GlimmerPredict2Gff3.pl
1.7 KB
برای ران این اسکریپت، اون رو دانلود کنین و تو پوشه خروجی های گلایمر بندازین و بعدش به صورت زیر در کرنال ترمینالتون در اوبنتو رانش کنین
بعد از ران گلیمر یک فایل جدید در پوشه خروجی انوتیشن ژنومتون ایجاد میشه که در نهایت میتونین از این فایل gff3 برای انالیزا و تفاسیر بعدی استفاده کنین. همین قدر ساده و مفید، هست مراحل انجامش نیازم نیست توی اون ورکشاپای عجیب غریب میلیونی شرکت کنید :) کافیه کانال ما رو چندماه دنبال کنید خودتون به ی متخصص بیوانفورماتیک خودبخود تبدیل میشید...
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
$ perl GlimmerPredict2Gff3.pl ~/TestIn.predict 2 ~/TestOut.gff3
بعد از ران گلیمر یک فایل جدید در پوشه خروجی انوتیشن ژنومتون ایجاد میشه که در نهایت میتونین از این فایل gff3 برای انالیزا و تفاسیر بعدی استفاده کنین. همین قدر ساده و مفید، هست مراحل انجامش نیازم نیست توی اون ورکشاپای عجیب غریب میلیونی شرکت کنید :) کافیه کانال ما رو چندماه دنبال کنید خودتون به ی متخصص بیوانفورماتیک خودبخود تبدیل میشید...
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
👍7
برای مشاهده خروجی های glimmer و سایر ابزارهای انوتیشن ژنوم میتونین از نرم افزار IGV استفاده کنین. این ابزار یه نمایشگر عالی برای مشاهده نواحی مختلف ژنومی و اجزای مولکولی ژنوم هستش. فقط دوستان یادتون باشه خیلی از این ابزاراها بخصوص گلیمر و IGV حتما روی سیستمی ران کنین که از لحاظ سخت افزاری مناسب باشه نرین روی ی لپتاپ قدیمی ران کنین که هنگ کنه بعد بگین ابزاره کار نکرد :)
نکته مهم: نرم افزار IGV خروجی خطی از اجزای مولکولی ژنوم ایجاد میکنه که شما بایستی با برش نواحی مختلفش تصویر دلخواهتون بسازین، اما اگر بخواین کل کروموزوم هاتون رو به صورت یکدست نشون بدین باید از circos استفاده کنین که قبلا لینک و سورسش براتون گذاشتم.
نکته مهم: نرم افزار IGV خروجی خطی از اجزای مولکولی ژنوم ایجاد میکنه که شما بایستی با برش نواحی مختلفش تصویر دلخواهتون بسازین، اما اگر بخواین کل کروموزوم هاتون رو به صورت یکدست نشون بدین باید از circos استفاده کنین که قبلا لینک و سورسش براتون گذاشتم.
❤5
IGV_Win_2.17.0-WithJava-installer.exe
56.2 MB
آخرین ورژن نرم افزار IGV برای ویندوز 64 همراه با java از پیش نصب شده
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
❤4
IGV_Linux_2.17.0_WithJava.zip
75.3 MB
آخرین ورژن نرم افزار IGV برای لینوکس 64 همراه با java از پیش نصب شده
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
👍4
IGV_Win_2.17.0-installer.exe
30 MB
آخرین ورژن نرم افزار IGV برای ویندوز 64 بدون جاوا - برای استفاده از این ورژن باید جاوا 17 را نصب کنید.
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
👍5
IGV_2.17.0.zip
37 MB
ابزارهای کامندلاین igv برای تمام ورژن های ویندوزی و لینوکسی
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
👍5
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
نکات ضروری برای جستجوی هدفمند گوگل اسکالر و دریافت منابع علمی و رصد رکوردهای علمی
حتما این ویدیو رو ببینید اگر میخاین در حوزه های کاریتون سرچ هدفمند و استراتژیکی داشته باشین و به بهترینا برسین.
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
حتما این ویدیو رو ببینید اگر میخاین در حوزه های کاریتون سرچ هدفمند و استراتژیکی داشته باشین و به بهترینا برسین.
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
👍7
Media is too big
VIEW IN TELEGRAM
ضروریات سرچ علمی و جستجوی پایگاه های علمی.
حتما این ویدیو رو ببینید اگر میخاین در حوزه های کاریتون سرچ هدفمند و استراتژیکی داشته باشین و به بهترینا برسین.
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
حتما این ویدیو رو ببینید اگر میخاین در حوزه های کاریتون سرچ هدفمند و استراتژیکی داشته باشین و به بهترینا برسین.
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
👍9
معرفی نرم افزار
یکی از بهترین ابزارهای کموانفورماتیک و ارزیابی ساختارهای شیمیایی نرم افزار mercury است که می توان از آن برای مقاصد مختلفی استفاده کرد. در این پست می توانید آخرین بیلد مرکوری برای سه سیستم عامل ویندوز، لینوکس و مک دانلود کنید. نسخه آپلود شده نسخه 4.2 مرکوری است که براساس آخرین اپدیت شرکت سازنده آن می باشد.
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
یکی از بهترین ابزارهای کموانفورماتیک و ارزیابی ساختارهای شیمیایی نرم افزار mercury است که می توان از آن برای مقاصد مختلفی استفاده کرد. در این پست می توانید آخرین بیلد مرکوری برای سه سیستم عامل ویندوز، لینوکس و مک دانلود کنید. نسخه آپلود شده نسخه 4.2 مرکوری است که براساس آخرین اپدیت شرکت سازنده آن می باشد.
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
👍6
mercurystandalone-4.2.0-windows-installer.exe
308.9 MB
نسخه 4.2 مرکوری برای ویندوز
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
👍5
mercurystandalone-4.2.0-linux-x64-installer.run
389.1 MB
نسخه 4.2 مرکوری برای لینوکس
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
با ما همراه باشید.
🧬@IRBioinformatics
استفاده از مطالب با ذکر منبع بلامانع است
👍6
معرفی دارو: آتورواستاتین
آتورواستاتین (به انگلیسی: Atorvastatin) که با نام تجاری لیپیتور نیز فروخته میشود، یک داروی استاتینی است که برای پیشگیری از بیماریهای قلبی عروقی در افراد در معرض خطر بالا و برای درمان سطوح غیرطبیعی چربی استفاده میشود.
آتورواستاتین به صورت خوراکی مصرف میشود. عوارض جانبی جدی ممکن است شامل رابدومیولیز، مشکلات کبدی و دیابت باشد. مصرف آتورواستاتین در دوران بارداری ممکن است به جنین آسیب برساند.
تاریخ تایید: 1996
وزن مولکولی: 558.65 دالتون
فرمول شیمیایی: C33H35FN2O5
🧬@IRBioinformatics
آتورواستاتین (به انگلیسی: Atorvastatin) که با نام تجاری لیپیتور نیز فروخته میشود، یک داروی استاتینی است که برای پیشگیری از بیماریهای قلبی عروقی در افراد در معرض خطر بالا و برای درمان سطوح غیرطبیعی چربی استفاده میشود.
آتورواستاتین به صورت خوراکی مصرف میشود. عوارض جانبی جدی ممکن است شامل رابدومیولیز، مشکلات کبدی و دیابت باشد. مصرف آتورواستاتین در دوران بارداری ممکن است به جنین آسیب برساند.
تاریخ تایید: 1996
وزن مولکولی: 558.65 دالتون
فرمول شیمیایی: C33H35FN2O5
🧬@IRBioinformatics
👍6
معرفی نرم افزار: VTX
یکی از ابزارهای گرافیکی برای نشان دادن خروجی های مدلینگ به همراه فیچرهای ارزیابی فایل های دینامیک مولکولی که اخیرا توسعه یافته است نرم افزار VTX می باشد. در این ابزار می توانید با یک ویوو دقیق تر وضعیت سه بعدی ساختار خود را مشاهده کنید. این ابزار دارای پشتیبانی قوی از انواع فرمت های زیستی است.
دانلود نسخه ویندوز 64 بیتی
دانلود نسخه لینوکس 64 بیتی
دانلود نسخه ویندوزی به همراه فایل راهنما از سایت گیت هاب
این ابزار رایگان است و نیازی به نصب لایسنس ندارد.
🧬@IRBioinformatics
یکی از ابزارهای گرافیکی برای نشان دادن خروجی های مدلینگ به همراه فیچرهای ارزیابی فایل های دینامیک مولکولی که اخیرا توسعه یافته است نرم افزار VTX می باشد. در این ابزار می توانید با یک ویوو دقیق تر وضعیت سه بعدی ساختار خود را مشاهده کنید. این ابزار دارای پشتیبانی قوی از انواع فرمت های زیستی است.
دانلود نسخه ویندوز 64 بیتی
دانلود نسخه لینوکس 64 بیتی
دانلود نسخه ویندوزی به همراه فایل راهنما از سایت گیت هاب
این ابزار رایگان است و نیازی به نصب لایسنس ندارد.
🧬@IRBioinformatics
👍3🔥2👏1
هر تصویری که برای پروژه هاتون انتخاب میکنین برایند میزان تلاشی هستش که برای تهیه اون تصویر یا خروجی کردین. اگر صرفا به یک تصویر ساده با کیفیت پایین بسنده کنین، در این حالت هیچ وقت نمیتونین خروجی های خیلی عالی درست کنین و همیشه به خاطر این مورد ممکنه کارهاتون دیده نشه. در نیتجه سعی کنین همیشه بهترین ابزار برای طراحی و ترسیم الگوی گرافیکی کارتون انتخاب کنین
🧬@IRBioinformatics
🧬@IRBioinformatics
👍4🔥2👏1
تصویر روز: ساختار سیتواسکلتون سلولی
دنیای سلول های زیستی دنیای پیچیده و بسیار عجیبی است به نحوی که هر چقدر تکنولوژی پیشرفت می کند دانسته های فراوان تری از دنیای سلول در اختیار بشر قرار می گیرد. معماری سلول وابسته به تعامل و برهمکنش هزاران پروتئین و مولکول های زیستی دیگر است که سبب ایجاد یک حالت پایدار در سلول می شوند. امروزه به لطف تکنیک کریستالوگرافی اشعه ایکس محققان می توانند تصویر واضحی از درون سلول ایجاد کنند و براساس آن به پردازش داده های زیستی می پردازند. در تصویر پیوست ساختار سه بعدی سیتواسکلتون سلولی را مشاهده می کنید که در کنار زیبایی شگرف این ساختار پیچیدگی غیرقابل بحث آن نیز نمایان است...
در تصویر: A: پروتئین اکتین، B: فیلامنت های حدواسط، C، میکروتوبول ها، D: فورمین، E: پروتئین های capping، و F: کمپلکس Arp2/3، ناحیه G: پلکتین، ناحیه H: مجموعه ریبوزومی و I: آمینواسیل tRNAسینتتاز
🧬@IRBioinformatics
دنیای سلول های زیستی دنیای پیچیده و بسیار عجیبی است به نحوی که هر چقدر تکنولوژی پیشرفت می کند دانسته های فراوان تری از دنیای سلول در اختیار بشر قرار می گیرد. معماری سلول وابسته به تعامل و برهمکنش هزاران پروتئین و مولکول های زیستی دیگر است که سبب ایجاد یک حالت پایدار در سلول می شوند. امروزه به لطف تکنیک کریستالوگرافی اشعه ایکس محققان می توانند تصویر واضحی از درون سلول ایجاد کنند و براساس آن به پردازش داده های زیستی می پردازند. در تصویر پیوست ساختار سه بعدی سیتواسکلتون سلولی را مشاهده می کنید که در کنار زیبایی شگرف این ساختار پیچیدگی غیرقابل بحث آن نیز نمایان است...
در تصویر: A: پروتئین اکتین، B: فیلامنت های حدواسط، C، میکروتوبول ها، D: فورمین، E: پروتئین های capping، و F: کمپلکس Arp2/3، ناحیه G: پلکتین، ناحیه H: مجموعه ریبوزومی و I: آمینواسیل tRNAسینتتاز
🧬@IRBioinformatics
❤3🔥3👏1
معرفی ابزار: Mols2Grid
ابزار Mols2Grid یک ابزار نمایش مولکولی ساده و رایگان بر مبنای بسته نرم افزاری RdKit است که برای مشاهده ساختار دو بعدی ترکیبات شیمیایی مورد استفاده قرار می گیرد. اگر می خواهید یک شمای بسیار با کیفیت و حرفه ای از لیگاندهای شیمیایی خود ایجاد کنید می توانید از این بسته نرم افزاری رایگان استفاده کنید. برای استفاده از آن بایستی فایل دو بعدی ساختارهای خود در فرمت sdf یا SMILES را داشته باشید.
دانلود آخرین ورژن نرم افزارMols2Grid
🧬@IRBioinformatics
ابزار Mols2Grid یک ابزار نمایش مولکولی ساده و رایگان بر مبنای بسته نرم افزاری RdKit است که برای مشاهده ساختار دو بعدی ترکیبات شیمیایی مورد استفاده قرار می گیرد. اگر می خواهید یک شمای بسیار با کیفیت و حرفه ای از لیگاندهای شیمیایی خود ایجاد کنید می توانید از این بسته نرم افزاری رایگان استفاده کنید. برای استفاده از آن بایستی فایل دو بعدی ساختارهای خود در فرمت sdf یا SMILES را داشته باشید.
دانلود آخرین ورژن نرم افزارMols2Grid
🧬@IRBioinformatics
🔥4👍1
معرفی دیتابیس Phytozome:
دیتابیس فیتوزوم یک پایگاه داده اختصاصی برای ژنوم های توالی یابی شده گیاهی است که می توان از این ژنوم ها به عنوان رفرنس در مپینگ داده های RNASeq، مطالعات ژنومی و ... استفاده کرد. این پایگاه داده رایگان است و برای استفاده از آن بایستی حتما یک اکانت تهیه کنید. داده هایی که در این پایگاه داده قرار دارد عمدتا داده های مناسبی برای کارهای ژنومی هستند و در این وبسایت می توانید انواع ورژن های مختلف داده های ژنومی گیاهی را پیدا کنید.
دوستانی که در رشته های بیوتک کشاورزی، اصلاح نباتات، زراعت، ژنتیک گیاهی، مهندسی تولیدات گیاهی باغبانی و ... تحصیل می کنند می توانند اطلاعات کامل و کاربردی از این دیتابیس دریافت نمایند.
لینک ورود به این پایگاه داده
🧬@IRBioinformatics
دیتابیس فیتوزوم یک پایگاه داده اختصاصی برای ژنوم های توالی یابی شده گیاهی است که می توان از این ژنوم ها به عنوان رفرنس در مپینگ داده های RNASeq، مطالعات ژنومی و ... استفاده کرد. این پایگاه داده رایگان است و برای استفاده از آن بایستی حتما یک اکانت تهیه کنید. داده هایی که در این پایگاه داده قرار دارد عمدتا داده های مناسبی برای کارهای ژنومی هستند و در این وبسایت می توانید انواع ورژن های مختلف داده های ژنومی گیاهی را پیدا کنید.
دوستانی که در رشته های بیوتک کشاورزی، اصلاح نباتات، زراعت، ژنتیک گیاهی، مهندسی تولیدات گیاهی باغبانی و ... تحصیل می کنند می توانند اطلاعات کامل و کاربردی از این دیتابیس دریافت نمایند.
لینک ورود به این پایگاه داده
🧬@IRBioinformatics
👍7🍾2
740773424082723
<unknown>
یادمون باشه هیچ چیز در این دنیا ابدی نیست، اونقدر باید مهربون باشیم باهم که انگار فردایی نیست. اگر میخواهیم موفق باشیم باید حسادت و رقابت رو کنار بزاریم و بذر همیاری و مهربونی و همکاری در دلمون بکاریم. تا وقتی میتونیم و توانش داریم به هم کمک کنیم تا بتونیم به اوج برسیم
🧬🆔@IRBioinformatics
🧬🆔@IRBioinformatics
❤9👍3
سوال:
من دانشجوی ورودی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی هستم و علاقه مند به تحصیل در رشته بیوانفورماتیک هستم، چه زبان های برنامه نویسی باید یادبگیرم که کارایی بهتری داره و میخام پایان نامم هم RNA-seq انجام بدم، به نظرتون چطوری پلنم رو ببرم جلو:
درخواست کننده: علی دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتک کشاورزی
پاسخ: دوست عزیز و ارجمند، ضمن تشکر از شما بابت ارسال این سوال. همانطور که می دانید رشته بیوانفورماتیک کاربردهای وسیعی داره و بایستی اول ببنید در چه زمینه ای از بیوانفورماتیک می خواید ادامه تحصیل بدید. مثلا اگر به مباحث پروتئینی علاقه دارید باید به سمت بیوانفورماتیک ساختاری برین و اگر به بحث ژن ها و ژنوم علاقه مند هستین بایستی وارد حوزه بیوانفورماتیک ژنومیکس و ترانسکریپتومیکس بشین. و اگر میخاین در حوزه متابولیت ها ادامه بدید قاعدتا باید متدولوژی های بیوانفورماتیکی در حوزه متابولومیکس را یاد بگیرید. اما به صورت کلی شما بایستی اطلاعات کافی و کاربردی در این زمینه داشته باشید. یعنی شما بایستی حتما اطلاعات کاربردی در سه زمینه پروتئوم، ژنوم، و متابولوم داشته باشین به صورت کلی. چون وقتی که می خواین به عنوان مثال روی یک ژنوم گیاهی کار کنین قاعدتا هم نیازه ماهیت پروتئین ها رو درک کنین و هم بحث متابولیت ها رو بلد باشید. در کل رفتن سمت بیوانفورماتیک به دو صورت هستش: یا اینکه میتونین یوزر بیوانفورماتیک قوی باشین: یعنی در کار با ابزارها به یک فرد متخصص تبدیل بشین، یا اینکه یک توسعه دهنده بیوانفورماتیکی قوی باشین: که در این صورت دیگه خودتون کد نویسی میکنین و انعطاف پذیری کارهایی که انجام میدین دست خودتون هستش.
ولی برای شروع و برای اینکه ابهامی نداشته باشید در کار، سعی کنید مرحله به مرحله جلو برید و اول مفاهیم و فرآیندهای کلی و تئوری رو یاد بگیرید و بعدش برین سراغ استپ های بعدی. در این صورت میتونین به یک فرد قوی در این زمینه تبدیل بشین. برای شرکت در آزمون بیوانفورماتیک هم باید بدونید که بچه های بیوتک کشاورزی میتونن شرکت کنن در آزمون بیوانفورماتیک دکترا ولی خب مستلزم این هستش شما با درس های پایه ای بیوانفورماتیکی مثل ساختمان داده، الگوریتم، ریاضیات گسسته و... آشنایی داشته باشید تا در آزمون قبول بشید. و نکته خیلی مهمتر از یادگیری زبان غافل نشید که اصل کار و کلید موفقیت شما هم همین مورد هستش. در خصوص برنامه نویسی هم ترجیحا پایتون و R رو باهم یاد بگیرید چون این دو زبان مکمل هم هستند و نمیتونین اونا رو تفکیک کنین. ی جاهایی مجبور میشین از پایتون استفاده کنین و کد R برای اون کار نیست و برعکس.
لذا حتما دوتا زبان رو باهم برنامه ریزی کنید یاد بگیرید و در کنار این ها شما بایستی مسلط به Bash noscripting هم باشید. چون برای انجام RNA-seq اکثر انالیزهاتون تو محیط لینوکسه، شما نیاز به کار با بش اسکریپتینگ هم دارین و در نهایت اینکه برخی ماژول های پایتون و R منحصرا توی لینوکس کار می کنن. بخصوص اینکه شما برای RNAseq باید کار با آناکوندا هم بلد باشید. توصیه ما به شما اینه اول مباحث تئوری رو یاد بگیرید، مفاهیم پایه R و پایتون رو یاد بگیرید. کار با لینوکس رو مسلط بشید. کار با bash رو یاد بگیرید ابزارها و نیازمندی های آنالیزی که برای پردازش داده هاتون نیاز دارین دسته بندی کنین و قدم به قدم برین جلو تا بتونین به هدفی که دارین برسین. و در نهایت بازهم تاکید می کنم از یادگیری زبان غافل نشید. شاه کلید موفقیت شما در این راه یادگیری زبان هستش که تفهیم مطالب رو براتون آسون می کنه...
🧬🆔@IRBioinformatics
من دانشجوی ورودی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی هستم و علاقه مند به تحصیل در رشته بیوانفورماتیک هستم، چه زبان های برنامه نویسی باید یادبگیرم که کارایی بهتری داره و میخام پایان نامم هم RNA-seq انجام بدم، به نظرتون چطوری پلنم رو ببرم جلو:
درخواست کننده: علی دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتک کشاورزی
پاسخ: دوست عزیز و ارجمند، ضمن تشکر از شما بابت ارسال این سوال. همانطور که می دانید رشته بیوانفورماتیک کاربردهای وسیعی داره و بایستی اول ببنید در چه زمینه ای از بیوانفورماتیک می خواید ادامه تحصیل بدید. مثلا اگر به مباحث پروتئینی علاقه دارید باید به سمت بیوانفورماتیک ساختاری برین و اگر به بحث ژن ها و ژنوم علاقه مند هستین بایستی وارد حوزه بیوانفورماتیک ژنومیکس و ترانسکریپتومیکس بشین. و اگر میخاین در حوزه متابولیت ها ادامه بدید قاعدتا باید متدولوژی های بیوانفورماتیکی در حوزه متابولومیکس را یاد بگیرید. اما به صورت کلی شما بایستی اطلاعات کافی و کاربردی در این زمینه داشته باشید. یعنی شما بایستی حتما اطلاعات کاربردی در سه زمینه پروتئوم، ژنوم، و متابولوم داشته باشین به صورت کلی. چون وقتی که می خواین به عنوان مثال روی یک ژنوم گیاهی کار کنین قاعدتا هم نیازه ماهیت پروتئین ها رو درک کنین و هم بحث متابولیت ها رو بلد باشید. در کل رفتن سمت بیوانفورماتیک به دو صورت هستش: یا اینکه میتونین یوزر بیوانفورماتیک قوی باشین: یعنی در کار با ابزارها به یک فرد متخصص تبدیل بشین، یا اینکه یک توسعه دهنده بیوانفورماتیکی قوی باشین: که در این صورت دیگه خودتون کد نویسی میکنین و انعطاف پذیری کارهایی که انجام میدین دست خودتون هستش.
ولی برای شروع و برای اینکه ابهامی نداشته باشید در کار، سعی کنید مرحله به مرحله جلو برید و اول مفاهیم و فرآیندهای کلی و تئوری رو یاد بگیرید و بعدش برین سراغ استپ های بعدی. در این صورت میتونین به یک فرد قوی در این زمینه تبدیل بشین. برای شرکت در آزمون بیوانفورماتیک هم باید بدونید که بچه های بیوتک کشاورزی میتونن شرکت کنن در آزمون بیوانفورماتیک دکترا ولی خب مستلزم این هستش شما با درس های پایه ای بیوانفورماتیکی مثل ساختمان داده، الگوریتم، ریاضیات گسسته و... آشنایی داشته باشید تا در آزمون قبول بشید. و نکته خیلی مهمتر از یادگیری زبان غافل نشید که اصل کار و کلید موفقیت شما هم همین مورد هستش. در خصوص برنامه نویسی هم ترجیحا پایتون و R رو باهم یاد بگیرید چون این دو زبان مکمل هم هستند و نمیتونین اونا رو تفکیک کنین. ی جاهایی مجبور میشین از پایتون استفاده کنین و کد R برای اون کار نیست و برعکس.
لذا حتما دوتا زبان رو باهم برنامه ریزی کنید یاد بگیرید و در کنار این ها شما بایستی مسلط به Bash noscripting هم باشید. چون برای انجام RNA-seq اکثر انالیزهاتون تو محیط لینوکسه، شما نیاز به کار با بش اسکریپتینگ هم دارین و در نهایت اینکه برخی ماژول های پایتون و R منحصرا توی لینوکس کار می کنن. بخصوص اینکه شما برای RNAseq باید کار با آناکوندا هم بلد باشید. توصیه ما به شما اینه اول مباحث تئوری رو یاد بگیرید، مفاهیم پایه R و پایتون رو یاد بگیرید. کار با لینوکس رو مسلط بشید. کار با bash رو یاد بگیرید ابزارها و نیازمندی های آنالیزی که برای پردازش داده هاتون نیاز دارین دسته بندی کنین و قدم به قدم برین جلو تا بتونین به هدفی که دارین برسین. و در نهایت بازهم تاکید می کنم از یادگیری زبان غافل نشید. شاه کلید موفقیت شما در این راه یادگیری زبان هستش که تفهیم مطالب رو براتون آسون می کنه...
🧬🆔@IRBioinformatics
👍10❤3🙏1