о Taq Полимераза- особая полимераза, которую добывают из бактерий, живущих в термальных источниках, потому что родная полимераза зачастую тупо не работает при высоких температурах.

Вся эта радость заливается в колодцы на пластинке (Вот на видео я это как раз таки и делаю!) вместе с комплиментарной ДНК. Что это такое и чем она отличается от обычной? Это укороченная версия обычной ДНК, которая была искусственно создана из матричной РНК с помощью реверсивной транскрипции. Если я начну еще и это объяснять, то пост получится просто бесконечно долгим, так что тут достаточно знать, что это просто кусок ДНК в котором присутствуют только фрагменты, которые реально что-то кодируют. Да, не во всей ДНК реально что-то закодированно, довольно много фрагментов вообще ничего не делают.

И так все это перемешивается в центрифуге (это она на видеве!) и отправляется в ПЦР-анализатор. Вот тут начинается магия науки.

Процесс, где ДНК рвут напополам называется денатурацией. В тесте она происходит не с помощью хеликазы, а путем нагревания всех-всех штук в пластинке до 95 градусов. Водородные связи рушатся, образуются две одиночные ДНК. Дальше начинается амплификация- обозначение того какой кусок ДНК мы хотим рассмотреть. Для этого как раз используются добавленные праймеры. Чтобы она началась и праймеры прилипли, анализатор остужается, до 60 градусов. Затем все снова нагревается, примерно до 65, и Taq полимиераза начинает формировать цепочки по принципу комплиметраности. То что я сейчас расписала- один цикл ПЦР. Для результата он повторяется раз тридцать, поэтому на выходе, так как каждый раз количество ДНК в пробирке удваивается, мы получаем нереально много копий одного и того же участка.

Что с этими копиями делать дальше? В кПЦР, котрый использую я, важны скорее не сами копии, а то как они образуются. Помните SYBR green? Вот тут он как раз таки и нужен. SYBR начинает светиться, когда связывается с ДНК. Причем исключительно с двухцепочной. Поэтому чем больше ДНК в пробирке, тем сильнее свет. Этот свет считывает датчик анализатора и делает график, возрастающий по экспоненте, по которому можно понять уровень экспрессии определенного гена.

А что вообще такое экспрессия гена? Про это будет еще вторая часть, чтобы не затягивать сильно, а то уже пост километровый :)

Я только рада вопросам и в принципе поговорить о биологии! Так что любой фидбек, как и предложения для постов, приветствуется

Как и репосты (*подмигивание*), у меня тут не просто научпоп контент а КОНТЕНТИЩЕ, над которым я действительно запариваюсь, чтобы все было понятно и правильно с научной точки зрения

Хотя мне иногда кажется, что мои объяснения сложных штук звучат примерно так, потому что мне уже сложновато понимать, что люди без биологического бэкграунда знают, а что нет

Блин день дурака на самом деле почти что мой профессиональный праздник. Очень много вещей по отношению к природе и животным, которые я делаю из чистого любопытства и энтузиазма, люди считывают как дурость

Ну кто как не биолог полезет объедать тёрн с куста например :))

Или проведет закат так

Как и ловля змей

Иногда чувствую себя как персонаж «дурака и молнии». Только вместо молнии всё живое, что меня окружает.
А люди смотрят как на пришибленную все равно, хотя вроде бы ничего такого :)