Single cell sequencing

توالی یابی تک سلولی با استفاده از فناوری های بهینه شده توالی یابی نسل جدید اطلاعات توالی سلول ها را جداگانه بررسی می کند و وضوح بالاتری از تفاوت های سلولی و درک بهتری از عملکرد سلول های فردی در پس زمینه محیط ارائه می دهد.
به عنوان مثال در سرطان می توان بدین طریق متوجه تک سلول های حامل جهش های خاص شد که گویا وضعیت های متفاوت و هتروجنیتی موجود در کلونی سرطان است

#WorkFlow
#scRNA_seq

📑لینک ویکی

🆔@BioUT

Answer:
building in which you were born 🐣

🆔@BioUT

Online Now: The Tumor Profiler Study: integrated, multi-omic, functional tumor profiling for clinical decision support

استفاده و تلفیق فناوری های پروفایل کردن مولکولی فرصت های جدیدی را برای پزشکی شخصی ایجاد می کرده است. در اینجا ، در این مقاله مطالعه تومور پروفایلر را معرفی می کنیم، که یک مطالعه مشاهده ای ترکیبی با رویکرد تشخیصی آینده نگر است که به منظور ارزیابی ارتباط پروفایل تومور برای پشتیبانی از تصمیم گیری های بالینی با یک رویکرد اکتشافی برای بهبود درک بیولوژیکی بیماری است.

#Cancer
#Multi_omics
#Data_integration

📑لینک مقاله🆔

@BioUT

Multiple freeze-thaw cycles lead to a loss of consistency in poly(A)-enriched RNA sequencing

1. در برخی از دیتاست های RNAseq دیده شه که freeze-thaw باعث تخریب باز ها می شود
2. کیفیت RIN پس از freeze-thaw اول کاهش نمیابد.
3. پس از freeze-thaw دیگر DE قابلیت تولید مجدد را از دست می دهد.

#Freeze_thaw
#RNA_seq

📑لینک مقاله

🆔@BioUT

Prioritizing and characterizing functionally relevant genes across human tissues

الویت بندی و ویژگی شناسی عملکردی ژنها در بافت های انسانی

#Gene_prioritizing
#Functional_characterizing

📑لینک مقاله

🆔@BioUT

What is T-cell transfer therapy? This is a type of #immunotherapy that makes your own immune cells better able to attack cancer:

T-Cell تراپی چیست ؟
چگونه باعث بهتر عملکردن دستگاه ایمنی نسبت به سلول های سرطانی شده ؟

#immunotherapy
#tumor_infiltrating_lymphocytes
#CAR_T_cell

📑لینک مقاله

🆔@BioUT

How our body works and math models that make sense of it all.

📑لینک کتاب

🆔@BioUT

Cancer research needs a better map
تحقیقات سرطان به نقشه ای بهتر نیاز دارد

تقریبا 15 سال پیش محققین بالینی و پایه بر این شدند تا با کمک اطلاعات ژنومی تومورهای هزاران بیمار به مطالعه عمیقتری دست بزنند. نتیجه آن TCGA و ICGC بود و تقریبا هر هدف دارویی جدید سرطانی نتیجه همین تلاش ها بود...

📑لینک

🆔@BioUT

Matthias Mann

"Marrying #microscopy and #digitalpathology with single cell type proteomics at last. We developed Deep Visual Proteomics integrating #Imaging #AI #LMD and #MassSpectrometry."

🆔@BioUT

🎓 قابل توجه دانشجویان عزیز

📚⛔️انجام کلیه پروژه های دانشجویی و غیره در حوزه کامپیوتر، بیوانفورماتیک و آنالیز داده در اسرع وقت 🤩🗂

💻 برنامه نویسی R متلب پایتون ...
- R programming
- Python programming
- MATLAB programming
- Statistical analysis
- Constraint based metabolic networks modeling
- Computational genomics
- Computational oncology
- Machine learning
- Data Science

⌨️ تهیه word و PowerPoint و excel

با قیمت دانشجویی و پشتیبانی بعد از تحویل.

آماده همکاری با گروه ها و مراکز علمی 🏛 آزمایشگاه های ژنتیک و تشخیص طبی 🏨 سراسر کشور در حوزه های تشخیص و طراحی بیومارکرها و آنالیز توالی DNA و بیان ژن


@BioUT

Neutrophils create a fertile soil for metastasis

نوتروفیل ها میتوانند محیط مناسب متاستاز را فراهم کنند

نوتروفیل ها می توانند پخش شدن تومور (متاستاز) را تسهیل کنند، هر چند که در حال حاضر اینکه چگونه نوتروفیل ها در محل های متاستاز فعال هستند همچنان مبهم است. protease cathepsin C ترشح شده توسط سلول های سرطان پستان عامل ایجاد اله نوتروفیل خارج سلولی در محل متاستاز هستند که باعث ایجاد سرطان ریه می شود.

📑لینک مقاله

🆔@BioUT

Lymphoma is a broad term for cancer that begins in cells of the lymph system. The two main types are Hodgkin #lymphoma and non-Hodgkin lymphoma
لینفوما واژه ای با گسترده زیاد است برای هر نوع سرطان با منشا دستگاه لنفاوی. دو گروه اصلی آن هوچکین و غیرهوچکین (NHL) هستند. نوع هوچکین اغلب قابل درمان هست. ولی پیشرفت NHL به زیر نوعش بستگی دارد.


📑لینک مقاله
🆔@BioUT

دوستان مسلط به JS در صورت تمایل به همکاری در یک پروژه علمی به آیدی @mohsenrahiminejad پیام دهند.
جبران خدمت پس از تعیین شرایط به صورت مالی 💴 خواهد بود.

Patrick Henry Winston was an American computer scientist and professor at the Massachusetts Institute of Technology. Winston was director of the MIT Artificial Intelligence Laboratory from 1972 to 1997, succeeding Marvin Minsky, who left to help found the MIT Media Lab. Wikipedia
Born: February 5, 1943, Peoria, IL
Died: July 19, 2019, Massachusetts General Hospital, Boston, MA
Doctoral advisor: Marvin Minsky
Education: Massachusetts Institute of Technology
Awards: IJCAI Computers and Thought Award, AAAI Fellow

🆔@BioUT

💻جلسه اول - مدلسازی سلول ها بوسیله ساخت شبکه های متابولیکی آنها با استفاده از داده های بیان ژن (معرفی - نصب)🦠🧬

#Genome_scale_metabolic_networks
#Cell_modeling
#Cancer_modeling
#Microorganism_modeling
#Metabolic_phenotype_prediction
#Cobra_toolbox

🆔@BioUT

🆔@BioUT

سخنرانی علمی📜
عنوان:
Computational methods for integrative inference of
genome-scale gene regulatory networks 🧬
سخنران :🧑‍🎓
آقای دکتر علیرضا فتوحی سیاه پیرانی
دکتری زیست شناسی محاسباتی از دانشگاه ویسکانسین

زمان:
⏰ 10 ساعت (با تاخیر)
📆 1399 /12 /04 دوشنبه
آدرس:🏢
https://join.skype.com/iHRB4dmZy0yp58

Journalling for self-awareness

Journalling will also make you more self-aware. A few minutes of contemplative writing in the morning or evening are enough to wrangle all of your self-sabotaging thoughts into the lights where they can be changed. Journalling doesn’t have to be complicated.

لینک منبع
Dr. Kimberly Stearns

🆔@BioUT

What is few-shot learning?

As the name implies, few-shot learning refers to the practice of feeding a learning model with a very small amount of training data, contrary to the normal practice of using a large amount of data.

لینک منبع

Following is an amazing example of few-shot learning in bioinformatics

https://www.nature.com/articles/s43018-020-00169-2

🆔@BioUT

🆔@BioUT

🌀 اولین دوره مسابقه Optimizer

🕙زمان برگزاری: تیرماه ۱۴۰۰
📅 پایان ثبت‌نام: ۳۰ فروردین ۱۴۰۰

♨️ سوال مسابقه از هم‌اکنون از طریق وب‌سایت رویداد قابل دسترسی است.

📝 برای اطلاعات بیشتر و ثبت نام می‌توانید به سایت مسابقه مراجعه نمایید.

💠 همچنین می‌توانید ما را از طریق شبکه‌های اجتماعی دنبال نمایید:
📢 کانال تلگرام
📷 صفحه اینستاگرام
🌐 صفحه لینکدین

🆔 @optimizer_math