آغاز به کار انجمن علمی بین رشته ای بیوانفورماتیک

انجمن علمی بیوانفورماتیک دانشگاه سیستان و بلوچستان، با نام "نوکلئوبیت" به عنوان مرجع فعالیت‌های آموزشی و پژوهشی در این حوزه بین رشته ای زیست شناسی، علوم کامپیوتر و ریاضیات آغاز به کار کرد.

این انجمن در زمینه انتشار محتواهای آموزشی، برگزاری کارگاه‌های پژوهشی و آموزشی در حوزه کاربرد های علوم کامپیوتر و محاسبات در زیست شناسی، اجرای طرح‌های پژوهشی زیر نظر اعضای برجسته هیئت علمی دانشگاه‌های داخلی و خارجی، ارتباط با صنعت، توانمندسازی برای ورود به بازار کار، حمایت از پایان‌نامه‌های دانشجویی، توسعه دانش در این حوزه و ... فعالیت خواهد کرد.

👨‍💻در کانال انجمن علمی بیوانفورماتیک با ما همراه باشید…

| 🧬🧮💻 @USB_Bioinformatics |

هوش مصنوعی بیولوژیکی:
دانشمندان موفق شده‌اند هوش مصنوعی را با سلول‌های زنده مغز انسان ترکیب کنند! این سیستم‌ها برخلاف مدل‌های سنتی سیلیکونی، قدرت یادگیری تطبیقی، پردازش موازی و مصرف انرژی فوق‌العاده بهینه دارند.

🔴 چالش‌های فنی:

⚙ پایدارسازی سلول‌های مغزی: نورون‌های زنده نیاز به محیطی خاص برای بقا دارند، و حفظ عملکرد آن‌ها در طولانی‌مدت هنوز یک چالش است.
⚙ ارتباط با سیستم‌های دیجیتال: ایجاد یک واسط کارآمد بین نورون‌های زنده و مدارهای سیلیکونی برای پردازش داده‌ها، پیچیده و دشوار است.
⚙ سرعت پردازش: در حالی که مغز انسان در پردازش‌های خاص برتر است، هنوز مشخص نیست که این سیستم‌ها می‌توانند در محاسبات پیچیده با کامپیوترهای مدرن رقابت کنند یا نه.

⚡ نقدها و نگرانی‌ها:

❌ آگاهی و هویت: اگر این سیستم‌ها به سطحی از شناخت برسند، آیا باید برای آن‌ها حقوقی قائل شد؟
❌ اخلاق زیستی: آیا استفاده از سلول‌های زنده مغز انسان در فناوری قابل قبول است؟

منبع:

https://www.newscientist.com/article/2407768-ai-made-from-living-human-brain-cells-performs-speech-recognition/

#هوش_مصنوعی #بیوتکنولوژی #زیست_شناسی #بیوانفورماتیک

سلام به همه‌ی دوستان عزیز و دانشجویان پرتلاش رشته‌ی زیست‌شناسی!
با کمال خوشحالی و افتخار، شما عزیزان را به مراسم معارفه‌ی رشته‌ی زیست‌شناسی دعوت می‌کنیم؛ جایی که قرار است با فضای رشته، برنامه‌های آموزشی، فعالیت‌های علمی و انجمن‌های دانشجویی آشنا شوید و اولین قدم‌های خود را در مسیر جذاب و پرهیجان دنیای زیست‌شناسی بردارید.

این معارفه فرصتیه تا با اساتید گرامی، دانشجویان ترم‌های بالاتر و دوستان جدیدتون آشنا بشید، سوالاتتون رو بپرسید و کمی از تجربه‌ها و مسیر آینده‌ی تحصیلی‌تون بیشتر بدونید.

منتظر حضور گرم و صمیمانه‌ی شما هستیم تا با هم شروعی پرانرژی و خاطره‌انگیز بسازیم.
به جمع خانواده‌ی زیست‌شناسی خوش آمدید!

@genome_usb
@USB_Bioinformatics

🔍 اگر به مدل‌سازی مسیرهای سلولی علاقه داری، این مقاله رو از دست نده!

🧬 محققان در تازه‌ترین مقاله BMC Bioinformatics یک شبیه‌ساز فوق‌العاده معرفی کرده‌اند: Cell4D
ابزاری که می‌تونه رفتار مولکول‌ها، واکنش‌ها، انتشار، تعاملات غشایی و حتی میکرودومین‌های سلولی رو در یک مدل فضایی–زمانی دقیق بازسازی کنه.

چرا جذابه؟
چون دقیقا همون چیزیه که فاصله بین «داده‌های بی‌انتها» و «درک واقعی از فرایندهای سلولی» رو کم می‌کنه—بدون اینکه نیاز باشه حرفه‌ای برنامه‌نویس باشی!

🌐 اگر به #بیوانفورماتیک، #سیستم‌بیولوژی، یا #مدل‌سازی مولکولی علاقه‌مند هستی، این مقاله می‌تونه دیدت رو نسبت به شبیه‌سازی سلولی کاملاً تغییر بده.

📎 لینک مطالعه مقاله 👇

https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-024-05739-0

📌 پیشنهاد نوکلئوبیت: حتماً برای پروژه‌ها و ایده‌های پژوهشی‌تون از این ابزار الهام بگیرین!

🤖🧪 وقتی هوش مصنوعی از دانشمندان ویروس‌شناس جلو می زند!

در یک مطالعه‌ی جنجالی، مدل‌های پیشرفته هوش مصنوعی مثل GPT-4o و Gemini Pro 2.5 در شبیه‌سازی آزمایشگاه‌های ویروسی عملکردی دقیق‌تر و سریع‌تر از بسیاری از ویروس‌شناسان انسانی نشان دادند!

این مدل‌ها توانستند درک بهتری از روندهای آزمایشگاهی، طراحی ویروس و تحلیل داده‌های زیستی نشان بدهند.
درحالی‌که دقت ویروس‌شناس‌ها حدود ۲۲٪ بود، دقت این مدل‌ها به حدود ۴۴٪ رسیدند! 😳

🔍با این حال علاوه بر شگفتی از توانمندی AI در حل مسائل پیچیده زیستی، نگرانی های شدید درباره احتمال سوءاستفاده‌ بیولوژیکی و تهدیدات امنیت زیستی (Biohazard) نیز بیش از پیش مطرح می شود.

لینک مطالعه بیشتر

| 🧬🧮💻 @USB_Bioinformatics |

🤖🔬هوش مصنوعی Evo2 در نقش طراح ژن!

ابزار پیشرفته‌ی Evo2، نسل جدیدی از مدل‌های هوش مصنوعی مولد (Generative AI)، اخیراً توسط پژوهشگران دانشگاه استنفورد، موسسه Arc، و شرکت NVIDIA توسعه یافته و منتشر شده است. این ابزار با هدف تسریع درک زیست‌شناسی مولکولی، طراحی ژن‌های نو، و پیش‌بینی عملکرد آن‌ها طراحی شده است.

این هوش مصنوعی آموزش‌دیده بر مجموعه داده‌ای شامل ژنوم بیش از ۱۵٬۰۰۰ گونه یوکاریوتی (از جمله انسان و گیاه) و تعداد زیادی پروکاریوت میباشد وقابلیت پیش‌بینی ساختار و عملکرد پروتئین‌ها بر اساس DNA را دارا میباشد.

💢کاربردها:
–شناسایی جهش‌های بیماری‌زا یا بی‌ضرر در ژنوم انسانی
–طراحی ژن‌های مهندسی‌شده با عملکرد مشخص
– توسعه روش‌های درمانی بر پایه ژنتیک
– تقویت ابزارهای ویرایش ژن مانند CRISPR

ابزار Evo2 قادر است برهم‌کنش‌های بلندبرد ژنتیکی (بین ژن‌هایی که در فواصل دور از هم روی DNA قرار دارند) را نیز تحلیل و پیش‌بینی کند. قابلیتی که در بسیاری از ابزارهای پیشین وجود نداشت.

لینک متن کامل

| 🧬🧮💻 @USB_Bioinformatics |

💻🧬چرا باید با بیوانفورماتیک آشنا باشیم؟

#بخش_اول

1) زیست‌شناسی امروز بدون داده کامل نیست

حجم عظیمی از داده‌های ژنتیکی و مولکولی تولید می‌شود و تنها با ابزارهای محاسباتی قابل تحلیل هستند. آشنایی با بیوانفورماتیک یعنی فهم بهتر بخش مهمی از علم روز.


2) جزو واحدهای درسی رسمی رشته است

بیوانفورماتیک از سرفصل‌های مصوب رشته زیست‌شناسی محسوب می‌شود و در دوره کارشناسی و کارشناسی ارشد تدریس می‌شود.
یادگیری زودتر آن باعث می‌شود دانشجو هنگام گذراندن واحد درسی مربوطه عملکرد بهتری داشته باشد و مفاهیم را سریع‌تر و عمیق‌تر درک کند.

| 🧬🧮💻 @USB_Bioinformatics |

💻🧬چرا باید با بیوانفورماتیک آشنا باشیم؟

#بخش_دوم

3) پاسخ به پرسش‌هایی که آزمایشگاه به‌تنهایی قادر به حل آن‌ها نیست

تجزیه‌وتحلیل جهش‌ها، پیش‌بینی ساختار پروتئین، شناسایی ژن‌های مرتبط با بیماری و بررسی تکاملی گونه‌ها نمونه‌هایی از مسائلی هستند که بدون روش‌های بیوانفورماتیکی کامل بررسی نمی‌شوند.

4) فرصت‌های شغلی و پژوهشی بیشتر

ترکیب مهارت زیست‌شناسی و تحلیل داده یکی از پرتقاضاترین تخصص‌ها در ایران و جهان است. تسلط بر بیوانفورماتیک مسیر ورود به پروژه‌ها، کارآموزی‌ها و پژوهش‌های پیشرفته را هموار می‌کند.


| 🧬🧮💻 @USB_Bioinformatics |

💻🧬 رشته بیوانفورماتیک؛ مسیر ورود، شرایط ادامه تحصیل و واقعیت‌های بازار کار

#بخش_اول
#معرفی_رشته
#مسیر_ورود

بیوانفورماتیک شاخه‌ای میان‌رشته‌ای در مقطع کارشناسی ارشد و در مرز زیست‌مولکولی، آمار و علوم کامپیوتر است که با استفاده از تحلیل داده‌های زیستی به پژوهش در حوزه‌های ژنومیکس، پروتئومیکس، طراحی دارو و پزشکی شخصی کمک می‌کند. این رشته به مهارت‌محوری بسیار وابسته است و موفقیت در آن بیش از هر چیز به توانایی تحلیل داده و برنامه‌نویسی بستگی دارد.

🎓 مسیر ادامه تحصیل و ورود از طریق کنکور ارشد

1) وزارت علوم
–بیوانفورماتیک به‌صورت مستقیم (رشته ی بیوانفورماتیک) یا از طریق رشته‌های مرتبط مانند ژنتیک، بیوشیمی و بیوفیزیک قابل ورود است.
–سطح رقابت متوسط رو به بالاست.

دانشجو باید پس از ورود مهارت‌هایی مانند Python، R، لینوکس و تحلیل داده را به‌طور جدی دنبال کند، زیرا بسیاری از دانشگاه‌ها این مباحث را به شکل محدود آموزش می‌دهند.

2) وزارت بهداشت
–ورود از طریق رشته اینفورماتیک پزشکی با گرایش‌های مرتبط با بیوانفورماتیک انجام می‌شود.
–ظرفیت محدودتر و رقابت بیشتر است.
–تمرکز بر تحلیل داده‌های زیست‌پزشکی و مباحث کاربردی‌تر است.

| 🧬🧮💻 @USB_Bioinformatics |

🌿 رویکرد ژنومیکس مقایسه‌ای برای بازسازی ساختار کروموزوم‌های اجدادی و مسیرهای تکاملی گیاهان

جدیدترین مقاله منتشر شده در Nature Protocols یک روش پیشرفته و دقیق در حوزه ژنومیکس مقایسه‌ای معرفی می‌کند که به کمک آن می‌توان ساختار کاریوتایپ (نقشه کروموزومی) سلول‌های اجدادی گیاهان را استنباط کرد و مسیرهای تکاملی کروموزوم‌های گیاهی را بازسازی نمود.

این روش بر اساس تحلیل مقایسه‌ای توالی‌های ژنومی گونه‌های مختلف گیاهی انجام می‌شود تا تغییرات ساختاری، مانند جابجایی‌ها، الحاقات یا حذف‌های کروموزومی در طول تاریخ تکامل مشخص شود. با استفاده از این رویکرد، می‌توان مدل‌هایی از نحوه شکل‌گیری و تکامل کروموزوم‌ها ارائه داد که به فهم بهتر فرآیندهای ژنتیکی و تکاملی گیاهان کمک شایانی می‌کند.

مزیت مهم این پروتکل، امکان بررسی دقیق‌تر اجداد ژنتیکی و شناسایی تحولات پیچیده در ساختار ژنومی گیاهان است که می‌تواند در زمینه‌های متنوعی مانند کشاورزی، اصلاح نژاد و حفاظت از گونه‌ها کاربرد داشته باشد.

لینک مقاله کامل

| 🧬🧮💻 @USB_Bioinformatics |

💻🧬چرا باید با بیوانفورماتیک آشنا باشیم؟

#بخش_سوم

5) درک بهتر مفاهیم تخصصی در سال‌های بعد

آشنایی با بیوانفورماتیک باعث می‌شود فهم درس‌هایی مانند ژنومیک، تکامل، بیوشیمی پیشرفته، ژنتیک مولکولی و بیولوژی ساختاری بسیار ساده‌تر و عمیق‌تر شود.


6) هماهنگی با آینده علم

پزشکی شخصی، ژن‌درمانی، داروسازی محاسباتی و کاربردهای هوش مصنوعی در زیست‌شناسی همگی به بیوانفورماتیک وابسته‌اند. یادگیری آن یعنی حرکت هم‌گام با آینده علم.


| 🧬🧮💻 @USB_Bioinformatics |