معرفی ابزار:
ابزار GSDS یکی از ابزارهای کلیدی برای ارزیابی ماهیت داده های ژنومی است که از طریق آن می توانید ساختار کلیدی ژن ها و همچنین جایگاه اینترون ها و اگزون ها را مشخص کنید. برای استفاده از این ابزار بایستی از پایگاه داده اطلاعاتی زیر استفاده نمایید. این ابزار فایل نصبی ندارد و عمدتا به صورت انلاین بایستی از آن استفاده نمود.
http://gsds.gao-lab.org/
#اگزون
#ژن
🧬@IRBioinformatics
ابزار GSDS یکی از ابزارهای کلیدی برای ارزیابی ماهیت داده های ژنومی است که از طریق آن می توانید ساختار کلیدی ژن ها و همچنین جایگاه اینترون ها و اگزون ها را مشخص کنید. برای استفاده از این ابزار بایستی از پایگاه داده اطلاعاتی زیر استفاده نمایید. این ابزار فایل نصبی ندارد و عمدتا به صورت انلاین بایستی از آن استفاده نمود.
http://gsds.gao-lab.org/
#اگزون
#ژن
🧬@IRBioinformatics
چگونه مشخصات پردازنده سیستم عامل لینوکس را مشاهده کنیم؟
برای این کار کافی است یکی از کامندهای زیر را در ترمینال لینوکس وارد کنید تا مشخصات سخت افزاری سیستم برای شما نشان داده شود.
1- کامند اول مشخصات کلی cpu و سیستم عامل را در اختیار شما قرار می دهد.
2- کامند دوم اطلاعات ضروری که کاربر نیاز دارد را نشان می دهد
3- کامند سوم سرعت cpu را به هرتز برای کاربر در کنار سایر مشخصات نشان می دهد.
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
برای این کار کافی است یکی از کامندهای زیر را در ترمینال لینوکس وارد کنید تا مشخصات سخت افزاری سیستم برای شما نشان داده شود.
1- کامند اول مشخصات کلی cpu و سیستم عامل را در اختیار شما قرار می دهد.
2- کامند دوم اطلاعات ضروری که کاربر نیاز دارد را نشان می دهد
3- کامند سوم سرعت cpu را به هرتز برای کاربر در کنار سایر مشخصات نشان می دهد.
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
lscpu
lscpu | grep -i bogo
lscpu | grep -i hz
تعیین مشخصات کلی و جزیی پردازنده ها و سایر اطلاعات موردنیاز از بیس سخت افزاری که کاربر هنگام کار بر روی سیستم عامل لینوکس می خواهد به آنها دسترسی پیدا کند
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
sudo apt install inxi -y
inxi
خروجی دستور lscpu و مشاهده اطلاعات سخت افزاری سیستم هنگام کار بر روی سیستم عامل لینوکس
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
🧬@IRBioinformatics
#لینوکس
#نکات
مشاهده مشخصات کارت حافظه در لینوکس
برای مشاهده مشخصات کارت حافظه در لینوکس از کامندهای زیر می توانید به ترتیب استفاده کنید.
کامند اول: لیست کارتهای حافظه به همراه ظرفیت آنها
کامند دوم: مشخصات حافظه ها از لحاظ ظرفیت، سرعت، نوع، و برند و مشخصات دیگر
کامند سوم: حداکثر حافظه قابل نصب بر روی سیستم
کامند چهارم: مشاهده اسلات های باز حافظه و اطلاع از امکان نصب حافظه بیشتر یا خیر
برای مشاهده مشخصات کارت حافظه در لینوکس از کامندهای زیر می توانید به ترتیب استفاده کنید.
کامند اول: لیست کارتهای حافظه به همراه ظرفیت آنها
کامند دوم: مشخصات حافظه ها از لحاظ ظرفیت، سرعت، نوع، و برند و مشخصات دیگر
کامند سوم: حداکثر حافظه قابل نصب بر روی سیستم
کامند چهارم: مشاهده اسلات های باز حافظه و اطلاع از امکان نصب حافظه بیشتر یا خیر
dmidecode -t memory | grep -i size
lshw -short -C memory
dmidecode -t memory | grep -i max
lshw -short -C memory | grep -i empty
مشاهده ip و gateway در سیستم عامل لینوکس: از یکی از دو دستور زیر استفاده کنید. دقت داشته باشید که برای استفاده از netstat حتما بایستی از قبل آن را بر روی سیستم عامل خود نصب کنید. در صورتی که از درایو مجازی برای اجرای لینوکس استفاده می کنید، چنانچه مجوز اجرای این دستور را نداشتید به صورت super-user یا root دستور آخر را اجرا کنید.
ip route | column -t
sudo apt install net-tools
netstat -r
👍1
مشاهده مشخصات BIOS: دقت داشته باشید برای اجرای کامند زیر بایستی به صورت root آن را اجرا کنید. در حالت عادی دسترسی به خروجی این کامند میسر نمی باشد (مطابق شکل نشان داده شده)
sudo -su
dmidecode -t bios
👍3
معرفی نرم افزار:
مجموعه نرم افزاری امبر یکی از بهترین ابزارهای محاسباتی برای انجام دینامیک مولکولی است که در دو نسخه فری و تجاری برای کاربران ارائه می شود. همانند گرومکس این ابزار می تواند در بازه های زمانی مختلف برای انجام انواع شبیه سازی های دینامیک مولکولی مورد استفاده قرار گیرد و همچنین می توان از آن برای کارهای محاسباتی همانند مدلسازی های کوانتومی بهره برد. در این بخش فایل آخرین ورژن نرم افزار امبر و امبرتولز 23 برای کاربران عزیز قرار داه شده است.
🧬@IRBioinformatics
مجموعه نرم افزاری امبر یکی از بهترین ابزارهای محاسباتی برای انجام دینامیک مولکولی است که در دو نسخه فری و تجاری برای کاربران ارائه می شود. همانند گرومکس این ابزار می تواند در بازه های زمانی مختلف برای انجام انواع شبیه سازی های دینامیک مولکولی مورد استفاده قرار گیرد و همچنین می توان از آن برای کارهای محاسباتی همانند مدلسازی های کوانتومی بهره برد. در این بخش فایل آخرین ورژن نرم افزار امبر و امبرتولز 23 برای کاربران عزیز قرار داه شده است.
🧬@IRBioinformatics
👍1
Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
135.1 MB
نرم افزار miniconda محیط تلفیقی بر پایه پایتون برای نصب و اجرای نرم افزارهای وابسته با پایتون
🧬@IRBioinformatics
🧬@IRBioinformatics
👍1
ambertools-feedstock-main.zip
42.5 KB
نصب امبرتولز با واسطه conda: برای مشاهده کدها و شیوه نصب فایل readme را مشاهده کنید
🧬@IRBioinformatics
🧬@IRBioinformatics
👍2❤1