معرفی نرم افزار
نرم افزار گرومکس
این ابزار یکی از بهترین و کاربردی ترین ابزارهایی است که در حال حاضر برای شبیه سازی دینامیک مولکولی از آن استفاده می شود. این برنامه کاملا رایگان است و کاربران می توانند در دو حالت پیشفرض و مدیفای شده از کدها و فورس فیلدهایی که این برنامه برای کاربران فراهم آورده است استفاده نمایند. برای نصب گرومکس بایستی اخرین ورژن کمپایلر gcc و همچنین نسخه متناسب Cmake بر روی سیستم عامل شما نصب باشد تا برنامه به درستی کار کند. دقت داشته باشید که گرومکس بر روی سیستم عامل لینوکس و کلاسترهای مبتنی بر لینوکس از حداکثر کارایی و انعطاف پذیری برای انجام پروژه های دینامیک مولکولی برخوردار است. در ادامه می توانید فایل سورس این نرم افزار را به صورت رایگان دانلود نمایید و مطابق با فایل readme موجود در پوشه فشرده اپلود شده در کانال آن را نصب نمایید
🆔@IRBioinformatics🤏😘
نرم افزار گرومکس
این ابزار یکی از بهترین و کاربردی ترین ابزارهایی است که در حال حاضر برای شبیه سازی دینامیک مولکولی از آن استفاده می شود. این برنامه کاملا رایگان است و کاربران می توانند در دو حالت پیشفرض و مدیفای شده از کدها و فورس فیلدهایی که این برنامه برای کاربران فراهم آورده است استفاده نمایند. برای نصب گرومکس بایستی اخرین ورژن کمپایلر gcc و همچنین نسخه متناسب Cmake بر روی سیستم عامل شما نصب باشد تا برنامه به درستی کار کند. دقت داشته باشید که گرومکس بر روی سیستم عامل لینوکس و کلاسترهای مبتنی بر لینوکس از حداکثر کارایی و انعطاف پذیری برای انجام پروژه های دینامیک مولکولی برخوردار است. در ادامه می توانید فایل سورس این نرم افزار را به صورت رایگان دانلود نمایید و مطابق با فایل readme موجود در پوشه فشرده اپلود شده در کانال آن را نصب نمایید
🆔@IRBioinformatics🤏😘
gromacs-2023.3.tar.gz
40.1 MB
اخرین بیلد بروزرسانی شده نرم افزار گرومکس
🆔@IRBioinformatics🤏😘
🆔@IRBioinformatics🤏😘
regressiontests-2023.3.tar.gz
46.4 MB
در صورتی که موقع نصب گرومکس مشکل در نصب برنامه وجود داشت می توانید فایل regression اخرید بیلد اپلود شده در کانال را به صورت دستی به مسیر نصب گرومکس هنگام اجرای کامندهای اولیه گرومکس اضافه کنید و آن را نصب کنید.
🆔@IRBioinformatics🤏😘
🆔@IRBioinformatics🤏😘
نصب سریع و آنی گرومکس با استفاده از کد زیر:
دقت داشته باشید برای نصب گرومکس بایستی از قبل فایل cmake و gcc سیستم عامل شما به روز باشد در غیر این صورت امکان نصب این برنامه وجود ندارد و با fatal error موقع نصب مواجه می شوید.
دقت داشته باشید برای نصب گرومکس بایستی از قبل فایل cmake و gcc سیستم عامل شما به روز باشد در غیر این صورت امکان نصب این برنامه وجود ندارد و با fatal error موقع نصب مواجه می شوید.
tar xfz gromacs-2023.3.tar.gz
cd gromacs-2023.3
mkdir build
cd build
cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON -DREGRESSIONTEST_DOWNLOAD=ON
make
make check
sudo make install
source /usr/local/gromacs/bin/GMXRC
👍1
معرفی ابزار:
یکی از ابزارهای فوق العاده عالی که کاربران بیولوژیست و بیوتکنولوژیست می توانند از آن برای ترسیم داده های امیکسی و بیوانفورماتیکی استفاده نمایند ابزار TBtools است. این ابزار چندمنظوره و رایگان در دو پلتفرم لینوکس و ویندوز قابل اجرا است و دوستان می توانند با استفاده از این ابزار آنالیزهای فوق العاده باکیفیتی انجام دهند و خروجی های بسیار با ارزشی را برای چاپ مقالات خود تدوین نمایند. فایل این ابزار به همراه راهنمای نصب آن در ادامه قرار داده شده است. دقت داشته باشید برای نصب این ابزار بایستی حتما اخرین ورژن نرم افزار Java بر روی سیستم عامل شما نصب باشد.
🆔🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
یکی از ابزارهای فوق العاده عالی که کاربران بیولوژیست و بیوتکنولوژیست می توانند از آن برای ترسیم داده های امیکسی و بیوانفورماتیکی استفاده نمایند ابزار TBtools است. این ابزار چندمنظوره و رایگان در دو پلتفرم لینوکس و ویندوز قابل اجرا است و دوستان می توانند با استفاده از این ابزار آنالیزهای فوق العاده باکیفیتی انجام دهند و خروجی های بسیار با ارزشی را برای چاپ مقالات خود تدوین نمایند. فایل این ابزار به همراه راهنمای نصب آن در ادامه قرار داده شده است. دقت داشته باشید برای نصب این ابزار بایستی حتما اخرین ورژن نرم افزار Java بر روی سیستم عامل شما نصب باشد.
🆔🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
TBtools-II-master.zip
14 MB
دانلود نسخه لینوکسی نرم افزار tbtools
🆔🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
🆔🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
TBtools-II_windows-x32_2_029.exe
76.3 MB
ابزار tbtools نسخه ویندوز 32 بیتی
🆔🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
🆔🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
TBtools-II_windows-x64_2_029.exe
161.7 MB
ابزار tbtools نسخه ویندوز 64 بیتی
🆔🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
🆔🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
TBtools_JRE1.6.jar
15.2 MB
ابزار tbtools نسخه جاوا
🆔🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
🆔🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
TBtools-II-2.029.zip
14 MB
نسخه source code ابزار tbtools
🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
🧬https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
TBtools-II_windows-x64_2_029_latestJDK.exe
173.9 MB
نسخه ویندوزی tbtools مبتنی بر جاوا نصبی
🆔https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
🆔https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
معرفی ابزار:
ابزار GSDS یکی از ابزارهای کلیدی برای ارزیابی ماهیت داده های ژنومی است که از طریق آن می توانید ساختار کلیدی ژن ها و همچنین جایگاه اینترون ها و اگزون ها را مشخص کنید. برای استفاده از این ابزار بایستی از پایگاه داده اطلاعاتی زیر استفاده نمایید. این ابزار فایل نصبی ندارد و عمدتا به صورت انلاین بایستی از آن استفاده نمود.
http://gsds.gao-lab.org/
#اگزون
#ژن
🧬@IRBioinformatics
ابزار GSDS یکی از ابزارهای کلیدی برای ارزیابی ماهیت داده های ژنومی است که از طریق آن می توانید ساختار کلیدی ژن ها و همچنین جایگاه اینترون ها و اگزون ها را مشخص کنید. برای استفاده از این ابزار بایستی از پایگاه داده اطلاعاتی زیر استفاده نمایید. این ابزار فایل نصبی ندارد و عمدتا به صورت انلاین بایستی از آن استفاده نمود.
http://gsds.gao-lab.org/
#اگزون
#ژن
🧬@IRBioinformatics
چگونه مشخصات پردازنده سیستم عامل لینوکس را مشاهده کنیم؟
برای این کار کافی است یکی از کامندهای زیر را در ترمینال لینوکس وارد کنید تا مشخصات سخت افزاری سیستم برای شما نشان داده شود.
1- کامند اول مشخصات کلی cpu و سیستم عامل را در اختیار شما قرار می دهد.
2- کامند دوم اطلاعات ضروری که کاربر نیاز دارد را نشان می دهد
3- کامند سوم سرعت cpu را به هرتز برای کاربر در کنار سایر مشخصات نشان می دهد.
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
برای این کار کافی است یکی از کامندهای زیر را در ترمینال لینوکس وارد کنید تا مشخصات سخت افزاری سیستم برای شما نشان داده شود.
1- کامند اول مشخصات کلی cpu و سیستم عامل را در اختیار شما قرار می دهد.
2- کامند دوم اطلاعات ضروری که کاربر نیاز دارد را نشان می دهد
3- کامند سوم سرعت cpu را به هرتز برای کاربر در کنار سایر مشخصات نشان می دهد.
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
lscpu
lscpu | grep -i bogo
lscpu | grep -i hz
تعیین مشخصات کلی و جزیی پردازنده ها و سایر اطلاعات موردنیاز از بیس سخت افزاری که کاربر هنگام کار بر روی سیستم عامل لینوکس می خواهد به آنها دسترسی پیدا کند
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
sudo apt install inxi -y
inxi
خروجی دستور lscpu و مشاهده اطلاعات سخت افزاری سیستم هنگام کار بر روی سیستم عامل لینوکس
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
مشاهده مشخصات کارت حافظه در لینوکس
برای مشاهده مشخصات کارت حافظه در لینوکس از کامندهای زیر می توانید به ترتیب استفاده کنید.
کامند اول: لیست کارتهای حافظه به همراه ظرفیت آنها
کامند دوم: مشخصات حافظه ها از لحاظ ظرفیت، سرعت، نوع، و برند و مشخصات دیگر
کامند سوم: حداکثر حافظه قابل نصب بر روی سیستم
کامند چهارم: مشاهده اسلات های باز حافظه و اطلاع از امکان نصب حافظه بیشتر یا خیر
برای مشاهده مشخصات کارت حافظه در لینوکس از کامندهای زیر می توانید به ترتیب استفاده کنید.
کامند اول: لیست کارتهای حافظه به همراه ظرفیت آنها
کامند دوم: مشخصات حافظه ها از لحاظ ظرفیت، سرعت، نوع، و برند و مشخصات دیگر
کامند سوم: حداکثر حافظه قابل نصب بر روی سیستم
کامند چهارم: مشاهده اسلات های باز حافظه و اطلاع از امکان نصب حافظه بیشتر یا خیر
dmidecode -t memory | grep -i size
lshw -short -C memory
dmidecode -t memory | grep -i max
lshw -short -C memory | grep -i empty
مشاهده ip و gateway در سیستم عامل لینوکس: از یکی از دو دستور زیر استفاده کنید. دقت داشته باشید که برای استفاده از netstat حتما بایستی از قبل آن را بر روی سیستم عامل خود نصب کنید. در صورتی که از درایو مجازی برای اجرای لینوکس استفاده می کنید، چنانچه مجوز اجرای این دستور را نداشتید به صورت super-user یا root دستور آخر را اجرا کنید.
ip route | column -t
sudo apt install net-tools
netstat -r
👍1