обозначают пару кислота-амид: N+D для аспарагина+аспарагиновой кислоты и Q+E для глутамина+глутаминовой кислоты. То что EQ вместе, можно запомнить по ассоциации с эмоциональным интеллектом (EQ, по аналогии с IQ). В моем универе несколько курсов посвящено EQ и софт скиллам, поэтому у меня легко возникла ассоциацияи задергался глаз. К тому же глутамат, в отличие от аспартата, является нейромедиатором и к когнитивным делам имеет прямое отношение. Для запоминания ND выберите, что вам ближе: Non Disclosure, NoDe, Napalm Death, НаДя, NuDes, NanoDrop, whatever.
Кто есть кто в каждой паре: аспарагиN обозначается своей последней буквой, к тому же буква N в английских названиях asparagine и aspartic acid есть только в амиде. С глутамином и глутаминовой кислотой не придумала ничего лучше, чем то, что первая буква в acid и E - гласные, поэтому glutamic acid - это E, глутамат - Q.
То что L обозначает leucine, а не lysine (который K), можно запомнить по тому, что у лейцина есть брат изолейцин, и они оба обозначаются первыми буквами.
Tyrosine обозначается Y, потому что в нём есть эта буква. Забавно, что tyrosine читается как тайросин, тай - это галстук, и буква Y в какой-то степени на него похожа.
Согласно номенклатуре, для аминокислот, у которых первая буква не совпадает с первой буквой остальных, она и используется для обозначения: Сysteine, Histidine. Isoleucine, Methionine, Serine, Valine. Две или больше аминокислот начинаются с букв A, G, L, P и T. Эти буквы были зарезервированы за самыми часто встречающимися и простыми по структуре аминокислотами: Alanine, Glycine, Leucine, Proline, Threonine.
Аргинин и фенилаланин обозначили буквами R и F, соответственно, по фонетической ассоциации. Действительно легко запомнить.
Триптофан окрестили буквой W, потому что его боковая цепь с двумя кольцами такая же большая, как эта буква. Авторская альтернативная ассоциация: triptophan созвучен trip-to-fun, а трип/путь к веселью действительно по траектории может ассоциироваться с буквой W, похожей на американские горки.
Основная сложность возникает с запоминанием остальных аминокислот. Их назвали просто красивыми буквами без определенных ассоциаций: N - asparagine, D - aspartic acid, Q - glutamine, E - glutamic acid, K - lysine, Y - tyrosine. Вот что выдумала, чтобы запомнить:
Нужно запомнить, какие две буквы обозначают пару кислота-амид: N+D для аспарагина+аспарагиновой кислоты и Q+E для глутамина+глутаминовой кислоты. То что EQ вместе, можно запомнить по ассоциации с эмоциональным интеллектом (EQ, по аналогии с IQ). В моем универе несколько курсов посвящено EQ и софт скиллам, поэтому у меня легко возникла ассоциация
Кто есть кто в каждой паре: аспарагиN обозначается своей последней буквой, к тому же буква N в английских названиях asparagine и aspartic acid есть только в амиде. С глутамином и глутаминовой кислотой не придумала ничего лучше, чем то, что первая буква в acid и E - гласные, поэтому glutamic acid - это E, глутамат - Q.
То что L обозначает leucine, а не lysine (который K), можно запомнить по тому, что у лейцина есть брат изолейцин, и они оба обозначаются первыми буквами.
Tyrosine обозначается Y, потому что в нём есть эта буква. Забавно, что tyrosine читается как тайросин, тай - это галстук, и буква Y в какой-то степени на него похожа.
Forwarded from Zmall Pharma
Многие бизнесмены-кабанчики ревут белугой от того, что долгие годы они действовали по схеме: куплю за дофигаллион - через неделю продам за два. Без всяких вложений в производство и разработки, без всяких долговременных инвестиций. Ведь вложенный дофигаллион, если он вложен в R&D, даёт дофигаллиард через год-два. Как было в известной поговорке - "весна покажет, кто где срал". Так и сейчас - умрут перепродажные конторки, но выстоят те, у кого есть своё производство в России.
Много вакансий. Моя нынешняя организация (НИИ СБМ Роспотребнадзора) расширяется. Рекомендую обратить внимание!
Forwarded from Вакансии НИИ Cистемной Биологии и Медицины Роспотребнадзора
Мы ищем коллег!
Во вновь организованный Институт Системной Биологии и Медицины Роспотребнадзора (НИИ СБМ) требуются квалифицированные сотрудники с опытом работы. На данный момент у нас открыто сразу несколько вакансий. Находимся по адресу г. Москва, Научный проезд, д. 18. Это рядом с м. Калужская, 10 минут пешком. У нас действительно хороший приборный парк и условия труда.
—Вакансия №1—
В Лабораторию простых систем НИИ СБМ требуется опытный сотрудник-специалист в области энзимологии и биохимии для реализации проектов по синтетической биологии. Необходимо знание термодинамики, кинетики реакций (сложные случаи с несколькими субстратами, ингибированием процесса продуктами реакции, и т.п.) как для теоретических вычислений, так и для реализации их на практике (кинетика, подбор условий, буферов, определение констант, и т.п.). Особый упор на определение констант скорости. Руководители направления: академик В.М. Говорун и к.б.н. Матюшкина Д.С. Молодой междисциплинарный коллектив. Конкурентная в рамках научного и Хим/Биотех-R'n'D рынков заработная плата.
Присылать мотивационное письмо и резюме Матюшкиной Дарье Сергеевне:
d.matyushkina@gmail.com
—Вакансия №2—
В Центр масс-спектрометрии и геномики НИИ СБМ требуется сотрудник, который будет заниматься разработкой протоколов секвенирования на BGI и ONT. Проводить внедрение этих протоколов в практику (доведение до потока, при необходимости). В том числе, тестирование реагентов от новых поставщиков.
Необходим опыт работы с какой-нибудь NGS платформой обязателен (ну, скажем, от года), подтвержденный публикациями или патентами. Знание принципов работы секвенаторов — преимущество (если заявитель скажет, что знает — проверим :)). Опыт анализа данных NGS и статистической работы с массивами данных, хотя бы минимальный — желательно. Высокая мотивация разбираться в методах и протоколах - обязательно. Степень — преимущество.
Присылать мотивационное письмо и резюме Сперанской Анне Сергеевне:
hanna.s.939@gmail.com
—Вакансия №3—
В Центр масс-спектрометрии и геномики НИИ СБМ требуется сотрудник-специалист по подготовка библиотек к секвенированию по заданным протоколам. Опыт работы в мол.биол. лаборатории — минимальный нужен, совсем без опыта не возьмем. Высокая мотивация разбираться в принципах используемых методов (прежде всего, самостоятельно) — обязательно! Готовность выдвигать обоснованные
предложения об использовании новых методов (и готовность потом эти предложения реализовывать) — желательно.
Присылать мотивационное письмо и резюме Сперанской Анне Сергеевне:
hanna.s.939@gmail.com
Во вновь организованный Институт Системной Биологии и Медицины Роспотребнадзора (НИИ СБМ) требуются квалифицированные сотрудники с опытом работы. На данный момент у нас открыто сразу несколько вакансий. Находимся по адресу г. Москва, Научный проезд, д. 18. Это рядом с м. Калужская, 10 минут пешком. У нас действительно хороший приборный парк и условия труда.
—Вакансия №1—
В Лабораторию простых систем НИИ СБМ требуется опытный сотрудник-специалист в области энзимологии и биохимии для реализации проектов по синтетической биологии. Необходимо знание термодинамики, кинетики реакций (сложные случаи с несколькими субстратами, ингибированием процесса продуктами реакции, и т.п.) как для теоретических вычислений, так и для реализации их на практике (кинетика, подбор условий, буферов, определение констант, и т.п.). Особый упор на определение констант скорости. Руководители направления: академик В.М. Говорун и к.б.н. Матюшкина Д.С. Молодой междисциплинарный коллектив. Конкурентная в рамках научного и Хим/Биотех-R'n'D рынков заработная плата.
Присылать мотивационное письмо и резюме Матюшкиной Дарье Сергеевне:
d.matyushkina@gmail.com
—Вакансия №2—
В Центр масс-спектрометрии и геномики НИИ СБМ требуется сотрудник, который будет заниматься разработкой протоколов секвенирования на BGI и ONT. Проводить внедрение этих протоколов в практику (доведение до потока, при необходимости). В том числе, тестирование реагентов от новых поставщиков.
Необходим опыт работы с какой-нибудь NGS платформой обязателен (ну, скажем, от года), подтвержденный публикациями или патентами. Знание принципов работы секвенаторов — преимущество (если заявитель скажет, что знает — проверим :)). Опыт анализа данных NGS и статистической работы с массивами данных, хотя бы минимальный — желательно. Высокая мотивация разбираться в методах и протоколах - обязательно. Степень — преимущество.
Присылать мотивационное письмо и резюме Сперанской Анне Сергеевне:
hanna.s.939@gmail.com
—Вакансия №3—
В Центр масс-спектрометрии и геномики НИИ СБМ требуется сотрудник-специалист по подготовка библиотек к секвенированию по заданным протоколам. Опыт работы в мол.биол. лаборатории — минимальный нужен, совсем без опыта не возьмем. Высокая мотивация разбираться в принципах используемых методов (прежде всего, самостоятельно) — обязательно! Готовность выдвигать обоснованные
предложения об использовании новых методов (и готовность потом эти предложения реализовывать) — желательно.
Присылать мотивационное письмо и резюме Сперанской Анне Сергеевне:
hanna.s.939@gmail.com
Ну и конечно же, куда без вакансии в синтезе пептидов - будем поднимать техпроцессы синтеза пептидных стандартов, синтеза олигонуклеотидов. Будет много интересной науки и технологии. Пишите!
UPD: ВАКАНСИЯ ЗАКРЫТА
#хантим #вакансия
В Лабораторию простых систем НИИ СБМ Роспотребнадзора, Москва, требуется химик-органик на синтез пептидов и/или олигонуклеотидов.
Руководители направления: академик В.М. Говорун и к.б.н. Матюшкина Д.С., к.х.н. Федоров О.В.
ЗП: Конкурентная в рамках научного и Хим/Биотех-R'n'D рынков заработная плата.
Обязанности:
Эксплуатация комплекса пептидного синтезатора, выполнение синтезов пептидных стандартов.
Выполнение синтезов исходных соединений, подготовка и очистка реагентов для пептидного синтеза.
Препаративная и аналитическая хроматография стандартов, контроль качества.
Анализ научной литературы.
Ведение лабораторной документации.
Требования:
- Опыт работы в синтетической лаборатории от трёх лет.
- Свободное чтение технической и научной литературы на английском языке.
- Желателен опыт твердофазного пептидного или олигонуклеотидного синтеза, но также рассматриваем кандидатов с опытом химика-синтетика, готовых пройти обучение за счёт организации.
- Базовые знания теории хроматографии.
- Обязательны готовность обучаться и повышать свою квалификацию.
- Уровень образования: высшее (магистратура, специалитет) + опыт работы в RnD/производстве/научной организации. или PhD.
Условия:
Молодой междисциплинарный коллектив. Сотрудники Центра высоко квалифицированы, активно публикуются. Обучение, повышение квалификации и обмен опытом в коллективе не просто приветствуются, а обязательны.
Широкий ассортимент задач, относящихся к области системной биологии, есть возможность принять участие в любом научном проекте Центра.
Присылать мотивационное письмо и резюме - к.х.н., с.н.с. Лаборатории простых систем НИИ СБМ Федорову Олегу Владимировичу:
ofedorov@pharm-sintez.ru
t.me/radical_subject
#хантим #вакансия
В Лабораторию простых систем НИИ СБМ Роспотребнадзора, Москва, требуется химик-органик на синтез пептидов и/или олигонуклеотидов.
Руководители направления: академик В.М. Говорун и к.б.н. Матюшкина Д.С., к.х.н. Федоров О.В.
ЗП: Конкурентная в рамках научного и Хим/Биотех-R'n'D рынков заработная плата.
Обязанности:
Эксплуатация комплекса пептидного синтезатора, выполнение синтезов пептидных стандартов.
Выполнение синтезов исходных соединений, подготовка и очистка реагентов для пептидного синтеза.
Препаративная и аналитическая хроматография стандартов, контроль качества.
Анализ научной литературы.
Ведение лабораторной документации.
Требования:
- Опыт работы в синтетической лаборатории от трёх лет.
- Свободное чтение технической и научной литературы на английском языке.
- Желателен опыт твердофазного пептидного или олигонуклеотидного синтеза, но также рассматриваем кандидатов с опытом химика-синтетика, готовых пройти обучение за счёт организации.
- Базовые знания теории хроматографии.
- Обязательны готовность обучаться и повышать свою квалификацию.
- Уровень образования: высшее (магистратура, специалитет) + опыт работы в RnD/производстве/научной организации. или PhD.
Условия:
Молодой междисциплинарный коллектив. Сотрудники Центра высоко квалифицированы, активно публикуются. Обучение, повышение квалификации и обмен опытом в коллективе не просто приветствуются, а обязательны.
Широкий ассортимент задач, относящихся к области системной биологии, есть возможность принять участие в любом научном проекте Центра.
Присылать мотивационное письмо и резюме - к.х.н., с.н.с. Лаборатории простых систем НИИ СБМ Федорову Олегу Владимировичу:
ofedorov@pharm-sintez.ru
t.me/radical_subject
A Certain Scientific Impostor
#music Доброй ночи. https://www.youtube.com/watch?v=SRmgAqyIweU
https://youtu.be/2TTsk7dX4AQ
ЯМР-спектрометристы: подержите наше пиво. Сейчас мы вам сыграем трек нашей молодости прямо на протонах.
Любопытно:
1) качество шиммирования можно легко оценить на слух (по скорости спадания фида)
2) как вам концепция услышать константу спин-спинового взаимодействия по частоте wah-wah осцилляций интенсивности в звуке фида мультиплета? Таймкод - 17:00
3) при достаточной сноровке можно понять на слух по фиду не только качество, но и общий вид спектра, примерное расположение групп сигналов. Ведь делать фурье-преобразование звукового сигнала для нашего мозга это рутинная работа.
Сложно удержаться от аналогии ЯМР эксперимента с этаким ударом крохотным молоточком по молекулярному камертону.
ЯМР-спектрометристы: подержите наше пиво. Сейчас мы вам сыграем трек нашей молодости прямо на протонах.
Любопытно:
1) качество шиммирования можно легко оценить на слух (по скорости спадания фида)
2) как вам концепция услышать константу спин-спинового взаимодействия по частоте wah-wah осцилляций интенсивности в звуке фида мультиплета? Таймкод - 17:00
3) при достаточной сноровке можно понять на слух по фиду не только качество, но и общий вид спектра, примерное расположение групп сигналов. Ведь делать фурье-преобразование звукового сигнала для нашего мозга это рутинная работа.
Сложно удержаться от аналогии ЯМР эксперимента с этаким ударом крохотным молоточком по молекулярному камертону.
Forwarded from SciHugs
Считаете вы свои ламповые квантовые расчеты (разумеется, DFT) и пьете чаек, пишете потом статью по результатам расчетов и радуетесь жизни. А скромный дедушка из Мэриленда радостно потирает ручки, потому что вы в очередной раз воспользовались результатами его научных трудов. Встречайте - Джон Пердью, самый цитируемый из ныне живущих физиков. Он в команде с другими наверняка не менее крутыми учеными разработал парочку-троечку приближений, которыми вы наверняка пользуетесь во время расчетов. Пожелаем же ему еще много лет и еще больше цитирований)
https://en.wikipedia.org/wiki/John_Perdew
https://en.wikipedia.org/wiki/John_Perdew
Wikipedia
John Perdew
American physicist
A Certain Scientific Impostor
Химиков органиков в нашем институте пока маловато, но молодёжные семинары открыты к посещению для коллег по области, поэтому приглашаем всех желающих. 30 мая в 19:00, НИИ СБМ Роспотребнадзора, Научный проезд, 18.
Выложили запись лекции на канале нашего института!
https://youtu.be/yZExm7utKko
https://youtu.be/yZExm7utKko
YouTube
III Молодёжный семинар НИИ СБМ: «Возможности современного пептидного синтеза на границах фаз»
III Молодёжный семинар НИИ СБМ
Докладчик:
Фёдоров Олег, Лаборатория простых систем НИИ СБМ
Тема:
«Возможности современного пептидного синтеза на границах фаз»
Аннотация:
Целью доклада является ознакомление слушателей с ключевыми современными подходами…
Докладчик:
Фёдоров Олег, Лаборатория простых систем НИИ СБМ
Тема:
«Возможности современного пептидного синтеза на границах фаз»
Аннотация:
Целью доклада является ознакомление слушателей с ключевыми современными подходами…
Forwarded from Computational and Quantum Chemistry
If you use ChemDraw - LEARN KEY COMMANDS! Save yourself hours of frustration and wasted time!
—
From https://twitter.com/That__Chemist
—
From https://twitter.com/That__Chemist
A Certain Scientific Impostor
Новый бложик импостера (<==) Да, тут назрел анонс - я сделал себе блог-визитку на Zola, она очень простая в освоении и сверхсветово-быстрая поскольку JS-free. Это генератор статических сайтов с Rust под капотом. Я ее рекомендую всем кому интересно запилить…
Благодаря моей послеотпускной прокрастинации сайт сегодня воскрес на новом домене https://radicalsubject.space/, заходите в гости.
Forwarded from Fett Schmackofatz
Закупил эфира перед пруф оф стейк алгоритмом, все ли правильно делаю пацаны?