داشتم فکر میکردم دیدم بهترین پناهگاه تو تهران، ایستگاه مترو تجریشه. لامصب اگه دو طبقه دیگه بره پایین به هسته زمین میرسه.😂
😁16👍1
معرفی نرم افزار Pandora
ابزار پاندورا یکی از ابزارهای کلیدی بیوانفورماتیکی است که با هدایت پرفسور Li C. Xue از دانشگاه Radboud هلند و محقق ارشد تیم ایشان سرکار خانم دکتر فرزانه میمندی به منظور بررسی برهمکنش های پپتید-کمپلکس MHCII طراحی و ارائه شده است. این ابزار با دقت بالایی برهمکنش های پپتید-MHCII را پیش بینی می کند و می توان از آن به عنوان ابزاری هدفمند و کاربردی در مطالعات سرطان استفاده نمود.
اطلاعات بیشتر را از اینجا بخوانید
ابزار پاندورا یکی از ابزارهای کلیدی بیوانفورماتیکی است که با هدایت پرفسور Li C. Xue از دانشگاه Radboud هلند و محقق ارشد تیم ایشان سرکار خانم دکتر فرزانه میمندی به منظور بررسی برهمکنش های پپتید-کمپلکس MHCII طراحی و ارائه شده است. این ابزار با دقت بالایی برهمکنش های پپتید-MHCII را پیش بینی می کند و می توان از آن به عنوان ابزاری هدفمند و کاربردی در مطالعات سرطان استفاده نمود.
اطلاعات بیشتر را از اینجا بخوانید
👍6❤1
📚 چند توصيه براي خواندن حجم زيادی از مقالات
1️⃣خواندن عنوان و چكيده: ابتدا بايد عنوان و چكيده را به دقت مطالعه كنيد اين كار برای اين منظور است که ارتباط موضوع مقاله با موضوع خود را درک كنيد.
2️⃣خواندن مقدمه و نتيجه گيری: مي توان گفت قسمت اعظم مقاله در مقدمه و نتيجه گيری خلاصه شده است پس با خواندن آن بهتر می توانيد تصميم گيری كنيد كه اين مقاله را انتخاب كنيد يا خیر.
3️⃣خواندن بحث: اگر با خواندن بحث به اين نتيجه رسيديد كه موضوع مقاله در راستاي موضوع شماست، به احتمال زياد اين مقاله برای استفاده انتخاب می شود.
● اكنون كه مقاله ای با اطمينان زياد در دست داريد، خواندن قسمت نتايج توصيه می شود براي خواندن اين قسمت كافيست جملات ابتدايی پاراگراف ها را مطالعه كنيد تا به موضوع پی ببريد.
● همچنين قسمت منابع می تواند كمك زيادي برای دستیابی به مقالات مرتبط با موضوع شما كند پس از آن غافل نشويد.
● با طی كردن اين مراحل تعداد مقالات باقيمانده كه از بين حجم زيادی از آنها انتخاب می شوند كارآمد ترين مقالات در رابطه با موضوع شما هستند پس براي خواندن كامل و با دقت آن برنامه ريزی كنيد.
1️⃣خواندن عنوان و چكيده: ابتدا بايد عنوان و چكيده را به دقت مطالعه كنيد اين كار برای اين منظور است که ارتباط موضوع مقاله با موضوع خود را درک كنيد.
2️⃣خواندن مقدمه و نتيجه گيری: مي توان گفت قسمت اعظم مقاله در مقدمه و نتيجه گيری خلاصه شده است پس با خواندن آن بهتر می توانيد تصميم گيری كنيد كه اين مقاله را انتخاب كنيد يا خیر.
3️⃣خواندن بحث: اگر با خواندن بحث به اين نتيجه رسيديد كه موضوع مقاله در راستاي موضوع شماست، به احتمال زياد اين مقاله برای استفاده انتخاب می شود.
● اكنون كه مقاله ای با اطمينان زياد در دست داريد، خواندن قسمت نتايج توصيه می شود براي خواندن اين قسمت كافيست جملات ابتدايی پاراگراف ها را مطالعه كنيد تا به موضوع پی ببريد.
● همچنين قسمت منابع می تواند كمك زيادي برای دستیابی به مقالات مرتبط با موضوع شما كند پس از آن غافل نشويد.
● با طی كردن اين مراحل تعداد مقالات باقيمانده كه از بين حجم زيادی از آنها انتخاب می شوند كارآمد ترين مقالات در رابطه با موضوع شما هستند پس براي خواندن كامل و با دقت آن برنامه ريزی كنيد.
👍12😁1
یه قطعهی ماشینچینی رفیقم خراب شده، ۲ جا پیدا کرده، مشهد بهش گفتن ۷تومن، اصفهان گفته ۱۰تومن.
اینم رو حساب اینکه از اصفهان زودتر میرسه رفته ۱۰ تومن رو داده که زود راه بیافته.
بارنامه رو فرستاد، دیدیم اصفهانیه خودش از مشهدیه خریده،۳ تومن کشیده روش داده به این.😂
اینم رو حساب اینکه از اصفهان زودتر میرسه رفته ۱۰ تومن رو داده که زود راه بیافته.
بارنامه رو فرستاد، دیدیم اصفهانیه خودش از مشهدیه خریده،۳ تومن کشیده روش داده به این.😂
😁19
ژورنال e-life یه روش جدید چاپ مقاله ارائه کرده.این روش از ۳۱ ژانویه ۲۰۲۳ اجرایی شده رویه به این صورته که مقاله رو میفرستی، اگه استاندارد باشه، میفرستن برای داوری. نظر داورها چه اکسپت باشه چه ریجکت در هرصورت مقاله چاپ میشه، و همه میتونن کامنت ها و نتیجه رو ببینن و همیشه ام قابل ریوایزه. یعنی مقاله دیگه خاک نمیخوره تا یه جا نشونش بدن 😁🤏♧
😁8
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
#اخبار_بیوتکنولوژی با افتخار آلبومین و آیویآیجی (ivig) تولید شده در بزرگترین پالایشگاه پلاسمای ایران وارد بازار شدند مدیرعامل شرکت نوژین زیست فارمد از ورود محصولات بزرگترین پالایشگاه پلاسمای کشور به بازار در ماه گذشته خبر داد و گفت: پالایشگاه پلاسمای نوژین…
در حاشیه مراسم رونمایی از دو محصول کلیدی دارویی کشور
خوشحالم که جز تیمی بودم که تونستیم در بزرگترین مجموعه پلایشگاهی پلاسمای کشور دو داروی ارزشمند آلبومین و IVIG را به صورت انبوه تولید کنیم. کار کردن در کنار مغز متفکر این پروژه جناب اقای دکتر جعفر آقایی عزیز دانشمند جوان و برجسته، مدیر با اخلاق و توانمند تضمین کیفیت پروژه آقای مهندس پوربابا و اقای مهندس طوسی مدیر جسور و توانمند و کاربلد پروژه و همه دوستان دیگه درس هایی به من یاد داد که شیوه فکری و یادگیری من رو تغییر داد و باعث شد با تمام وجود در مسیری قدم بردارم که لحظه به لحظه کار کردن در آن مقدس و با برکت بود. و افتخار بزرگتر کسب تجربه از کلمه کلمه صحبت های پرفسور فریدون مهبودی است که بنیانگذار و مدیر این پروژه دارویی است.
@irbioinformatics
خوشحالم که جز تیمی بودم که تونستیم در بزرگترین مجموعه پلایشگاهی پلاسمای کشور دو داروی ارزشمند آلبومین و IVIG را به صورت انبوه تولید کنیم. کار کردن در کنار مغز متفکر این پروژه جناب اقای دکتر جعفر آقایی عزیز دانشمند جوان و برجسته، مدیر با اخلاق و توانمند تضمین کیفیت پروژه آقای مهندس پوربابا و اقای مهندس طوسی مدیر جسور و توانمند و کاربلد پروژه و همه دوستان دیگه درس هایی به من یاد داد که شیوه فکری و یادگیری من رو تغییر داد و باعث شد با تمام وجود در مسیری قدم بردارم که لحظه به لحظه کار کردن در آن مقدس و با برکت بود. و افتخار بزرگتر کسب تجربه از کلمه کلمه صحبت های پرفسور فریدون مهبودی است که بنیانگذار و مدیر این پروژه دارویی است.
@irbioinformatics
👍8👏1
#دانستنی_ها
دیوید بیکر، پیشگام زیستشناسی محاسباتی، بهتازگی بهخاطر کار تحولآفرین خود در طراحی پروتئین، برنده جایزه نوبل شیمی شد. دستاوردهای او تأثیر عمیقی بر علوم پایه و زیستفناوری کاربردی داشته و درک ما از تاخوردگی پروتئینها را دگرگون کرده و راه را برای ایجاد پروتئینهای جدید با عملکردهای هدفمند هموار ساخته است.
تحقیقات بیکر پیرامون ابزار Rosetta، یک پلتفرم محاسباتی پیچیده که توسط تیم او برای پیشبینی و طراحی ساختارهای پروتئینی توسعه یافته، متمرکز است. با استفاده از Rosetta، تیم او توانسته یکی از چالشهای اصلی زیستشناسی را برطرف کند: پیشبینی دقیق ساختار سهبعدی پروتئین بر اساس توالی آمینواسیدی آن. این پیشرفت درک ما از چگونگی شکلگیری ساختارهای فعال پروتئینها، که یک جنبه اساسی در بسیاری از فرآیندهای زیستی است، را بهطور چشمگیری افزایش داده است.
یکی از چشمگیرترین دستاوردهای بیکر در زمینه طراحی پروتئین دی نوو است—یعنی ساخت پروتئینهای کاملاً جدید که در طبیعت وجود ندارند. تیم او پروتئینهایی با دقت بینظیر طراحی کردهاند که قادر به اتصال به مولکولهای خاص، کاتالیز واکنشهای شیمیایی، و حتی ایفای نقش بهعنوان عوامل درمانی بالقوه هستند. این پروتئینهای مهندسیشده اکنون امکان نوآوری در حوزههایی از کشف دارو گرفته تا نانوفناوری را فراهم میکنند.
@irbioinformatics
دیوید بیکر، پیشگام زیستشناسی محاسباتی، بهتازگی بهخاطر کار تحولآفرین خود در طراحی پروتئین، برنده جایزه نوبل شیمی شد. دستاوردهای او تأثیر عمیقی بر علوم پایه و زیستفناوری کاربردی داشته و درک ما از تاخوردگی پروتئینها را دگرگون کرده و راه را برای ایجاد پروتئینهای جدید با عملکردهای هدفمند هموار ساخته است.
تحقیقات بیکر پیرامون ابزار Rosetta، یک پلتفرم محاسباتی پیچیده که توسط تیم او برای پیشبینی و طراحی ساختارهای پروتئینی توسعه یافته، متمرکز است. با استفاده از Rosetta، تیم او توانسته یکی از چالشهای اصلی زیستشناسی را برطرف کند: پیشبینی دقیق ساختار سهبعدی پروتئین بر اساس توالی آمینواسیدی آن. این پیشرفت درک ما از چگونگی شکلگیری ساختارهای فعال پروتئینها، که یک جنبه اساسی در بسیاری از فرآیندهای زیستی است، را بهطور چشمگیری افزایش داده است.
یکی از چشمگیرترین دستاوردهای بیکر در زمینه طراحی پروتئین دی نوو است—یعنی ساخت پروتئینهای کاملاً جدید که در طبیعت وجود ندارند. تیم او پروتئینهایی با دقت بینظیر طراحی کردهاند که قادر به اتصال به مولکولهای خاص، کاتالیز واکنشهای شیمیایی، و حتی ایفای نقش بهعنوان عوامل درمانی بالقوه هستند. این پروتئینهای مهندسیشده اکنون امکان نوآوری در حوزههایی از کشف دارو گرفته تا نانوفناوری را فراهم میکنند.
@irbioinformatics
👍6
CryoEM structure of designed modular protein oligomer C6-79 (PDB code: 8F6R)
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
@irbioinformatics
اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی
@irbioinformatics
👍5
بررسی محصولات پرچم دار شرکت داروسازی عبیدی در بازار داروسازی ایران به همراه سهم هر دارو تولید شده توسط این کمپانی معتبر در بازار دارویی ایران
@irbioinformatics
@irbioinformatics
👍4
عبیدی.pdf
1.4 MB
بررسی محصولات پرچم دار شرکت داروسازی عبیدی در بازار داروسازی ایران به همراه سهم هر دارو تولید شده توسط این کمپانی معتبر در بازار دارویی ایران
@irbioinformatics
@irbioinformatics
👍4
نوآوریهای کشاورزی، مانند کشاورزی دقیق، بیوتکنولوژی گیاهی و شیوههای پایدار، برای امنیت غذایی جهانی و حفظ تنوع زیستی ضروری هستند. توسعه این فناوریها به کشاورزان این امکان را میدهد که غذای بیشتری را در همان زمین یا زمین کمتری تولید کنند، که منجر به کاهش تبدیل زیستگاهها، حفاظت از تنوع زیستی و کمک به اهداف کنوانسیون تنوع زیستی و چارچوب جهانی تنوع زیستی مرتبط میشود.
@irbioinformatics
@irbioinformatics
👍5
تکرارهای کوتاه و پالیندرومی مرتبسازی شده بهطور منظم (CRISPR) و پروتئینهای مرتبط (CRISPR-Cas) اجزای سیستم ایمنی تطبیقی پروکاریوتها هستند که از آنها در برابر حمله عناصر ژنتیکی متحرک (MGE) از طریق برش RNA راهنماییشدهی اسیدهای نوکلئیک هدف محافظت میکنند. ریبونوکلئازهای Cas13 با سازماندهی حوزههای متنوع و دو حوزه محافظتشده HEPN مشخص میشوند. پروتئینهای Cas13 بهطور کلی دارای دو فعالیت ریبونوکلئاز آنزیمی متمایز هستند که برای تداخل بهینه ضروری است. علاوه بر فعالیت برش RNA هدف که توسط حوزههای HEPN ارائه میشود، فعالیت پردازش pre-crRNA به پروتئینهای Cas13 کمک میکند تا مجتمعهای مداخلهای بالغ تشکیل دهند. علاوه بر فعالیت برش cis برنامهپذیر، پروتئینهای Cas13 فعالیت جانبی نیز در هنگام تعامل با RNA هدف از خود نشان میدهند که منجر به برش غیر انتخابی RNA محیط میشود. در اینجا میتوانید ساختار cryoEM یک آنزیم Cas13 را در ترکیب با gRNA و RNA هدف (کد PDB: 8WCE) مشاهده کنید.
@irbioinformatics
@irbioinformatics
👍5