#اینفوگرافی
آشنایی با انواع تست الیزا
@irbioinformatics

معرفی ژورنال
ژورنال Mobile DNA یکی از ژورنال های مجموعه BMC است که توسط انتشارات اشپرینگر چاپ می شود و حوزه تخصصی مطالبی که در این مجله چاپ می شود در رابطه با عناصر جهنده ژنومی است. این ژورنال عوامل دخیل در تشکیل و حرکت و تنظیم رفتار عوامل جهنده ژنتیکی چه در پروکاریوت ها و چه در یوکاریوت ها را چاپ می کند.
اگر در پایان نامه یا پروژه خود دیتاهایی دارید که در رابطه با عناصر جهنده ژنومی مانند ترانسپوزون ها، عوامل LTR، عومل LINE & SINE و ... است می توانید شانس خود را برای چاپ داده های مورد نظر در این ژورنال را امتحان کنید.
ایمپکت فاکتور این ژورنال 4.7 می باشد زمان تصمیم گیری برای چاپ یا عدم چاپ مقاله در این ژورنال تنها 6 روز است و پروسه سابمیت تا اکسپت در آن 96 روز طول می کشد.
@irbioinformatics

معرفی مقاله
A beginner’s guide to manual curation of transposable elements
در مطالعه عناصر ترانسپوزون (TEs)، ایجاد یک مجموعه با اعتماد بالا از توالی‌های توافقی که تنوع عناصر ترانسپوزون موجود در یک ژنوم خاص را نشان می‌دهد، گام کلیدی در مسیر بررسی این عناصر جذاب ژنومی است. الگوریتم‌ها و ابزارهای متعددی برای شناسایی خودکار خانواده‌های احتمالی ترانسپوزون در یک ژنوم در دسترس هستند. با وجود این منابع ارزشمند، تولید یک کتابخانه از توالی‌های توافقی کامل و با کیفیت بالا از عناصر ترانسپوزون همچنان عمدتاً فرآیندی نیازمند بررسی و ویرایش دستی است. این دانش معمولاً به صورت تجربی از مربی به شاگرد در گروه‌های تحقیقاتی منتقل می‌شود که دسترسی افراد خارج از این حوزه به این مهارت تخصصی را دشوار می‌سازد....در این مقاله این مورد به دقت توضیح داده شده است.
@irbioinformatics

جنگجوی زندگیتون باشین همیشه همه جا🤞💪

مراحل انجام آنالیز داده های RNAseq
برای هر مرحله ابزارهای مختلفی وجود دارد که در ادامه به توضیح روش ها و ابزارهای موجود حواهیم پرداخت
@irbioinformatics

یه زمانی تو قرن ۱۹ اقای رابرت بوش زندگی می‌کرد ایشون از کارافرینان اون دوره بودن که کارخانه جات بوش رو بنا نهادن، برندی که الان تو حوزه لوازم خانگی جز بهترین هاست ایشون یه شعاری داشتن که میگفت
“I would rather lose money than trust.”
همین شعار باعث شد جز اولین ها باشه که خدمات پس از فروش رو راه بندازه و اولین کسی بود که در سال ۱۹۱۳ در صنعت ورکشاپای اموزشی برگزار کرد تا شاگردای جوانش رو تربیت کنه و تعلیم بده و امور کارخونه هاش بهشون بسپره. وقتی به گذشتش نگاه کردم دیدم ایشون یکی از پیشگامان سرمایه گذاری روی اختراعات جدید بوده و کلی ایده های جدید ساپورت میکرده. واقعا کارش بی نظیر بوده

کدون های اسید آمینه ها
Amino acids
😍

داشتم فکر میکردم دیدم بهترین پناهگاه تو تهران، ایستگاه مترو تجریشه. لامصب اگه دو طبقه دیگه بره پایین به هسته زمین میرسه.😂

معرفی نرم افزار Pandora
ابزار پاندورا یکی از ابزارهای کلیدی بیوانفورماتیکی است که با هدایت پرفسور Li C. Xue از دانشگاه Radboud هلند و محقق ارشد تیم ایشان سرکار خانم دکتر فرزانه میمندی به منظور بررسی برهمکنش های پپتید-کمپلکس MHCII طراحی و ارائه شده است. این ابزار با دقت بالایی برهمکنش های پپتید-MHCII را پیش بینی می کند و می توان از آن به عنوان ابزاری هدفمند و کاربردی در مطالعات سرطان استفاده نمود.
اطلاعات بیشتر را از اینجا بخوانید

📚 چند توصيه براي خواندن حجم زيادی از مقالات

1️⃣خواندن عنوان و چكيده: ابتدا بايد عنوان و چكيده را به دقت مطالعه كنيد اين كار برای اين منظور است که ارتباط موضوع مقاله با موضوع خود را درک كنيد.

2️⃣خواندن مقدمه و نتيجه گيری: مي توان گفت قسمت اعظم مقاله در مقدمه و نتيجه گيری خلاصه شده است پس با خواندن آن بهتر می توانيد تصميم گيری كنيد كه اين مقاله را انتخاب كنيد يا خیر.

3️⃣خواندن بحث: اگر با خواندن بحث به اين نتيجه رسيديد كه موضوع مقاله در راستاي موضوع شماست، به احتمال زياد اين مقاله برای استفاده انتخاب می شود.

‌● اكنون كه مقاله ای با اطمينان زياد در دست داريد، خواندن قسمت نتايج توصيه می شود براي خواندن اين قسمت كافيست جملات ابتدايی پاراگراف ها را مطالعه كنيد تا به موضوع پی ببريد.

‌● همچنين قسمت منابع می تواند كمك زيادي برای دستیابی به مقالات مرتبط با موضوع شما كند پس از آن غافل نشويد.

‌● با طی كردن اين مراحل تعداد مقالات باقيمانده كه از بين حجم زيادی از آنها انتخاب می شوند كارآمد ترين مقالات در رابطه با موضوع شما هستند پس براي خواندن كامل و با دقت آن برنامه ريزی كنيد.

یه قطعه‌ی ماشین‌چینی‌ رفیقم خراب شده، ۲ جا پیدا کرده، مشهد بهش گفتن ۷تومن، اصفهان گفته ۱۰تومن.
اینم رو حساب اینکه از اصفهان زودتر میرسه رفته ۱۰ تومن رو داده که زود راه بیافته.
بارنامه رو فرستاد، دیدیم اصفهانیه خودش از مشهدیه خریده،۳ تومن کشیده روش داده به این.😂

ژورنال e-life یه روش جدید چاپ مقاله ارائه کرده.این روش از ۳۱ ژانویه ۲۰۲۳ اجرایی شده رویه به این صورته که مقاله رو میفرستی، اگه استاندارد باشه، میفرستن برای داوری. نظر داورها چه اکسپت باشه چه ریجکت در هرصورت مقاله چاپ میشه، و همه میتونن کامنت ها و نتیجه رو ببینن و همیشه ام قابل ریوایزه. یعنی مقاله دیگه خاک نمیخوره تا یه جا نشونش بدن 😁🤏♧

شوخی با پمپ سدیم-پتاسیم ATPase😂🤏•

#دانستنی_ها
دیوید بیکر، پیشگام زیست‌شناسی محاسباتی، به‌تازگی به‌خاطر کار تحول‌آفرین خود در طراحی پروتئین، برنده جایزه نوبل شیمی شد. دستاوردهای او تأثیر عمیقی بر علوم پایه و زیست‌فناوری کاربردی داشته و درک ما از تاخوردگی پروتئین‌ها را دگرگون کرده و راه را برای ایجاد پروتئین‌های جدید با عملکردهای هدفمند هموار ساخته است.

تحقیقات بیکر پیرامون ابزار Rosetta، یک پلتفرم محاسباتی پیچیده که توسط تیم او برای پیش‌بینی و طراحی ساختارهای پروتئینی توسعه یافته، متمرکز است. با استفاده از Rosetta، تیم او توانسته یکی از چالش‌های اصلی زیست‌شناسی را برطرف کند: پیش‌بینی دقیق ساختار سه‌بعدی پروتئین بر اساس توالی آمینواسیدی آن. این پیشرفت درک ما از چگونگی شکل‌گیری ساختارهای فعال پروتئین‌ها، که یک جنبه اساسی در بسیاری از فرآیندهای زیستی است، را به‌طور چشمگیری افزایش داده است.

یکی از چشمگیرترین دستاوردهای بیکر در زمینه طراحی پروتئین دی نوو است—یعنی ساخت پروتئین‌های کاملاً جدید که در طبیعت وجود ندارند. تیم او پروتئین‌هایی با دقت بی‌نظیر طراحی کرده‌اند که قادر به اتصال به مولکول‌های خاص، کاتالیز واکنش‌های شیمیایی، و حتی ایفای نقش به‌عنوان عوامل درمانی بالقوه هستند. این پروتئین‌های مهندسی‌شده اکنون امکان نوآوری در حوزه‌هایی از کشف دارو گرفته تا نانوفناوری را فراهم می‌کنند.
@irbioinformatics