آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی – Telegram
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
1.57K subscribers
1.57K photos
40 videos
423 files
716 links
Iranian Researchers Bioinformatics Academy


Our sister channel:
✅️ https://news.1rj.ru/str/apply_for_future

Our Instagram link:
✅️ https://www.instagram.com/irbioinformatics/

📬 Admin: @h3nrasouli
Download Telegram
تعاریف زیر را برای همیشه به خاطر بسپارید
#تعریف
#اصطلاحات
👍1
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
تعاریف زیر را برای همیشه به خاطر بسپارید #تعریف #اصطلاحات
1. هاپلویید (Haploid)
تعریف: هاپلویید به حالتی اطلاق می‌شود که یک سلول تنها یک مجموعه کامل از کروموزوم‌ها (n) را دارد. به عبارت دیگر، در این حالت، کروموزوم‌ها به صورت تکی و بدون جفت وجود دارند.
مثال: سلول‌های جنسی (گامت‌ها) در انسان، مانند اسپرم و تخمک، هاپلویید هستند و 23 کروموزوم دارند.

2. دیپلویید (Diploid)
تعریف: دیپلویید به حالتی اطلاق می‌شود که یک سلول دو مجموعه کامل از کروموزوم‌ها (2n) را دارد، یعنی هر کروموزوم با یک همتای خود جفت شده است.
مثال: سلول‌های سوماتیک در انسان‌ها دیپلویید هستند و 46 کروموزوم دارند (23 جفت).

3. پلی پلویید (Polyploid)
تعریف: پلی پلویید به حالتی اطلاق می‌شود که یک سلول دارای بیش از دو مجموعه کامل از کروموزوم‌ها است. این حالت می‌تواند شامل سه یا بیشتر مجموعه‌های کروموزوم باشد.
مثال: گیاهانی مانند گندم که به صورت تری‌پلویید (3n) یا تری‌پلویید (4n) وجود دارند.

4. تریزومی (Trisomy)
تعریف: تریزومی یک نوع آنیوپلوییدی است که در آن یک کروموزوم خاص به صورت اضافی وجود دارد، به طوری که مجموع کروموزوم‌ها یکی بیشتر از حالت دیپلویید (2n + 1) است.
مثال: تریزومی 21 که به سندرم داون (Down syndrome) معروف است، به دلیل وجود یک کروموزوم اضافی در شماره 21 است.

5. یوپلوئیدی (Euploid)
تعریف: یوپلوئید به حالتی اطلاق می‌شود که سلول‌ها دارای تعداد صحیحی از مجموعه‌های کروموزومی هستند، یعنی می‌تواند هاپلویید (n) یا دیپلویید (2n) یا پلی‌پلویید (3n، 4n و غیره) باشد.
مثال: یک گیاه گندم با 6 مجموعه کروموزوم (hexaploid) که دارای 42 کروموزوم است (6n).

6. آنیوپلوییدی (Aneuploidy)
تعریف: آنیوپلوییدی به حالتی اطلاق می‌شود که تعداد کروموزوم‌ها در یک سلول از تعداد طبیعی آنها انحراف دارد، یعنی کمتر یا بیشتر از تعداد طبیعی کروموزوم‌ها.
مثال: سندرم تری‌زومی 18 که به دلیل وجود یک کروموزوم اضافی در شماره 18 ایجاد می‌شود.

7. اپیزومی (Epizomy)
تعریف: اپیزومی به حالتی اطلاق می‌شود که یک DNA اضافی به صورت غیر کروموزومی در سلول وجود دارد. این DNA می‌تواند به شکل حلقه‌ای باشد و معمولاً به ویروس‌ها و پلاسمیدها تعلق دارد.
مثال: پلاسمیدهای موجود در باکتری‌ها که می‌توانند ژن‌های مقاومت به آنتی‌بیوتیک‌ها را حمل کنند و به آن‌ها اجازه می‌دهند که در شرایط خاص بقا یابند.
👍4💯1
#تلومراز (Telomerase) یک آنزیم مهم است که به حفظ طول تلومرها، نواحی انتهایی کروموزوم‌ها، کمک می‌کند. تلومرها از توالی‌های تکراری DNA تشکیل شده‌اند که از کروموزوم‌ها در برابر تخریب و انقباض محافظت می‌کنند. با هر بار تقسیم سلولی، تلومرها کوتاه‌تر می‌شوند و در نهایت می‌توانند به اندازه‌ای کوتاه شوند که باعث توقف تقسیم سلولی و پیری شوند. تلومراز با اضافه کردن توالی‌های تکراری به انتهای کروموزوم‌ها، این فرایند را معکوس می‌کند و به سلول‌ها اجازه می‌دهد تا به طور نامحدود تقسیم شوند، به ویژه در سلول‌های بنیادی و سلول‌های جنسی.

تلومراز در زمینه‌های مختلفی کاربرد دارد، از جمله تحقیقات بیولوژی مولکولی، ژنتیک و پزشکی. در بسیاری از سلول‌های سرطانی، تلومراز فعال است و این امر به رشد غیرکنترل‌شده سلول‌ها کمک می‌کند. بنابراین، تحقیقات زیادی برای توسعه درمان‌های هدفمند که بتوانند تلومراز را مهار کنند، انجام می‌شود. همچنین تلومراز به عنوان یک هدف تحقیقاتی برای درمان‌های ضدپیری و بیماری‌های مرتبط با پیری، مانند بیماری‌های قلبی و عروقی، مورد توجه قرار گرفته است.
#دانستنی
👍8
📃A Comprehensive Review of Bioinformatics Tools for Genomic Biomarker Discovery Driving Precision Oncology

📗Journal: Genes (I.F.=2.8)
🗓Publish year: 2024

🧑‍💻Authors: Alexis J. Clark, James W. Lillard, Jr.
🏢University: Morehouse School of Medicine, USA

📎 Study the paper

📲Channel: @irBioinformatics
#review #biomarker #oncology
👍2👏2
📌سایت‌های رایگان دریافت کتاب و مقاله‌های انگلیسی

🔰درحال حاضر، سایت‌های زیادی برای دانلود کتاب‌ها  انگلیسی وجود دارن. خوبی بعضی‌از این سایت‌ها اینه که نیازی به پرداخت هزینه برای دریافت کتاب موردنظرتون نیست. با این کتاب‌ها می‌تونید دانش خودتون رو درزمینه قواعد و دایره لغات زبان انگلیسی افزایش بدید. پس بریم تا منابع معتبر دانلود رایگان کتاب‌ها رو معرفی کنیم!

🔰سایت "BookBoon"، اولین سایتیه که می‌خوایم بهتون معرفی کنیم. این سایت بیشتراز ۵۰ میلیون کتاب به‌شکل "PDF" داره‌. این وب‌سایت شامل کتاب‌های کوتاه و مقالات مختلفه. توی این سایت، امکان دسته‌بندی کتاب‌ها وجود داره که همین خصوصیت یکی‌از مزایای این سایت رو می‌سازه.

🔰یکی‌از سایت‌های مناسب برای مباحث علمی، "DOAbooks" هست که توسط یکی‌از موسسه‌های هلندی ایجاد شده. این سایت دسترسی رایگان به کتاب‌ها رو ممکن می‌کنه و به کاربران این اجازه رو میده که کتاب‌های نشرهای مختلف رو ببینن. همچنین تمام امکانات این سایت رایگانه!

🔰سایت "OAPEN" یه منبع معتبر برای دریافت رایگان کتاب‌های دانشگاهی علمیه که به دانشجویان و محققان کمک می‌کنه تا در زمینه علوم انسانی بتونن علم خودشون رو بیشتر کنن. اما نکته قابل توجه درمورد این سایت، اینه که "OAPEN" فقط به کشورهای درحال توسعه، خدمات ارائه میده!

🔰سایت "hu1lib" یکی دیگه از سایت‌هاییه که کتاب‌های انگلیسی رو به‌صورت رایگان در دسترس میزارن. این سایت کتاب‌های مختلف انگليسی ازجمله رمان‌ها رو به‌صورت رایگان قرار داده.

🔰برای دانلود رایگان کتاب‌های انگلیسی همچنین می‌توان به سایت"gen.lib.rus.ec" اشاره کرد. این سایت، داستان‌های علمی، رمان‌ها و انواعی از کتاب‌های انگلیسی رو پوشش می‌ده. بنابراین، برای اینکه علم خودتون رو چه در زمینه علمی و چه در زمینه قواعد افزایش بدید، می‌تونید از این سایت استفاده کنید.

🔰کتابخونه "booksee.org"، یک سایت روسیه که مجلات و کتاب‌های انگلیسی رو شامل میشه. همچنین، این سایت رایگانه و نیازی به پرداخت هزینه برای استفاده از این کتاب‌ها نیست.

🔰سایت "freebookspot.club" مناسب برای دانلود رایگان کتاب‌ها و داستان‌های انگلیسیه که انواعی از داستان‌ها و کتاب‌ها با ژانرهای علمی و... داره.

🔰سایت "bookyards.com" یکی دیگه از سایت‌های رایگانه که کتاب‌ها رو براساس نام نویسنده، ژانر و نام کتاب، اون‌ها رو دسته‌بندی می‌کنه. همچنین، در این سایت میشه با سرچ حروف اول اسم کتاب یا نویسنده کتاب موردنظرتون رو پیدا کنید.


--------------------------------------------
کانال بیوانفورماتیک محققان ایران
https://news.1rj.ru/str/IRBioinformatics
👍4
با ابزار جدید CABS-DOCK به راحتی برهمکنش های پروتئین-پپتید و پروتئین-پروتئین را می توانید بررسی کنید. در مقایسه با سرورهای دیگر محاسباتی این ابزار از زمان کوتاه تری برای بررسی برهمکنش بین رسپتور و لیگاند پروتئینی استفاده می کند. برای دسترسی به این سرور بر روی لینک زیر کلیک کنید
https://biocomp.chem.uw.edu.pl/CABSdock/
👍5
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
با ابزار جدید CABS-DOCK به راحتی برهمکنش های پروتئین-پپتید و پروتئین-پروتئین را می توانید بررسی کنید. در مقایسه با سرورهای دیگر محاسباتی این ابزار از زمان کوتاه تری برای بررسی برهمکنش بین رسپتور و لیگاند پروتئینی استفاده می کند. برای دسترسی به این سرور بر…
خوبی این ابزار CABS-DOCK اینه که لیگاند رو به صورت کاملا انعطاف پذیر در نظر می گیره و این مورد میتونه به صورت موثری در افزایش حالت های برهمکنش یک پپتید با پروتئین موثر باشه و دید دقیق تری از چگونگی برهمکنش پروتئین-پپتید در اختیار محققین قرار بده. اومدن نتایج خروجی این ابزار رو با داده های اکسپریمنتال هم بررسی کردن و متوجه شدن خیلی دقیقه خروجی ها و الان کاربرهای زیادی داره به خاطر همین مسئله. امتحانش و یادگیری این ابزار خالی از لطف نیست...
👍5
جایزه صلح نوبل به یک سازمان ژاپنی رسید... ترجمه اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی👇👇👇(استفاده با ذکر منبع مجاز است)

کمیته نوبل نروژ تصمیم گرفته است تا جایزه نوبل صلح ۲۰۲۴ را به سازمان ژاپنی نیهون هیدانکیو اعطا کند. این حرکت مردمی از بازماندگان بمب‌گذاری‌های اتمی هیروشیما و ناگازاکی، که به‌عنوان هیباکوشا نیز شناخته می‌شود، به‌خاطر تلاش‌های خود برای دستیابی به جهانی بدون سلاح‌های هسته‌ای و برای نشان دادن از طریق شهادت‌های شاهدان که سلاح‌های هسته‌ای هرگز نباید دوباره استفاده شوند، این جایزه صلح را دریافت می‌کند.

در پاسخ به حملات بمب‌گذاری اتمی در آگوست ۱۹۴۵، یک حرکت جهانی شکل گرفت که اعضای آن بی‌وقفه برای افزایش آگاهی درباره عواقب انسانی فاجعه‌بار استفاده از سلاح‌های هسته‌ای کار کردند. به‌تدریج، یک هنجار بین‌المللی قوی توسعه یافت که استفاده از سلاح‌های هسته‌ای را به‌عنوان عملی غیرقابل قبول از نظر اخلاقی محکوم می‌کرد. این هنجار به‌عنوان «تابو هسته‌ای» شناخته می‌شود.
👍5👎1
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی
جایزه صلح نوبل به یک سازمان ژاپنی رسید... ترجمه اختصاصی کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی👇👇👇(استفاده با ذکر منبع مجاز است) کمیته نوبل نروژ تصمیم گرفته است تا جایزه نوبل صلح ۲۰۲۴ را به سازمان ژاپنی نیهون هیدانکیو اعطا کند. این حرکت مردمی از بازماندگان بمب‌گذاری‌های…
شهادت‌های هیباکوشا – بازماندگان هیروشیما و ناگازاکی – در این زمینه وسیع بی‌نظیر است.
این شاهدان تاریخی به ایجاد و تقویت مخالفت گسترده‌ای با سلاح‌های هسته‌ای در سراسر جهان کمک کرده‌اند، با استفاده از داستان‌های شخصی، ایجاد کمپین‌های آموزشی مبتنی بر تجربیات خود و صدور هشدارهای فوری در مورد گسترش و استفاده از سلاح‌های هسته‌ای. هیباکوشا به ما کمک می‌کند تا غیرقابل وصف را توصیف کنیم، غیرقابل تصور را بیاندیشیم و به‌گونه‌ای درد و رنج غیرقابل درک ناشی از سلاح‌های هسته‌ای را درک کنیم.
سرنوشت کسانی که از آتش‌سوزی‌های هیروشیما و ناگازاکی جان سالم به‌در بردند، مدت‌ها پنهان و نادیده گرفته شد. در سال ۱۹۵۶، انجمن‌های محلی هیباکوشا به همراه قربانیان آزمایش‌های هسته‌ای در اقیانوس آرام، کنفدراسیون سازمان‌های آسیب‌دیدگان بمب اتمی و هیدروژنی ژاپن را تشکیل دادند. این نام به‌طور مختصر در زبان ژاپنی به نیهون هیدانکیو تبدیل شد. این سازمان به بزرگ‌ترین و تأثیرگذارترین سازمان هیباکوشا در ژاپن تبدیل می‌شود.
هسته‌ی دیدگاه آلfred نوبل، باور به این بود که افراد متعهد می‌توانند تفاوت ایجاد کنند. با اعطای جایزه نوبل صلح امسال به نیهون هیدانکیو، کمیته نوبل نروژ می‌خواهد از تمام بازماندگانی که با وجود رنج‌های جسمی و خاطرات دردناک، تصمیم گرفته‌اند از تجربیات پرهزینه خود برای پرورش امید و مشارکت در صلح استفاده کنند، تجلیل کند.
نیهون هیدانکیو هزاران روایت شاهدی ارائه داده، قطعنامه‌ها و فراخوان‌های عمومی صادر کرده و هر ساله هیئت‌هایی به سازمان ملل و انواع کنفرانس‌های صلح ارسال کرده است تا جهان را از نیاز فوری به خلع سلاح هسته‌ای آگاه کند.
یک روز، هیباکوشا دیگر در میان ما به‌عنوان شاهدانی از تاریخ نخواهند بود. اما با فرهنگ قوی یادآوری و تعهد مستمر، نسل‌های جدید در ژاپن تجربیات و پیام این شاهدان را ادامه می‌دهند. آن‌ها در حال الهام‌بخشی و آموزش به مردم در سراسر جهان هستند. به این ترتیب، آن‌ها به حفظ تابو هسته‌ای کمک می‌کنند – پیش‌شرطی برای آینده‌ای صلح‌آمیز برای بشریت.

برای مطالعه جزییات بیشتر وارد لینک خبر شوید
👍41
🔴هر کلاسی شرکت میکنی دست نگه دار!!

⭕️کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی کاملا رایگان همه چی برات گذاشتن تا یادگیری رو شروع کنی......



سوالات مخاطبان کانال که شاید بدرد شما هم بخورد:

1⃣سوال اول:
من دانشجوی ورودی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی هستم و علاقه مند به تحصیل در رشته بیوانفورماتیک هستم، چه زبان های برنامه نویسی باید یادبگیرم که کارایی بهتری داره و میخام پایان نامم هم RNA-seq انجام بدم، به نظرتون چطوری پلنم رو ببرم جلو؟
⬅️ پاسخ

2⃣سوال دوم:
آیا می توان با یادگیری مباحث بیوانفورماتیکی (چه در حوزه بیوانفورماتیک ساختاری و چه در حوزه ژنومیکس و سایر حوزه ها) به صورت پاره وقت و فریلنسری کار گیر آورد؟ بعد از چند وقت آموزش و با چه درآمدی یادگیری مباحث بیوانفورماتیکی در سطح مقدماتی و پیشرفته میتونه کمک کننده باشه؟

⬅️پاسخ

3⃣سوال سوم: 
من دانشجوی ترم اخر رشته میکروبیولوژی در مقطع ارشد هستم و پایان نامم روی باکتری های بیماری زای سالمونلا هستش. به چه صورت می تونم کار بیوانفورماتیکی توی کارم داشته باشم و اینکه ایا یادگیری مباحث بیوانفورماتیکی به درد آینده شغلی من میخوره؟ من میخوام فعلا در یک کار آزمایشگاهی مشغول بشم و ایا یادگیری این مباحث در درآمد من تاثیر داره؟
⬅️پاسخ




🔰مرجع آموزش های رایگان
👇👇👇👇👇
🧬🆔
@IRBioinformatics
👍4
آکادمی بیوانفورماتیک محققان ایرانی pinned «🔴هر کلاسی شرکت میکنی دست نگه دار!! ⭕️کانال بیوانفورماتیک محققان ایرانی کاملا رایگان همه چی برات گذاشتن تا یادگیری رو شروع کنی...... سوالات مخاطبان کانال که شاید بدرد شما هم بخورد: 1⃣سوال اول: من دانشجوی ورودی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی هستم…»
ابتدا فکر می‌کرد می‌تواند کسی را پیدا کند که با او حرف بزند، بعد فهمید حرف‌زدن با دیگران مثل حرف‌زدن با یک پرنده یا ماهی است؛ عجیب، بیهوده، و حتی احمقانه. دیگران در دنیای کاملاً متفاوتی زندگی می‌ کنند. سفره دلتون هرجایی باز نکنین حتی ب اندازه🤏

#نکته_روز
👏5👍2👎1
تحقیقات جدید در مورد مرجان ها: کشف جدید در مورد مرجان ها ممکن است معمای «پلاستیک مفقود شده» در اقیانوس را حل کند
@IRBioinformatics
محققان میکروپلاستیک‌ها را در تمام اجزای مرجان، از جمله اسکلت آن، کشف کرده‌اند.

محققان از ژاپن و تایلند میکروپلاستیک‌ها را در هر سه بخش آناتومی مرجان—مخاط سطحی، بافت و اسکلت—کشف کرده‌اند. این دستاورد با استفاده از یک روش جدید تشخیص میکروپلاستیک به‌دست آمد که تیم برای اولین بار آن را بر روی مرجان به‌کار گرفت.
@IRBioinformatics
این یافته‌ها ممکن است توضیحی برای «مشکل پلاستیک مفقود شده» باشند که دانشمندان را به چالش کشیده است، جایی که حدود ۷۰٪ از زباله‌های پلاستیکی که به اقیانوس‌ها وارد شده‌اند، قابل مشاهده نیستند. تیم فرض می‌کند که مرجان ممکن است به‌عنوان یک «مخزن» برای میکروپلاستیک‌ها عمل کند و آن‌ها را از اقیانوس‌ها جذب کند. یافته‌های آن‌ها در مجله علم محیط‌زیست کل منتشر شده است.

#دانستنی #مرجان #میکروپلاستیک
👍6
ویکتور آمبروس و گری رووکون آماده‌اند تا در سال ۲۰۲۴ جایزه نوبل فیزیولوژی یا پزشکی را برای کشفیات نوآورانه خود در زمینه نقش میکروRNAها در تنظیم ژن و تأثیرات آن‌ها در زیست‌شناسی توسعه و بیماری دریافت کنند.
کار پیشگامانه آمبروس و رووکون در اوایل دهه ۱۹۹۰، اولین میکروRNA، به نام lin-4، را در نماتود Caenorhabditis elegans شناسایی کرد. آن‌ها نشان دادند که lin-4 چگونه زمان‌بندی توسعه را با سرکوب بیان ژن‌های هدف خاص تنظیم می‌کند. این کشف لایه‌ای از تنظیم ژنتیکی را که قبلاً شناخته نشده بود، آشکار کرد و نشان داد که میکروRNAها نقش مهمی در تنظیم بیان ژن در سطح پس‌از رونویسی دارند.تصویر پیوست به شکل ساختار cryoEM پروتئین‌های انسانی Drosha و DGCR8 در ترکیب با pri-miRNA. این پروتئین‌ها در مراحل اولیه بیوژنز miRNA نقش دارند (کد PDB: 9ASM).
👍4