Biostatistics on the Table – Telegram
Biostatistics on the Table
258 subscribers
91 photos
5 videos
1 file
102 links
Место, где ML расшифровывается как Maximum Likelihood
Download Telegram
Sample size calculations in randomised trials: mandatory and mystical

Clinically relevant difference: used in the theory of clinical trials as opposed to cynically relevant difference, which is used in practice.
(c) Stephen Senn
👍1💘1
Любимый фрагмент интервью с сэром Дэвидом Коксом
🔥4
Решил опубликовать хоть что-то, что может оказаться для кого-то полезным.

Я считаю, что отличным ресурсом для изучения прикладной статистики и анализа данных являются блоги. Некоторые из них по своей содержательности, качеству изложения и другим параметрам многократно превосходят большинство методологических статей, недавно вот и плагиат из такого блога в статью случился, что неудивительно.

Привожу список блогов, за которыми стараюсь следить или, как минимум, время от времени обращаться к публикациям в них. Этот список отражает мои личные интересы, даже не то, какие задачи мне приходится решать, поэтому он получился сильно смещенным, но все равно некоторые блоги рекомендую посмотреть хотя бы ради эстетического удовольствия.

Andrew Heiss ведет потрясающе красивый и очень полезный блог с акцентом на причинно-следственный вывод и байесовский анализ.

Solomon Kurz публикует блогпосты про байесовский анализ и смешанные модели, а также он проделал невероятную работу по переводу примеров из книг на tidyverse и brms.

Noah Greifer является разработчиком нескольких пакетов, благодаря которым, в том числе, R сложно с чем-то сравнить, а исключительно из его комментариев на stackoverflow и crossvalidated можно составить отличный полноценный учебник.

Gavin Simpson ведет блог с акцентом на обобщенные аддитивные модели, если вам неуютно находиться в линейном мире, но не хочется уходить из мира интерпретируемого, очень рекомендую к прочтению.

Darren Dahly ведет блог по биостатистике, общий замысел которого можно обозначить названием одной из его публикаций I’m not a real statistician, and you can be one too (NB! это блог не из разряда "статистика – это просто").

Demetri Pananos является уже real statistician, но по-моему очень понятно пишет про сложные байесовские модели.

Matthew Jané ведет блог с говорящим названием Meta-Analysis Magic, это как раз он подвергся плагиату, если вам кажется, что нет ничего круче методологии Cochrane, то советую заглянуть, чтобы убедиться в обратном.

Vincent Arel-Bundock является автором пакета {{marginaleffects}}, только ради которого стоит изучать R.

Wolfgang Viechtbauer ведет блог, который одновременно является расширенной документацией {{metafor}} – другого пакета, только ради которого стоит изучать R.

Jonathan Bartlett ведет блог, посвященный, в том числе, одной из незаслуженно игнорируемых тем – статистический вывод в условиях пропущенных значений.

Stephen Wild и Tristan Mahr публикуют классные примеры прикладного байесовского анализа с использованием R, Stan и Turing.jl.

Mattan Ben-Shachar является соавтором мета-пакета {{easystats}}, который я, честно говоря, почти не использую, но блог очень содержательный и охватывает много интересных и сложных тем.

Наконец блоги «классиков»: Frank Harrell и Andrew Gelman, которого, так совпало, можно сегодня поздравить с 20-летием блогинга! )
🔥7👍32🆒1
Forwarded from Maksim Kuznetsov
Вчера вечером наткнулся на учебник по статистике для экологов, решил полистать перед сном, в итоге листал до трех ночи. В итоге понял, что именно такого учебника мне всегда не хватало.
🔥6
Часто стало получаться так, что у меня в библиотеке есть книги Нобелевских лауреатов по экономике
Нобелевские лауреаты 2024: Дарон Аджемоглу, Джеймс Робинсон, Саймон Джонсон за изучение формирования институтов и их роли в процветании. Ура!
Biostatistics on the Table
Часто стало получаться так, что у меня в библиотеке есть книги Нобелевских лауреатов по экономике
Если про Why nations fail, думаю, знают многие, ещё вот такая книга переведена на русский язык
🔥4
Forwarded from Maksim Kuznetsov
Автор пакет marginaleffects драфт новой книги опубликовал
https://marginaleffects.com/
2
С нетерпением жду выхода новых видео на канале ritvikmath, с тех пор как на него наткнулся. Честно говоря, я никогда не задумывался, что доказательство валидности* функции плотности вероятности стандартного нормального распределения – нетривиальная задача.

* валидная функция плотности вероятности (pdf) должна интегрироваться в 1, но существуют функции не обладающие таким свойством, но которые можно использовать вместо настоящих pdf в качестве априорных распределений в байесовском статистическом выводе. Очень известный пример –конъюгированное априорное распределение Джеффриса для биномиального распределения (Beta(1/2, 1/2)).
🔥2👍1
Forwarded from Maksim Kuznetsov
Симпатичная задчака по генетике/терверу. Xh - аллель гемофилии, вопрос: какова вероятность того, что женщина обведенная окружностью является носителем?
🔥2
Человек анализом данных занимается, говорит, что профессионально, пишет пост, утверждения в котором можно элементарно проверить, для этого не нужно знать математику.
Forwarded from статИИстик
Как можно сравнить группы по тем или иным количественным переменным, чтобы исключить влияние других ковариат, например, пола и возраста? Читайте на statshots.ru
статИИстик
Как можно сравнить группы по тем или иным количественным переменным, чтобы исключить влияние других ковариат, например, пола и возраста? Читайте на statshots.ru
y <- swiss$Agriculture
x <- swiss$Education
z <- swiss$Examination

resid_y_on_z <- residuals( lm(y ~ z) )
resid_x_on_z <- residuals( lm(x ~ z) )

## Adjusted coefficient x on y
coef( lm(y ~ x + z) )[[2]]
#> [1] -0.7379441

## То что предлагается в публикации
coef( lm(resid_y_on_z ~ x) )[[2]]
#> [1] -0.3779868

## То как это работает на самом деле
coef( lm(resid_y_on_z ~ resid_x_on_z) )[[2]]
#> [1] -0.7379441

## И так тоже работает
coef( lm(y ~ resid_x_on_z) )[[2]]
#> [1] -0.7379441

## NB! стандартные ошибки для оценок
## будут недооцененными и число степеней свободы
🤗2
Порядковые переменные мне представляются очень сложными как с точки зрения анализа, так и с точки зрения визуализации, поэтому всегда радуюсь, когда встречаю что-то простое и элегантное, связанное с ними.
Сегодня наткнулся на простой и красивый подход к визуализации связанных порядковых переменных, сам я часто для этих целей часто использовал alluvial plots, но теперь кажется это в прошлом.
🔥5
Обожаю курсеру, конечно
👍2
Biostatistics on the Table
Блуждал по интернету и наткнулся на такое: курс по причинно-следственному выводу от Нобелевского лауреата 2021 года https://mru.org/courses/mastering-econometrics/path-cause-effect
Сам не смотрел, но промо курса нельзя не оценить высоко )
На фото собственно автор курса и лауреат НП по экономике Джошуа Ангрист
#методы #сausal #inference #учебники #публикации

Ведущий научный сотрудник ЛССИ Борис Соколов недавно выложил в публичный доступ черновую версию своего обзора основных целевых величин (эстимандов), использующихся в статистическом каузальном анализе: АТЕ, АТТ, АТС и прочие тыквенные LATE с CATE. Хотя это ещё не полноценная статья, прошедшая рецензирование, данный текст может оказаться полезным как студентам, так и "взрослым" исследователям или прикладным аналитикам, применяющим соответствующие методы на практике - благо на русском языке литературы по теме откровенно мало.

P.S. Если вы найдёте в рукописи ошибки, неточности, упущения и т.д., или у вас будут иные идеи насчёт того, как её улучшить, можно написать напрямую автору на электронную почту - он открыт к обратной связи и конструктивной критике.
👍21🔥1
Уже давно заметил, что январь очень хороший месяц с точки зрения появления новых образовательных проектов. Хочу поделиться двумя, за которыми обязательно буду следить.

- Gavin Simpson выложил первое видео из серии, которая будет посвящена постпроцессингу обобщенных аддитивных моделей (GAM) с использованием пакета {{gratia}}

- Стартовал полноценный курс от Jonathan Templin по пропущенным значениям, основанный на книге Applied missing data analysis (с реализацией методов в R c использованием пакетов {{mice}} и {{Amelia}} и даже JAGS и Stan обещаны). Здесь стоит добавить, что хороших видео-материалов по пропускам очень мало и к тому же в них часто используется "неконвенциональное" ПО вроде Mplus (как в серии семинаров Craig Enders, автора указанной выше книги часть 1, часть 2) или IVEware (как в серии семинаров Trivellore Raghunathan часть 1, часть 2, часть 3, часть 4)
🔥7👍21
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
Раздумываю над темой для первого длинного текста на около(био)статистическую тему, а пока решил сделать небольшую рубрику, которую буду периодически наполнять содержанием.

Если вы думаете, что лекции и семинары по статистике от статистиков и (особенно) для статистиков - это скучно, то я с вами согласен 🙂, мой опыт именно такой, в среде профессиональных статистиков как-то очень немного талантливых рассказчиков, наблюдается даже странная ситуация, когда текст автора очень увлекательный, а к прослушиванию доклада по той же теме в исполнении того же самого автора такой эпитет применить совсем нельзя.

Но бывают исключения, одно из ярких открытий для меня - выступления Эндрю Гелмана, я иногда включаю их буквально для того, чтобы расслабиться. Особенно интересен контраст, тексты Гелмана всегда очень, иногда даже кажется, что чрезмерно, серьезные.
3
Вот ещё