#سمینارهای_دوهفتگی_بیوانفورماتیک
#موضوع پیشگویی ساختار RNAبه روش شبکه عصبی
#توسط لطفی-روزبهانی
امروز، ۶ دی، ساعت ۱۶:۳۰، اتاق ۳۱۱

@CBRC_aut

برگزاری سمینارهای دو هفتگی بیوانفورماتیک

از ۱۵ مهرماه
دوشنبه ها
ساعت ۱۳-۱۵
اتاق ۳۱۳ دانشکده ریاضی و علوم کامپیوتر دانشگاه امیرکبیر
@icobi1

برگزاری سمینار های بیوانفورماتیک
موضوع: سرهم سازی ژنوم
توسط خانم فرزانه سالاری
دوشنبه ۱۵ مهر، ساعت ۱-۳
دانشکده ریاضی و علوم کامپیوتر دانشگاه امیرکبیر
اتاق ۳۱۳

خلاصه:
تعیین توالی ژنوم موجودات با آنچه که تکنولوژی‌های توالی‌یابی نسل جدید در مقیاس انبوه نامیده می‌شود، یکی از مباحث ‌‎داغ در زیست‌شناسی می‌باشد.
حجم زیاد داده‌های حاصل و هزینه‌ی کم این تکنولوژی‌ها، به‌دست آوردن توالی تعداد بسیار زیادی از قطعات کوتاه در ژنوم موجودات را امکان پذیر می‌‌سازد. با این وجود‏، بازسازی ژنوم با داشتن این قطعات کوتاه مساله‌ای دشوار است که بدون داشتن راه‌حل محاسباتی کارا برای آن نمی‌توان از این داده‌ها استفاده نمود. از این‌رو‏، مساله‌ی سرهم‌سازی ژنوم یکی از اساسی‌ترین مسائل در بیوانفورماتیک است.
در یک دهه‌ی گذشته، الگوریتم‌های مختلفی برای سرهم‌سازی ژنوم از ابتدا و بر اساس مرجع روی داده‌های با طول کوتاه توسعه یافتند که تمرکز اصلی ما بر روی سرهم‌سازی ژنوم بر اساس مرجع می‌باشد. در این کار، چارچوب ‌‎جدیدی ارایه می‌کنیم که کیفیت توالی‌های ژنوم‌ بازسازی شده را از طریق حل مشکل خوانش‌های چندنگاشته، بهبود می‌بخشد.
برای دست‌یابی به این هدف، فضای جستجو برای خوانش‌هایی که به طور نادقیق روی ژنوم نگاشت می‌شوند را کاهش می‌دهیم تا احتمال نگاشت نادرست خوانش‌ها کم شود. ارزیابی نتایج اجرای چارچوب روی مجموعه‌های داده شبیه‌سازی شده و واقعی نشان می‌دهد که نرخ خطای ژنوم‌های بازسازی شده کاهش یافته است. بنابراین می‌توان از این چارچوب به عنوان یک ابزار پس پردازش در سرهم‌سازی ژنوم بهره برد.

برگزاری سمینار های بیوانفورماتیک
موضوع: مدلسازی تصادفی DNA
توسط خانم فاضله صالحی
دوشنبه 29 مهر، ساعت ۱-۳
دانشکده ریاضی و علوم کامپیوتر دانشگاه امیرکبیر
اتاق 313

برگزاری سمینار های بیوانفورماتیک
موضوع: drug repositioning
توسط خانم دکتر فاطمه زارع
دوشنبه۱۳ آبان، ساعت ۱-۳
دانشکده ریاضی و علوم کامپیوتر دانشگاه امیرکبیر
اتاق 313
@cbrc_aut

Abstract

De novo drug discovery is a time-consuming and expensive process. Nowadays, drug repositioning is utilized as a common strategy to discover a new drug indication for existing drugs.
This strategy is mostly used in cases with a limited number of candidate pairs of drugs and diseases.
In other words, they are not scalable to a large number of drugs and diseases. Most of the in-silico methods mainly focus on linear approaches while non-linear models are still scarce for new indication predictions.
Therefore, applying non-linear computational approaches can offer an opportunity to predict possible drug repositioning candidates.

برگزاری سمینار های بیوانفورماتیک
موضوع: پیش بینی ساختار RNA
توسط آقای پرهام حافظی
دوشنبه۱۱ آذر، ساعت ۱-۳
دانشکده ریاضی و علوم کامپیوتر دانشگاه امیرکبیر
اتاق 313

برگزاری سمینار های بیوانفورماتیک
موضوع: برهمکنش RNA-RNA
توسط آقای فواد عبدی
دوشنبه ۲۵ آذر، ساعت ۱-۳
دانشکده ریاضی و علوم کامپیوتر دانشگاه امیرکبیر
اتاق 313
@CBRC_aut

#توجه
با توجه به تعطیلی مراکز آموزشی و دانشگاهی در روز ۲۵ آذر، جلسه فردا برگزار نخواهد شد

برگزاری سمینار های بیوانفورماتیک
موضوع: برهمکنش RNA-RNA
توسط آقای فواد عبدی
دوشنبه ۹ دی، ساعت ۱-۳
دانشکده ریاضی و علوم کامپیوتر دانشگاه امیرکبیر
اتاق 313
@CBRC_aut

دفاع از رساله دکتری
سرکار خانم فاصله سادات صالحی
با موضوع:
" مدل سازی فرآیند ترمیم شکست های دو رشته ای DNA در طی چرخه سلولی "

دوشنبه، 7 بهمن 1398، ساعت 15
دانشکده ریاضی و علوم کامپیوتر، اتاق 311

@CBRC_aut

《برگزاری سمینار بیوانفورماتیک 》



موضوع: کشف امضاهای موتاسیونی جدید با استفاده از تخصیص دیریکله پنهان ترکیبی

ارائه دهنده: #مینا_شایگان

زمان: چهارشنبه، ۲ مهرماه ۱۳۹۹، ساعت ۱۸:۳۰

این سمینار به صورت مجازی برگزار خواهد گردید و حضور برای عموم آزاد است.

جهت دریافت اطلاعات بیشتر، کانال CBRC را دنبال نمایید.

@CBRC_aut

#خلاصه_سمینار 🧬🧬

ژنوم یک سلول سرطانی حامل جهش‌های سوماتیک است که در نتیجه عملکرد فرایندهای آسیب و ترمیم دی‌ان‌ای (مانند اشعه فرابنفش، تنباکو و ... ) از بدو تولد تا زمان پیدایش سلول سرطانی به وجود می‌آیند.


این فرایندهای جهش‌زا دارای الگوی جهشی خاصی هستند که به خوبی مشخص نشده‌اند.

تکنیک‌های توالی‌یابی این فرصت را به ما می‌دهند تا با به دست آوردن کاتالوگ‌های جهش‌های سوماتیک از ژنوم کامل افراد سرطانی، امضاهای فرایندهای جهش‌زا را در سرطان انسانی کشف کنیم.

با داشتن این امضاهای جهش، می‌توانیم مکانیسم پاتوژنتیک همه سرطان‌ها را درک و در نتیجه به تشخیص زودهنگام سرطان نیز کمک نماییم.

#مینا_شایگان

@CBRC_aut

سلام و عرض ادب

سمینارهای آزمایشگاه CBRC به صورت برخط برگزار می گردند و شرکت برای عموم رایگان است.
بستر مورد استفاده این مجموعه،Adobe connect می باشد.

📌لینک اتصال ما:

https://meeting.aut.ac.ir/bioinformatic/
جهت حضور می توانید از پانزده دقیقه قبل از شروع اقدام نمایید.
@CBRC_aut

پس از ورود نام خود، روی گزینه Enter room بالا کلیک نمایید. توجه نمایید که حتما نام خود را به صورت کامل بنویسید.
@CBRC_aut

در صورت داشتن نرم افزار، می توانید سمینار را روی سیستم خود و با استفاده از Adobe connect دنبال نمایید. در غیر این صورت روی open in browser کلیک نمایید
@CBRC_aut

جهت دانلود نرم افزار Adobe connect از لینکهای زیر می توانید اقدام نمایید

📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌


لینک دانلود نرم افزار برای IOS

https://apps.apple.com/us/app/adobe-connect/id430437503


📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌


لینک دانلود نرم افزار برای Android

https://play.google.com/store/apps/details?id=air.com.adobe.connectpro


📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌


لینک مستقیم دانلود نرم افزار برای Android


http://dl.tehranserver.ir/adobeconnect/Adobe_Connect_meeting_application/Adobe%20Connect_v2.6.9.apk



📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌


لینک مستقیم دانلود نرم افزار برای ویندوز


http://dl.tehranserver.ir/adobeconnect/ConnectAppSetup2020_1_5.exe


📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌📌


لینک مستقیم دانلود نرم افزار برای مکینتاش


http://dl.tehranserver.ir/adobeconnect/AdobeConnect_2019.1.1.dmg