#مقاله_ما
🆔@BioUT
Systematic identification of novel cancer genes through analysis of deep shRNA perturbation screens * Systematic perturbation screens provide comprehensive resources for the elucidation of cancer driver genes. The perturbation of many genes in relatively few cell lines in such functional screens necessitates the development of specialized computational tools with sufficient statistical power. Here we developed APSiC (Analysis of Perturbation Screens for identifying novel Cancer genes) to identify genetic drivers and effectors in perturbation screens even with few samples. Applying APSiC to the shRNA screen Project DRIVE, APSiC identified well-known and novel putative mutational and amplified cancer genes across all cancer types and in specific cancer types. ...*
https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkab627/6329117
🆔@BioUT
🆔@BioUT
Systematic identification of novel cancer genes through analysis of deep shRNA perturbation screens * Systematic perturbation screens provide comprehensive resources for the elucidation of cancer driver genes. The perturbation of many genes in relatively few cell lines in such functional screens necessitates the development of specialized computational tools with sufficient statistical power. Here we developed APSiC (Analysis of Perturbation Screens for identifying novel Cancer genes) to identify genetic drivers and effectors in perturbation screens even with few samples. Applying APSiC to the shRNA screen Project DRIVE, APSiC identified well-known and novel putative mutational and amplified cancer genes across all cancer types and in specific cancer types. ...*
https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkab627/6329117
🆔@BioUT
JafaRiLab
#پادکست اپیزود چهاردهم، چهارمین اپیزود از فصل دوم پادکست منتشر شد. - برای شکل های مقاله یا پوسترهای کنفرانس از چه رنگ هایی استفاده کنم؟ - رنگ ها چه تاثیری در جذب مخاطب (شامل خواننده، شنونده، داور و ادیتور مجلات) دارد؟ این اپیزود، یک اجرای دو نفره است…
پادکست یکی از اعضای گروه @BioUT که در زمینه آشکار سازی داده فعال هستن
🆔@BioUT
با همکاری دانشمندان کشورمان و با حمایت شرکت سل تک فارمد اولین واکسن mRNA ایرانی علیه بیماری کووید۱۹ وارد مطالعه پیش بالینی(فاز حیوانی) شد.
در مطالعه حیوانی این واکسن، ۱۰۰ میکرولیتر لیپوفکتامین حاوی ۱۰ یا ۲۰ میکروگرم از mRNA کد کننده پروتئین اسپایک ویروس SARS-CoV-2 ( ۸ موش در هر گروه دریافت کننده واکسن و ۶ موش در گروه کنترل) به صورت IM تزریق شد و سپس سرم این موش ها جهت ارزیابی ایمنی هومورال ایجاد شده در روزهای ۲۱، ۲۸، و ۸۴ پس از تزریق جمع آوری شد.
همچنین در گام بعدی، کارایی واکسن ها در موش های Balb/c (۶ تا ۸ هفته)، و C57BL/6 ( ۶ تا ۸ هفته) و نهایتا در در میمون های رزوس ( ۴ الی ۶ سال) بررسی شد (۱۰۰ میکروگرم در میمون)
نتایج این مطالعه از کارایی قابل قبول، هم در تولید انتی بادی خنثی کننده و هم در ایجاد ایمنی سلولی (اندازه گیری اینترفرون گاما به عنوان مارکر سلول های T کمکی) حکایت دارد.
نتایج این مطالعه در ژورنال واکسن با ایمپکت فاکتور ۴/۴ (Q2) منتشر شده است.
تبریک فراوان به دانشمندان در گیر در این پروژه 💐
https://www.mdpi.com/2076-393X/9/9/1007/htm
🆔@BioUT
با همکاری دانشمندان کشورمان و با حمایت شرکت سل تک فارمد اولین واکسن mRNA ایرانی علیه بیماری کووید۱۹ وارد مطالعه پیش بالینی(فاز حیوانی) شد.
در مطالعه حیوانی این واکسن، ۱۰۰ میکرولیتر لیپوفکتامین حاوی ۱۰ یا ۲۰ میکروگرم از mRNA کد کننده پروتئین اسپایک ویروس SARS-CoV-2 ( ۸ موش در هر گروه دریافت کننده واکسن و ۶ موش در گروه کنترل) به صورت IM تزریق شد و سپس سرم این موش ها جهت ارزیابی ایمنی هومورال ایجاد شده در روزهای ۲۱، ۲۸، و ۸۴ پس از تزریق جمع آوری شد.
همچنین در گام بعدی، کارایی واکسن ها در موش های Balb/c (۶ تا ۸ هفته)، و C57BL/6 ( ۶ تا ۸ هفته) و نهایتا در در میمون های رزوس ( ۴ الی ۶ سال) بررسی شد (۱۰۰ میکروگرم در میمون)
نتایج این مطالعه از کارایی قابل قبول، هم در تولید انتی بادی خنثی کننده و هم در ایجاد ایمنی سلولی (اندازه گیری اینترفرون گاما به عنوان مارکر سلول های T کمکی) حکایت دارد.
نتایج این مطالعه در ژورنال واکسن با ایمپکت فاکتور ۴/۴ (Q2) منتشر شده است.
تبریک فراوان به دانشمندان در گیر در این پروژه 💐
https://www.mdpi.com/2076-393X/9/9/1007/htm
🆔@BioUT
🆔@BioUT
Wednesday, September 22nd 2021
9AM PDT | 12PM EDT | 5PM BST | 6PM CEST
Emerging single-cell multi-omics sequencing technologies allow the capture of multiple modalities from a cell, including its epigenome, trannoscriptome, epitrannoscriptome and proteome. This combination of multiple layers of information also requires tailor-made computational tools for integrative analyses. Multi-omics sequencing methods are ideally placed for molecular biology research (including tracing cell lineages, producing cell type atlases of various organs, and mapping cellular spatial information), and its disease relevance, specifically in cancer research (tumour heterogeneity, cancer progression and its interactions with the microenvironment, mechanisms of response or resistance to therapy) and complex disease genetics (causal genetic variants, genes, mechanisms, relevant cell types, and the discovery of drug targets).
🆔@BioUT
Wednesday, September 22nd 2021
9AM PDT | 12PM EDT | 5PM BST | 6PM CEST
Emerging single-cell multi-omics sequencing technologies allow the capture of multiple modalities from a cell, including its epigenome, trannoscriptome, epitrannoscriptome and proteome. This combination of multiple layers of information also requires tailor-made computational tools for integrative analyses. Multi-omics sequencing methods are ideally placed for molecular biology research (including tracing cell lineages, producing cell type atlases of various organs, and mapping cellular spatial information), and its disease relevance, specifically in cancer research (tumour heterogeneity, cancer progression and its interactions with the microenvironment, mechanisms of response or resistance to therapy) and complex disease genetics (causal genetic variants, genes, mechanisms, relevant cell types, and the discovery of drug targets).
🆔@BioUT
Forwarded from زيست هنر
This media is not supported in your browser
VIEW IN TELEGRAM
BrainGate
این سامانه توسط یک رابط مغز-کامپیوتر امواج مغزی را از یک فرد معلول دریافت میکند. وقتی فرد به نوشتن حروف انگلیسی فکر میکند، امواج مغزی ثبتشده توسط #هوش_مصنوعی به صورت متن درمیآیند. سرعت این سامانه ۱۸ کلمه (۹۰ کاراکتر) بر دقیقه است و دقت آن ۹۴ درصد تخمین زده شده است.
#فیلم
#نوروساینس
@BioArts
این سامانه توسط یک رابط مغز-کامپیوتر امواج مغزی را از یک فرد معلول دریافت میکند. وقتی فرد به نوشتن حروف انگلیسی فکر میکند، امواج مغزی ثبتشده توسط #هوش_مصنوعی به صورت متن درمیآیند. سرعت این سامانه ۱۸ کلمه (۹۰ کاراکتر) بر دقیقه است و دقت آن ۹۴ درصد تخمین زده شده است.
#فیلم
#نوروساینس
@BioArts
🆔@BioUT
The US scientists who created the first living robots say the life forms, known as xenobots, can now reproduce -- and in a way not seen in plants and animals.
https://www.google.com/amp/s/amp.cnn.com/cnn/2021/11/29/americas/xenobots-self-replicating-robots-scn/index.html
🆔@BioUT
The US scientists who created the first living robots say the life forms, known as xenobots, can now reproduce -- and in a way not seen in plants and animals.
https://www.google.com/amp/s/amp.cnn.com/cnn/2021/11/29/americas/xenobots-self-replicating-robots-scn/index.html
🆔@BioUT
🆔@BioUT
The 2022 Hardiman Scholarship applications are now open
Who are these scholarships for?
Students starting their PhD in September 2022. The Hardiman PhD Scholarships are fully funded for four years, with a stipend of €18,500 p.a. plus fee waiver. High-achieving individuals, with drive and passion, who have an appetite for the research world and creativity, who thrive on intellectual excitement, and who will positively impact and shape the future for all in our society. Using your creative energy, your PhD journey at NUI Galway will be alive with possibilities and opportunities.
http://www.nuigalway.ie/hardiman-scholarships/
🆔@BioUT
The 2022 Hardiman Scholarship applications are now open
Who are these scholarships for?
Students starting their PhD in September 2022. The Hardiman PhD Scholarships are fully funded for four years, with a stipend of €18,500 p.a. plus fee waiver. High-achieving individuals, with drive and passion, who have an appetite for the research world and creativity, who thrive on intellectual excitement, and who will positively impact and shape the future for all in our society. Using your creative energy, your PhD journey at NUI Galway will be alive with possibilities and opportunities.
http://www.nuigalway.ie/hardiman-scholarships/
🆔@BioUT
🆔@BioUT
https://www.youtube.com/watch?v=9ksLuRoEq6A
Living brain cells in a dish can learn to play Pong when they are placed in what researchers describe as a "virtual game world".
🆔@BioUT
https://www.youtube.com/watch?v=9ksLuRoEq6A
Living brain cells in a dish can learn to play Pong when they are placed in what researchers describe as a "virtual game world".
🆔@BioUT
🆔@BioUT
Japanese scientists develop vaccine to eliminate cells behind aging
https://www.youtube.com/watch?v=-JtRzkzYysw
🆔@BioUT
Japanese scientists develop vaccine to eliminate cells behind aging
https://www.youtube.com/watch?v=-JtRzkzYysw
🆔@BioUT
YouTube
Japanese researchers create a 'vaccine' against getting old
Japanese scientists develop vaccine to eliminate cells behind aging
A Japanese research team said it developed a vaccine to remove so-called zombie cells that accumulate with age and damage nearby cells, causing aging-related diseases including arterial…
A Japanese research team said it developed a vaccine to remove so-called zombie cells that accumulate with age and damage nearby cells, causing aging-related diseases including arterial…
🆔@BioUT
بزرگترین رویداد بینالمللی بیوانفورماتیک کشور
با همکاری انجمن بیوانفورماتیک ایران و پردیسهای بینالمللی دانشگاه تهران و دانشگاه علوم پزشکی تهران در جزیره کیش
اولین کنفرانس بینالمللی و دهمین کنفرانس ملی بیوانفورماتیک ایران
سوم تا پنجم اسفند ماه ۱۴۰۰
مهلت ارسال چکیده مقالات: ۱۹ بهمن ۱۴۰۰
وبسایت همایش: icb10.ut.ac.ir
ما را در شبکههای اجتماعی دنبال بفرمایید:
لینکداین:
https://www.linkedin.com/in/iranian-bioinformatics-society-ibis-8b9a65120/
تلگرام:
https://news.1rj.ru/str/IranianBioinformaticsSociety
واتس آپ:
https://chat.whatsapp.com/IB0EGSGCiYhH2BYNJUyOGC
توییتر:
https://twitter.com/IrBioInfoSoc
اینستاگرام:
www.instagram.com/ibis1383
🆔@BioUT
بزرگترین رویداد بینالمللی بیوانفورماتیک کشور
با همکاری انجمن بیوانفورماتیک ایران و پردیسهای بینالمللی دانشگاه تهران و دانشگاه علوم پزشکی تهران در جزیره کیش
اولین کنفرانس بینالمللی و دهمین کنفرانس ملی بیوانفورماتیک ایران
سوم تا پنجم اسفند ماه ۱۴۰۰
مهلت ارسال چکیده مقالات: ۱۹ بهمن ۱۴۰۰
وبسایت همایش: icb10.ut.ac.ir
ما را در شبکههای اجتماعی دنبال بفرمایید:
لینکداین:
https://www.linkedin.com/in/iranian-bioinformatics-society-ibis-8b9a65120/
تلگرام:
https://news.1rj.ru/str/IranianBioinformaticsSociety
واتس آپ:
https://chat.whatsapp.com/IB0EGSGCiYhH2BYNJUyOGC
توییتر:
https://twitter.com/IrBioInfoSoc
اینستاگرام:
www.instagram.com/ibis1383
🆔@BioUT
🆔@BioUT
Keynote Speakers of 1st Internationanl Conference and 10th National Conference of Iranian Bioinformatics
🇮🇷Iran
🏝Kish Island
✅Dr Limsoon Wong
✅Dr Andreas Bender
✅Dr Wing-Kin Sung
✅Dr Janathan Pevsner
✅Dr Ali Shojaei
✅Dr Iman Hajirasouliha
✅Dr Mahmoud Ghandi
✅Dr Mohammad R.K.Mofrad
❗️Note: The list of speakers is being completed
#Bioinformatics
#International_Conference
#University_of_Tehran
#Tehran_University_of_Medical_Sciences
#Kish_Island
#February 2022
🆔@BioUT
Keynote Speakers of 1st Internationanl Conference and 10th National Conference of Iranian Bioinformatics
🇮🇷Iran
🏝Kish Island
✅Dr Limsoon Wong
✅Dr Andreas Bender
✅Dr Wing-Kin Sung
✅Dr Janathan Pevsner
✅Dr Ali Shojaei
✅Dr Iman Hajirasouliha
✅Dr Mahmoud Ghandi
✅Dr Mohammad R.K.Mofrad
❗️Note: The list of speakers is being completed
#Bioinformatics
#International_Conference
#University_of_Tehran
#Tehran_University_of_Medical_Sciences
#Kish_Island
#February 2022
🆔@BioUT
🆔@BioUT
Title: The Elements of Statistical Learning: Data Mining, Inference, and Prediction
Springer series in statistics, ISSN 0172-7397
Authors: Trevor Hastie, Robert Tibshirani, Jerome H. Friedman
Edition: 2
Publisher: Springer, 2009
ISBN: 0387848843, 9780387848846
Length: 745 pages
"During the past decade there has been an explosion in computation and information technology. With it have come vast amounts of data in a variety of fields such as medicine, biology, finance, and marketing. The challenge of understanding these data has led to the development of new tools in the field of statistics, and spawned new areas such as data mining, machine learning, and bioinformatics."
🆔@BioUT
Title: The Elements of Statistical Learning: Data Mining, Inference, and Prediction
Springer series in statistics, ISSN 0172-7397
Authors: Trevor Hastie, Robert Tibshirani, Jerome H. Friedman
Edition: 2
Publisher: Springer, 2009
ISBN: 0387848843, 9780387848846
Length: 745 pages
"During the past decade there has been an explosion in computation and information technology. With it have come vast amounts of data in a variety of fields such as medicine, biology, finance, and marketing. The challenge of understanding these data has led to the development of new tools in the field of statistics, and spawned new areas such as data mining, machine learning, and bioinformatics."
🆔@BioUT
🆔@BioUT
Science visualization trends of 2021
Reviewing a year of data viz
At the end of the year people take stock and reminisce. This also applies to data visualization scientists. Reviews summarizing the best visualizations of 2021 were published. I particularly enjoy Maarten Lambrechts summary of all the “Best of 2021” posts.
This year, while musing whether to keep or toss my Nature print issues (still undecided!), I browsed the science visualizations of 2021. Well, I checked those about biology and medicine as I really do not understand enough of physics to get the visualizations in Nature. Some visualizations and themes really stood out so I decided to summarize for you the top 10 science visualization trends of 2021 – enjoy!
https://helenajambor.wordpress.com/2022/01/04/science-visualization-trends-of-2021/?s=09
🆔@BioUT
Science visualization trends of 2021
Reviewing a year of data viz
At the end of the year people take stock and reminisce. This also applies to data visualization scientists. Reviews summarizing the best visualizations of 2021 were published. I particularly enjoy Maarten Lambrechts summary of all the “Best of 2021” posts.
This year, while musing whether to keep or toss my Nature print issues (still undecided!), I browsed the science visualizations of 2021. Well, I checked those about biology and medicine as I really do not understand enough of physics to get the visualizations in Nature. Some visualizations and themes really stood out so I decided to summarize for you the top 10 science visualization trends of 2021 – enjoy!
https://helenajambor.wordpress.com/2022/01/04/science-visualization-trends-of-2021/?s=09
🆔@BioUT