Online Now: Targeting pan-essential genes in cancer: challenges and opportunities

https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(20)30656-5?rss=yes&utm_source=dlvr.it&utm_medium=twitter

🆔@BioUT

Immunotherapy Sensitivity of Mismatch Repair-Deficient Cancer: Mutation Load Is Not Enough

https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(20)30664-4?rss=yes&utm_source=dlvr.it&utm_medium=twitter

🆔@BioUT

Wow, that is MICROSCOPY!!! 🤩

source: https://science.sciencemag.org/content/342/6158/611

#microscopy #science #highres #atomic

🆔@BioUT

The secret forces that squeeze and pull life into shape

🔺نیروهای مخفی که حیات را شکل می دهند!

🔹دانشمندان در حال کشف و پژوهش نقش نیروهای مکانیکی از جنین تا بزرگسالی در بدن هستند ،
نیروی مکانیکی مولکول ها که باعث تشکیل بافت و شکل گیری بدن می شود این مقاله مهم و جدید در نیچر چاپ شده است

🔹یک مکانیکال بیولوژیست در انستیتوی مهندسی زیستی کاتالونیا در اسپانیا می گوید ، اینکه فقط ژن ها را عامل شکل گیری بدانیم مانند این است که شما سعی می کنید کتابی فقط با نیمی از حروف الفبا بنویسید!

🔹در این پژوهش مفصل به بررسی شکل گیری جنین و بافت پرداخته شده است
همانطور که کشش بر پوست می تواند باعث تحریک سلولهای بنیادین برای تکثیر پوست شود فشار مکانیکی باعث تراکم و سفتی بافت ها می گردد
🔹این پژوهش می تواند به کلیدی برای رشد پوست در زمان بازسازی جراحی یا ترمیم زخم منجر شود

🔹در این پژوهش اشاره ای به ارتباط نیروی مکانیکی و سرطان نیز شده است

🆔@BioUT

#بیولوژی #تکوین

🔍 لینک مقاله

#BePositive #Protons #Chemistry #Smile
#مثبت_مثل_پروتون

🆔@BioUT

Delineating copy number and clonal substructure in human tumors from single-cell trannoscriptomes

تعیین تعداد کپی و زیر مجموعه های کلونال در تومورهای انسانی با استفاده از single-cell trannoscriptomes

تجزیه و تحلیل رونویسی تک سلولی به طور گسترده ای برای مطالعه تومورهای انسانی استفاده می شود. با این حال تعیین و تشخیص انواع سلولهای طبیعی در محیط تومور از سلولهای بدخیم و زیرمجموعه های کلونال در تومور همچنان چالش برانگیز است. برای رفع این چالش، ما یک رویکرد تقسیم بندی بیزی یکپارچه به نام کاریوتایپ کپی شماره تومورهای آنئوپلوئید (CopyKAT) را برای تخمین پروفایل تعداد کپی ژنومیک با تفکیک ژنومی متوسط 5 مگابیز از عمق خواندن در توالی RNA تک سلولی با بارگذاری بالا (scRNA) توسعه داده ایم. داده های موجود برای تجزیه و تحلیل 46501 سلول منفرد از 21 تومور از جمله سرطان پستان منفی سه گانه ، آدنوکارسینومای مجرای لوزالمعده ، سرطان آناپلاستیک تیروئید ، سرطان مجاری تهاجمی و گلیوبلاستوما از CopyKAT استفاده کردیم تا سلولهای سرطانی را از سلولهای طبیعی تشخیص دهیم (98٪).


🆔@BioUT

#سرطان #مدلسازی_بیزی #رونویسی_تک_سلولی

🔍 لینک مقاله

Single cell sequencing

توالی یابی تک سلولی با استفاده از فناوری های بهینه شده توالی یابی نسل جدید اطلاعات توالی سلول ها را جداگانه بررسی می کند و وضوح بالاتری از تفاوت های سلولی و درک بهتری از عملکرد سلول های فردی در پس زمینه محیط ارائه می دهد.
به عنوان مثال در سرطان می توان بدین طریق متوجه تک سلول های حامل جهش های خاص شد که گویا وضعیت های متفاوت و هتروجنیتی موجود در کلونی سرطان است

#WorkFlow
#scRNA_seq

📑لینک ویکی

🆔@BioUT

Answer:
building in which you were born 🐣

🆔@BioUT

Online Now: The Tumor Profiler Study: integrated, multi-omic, functional tumor profiling for clinical decision support

استفاده و تلفیق فناوری های پروفایل کردن مولکولی فرصت های جدیدی را برای پزشکی شخصی ایجاد می کرده است. در اینجا ، در این مقاله مطالعه تومور پروفایلر را معرفی می کنیم، که یک مطالعه مشاهده ای ترکیبی با رویکرد تشخیصی آینده نگر است که به منظور ارزیابی ارتباط پروفایل تومور برای پشتیبانی از تصمیم گیری های بالینی با یک رویکرد اکتشافی برای بهبود درک بیولوژیکی بیماری است.

#Cancer
#Multi_omics
#Data_integration

📑لینک مقاله🆔

@BioUT

Multiple freeze-thaw cycles lead to a loss of consistency in poly(A)-enriched RNA sequencing

1. در برخی از دیتاست های RNAseq دیده شه که freeze-thaw باعث تخریب باز ها می شود
2. کیفیت RIN پس از freeze-thaw اول کاهش نمیابد.
3. پس از freeze-thaw دیگر DE قابلیت تولید مجدد را از دست می دهد.

#Freeze_thaw
#RNA_seq

📑لینک مقاله

🆔@BioUT

Prioritizing and characterizing functionally relevant genes across human tissues

الویت بندی و ویژگی شناسی عملکردی ژنها در بافت های انسانی

#Gene_prioritizing
#Functional_characterizing

📑لینک مقاله

🆔@BioUT

What is T-cell transfer therapy? This is a type of #immunotherapy that makes your own immune cells better able to attack cancer:

T-Cell تراپی چیست ؟
چگونه باعث بهتر عملکردن دستگاه ایمنی نسبت به سلول های سرطانی شده ؟

#immunotherapy
#tumor_infiltrating_lymphocytes
#CAR_T_cell

📑لینک مقاله

🆔@BioUT

How our body works and math models that make sense of it all.

📑لینک کتاب

🆔@BioUT

Cancer research needs a better map
تحقیقات سرطان به نقشه ای بهتر نیاز دارد

تقریبا 15 سال پیش محققین بالینی و پایه بر این شدند تا با کمک اطلاعات ژنومی تومورهای هزاران بیمار به مطالعه عمیقتری دست بزنند. نتیجه آن TCGA و ICGC بود و تقریبا هر هدف دارویی جدید سرطانی نتیجه همین تلاش ها بود...

📑لینک

🆔@BioUT

Matthias Mann

"Marrying #microscopy and #digitalpathology with single cell type proteomics at last. We developed Deep Visual Proteomics integrating #Imaging #AI #LMD and #MassSpectrometry."

🆔@BioUT

🎓 قابل توجه دانشجویان عزیز

📚⛔️انجام کلیه پروژه های دانشجویی و غیره در حوزه کامپیوتر، بیوانفورماتیک و آنالیز داده در اسرع وقت 🤩🗂

💻 برنامه نویسی R متلب پایتون ...
- R programming
- Python programming
- MATLAB programming
- Statistical analysis
- Constraint based metabolic networks modeling
- Computational genomics
- Computational oncology
- Machine learning
- Data Science

⌨️ تهیه word و PowerPoint و excel

با قیمت دانشجویی و پشتیبانی بعد از تحویل.

آماده همکاری با گروه ها و مراکز علمی 🏛 آزمایشگاه های ژنتیک و تشخیص طبی 🏨 سراسر کشور در حوزه های تشخیص و طراحی بیومارکرها و آنالیز توالی DNA و بیان ژن


@BioUT

Neutrophils create a fertile soil for metastasis

نوتروفیل ها میتوانند محیط مناسب متاستاز را فراهم کنند

نوتروفیل ها می توانند پخش شدن تومور (متاستاز) را تسهیل کنند، هر چند که در حال حاضر اینکه چگونه نوتروفیل ها در محل های متاستاز فعال هستند همچنان مبهم است. protease cathepsin C ترشح شده توسط سلول های سرطان پستان عامل ایجاد اله نوتروفیل خارج سلولی در محل متاستاز هستند که باعث ایجاد سرطان ریه می شود.

📑لینک مقاله

🆔@BioUT

Lymphoma is a broad term for cancer that begins in cells of the lymph system. The two main types are Hodgkin #lymphoma and non-Hodgkin lymphoma
لینفوما واژه ای با گسترده زیاد است برای هر نوع سرطان با منشا دستگاه لنفاوی. دو گروه اصلی آن هوچکین و غیرهوچکین (NHL) هستند. نوع هوچکین اغلب قابل درمان هست. ولی پیشرفت NHL به زیر نوعش بستگی دارد.


📑لینک مقاله
🆔@BioUT

دوستان مسلط به JS در صورت تمایل به همکاری در یک پروژه علمی به آیدی @mohsenrahiminejad پیام دهند.
جبران خدمت پس از تعیین شرایط به صورت مالی 💴 خواهد بود.

Patrick Henry Winston was an American computer scientist and professor at the Massachusetts Institute of Technology. Winston was director of the MIT Artificial Intelligence Laboratory from 1972 to 1997, succeeding Marvin Minsky, who left to help found the MIT Media Lab. Wikipedia
Born: February 5, 1943, Peoria, IL
Died: July 19, 2019, Massachusetts General Hospital, Boston, MA
Doctoral advisor: Marvin Minsky
Education: Massachusetts Institute of Technology
Awards: IJCAI Computers and Thought Award, AAAI Fellow

🆔@BioUT