پارامتر PAE می‌تواند به‌صورت یک نمودار PAE قابل‌تفسیر به تصویر کشیده شود. هر ساختار پروتئینی پیش‌بینی‌شده در پایگاه داده ساختار پروتئینی AlphaFold (AFDB) همراه با یک نمودار PAE است. این نمودار یک گراف دو بعدی است که رزیدیوهای پروتئینی در امتداد محورهای آن قرار دارند. در هر مربع، سایه سبز نشان‌دهنده خطای فاصله مورد انتظار به آنگستروم (Å) برای یک جفت رزیدیو است. یک مربع سبز تیره نشان‌دهنده پیش‌بینی خوب (خطای کم) است، در حالی که یک مربع سبز روشن در این گراف نشان‌دهنده پیش‌بینی ضعیف (خطای بالا) است.
@irbioinformatics

این متن دیدم خیلی قشنگ بود: مضمون کلیش اینه: به عنوان یک دانشجوی دکترا، خودتان را بپذیرید. از افراد معمولی مشاوره نگیرید. نسبت به انجام کار خوب و کمک به بشریت وسواس داشته باشید. همواره کنجکاو باشید. به شدت یاد بگیرید. این‌ها ویژگی‌های مثبت هستند.
@irbioinformatics

گفتم بذار جای تاکسی پیاده برم، هم ارزون‌تره هم سالم‌تر؛ تو راه بستنی، شیرکاکائو کیک و بادو‌م‌زمینی خوردم، نه ارزون شد نه سالم!

😂

🔴اولین دوره آنالیز و تفسیر داده های آماری در کشاورزی
(با استفاده از نرم افزارهای SAS,  SPSS,  R)

✅زمان برگزاری:
پس از تکمیل ظرفیت (آبان ماه ۱۴۰۳)

✅اعطای گواهینامه دو زبانه معتبر از سوی دانشکده کشاورزی دانشگاه تهران

✅ویژگی دوره:
➖ضبط محتوا و انتشار فایل های آموزشی
➖ایجاد گروه آموزشی تلگرامی با حضور مدرسان دوره و رفع اشکال
➖پروژه محور
➖تخفیفات دانشجویی و گروهی

--------------------------------------

آکادمی مهارت دانشکده کشاورزی دانشگاه تهران

تلگرام | اینستاگرام | وب سایت

🧬PCR, Methods and Protocols 2023


@irbioinformatics

🎵ای دریغ

🎙#معین


با همه دریا دلی دل را به دریاها زدم
پشت پا بر اصل بی‌بنیاد این دنیا زدم

با هزاران آرزو با صدهزار شوق و امید
از پس دیروز و امروز ناگهان فردا رسید

ای دریغ از عمر رفته ، ای دریغ
قصهٔ ابریشم و بیداد تیغ

هوش مصنوعی انقدر قوی شده که کم‌کم دیگه نیاز سخت افزاری برای انجام MD به حداقل میرسونه
این مقاله رو بخونین و این ابزار جدید شبیه سازی دینامیک مولکولی چک‌کنین تا به قدرت هوش مصنوعی در پردازش اطلاعات زیستی پی ببرین
https://www.nature.com/articles/s41586-024-08127-z

بخاطر اورید اولین زنی که جایزه نوبل دریافت کرد، اولین فردی که دو جایزه نوبل گرفت و هنوز تنها فردی است که در دو دسته علمی مختلف دو جایزه نوبل دریافت کرده است: ماری اسکودوفسکا کوری.

این صفحه مخصوص بیماران در مجله JAMA به انواع خارش مزمن، علائم و نشانه‌های آن و راهبردهای درمانی می‌پردازد.

«عجله کن کارتو تموم کن که من هم بتونم به کارم برسم.»

گفته می‌شود ماری اسکودوفسکا کوری این جمله را هنگام این جلسه عکاسی در آزمایشگاهش به عکاس گفته است. این عکس در اوایل قرن بیستم گرفته شده است.

تلاش خستگی‌ناپذیر کوری برای تحقیق، با نگاهی به دستاوردهای علمی‌اش کاملاً آشکار می‌شود. او بی‌وقفه و با وجود کار فیزیکی سخت و در نهایت مرگبار، عناصر پلونیوم و رادیوم را کشف کرد، استفاده از تابش در پزشکی را ترویج داد و درک ما از رادیواکتیویته را به‌طور بنیادین تغییر داد. برای فداکاری علمی و پیشرفت‌های چشمگیرش، او جایزه نوبل فیزیک در سال ۱۹۰۳ و جایزه نوبل شیمی در سال ۱۹۱۱ را دریافت کرد. او دانشمندی پیشگام بود.

با برندگان نوبل در حوزه پروتئین چقدر آشنایی دارین؟ در این فایل ارزشمند لیست تمام محققانی که در حوزه پروتئین موفق به دریافت جایزه نوبل شده اند گنجانده شده است.

لیست تمام برندگان نوبل در حوزه پروتئین

کمپلکس V₀ از Enterococcus hirae یکی از اجزای کلیدی ATPase نوع واکوئلی (V-ATPase) است که نقش مهمی در انتقال پروتون از طریق غشاهای سلولی ایفا می‌کند. این پمپ پروتونی برای حفظ تعادل pH، تأمین انرژی برای انتقالات غشایی و همچنین پیشبرد فرآیندهایی مانند سنتز ATP و متابولیسم سلولی ضروری است.
@irbioinformatics
عملکرد اصلی کمپلکس V₀
عملکرد اصلی کمپلکس V₀ انتقال پروتون است. در طی عملیات، دامنه V₁ که به V₀ متصل است، از انرژی حاصل از هیدرولیز ATP برای ایجاد حرکت چرخشی در حلقه c کمپلکس V₀ استفاده می‌کند. این چرخش به پروتون‌ها امکان می‌دهد تا از سیتوپلاسم به سمت کمپلکس V₀ حرکت کرده و به فضای خارج سلولی یا واکوئل آزاد شوند. شیب پروتونی تولید شده از این فرآیند به عنوان منبع انرژی برای فرآیندهای فیزیولوژیکی مختلف، از جمله انتقال فعال ثانویه و حفظ تعادل pH داخل سلول، استفاده می‌شود.
@irbioinformatics
نقش V-ATPase در Enterococcus hirae
در Enterococcus hirae، V-ATPase که شامل کمپلکس V₀ نیز می‌شود، به‌ویژه برای خروج یون سدیم اهمیت دارد. این سیستم انتقال Na⁺ را با شیب پروتونی جفت می‌کند. این تبادل یونی برای سازگاری این باکتری با شرایط محیطی متغیر، از جمله تغییرات غلظت سدیم، حیاتی است.
@irbioinformatics
ساختار و اهمیت کمپلکس V₀
کمپلکس V₀ در Enterococcus hirae بخشی جدایی‌ناپذیر از دستگاه V-ATPase باکتریایی است. زیرواحدهای ساختاری آن به‌طور هماهنگ کار می‌کنند تا انتقال پروتون را تسهیل کرده و فرآیندهای حیاتی سلولی مانند تعادل یونی و تولید ATP را پیش ببرند. درک ساختار و عملکرد کمپلکس V₀ برای درک نقش‌های فیزیولوژیکی گسترده‌تر V-ATPase در متابولیسم و بقای باکتری‌ها بسیار مهم است.