Возможно, некоторые из вас задаются вопросом, куда я пропала. Я участвую в соревновании на Kaggle. Соревнование длится уже почти 3 месяца, но я посвятила ему всего несколько дней, да и то не с целью победить, а с целью набить руку на обучении разных сеточек и анализе возникающих ошибок.

Задача состоит в сегментации сосудов на трёхмерных сканах почек. Для обучения выданы сканы трёх почек, для одной из них доступен дополнительный скан высокого разрешения. Проверка происходит на скрытом тестовом наборе.
Подходить к решению задачи можно как минимум тремя способами:
1. Использовать покадровую 2D сегментацию.
2. Использовать сегментацию 2.5D - положить в цветовые каналы изображения 3 ч\б картинки с разной глубины.
3. Использовать трёхмерную сегментацию на воксельном объёме.
Я попробовала все подходы, к тому же несколько вариантов нормализации данных, метрик, способа инференса, трейн и тест аугментации. В итоге оказалось, что обычная двухмерная покадровая сегментация показывает в этой задаче наилучший результат.

Топовые решения пока никто не раскрывает. Очень интересно, какое решение будет у победителя. Возможно, напишу об этом, когда конкурс закончится. 🙂

А пока выкладываю трёхмерную реконструкцию эталонных разметок сосудов почек, сгенерированную с помощью маршрующих кубов по воксельному объёму и визуализированную библиотекой open3d.
Поразительно, насколько сосуды похожи на деревья!
🔣🔣🔣
Напишите в комментариях о вашем опыте участия в конкурсах и об интересных открытиях, которые вас ждали на этом пути.